seq1 = pF1KE3677.tfa, 804 bp
seq2 = pF1KE3677/gi568815583r_89650147.tfa (gi568815583r:89650147_89851231), 201085 bp

>pF1KE3677 804
>gi568815583r:89650147_89851231 (Chr15)

(complement)

1-723  (100001-100723)   99% ->
724-804  (101005-101085)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGCCCCTGTGCCCGCCGCTCTCCGAGTCCTGGATGCTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCAGCCCCTGTGCCCGCCGCTCTCCGAGTCCTGGATGCTCTCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCTGGGGCCCAACTCGGCGGCCGCCGCCCTCCGACAAGGACTGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCTGGGGCCCAACTCGGCGGCCGCCGCCCTCCGACAAGGACTGCGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCCCTCGTCTCGTCCCCAGACTCATGGGGCAGCACCCCAGCCGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCCCTCGTCTCGTCCCCAGACTCATGGGGCAGCACCCCAGCCGACAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGTGGCGAGCCCCGCGCGGCCAGGCACCCTCCGGGACCCCCGCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGTGGCGAGCCCCGCGCGGCCAGGCACCCTCCGGGACCCCCGCGCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCGTAGGTAGGCGCGGCGCGCGCAGCAGCCGCCTGGGCAGCGGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCGTAGGTAGGCGCGGCGCGCGCAGCAGCCGCCTGGGCAGCGGGCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCAGAGCGCCAGTGAGCGGGAGAAACTGCGCATGCGCACGCTGGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCAGAGCGCCAGTGAGCGGGAGAAACTGCGCATGCGCACGCTGGCCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCTGCACGAGCTGCGCCGCTTTCTACCGCCGTCCGTGGCGCCCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCCTGCACGAGCTGCGCCGCTTTCTACCGCCGTCCGTGGCGCCCGCGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGAGCCTGACCAAGATCGAGACGCTGCGCCTGGCTATCCGCTATATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAGAGCCTGACCAAGATCGAGACGCTGCGCCTGGCTATCCGCTATATCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCACCTGTCGGCCGTGCTAGGCCTCAGCGAGGAGAGTCTCCAGCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCACCTGTCGGCCGTGCTAGGCCTCAGCGAGGAGAGTCTCCAGCGCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCCGGCAGCGCGGTGACGCGGGGTCCCCTCGGGGCTGCCCGCTGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCCGGCAGCGCGGTGACGCGGGGTCCCCTCGGGGCTGCCCGCTGTGCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGACGACTGCCCCGCGCAGATGCAGACACGGACGCAGGCTGAGGGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGACGACTGCCCCGCGCAGATGCAGACACGGACGCAGGCTGAGGGGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGCAGGGGCGCGGGCTGGGCCTGGTATCCGCCGTCCGCGCCGGGGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGCAGGGGCGCGGGCTGGGCCTGGTATCCGCCGTCCGCGCCGGGGCGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGGGGATCCCCGCCTGCCTGCCCCGGAGCCCGAGCTGCACCCGAGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGGGGATCCCCGCCTGCCTGCCCCGGAGCCCGAGCTGCACCCGAGCCGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGACCCGCCTGCGCTGTTCGCCGAGGCGGCGTGCCCGGAAGGGCAGGCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100651 CGACCCGCCTGCGCTGTTCGCCGAGGCGGCGTGCCCTGAAGGGCAGGCGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGAGCCAAGCCCACCGTCCCCG         CTCCTTCCGGGCGACGTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100701 TGGAGCCAAGCCCACCGTCCCCGGTT...CAGCTCCTTCCGGGCGACGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGGCTCTGTTGGAGACCTGGATGCCCCTCTCGCCTCTGGAGTGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101023 CTGGCTCTGTTGGAGACCTGGATGCCCCTCTCGCCTCTGGAGTGGCTGCC

    800     .    :
    792 TGAGGAGCCCAAG
        |||||||||||||
 101073 TGAGGAGCCCAAG