seq1 = pF1KE3663.tfa, 588 bp
seq2 = pF1KE3663/gi568815586f_119079313.tfa (gi568815586f:119079313_119293855), 214543 bp

>pF1KE3663 588
>gi568815586f:119079313_119293855 (Chr12)

1-367  (100001-100367)   100% ->
368-431  (107713-107776)   100% ->
432-588  (114387-114543)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGACGGTCAGATGCCCTTCTCCTGCCACTACCCAAGCCGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGACGGTCAGATGCCCTTCTCCTGCCACTACCCAAGCCGCCTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGAGACCCCTTCCGGGACTCTCCCCTCTCCTCTCGCCTGCTGGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGAGACCCCTTCCGGGACTCTCCCCTCTCCTCTCGCCTGCTGGATGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTTGGCATGGACCCCTTCCCAGACGACTTGACAGCCTCTTGGCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTTGGCATGGACCCCTTCCCAGACGACTTGACAGCCTCTTGGCCCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGGCTCTGCCTCGTCTCTCCTCCGCCTGGCCAGGCACCCTAAGGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGGCTCTGCCTCGTCTCTCCTCCGCCTGGCCAGGCACCCTAAGGTCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGGTGCCCCGGGGCCCCACTGCCACCGCCAGGTTTGGGGTGCCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGGTGCCCCGGGGCCCCACTGCCACCGCCAGGTTTGGGGTGCCTGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGGCAGGACCCCCCCACCCTTCCCTGGGGAGCCCTGGAAAGTGTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGGCAGGACCCCCCCACCCTTCCCTGGGGAGCCCTGGAAAGTGTGTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATGTGCACAGCTTCAAGCCAGAGGAGTTGATGGTGAAGACCAAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATGTGCACAGCTTCAAGCCAGAGGAGTTGATGGTGAAGACCAAAGATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATACGTGGAGGTGTCTG         GCAAACATGAAGAGAAACAGCAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100351 ATACGTGGAGGTGTCTGGTA...CAGGCAAACATGAAGAGAAACAGCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAGGTGGCATTGTTTCTAAGAACTTCACAAAGAAAATCCA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 107737 AAGGTGGCATTGTTTCTAAGAACTTCACAAAGAAAATCCAGTA...TAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTTCCTGCAGAGGTGGATCCTGTGACAGTATTTGCCTCACTTTCCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114388 CTTCCTGCAGAGGTGGATCCTGTGACAGTATTTGCCTCACTTTCCCCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGGTCTGCTGATCATCGAAGCTCCCCAGGTCCCTCCTTACTCAACATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114438 GGGTCTGCTGATCATCGAAGCTCCCCAGGTCCCTCCTTACTCAACATTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAGAGAGCAGTTTCAACAACGAGCTTCCCCAGGACAGCCAGGAAGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114488 GAGAGAGCAGTTTCAACAACGAGCTTCCCCAGGACAGCCAGGAAGTCACC

    600     .
    583 TGTACC
        ||||||
 114538 TGTACC