seq1 = pF1KE3674.tfa, 1197 bp
seq2 = pF1KE3674/gi568815596r_210334490.tfa (gi568815596r:210334490_210576396), 241907 bp

>pF1KE3674 1197
>gi568815596r:210334490_210576396 (Chr2)

(complement)

1-81  (100001-100081)   98% ->
82-199  (104321-104438)   100% ->
200-407  (121083-121290)   100% ->
408-543  (134954-135089)   100% ->
544-690  (135653-135799)   100% ->
691-873  (138525-138707)   100% ->
874-1050  (140005-140181)   100% ->
1051-1123  (140938-141010)   100% ->
1124-1197  (141834-141907)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCAAAGGGCTTTCCCGAATCCTTATGCTGATTATAACAAATCCCT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCAAAGGGCCTTCCCGAATCCTTATGCTGATTATAACAAATCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGAAGGCTACTTTGATGCTGCCGGGAGG         CTGACTCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 GGCCGAAGGCTACTTTGATGCTGCCGGGAGGGTG...TAGCTGACTCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTTCTCACAACGCTTGACCAATAAGATTCGGGAGCTTCTTCAGCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104331 AGTTCTCACAACGCTTGACCAATAAGATTCGGGAGCTTCTTCAGCAAATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGAGAGGCCTGAAATCAGCAGACCCTCGGGATGGCACCGGTTACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104381 GAGAGAGGCCTGAAATCAGCAGACCCTCGGGATGGCACCGGTTACACTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGGGCAG         GTATTGCTGTGCTTTACTTACATCTTTATGATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104431 CTGGGCAGGTA...CAGGTATTGCTGTGCTTTACTTACATCTTTATGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TATTTGGGGACCCTGCCTACCTACAGTTAGCACATGGCTATGTAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121116 TATTTGGGGACCCTGCCTACCTACAGTTAGCACATGGCTATGTAAAGCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTCTGAACTGCTTAACCAAGCGCTCCATCACCTTCCTTTGTGGGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121166 AGTCTGAACTGCTTAACCAAGCGCTCCATCACCTTCCTTTGTGGGGATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGCCCCCTGGCAGTGGCCGCTGTGCTATATCACAAGATGAACAATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121216 AGGCCCCCTGGCAGTGGCCGCTGTGCTATATCACAAGATGAACAATGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCAGGCAGAAGATTGCATCACACG         GCTAATTCACCTAAAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 121266 AGCAGGCAGAAGATTGCATCACACGGTA...TAGGCTAATTCACCTAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGATTGATCCTCATGCTCCAAATGAAATGCTCTATGGGCGAATAGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134970 AAGATTGATCCTCATGCTCCAAATGAAATGCTCTATGGGCGAATAGGCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATCTATGCTCTTCTTTTTGTCAATAAGAACTTTGGAGTGGAAAAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135020 CATCTATGCTCTTCTTTTTGTCAATAAGAACTTTGGAGTGGAAAAGATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCAAAGCCATATTCAGCAG         ATTTGTGAAACAATTTTAACC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 135070 CTCAAAGCCATATTCAGCAGGTA...TAGATTTGTGAAACAATTTTAACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTGGAGAAAACCTAGCTAGGAAGAGAAACTTCACGGCAAAGTCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135674 TCTGGAGAAAACCTAGCTAGGAAGAGAAACTTCACGGCAAAGTCTCCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATGTATGAATGGTACCAGGAATATTATGTAGGGGCTGCTCATGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135724 GATGTATGAATGGTACCAGGAATATTATGTAGGGGCTGCTCATGGCCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTGGAATTTATTACTACCTGATGCAG         CCCAGCCTTCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 135774 CTGGAATTTATTACTACCTGATGCAGGTA...TAGCCCAGCCTTCAAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGCCAAGGGAAGTTACATAGTTTGGTCAAGCCCAGTGTAGACTACGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138540 AGCCAAGGGAAGTTACATAGTTTGGTCAAGCCCAGTGTAGACTACGTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCAGCTGAAATTCCCTTCTGGCAATTACCCTCCATGTATAGGTGATAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138590 CCAGCTGAAATTCCCTTCTGGCAATTACCCTCCATGTATAGGTGATAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GAGATCTGCTTGTCCATTGGTGCCATGGCGCCCCTGGGGTAATCTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138640 GAGATCTGCTTGTCCATTGGTGCCATGGCGCCCCTGGGGTAATCTACATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTCATCCAGGCCTATAAG         GTATTCAGAGAGGAAAAGTATCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 138690 CTCATCCAGGCCTATAAGGTA...CAGGTATTCAGAGAGGAAAAGTATCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTGTGATGCCTATCAGTGTGCTGATGTGATCTGGCAATATGGGTTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140028 CTGTGATGCCTATCAGTGTGCTGATGTGATCTGGCAATATGGGTTGCTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGAAGGGATATGGGCTGTGCCACGGTTCTGCAGGGAATGCCTATGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140078 AGAAGGGATATGGGCTGTGCCACGGTTCTGCAGGGAATGCCTATGCCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGACACTCTACAACCTCACACAGGACATGAAGTACCTGTATAGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140128 CTGACACTCTACAACCTCACACAGGACATGAAGTACCTGTATAGGGCCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TAAG         TTTGCTGAATGGTGCTTAGAGTATGGAGAACATGGAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140178 TAAGGTA...CAGTTTGCTGAATGGTGCTTAGAGTATGGAGAACATGGAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCAGAACACCAGACACCCCTTTCTCTCTCTTTGAAG         GAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 140975 GCAGAACACCAGACACCCCTTTCTCTCTCTTTGAAGGTA...CAGGAATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCTGGAACAATATATTTCCTGGCTGACCTGCTAGTCCCCACAAAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141839 GCTGGAACAATATATTTCCTGGCTGACCTGCTAGTCCCCACAAAAGCCAG

   1250     .    :    .
   1179 GTTCCCTGCATTTGAACTC
        |||||||||||||||||||
 141889 GTTCCCTGCATTTGAACTC