seq1 = pF1KE3673.tfa, 1110 bp
seq2 = pF1KE3673/gi568815585r_26969286.tfa (gi568815585r:26969286_27271639), 302354 bp

>pF1KE3673 1110
>gi568815585r:26969286_27271639 (Chr13)

(complement)

1-48  (100001-100048)   100% ->
49-129  (155044-155124)   100% ->
130-343  (165696-165909)   100% ->
344-573  (175810-176039)   99% ->
574-650  (181482-181558)   100% ->
651-734  (181674-181757)   100% ->
735-932  (196252-196449)   100% ->
933-1011  (200491-200569)   100% ->
1012-1110  (202256-202354)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAATCCTAATGACAGTCTCCAAATTCGCCTCCATCTGTACCATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100001 ATGGAAATCCTAATGACAGTCTCCAAATTCGCCTCCATCTGTACCATGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     49        GGCGCCAATGCTTCGGCATTAGAGAAAGAGATTGGTCCAGAAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 A...TAGGGCGCCAATGCTTCGGCATTAGAGAAAGAGATTGGTCCAGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTTTCCGGTCAATGAGCACTATTTTGGATTAGTCAAT         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 155087 AGTTTCCGGTCAATGAGCACTATTTTGGATTAGTCAATGTA...CAGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GGGAATACCTGCTACTGCAATTCAGTTCTTCAAGCACTTTATTTTTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165699 GGGAATACCTGCTACTGCAATTCAGTTCTTCAAGCACTTTATTTTTGTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCCATTTCGGGAAAAAGTTCTTGCGTATAAGAGTCAACCTAGGAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165749 TCCATTTCGGGAAAAAGTTCTTGCGTATAAGAGTCAACCTAGGAAAAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAGCCTTCTTACATGCTTAGCAGATCTCTTCCATAGCATAGCCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165799 AGAGCCTTCTTACATGCTTAGCAGATCTCTTCCATAGCATAGCCACTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGAAAAAGGTTGGAGTAATACCCCCTAAGAAGTTCATCACAAGATTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165849 AAGAAAAAGGTTGGAGTAATACCCCCTAAGAAGTTCATCACAAGATTACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAAGAAAATG         AGCTTTTTGACAACTACATGCAACAAGATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 165899 GAAAGAAAATGGTA...CAGAGCTTTTTGACAACTACATGCAACAAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCATGAATTCTTAAATTACCTACTAAATACAATTGCTGATATTTTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175840 CCCATGAATTCTTAAATTACCTACTAAATACAATTGCTGATATTTTACAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGAGAGAAAGCAGGAAAAACAAAATGGTCGTTTACCTAATGGTAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175890 GAAGAGAGAAAGCAGGAAAAACAAAATGGTCGTTTACCTAATGGTAATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATAATGAAAATAATAACAGCACACCAGACCCAACGTGGGTTGATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 175940 TGATAATGAAAATAATAACAGCACACCAGACCCAACGTGGGTTCATGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTTTTCAGGGAACATTAACTAATGAAACCAGATGTCTTACTTGTGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175990 TTTTTCAGGGAACATTAACTAATGAAACCAGATGTCTTACTTGTGAAACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574          ATAAGCAGCAAAGATGAAGATTTTTTAGACCTTTCTGTTGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176040 GTA...CAGATAAGCAGCAAAGATGAAGATTTTTTAGACCTTTCTGTTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTGGAACAAAATACATCAATTACTCACTGCTTAAG         GGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 181523 CGTGGAACAAAATACATCAATTACTCACTGCTTAAGGTA...CAGGGGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCAGCAACACAGAAACTCTGTGCAGTGAATACAAGTATTACTGTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181679 TCAGCAACACAGAAACTCTGTGCAGTGAATACAAGTATTACTGTGAAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGTCGCAGCAAACAGGAAGCACACAAACG         GATGAAAGTTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 181729 TGTCGCAGCAAACAGGAAGCACACAAACGGTA...TAGGATGAAAGTTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AAAACTGCCCATGATTCTAGCTCTACACCTGAAGAGATTTAAATATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196264 AAAACTGCCCATGATTCTAGCTCTACACCTGAAGAGATTTAAATATATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATCAACTTCATCGATATACAAAACTCTCTTACCGGGTAGTTTTTCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196314 ATCAACTTCATCGATATACAAAACTCTCTTACCGGGTAGTTTTTCCTTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAACTTCGTCTGTTTAACACTTCAGGTGATGCCACCAATCCAGACAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196364 GAACTTCGTCTGTTTAACACTTCAGGTGATGCCACCAATCCAGACAGAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GTACGACCTTGTTGCTGTTGTGGTTCACTGTGGAAG         TGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 196414 GTACGACCTTGTTGCTGTTGTGGTTCACTGTGGAAGGTA...TAGTGGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCAATCGAGGCCATTATATTGCAATAGTTAAGAGTCATGATTTTTGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200496 CCAATCGAGGCCATTATATTGCAATAGTTAAGAGTCATGATTTTTGGTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTGTTTGATGACGACATTGTAGAA         AAAATAGATGCACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 200546 TTGTTTGATGACGACATTGTAGAAGTA...CAGAAAATAGATGCACAAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TATTGAAGAATTCTACGGGTTGACATCAGATATCTCAAAGAACTCTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202273 TATTGAAGAATTCTACGGGTTGACATCAGATATCTCAAAGAACTCTGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :
   1079 CTGGTTACATCCTTTTCTATCAGTCTCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 202323 CTGGTTACATCCTTTTCTATCAGTCTCGGGAC