seq1 = pF1KE3655.tfa, 3036 bp
seq2 = pF1KE3655/gi568815595r_49705311.tfa (gi568815595r:49705311_49913787), 208477 bp
>pF1KE3655 3036
>gi568815595r:49705311_49913787 (Chr3)
(complement)
1-56 (100001-100056) 100% ->
57-225 (100141-100309) 100% ->
226-360 (100405-100539) 100% ->
361-467 (100620-100726) 100% ->
468-558 (101050-101140) 100% ->
559-694 (101245-101380) 100% ->
695-792 (101582-101679) 100% ->
793-939 (101772-101918) 100% ->
940-1122 (102333-102515) 99% ->
1123-1230 (102697-102804) 100% ->
1231-1311 (102956-103036) 100% ->
1312-1467 (103116-103271) 100% ->
1468-1633 (103360-103525) 100% ->
1634-1839 (103605-103810) 100% ->
1840-1904 (103909-103973) 100% ->
1905-2088 (104063-104246) 100% ->
2089-2163 (104324-104398) 100% ->
2164-2347 (104629-104812) 100% ->
2348-2430 (105320-105402) 100% ->
2431-2523 (105676-105768) 100% ->
2524-2715 (105861-106052) 100% ->
2716-2808 (107623-107715) 100% ->
2809-2909 (107791-107891) 100% ->
2910-3036 (108351-108477) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGATGCCCTGGACGCTTCGAAGCTACTGGATGAGGAGCTGTATTCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGATGCCCTGGACGCTTCGAAGCTACTGGATGAGGAGCTGTATTCAAG
50 . : . : . : . : . :
51 ACAGCT GTATGTGCTGGGCTCACCTGCCATGCAGAGGATTC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ACAGCTGTG...CAGGTATGTGCTGGGCTCACCTGCCATGCAGAGGATTC
100 . : . : . : . : . :
92 AGGGAGCCAGGGTCCTGGTGTCAGGCCTGCAGGGCCTGGGGGCCGAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100176 AGGGAGCCAGGGTCCTGGTGTCAGGCCTGCAGGGCCTGGGGGCCGAGGTG
150 . : . : . : . : . :
142 GCCAAGAACTTGGTTCTGATGGGTGTGGGCAGCCTCACTCTGCATGATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100226 GCCAAGAACTTGGTTCTGATGGGTGTGGGCAGCCTCACTCTGCATGATCC
200 . : . : . : . : . :
192 CCACCCCACCTGCTGGTCCGACCTGGCTGCCCAG TTTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
100276 CCACCCCACCTGCTGGTCCGACCTGGCTGCCCAGGTA...TAGTTTCTCC
250 . : . : . : . : . :
233 TCTCAGAGCAGGACTTGGAAAGGAGCAGAGCCGAGGCCTCTCAAGAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100412 TCTCAGAGCAGGACTTGGAAAGGAGCAGAGCCGAGGCCTCTCAAGAGCTC
300 . : . : . : . : . :
283 TTGGCTCAGCTCAACAGAGCTGTCCAGGTCGTCGTGCACACGGGTGACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100462 TTGGCTCAGCTCAACAGAGCTGTCCAGGTCGTCGTGCACACGGGTGACAT
350 . : . : . : . : . :
333 CACTGAGGACCTGCTGTTGGACTTCCAG GTGGTGGTGCTGA
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
100512 CACTGAGGACCTGCTGTTGGACTTCCAGGTC...CAGGTGGTGGTGCTGA
400 . : . : . : . : . :
374 CTGCTGCAAAGCTGGAGGAGCAGCTGAAGGTGGGCACCTTGTGTCATAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100633 CTGCTGCAAAGCTGGAGGAGCAGCTGAAGGTGGGCACCTTGTGTCATAAG
450 . : . : . : . : . :
424 CATGGAGTTTGCTTTCTGGCGGCTGACACCCGGGGCCTCGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
100683 CATGGAGTTTGCTTTCTGGCGGCTGACACCCGGGGCCTCGTGGGGTG...
500 . : . : . : . : . :
468 GCAGTTGTTCTGTGACTTTGGTGAGGACTTCACTGTGCAGGACCCCA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101047 CAGGCAGTTGTTCTGTGACTTTGGTGAGGACTTCACTGTGCAGGACCCCA
550 . : . : . : . : . :
