seq1 = pF1KE3668.tfa, 1395 bp
seq2 = pF1KE3668/gi568815591r_44045139.tfa (gi568815591r:44045139_44288953), 243815 bp

>pF1KE3668 1395
>gi568815591r:44045139_44288953 (Chr7)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-208  (135491-135653)   100% ->
209-363  (136529-136683)   100% ->
364-483  (137879-137998)   100% ->
484-579  (138890-138985)   100% ->
580-679  (139095-139194)   100% ->
680-863  (141121-141304)   100% ->
864-1019  (142336-142491)   100% ->
1020-1253  (143224-143457)   100% ->
1254-1395  (143674-143815)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGACGACAGAGCCAGGATGGAGGCCGCCAAGAAGGAGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGCTGGACGACAGAGCCAGGATGGAGGCCGCCAAGAAGGAGAAGGTA..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     GTAGAGCAGATCCTGGCAGAGTTCCAGCTGCAGGAGGAGGACCTGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .CAGGTAGAGCAGATCCTGGCAGAGTTCCAGCTGCAGGAGGAGGACCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAGGTGATGAGACGGATGCAGAAGGAGATGGACCGCGGCCTGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135537 AGAAGGTGATGAGACGGATGCAGAAGGAGATGGACCGCGGCCTGAGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGACCCATGAAGAGGCCAGTGTGAAGATGCTGCCCACCTACGTGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135587 GAGACCCATGAAGAGGCCAGTGTGAAGATGCTGCCCACCTACGTGCGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCCCAGAAGGCTCAG         AAGTCGGGGACTTCCTCTCCCTGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 135637 CACCCCAGAAGGCTCAGGTA...TAGAAGTCGGGGACTTCCTCTCCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCTGGGTGGCACTAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAGGTGGGAGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136553 ACCTGGGTGGCACTAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAGGTGGGAGAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGAGGGGCAGTGGAGCGTGAAGACCAAACACCAGATGTACTCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136603 GAGGAGGGGCAGTGGAGCGTGAAGACCAAACACCAGATGTACTCCATCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGAGGACGCCATGACCGGCACTGCTGAGATG         CTCTTCGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 136653 CGAGGACGCCATGACCGGCACTGCTGAGATGGTG...CAGCTCTTCGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACATCTCTGAGTGCATCTCCGACTTCCTGGACAAGCATCAGATGAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137889 ACATCTCTGAGTGCATCTCCGACTTCCTGGACAAGCATCAGATGAAACAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGAAGCTGCCCCTGGGCTTCACCTTCTCCTTTCCTGTGAGGCACGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137939 AAGAAGCTGCCCCTGGGCTTCACCTTCTCCTTTCCTGTGAGGCACGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATCGATAAG         GGCATCCTTCTCAACTGGACCAAGGGCTTCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 137989 CATCGATAAGGTG...CAGGGCATCCTTCTCAACTGGACCAAGGGCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGCCTCAGGAGCAGAAGGGAACAATGTCGTGGGGCTTCTGCGAGACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138921 AGGCCTCAGGAGCAGAAGGGAACAATGTCGTGGGGCTTCTGCGAGACGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCAAACGGAGAGGG         GACTTTGAAATGGATGTGGTGGCAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 138971 ATCAAACGGAGAGGGGTG...CAGGACTTTGAAATGGATGTGGTGGCAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGTGAATGACACGGTGGCCACGATGATCTCCTGCTACTACGAAGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139121 GGTGAATGACACGGTGGCCACGATGATCTCCTGCTACTACGAAGACCATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGTGCGAGGTCGGCATGATCGTGG         GCACGGGCTGCAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 139171 AGTGCGAGGTCGGCATGATCGTGGGTA...CAGGCACGGGCTGCAATGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TGCTACATGGAGGAGATGCAGAATGTGGAGCTGGTGGAGGGGGACGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141138 TGCTACATGGAGGAGATGCAGAATGTGGAGCTGGTGGAGGGGGACGAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCGCATGTGCGTCAATACCGAGTGGGGCGCCTTCGGGGACTCCGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141188 CCGCATGTGCGTCAATACCGAGTGGGGCGCCTTCGGGGACTCCGGCGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGACGAGTTCCTGCTGGAGTATGACCGCCTGGTGGACGAGAGCTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141238 TGGACGAGTTCCTGCTGGAGTATGACCGCCTGGTGGACGAGAGCTCTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AACCCCGGTCAGCAGCT         GTATGAGAAGCTCATAGGTGGCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 141288 AACCCCGGTCAGCAGCTGTA...CAGGTATGAGAAGCTCATAGGTGGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GTACATGGGCGAGCTGGTGCGGCTTGTGCTGCTCAGGCTCGTGGACGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142360 GTACATGGGCGAGCTGGTGCGGCTTGTGCTGCTCAGGCTCGTGGACGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACCTGCTCTTCCACGGGGAGGCCTCCGAGCAGCTGCGCACACGCGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142410 ACCTGCTCTTCCACGGGGAGGCCTCCGAGCAGCTGCGCACACGCGGAGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTCGAGACGCGCTTCGTGTCGCAGGTGGAGAG         CGACACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 142460 TTCGAGACGCGCTTCGTGTCGCAGGTGGAGAGGTG...CAGCGACACGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CGACCGCAAGCAGATCTACAACATCCTGAGCACGCTGGGGCTGCGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143233 CGACCGCAAGCAGATCTACAACATCCTGAGCACGCTGGGGCTGCGACCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CGACCACCGACTGCGACATCGTGCGCCGCGCCTGCGAGAGCGTGTCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143283 CGACCACCGACTGCGACATCGTGCGCCGCGCCTGCGAGAGCGTGTCTACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGCGCTGCGCACATGTGCTCGGCGGGGCTGGCGGGCGTCATCAACCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143333 CGCGCTGCGCACATGTGCTCGGCGGGGCTGGCGGGCGTCATCAACCGCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCGCGAGAGCCGCAGCGAGGACGTAATGCGCATCACTGTGGGCGTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143383 GCGCGAGAGCCGCAGCGAGGACGTAATGCGCATCACTGTGGGCGTGGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCTCCGTGTACAAGCTGCACCCCAG         CTTCAAGGAGCGGTTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 143433 GCTCCGTGTACAAGCTGCACCCCAGGTG...CAGCTTCAAGGAGCGGTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CATGCCAGCGTGCGCAGGCTGACGCCCAGCTGCGAGATCACCTTCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143690 CATGCCAGCGTGCGCAGGCTGACGCCCAGCTGCGAGATCACCTTCATCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GTCGGAGGAGGGCAGTGGCCGGGGCGCGGCCCTGGTCTCGGCGGTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143740 GTCGGAGGAGGGCAGTGGCCGGGGCGCGGCCCTGGTCTCGGCGGTGGCCT

   1450     .    :    .    :    .
   1370 GTAAGAAGGCCTGTATGCTGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||
 143790 GTAAGAAGGCCTGTATGCTGGGCCAG