515 CAGAGGCAGAACCCCTGACAGCTGCCATCCAGCACATCTCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
101097 CAGAGGCAGAACCCCTGACAGCTGCCATCCAGCACATCTCCCAGGTG...
600 . : . : . : . : . :
559 GGCTCCCCTGGCATTCTCACTCTGAGGAAAGGGGCCAATACCCACTA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101242 CAGGGCTCCCCTGGCATTCTCACTCTGAGGAAAGGGGCCAATACCCACTA
650 . : . : . : . : . :
606 CTTCCGTGATGGAGACTTGGTGACTTTCTCGGGAATTGAGGGAATGGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101292 CTTCCGTGATGGAGACTTGGTGACTTTCTCGGGAATTGAGGGAATGGTTG
700 . : . : . : . : . :
656 AGCTCAACGACTGTGATCCCCGGTCTATCCACGTGCGGG AG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
101342 AGCTCAACGACTGTGATCCCCGGTCTATCCACGTGCGGGGTA...CAGAG
750 . : . : . : . : . :
697 GATGGGTCCCTGGAGATTGGAGACACAACAACTTTCTCTCGGTACTTGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101584 GATGGGTCCCTGGAGATTGGAGACACAACAACTTTCTCTCGGTACTTGCG
800 . : . : . : . : . :
747 TGGTGGGGCTATCACTGAAGTCAAGAGACCCAAGACTGTGAGACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
101634 TGGTGGGGCTATCACTGAAGTCAAGAGACCCAAGACTGTGAGACATGTG.
850 . : . : . : . : . :
793 AAGTCCCTGGACACAGCCCTGCTCCAGCCCCATGTGGTGGCCCAG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101684 ..CAGAAGTCCCTGGACACAGCCCTGCTCCAGCCCCATGTGGTGGCCCAG
900 . : . : . : . : . :
838 AGCTCCCAGGAAGTTCACCATGCCCACTGCCTGCATCAGGCCTTCTGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101817 AGCTCCCAGGAAGTTCACCATGCCCACTGCCTGCATCAGGCCTTCTGTGC
950 . : . : . : . : . :
888 ACTGCACAAGTTCCAGCACCTCCATGGCCGGCCACCCCAGCCCTGGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101867 ACTGCACAAGTTCCAGCACCTCCATGGCCGGCCACCCCAGCCCTGGGATC
1000 . : . : . : . : . :
938 CT GTTGATGCAGAGACTGTAGTGGGCCTGGCCCGGGACCTG
||>>>...>>>||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
101917 CTGTG...CAGGTTGATGCAGAGACTGTGGTGGGCCTGGCCCGGGACCTG
1050 . : . : . : . : . :
979 GAACCACTGAAGCGGACAGAGGAAGAGCCACTGGAAGAGCCACTGGATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102372 GAACCACTGAAGCGGACAGAGGAAGAGCCACTGGAAGAGCCACTGGATGA
1100 . : . : . : . : . :
1029 GGCCCTAGTGCGGACAGTCGCCCTAAGCAGTGCAGGTGTCTTGAGCCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102422 GGCCCTAGTGCGGACAGTCGCCCTAAGCAGTGCAGGTGTCTTGAGCCCTA
1150 . : . : . : . : . :
1079 TGGTGGCCATGCTGGGTGCAGTAGCTGCCCAGGAAGTGCTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
102472 TGGTGGCCATGCTGGGTGCAGTAGCTGCCCAGGAAGTGCTGAAGGTG...
1200 . : . : . : . : . :
1123 GCAATCTCCAGGAAGTTCATGCCTCTGGACCAGTGGCTTTACTTTGA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102694 TAGGCAATCTCCAGGAAGTTCATGCCTCTGGACCAGTGGCTTTACTTTGA
1250 . : . : . : . : . :
1170 TGCCCTCGATTGTCTTCCGGAAGATGGGGAGCTCCTTCCCAGTCCTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102744 TGCCCTCGATTGTCTTCCGGAAGATGGGGAGCTCCTTCCCAGTCCTGAGG
1300 . : . : . : . : . :
1220 ACTGTGCCCTG AGAGGCAGCCGCTATGATGGGCAAATTGCA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
102794 ACTGTGCCCTGGTG...TAGAGAGGCAGCCGCTATGATGGGCAAATTGCA
1350 . : . : . : . : . :
1261 GTGTTTGGGGCTGGTTTTCAGGAGAAACTGAGACGCCAGCACTACCTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102986 GTGTTTGGGGCTGGTTTTCAGGAGAAACTGAGACGCCAGCACTACCTCCT
1400 . : . : . : . : . :
1311 G GTGGGCGCTGGTGCCATTGGTTGTGAGCTGCTCAAAGTCT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103036 GGTG...CAGGTGGGCGCTGGTGCCATTGGTTGTGAGCTGCTCAAAGTCT
1450 . : . : . : . : . :
1352 TTGCCCTAGTGGGACTGGGGGCCGGGAACAGCGGGGGCTTGACTGTTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103156 TTGCCCTAGTGGGACTGGGGGCCGGGAACAGCGGGGGCTTGACTGTTGTT
1500 . : . : . : . : . :
1402 GACATGGACCACATAGAGCGCTCCAATCTCAGCCGTCAGTTCCTCTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103206 GACATGGACCACATAGAGCGCTCCAATCTCAGCCGTCAGTTCCTCTTCAG
1550 . : . : . : . : . :
1452 GTCCCAGGACGTTGGT AGACCCAAGGCAGAGGTGGCTGCAG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
103256 GTCCCAGGACGTTGGTGTG...CAGAGACCCAAGGCAGAGGTGGCTGCAG
1600 . : . : . : . : . :
1493 CAGCTGCCCGGGGCCTGAACCCAGACTTACAGGTGATCCCGCTCACCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103385 CAGCTGCCCGGGGCCTGAACCCAGACTTACAGGTGATCCCGCTCACCTAC
1650 . : . : . : . : . :
1543 CCACTGGATCCCACCACAGAGCACATCTATGGGGATAACTTTTTCTCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103435 CCACTGGATCCCACCACAGAGCACATCTATGGGGATAACTTTTTCTCCCG
1700 . : . : . : . : . :
1593 TGTGGATGGTGTGGCTGCTGCCCTGGACAGTTTCCAGGCCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
103485 TGTGGATGGTGTGGCTGCTGCCCTGGACAGTTTCCAGGCCCGTG...CAG
1750 . : . : . : . : . :
1634 GGCGCTATGTGGCTGCTCGTTGCACCCACTATCTGAAGCCACTGCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103605 GGCGCTATGTGGCTGCTCGTTGCACCCACTATCTGAAGCCACTGCTGGAG
1800 . : . : . : . : . :
1684 GCAGGCACATCGGGCACCTGGGGCAGTGCTACAGTATTCATGCCACATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103655 GCAGGCACATCGGGCACCTGGGGCAGTGCTACAGTATTCATGCCACATGT
1850 . : . : . : . : . :
1734 GACTGAGGCCTACAGAGCCCCTGCCTCAGCTGCAGCTTCTGAGGATGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103705 GACTGAGGCCTACAGAGCCCCTGCCTCAGCTGCAGCTTCTGAGGATGCCC
1900 . : . : . : . : . :
1784 CCTACCCTGTCTGTACCGTGCGGTACTTCCCTAGCACAGCCGAGCACACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103755 CCTACCCTGTCTGTACCGTGCGGTACTTCCCTAGCACAGCCGAGCACACC
1950 . : . : . : . : . :
1834 CTGCAG TGGGCCCGGCATGAGTTTGAAGAACTCTTCCGACT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
103805 CTGCAGGTA...CAGTGGGCCCGGCATGAGTTTGAAGAACTCTTCCGACT
2000 . : . : . : . : . :
1875 GTCTGCAGAGACCATCAACCACCACCAACA GGCACACACTT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
103944 GTCTGCAGAGACCATCAACCACCACCAACAGTA...CAGGGCACACACTT
2050 . : . : . : . : . :
1916 CCCTGGCAGACATGGATGAGCCACAGACACTCACCTTACTGAAGCCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104074 CCCTGGCAGACATGGATGAGCCACAGACACTCACCTTACTGAAGCCAGTG
2100 . : . : . : . : . :
1966 CTTGGGGTCCTGAGAGTGCGTCCACAGAACTGGCAAGACTGTGTGGCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104124 CTTGGGGTCCTGAGAGTGCGTCCACAGAACTGGCAAGACTGTGTGGCGTG
2150 . : . : . : . : . :
2016 GGCTCTTGGCCACTGGAAACTCTGCTTTCATTATGGCATCAAACAGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104174 GGCTCTTGGCCACTGGAAACTCTGCTTTCATTATGGCATCAAACAGCTGC
2200 . : . : . : . : . :
2066 TGAGGCACTTCCCACCTAATAAA GTGCTTGAGGATGGAACT
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
104224 TGAGGCACTTCCCACCTAATAAAGTG...TAGGTGCTTGAGGATGGAACT
2250 . : . : . : . : . :
2107 CCCTTCTGGTCAGGTCCCAAACAGTGTCCCCAGCCCTTGGAGTTTGACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104342 CCCTTCTGGTCAGGTCCCAAACAGTGTCCCCAGCCCTTGGAGTTTGACAC
2300 . : . : . : . : . :
2157 CAACCAA GACACACACCTCCTCTACGTACTGGCAGCTGCCA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
104392 CAACCAAGTG...CAGGACACACACCTCCTCTACGTACTGGCAGCTGCCA
2350 . : . : . : . : . :
2198 ACCTGTATGCCCAGATGCATGGGCTGCCTGGCTCACAGGACTGGACTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104663 ACCTGTATGCCCAGATGCATGGGCTGCCTGGCTCACAGGACTGGACTGCA
2400 . : . : . : . : . :
2248 CTCAGGGAGCTGCTGAAGCTGCTGCCACAGCCTGACCCCCAACAGATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104713 CTCAGGGAGCTGCTGAAGCTGCTGCCACAGCCTGACCCCCAACAGATGGC
2450 . : . : . : . : . :
2298 CCCCATCTTTGCTAGTAATCTAGAGCTGGCTTCGGCTTCTGCTGAGTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104763 CCCCATCTTTGCTAGTAATCTAGAGCTGGCTTCGGCTTCTGCTGAGTTTG
2500 . : . : . : . : . :
2348 GCCCTGAGCAGCAGAAGGAACTGAACAAAGCCCTGGAAGTC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104813 GTG...CAGGCCCTGAGCAGCAGAAGGAACTGAACAAAGCCCTGGAAGTC
2550 . : . : . : . : . :
2389 TGGAGTGTGGGCCCTCCCCTGAAGCCTCTGATGTTTGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
105361 TGGAGTGTGGGCCCTCCCCTGAAGCCTCTGATGTTTGAGAAGGTG...CA
2600 . : . : . : . : . :
2431 GATGATGACAGCAACTTCCATGTGGACTTTGTGGTAGCGGCAGCTAGCC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105675 GGATGATGACAGCAACTTCCATGTGGACTTTGTGGTAGCGGCAGCTAGCC
2650 . : . : . : . : . :
2480 TGAGATGTCAGAACTACGGGATTCCACCGGTCAACCGTGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
105725 TGAGATGTCAGAACTACGGGATTCCACCGGTCAACCGTGCCCAGGTA...
2700 . : . : . : . : . :
2524 AGCAAGCGAATTGTGGGCCAGATTATCCCAGCCATTGCCACCACTAC
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105858 CAGAGCAAGCGAATTGTGGGCCAGATTATCCCAGCCATTGCCACCACTAC
2750 . : . : . : . : . :
2571 AGCAGCTGTGGCAGGCCTGTTGGGCCTGGAGCTGTATAAGGTGGTGAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105908 AGCAGCTGTGGCAGGCCTGTTGGGCCTGGAGCTGTATAAGGTGGTGAGTG
2800 . : . : . : . : . :
2621 GGCCACGGCCTCGTAGTGCCTTTCGCCACAGCTACCTACATCTGGCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105958 GGCCACGGCCTCGTAGTGCCTTTCGCCACAGCTACCTACATCTGGCTGAA
2850 . : . : . : . : . :
2671 AACTACCTCATCCGCTATATGCCTTTTGCCCCAGCCATCCAGACG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
106008 AACTACCTCATCCGCTATATGCCTTTTGCCCCAGCCATCCAGACGGTG..
2900 . : . : . : . : . :
2716 TTCCATCACCTGAAGTGGACCTCTTGGGACCGTCTGAAGGTACCAG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106058 .CAGTTCCATCACCTGAAGTGGACCTCTTGGGACCGTCTGAAGGTACCAG
2950 . : . : . : . : . :
2762 CTGGGCAGCCTGAGAGGACCCTGGAGTCGCTGCTGGCTCATCTTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
107669 CTGGGCAGCCTGAGAGGACCCTGGAGTCGCTGCTGGCTCATCTTCAGGTG
3000 . : . : . : . : . :
2809 GAGCAGCACGGGTTGAGGGTGAGGATCCTGCTGCACGGCTCAGC
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107719 ...TAGGAGCAGCACGGGTTGAGGGTGAGGATCCTGCTGCACGGCTCAGC
3050 . : . : . : . : . :
2853 CCTGCTCTATGCGGCCGGATGGTCACCTGAAAAGCAGGCCCAGCACCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107835 CCTGCTCTATGCGGCCGGATGGTCACCTGAAAAGCAGGCCCAGCACCTGC
3100 . : . : . : . : . :
2903 CCCTCAG GGTGACAGAACTGGTTCAGCAGCTGACAGGCCAG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
107885 CCCTCAGGTG...CAGGGTGACAGAACTGGTTCAGCAGCTGACAGGCCAG
3150 . : . : . : . : . :
2944 GCACCTGCTCCTGGGCAGCGGGTGTTGGTGCTAGAGCTGAGCTGTGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108385 GCACCTGCTCCTGGGCAGCGGGTGTTGGTGCTAGAGCTGAGCTGTGAGGG
3200 . : . : . : . :
2994 TGACGACGAGGACACTGCCTTCCCACCTCTGCACTATGAGCTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108435 TGACGACGAGGACACTGCCTTCCCACCTCTGCACTATGAGCTG