seq1 = pF1KE3650.tfa, 2010 bp
seq2 = pF1KE3650/gi568815579f_4372351.tfa (gi568815579f:4372351_4602007), 229657 bp

>pF1KE3650 2010
>gi568815579f:4372351_4602007 (Chr19)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-149  (102925-103001)   100% ->
150-288  (103095-103233)   100% ->
289-489  (116326-116526)   100% ->
490-606  (119216-119332)   100% ->
607-678  (119414-119485)   100% ->
679-838  (121353-121512)   99% ->
839-914  (121632-121707)   100% ->
915-1224  (121816-122125)   100% ->
1225-1328  (123952-124055)   100% ->
1329-1402  (125608-125681)   100% ->
1403-1473  (125956-126026)   100% ->
1474-1575  (126464-126565)   100% ->
1576-1789  (127141-127354)   100% ->
1790-1916  (128841-128967)   100% ->
1917-2010  (129564-129657)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCACACGCCTTCAAGCCCGGGGACTTGGTGTTCGCTAAGATGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCACACGCCTTCAAGCCCGGGGACTTGGTGTTCGCTAAGATGAAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCCTCACTGGCCTGCCAGG         ATCGACGACATCGCGGATG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CTACCCTCACTGGCCTGCCAGGGTG...CAGATCGACGACATCGCGGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCGCCGTGAAGCCCCCACCCAACAAGTACCCCATCTTTTTCTTTGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102944 GCGCCGTGAAGCCCCCACCCAACAAGTACCCCATCTTTTTCTTTGGCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACGAAAC         AGCCTTCCTGGGACCCAAGGACCTGTTCCCCTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102994 CACGAAACGTA...CAGAGCCTTCCTGGGACCCAAGGACCTGTTCCCCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGACAAATGTAAAGACAAGTACGGGAAGCCCAACAAGAGGAAAGGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103128 CGACAAATGTAAAGACAAGTACGGGAAGCCCAACAAGAGGAAAGGCTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGAAGGGCTGTGGGAGATCCAGAACAACCCCCACGCCAGCTACAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103178 ATGAAGGGCTGTGGGAGATCCAGAACAACCCCCACGCCAGCTACAGCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTCCG         CCAGTGAGCTCCTCCGACAGCGAGGCCCCCGAGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103228 CCTCCGGTG...CAGCCAGTGAGCTCCTCCGACAGCGAGGCCCCCGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACCCCGCCGACGGCAGTGACGCTGACGAGGACGATGAGGACCGGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116361 CAACCCCGCCGACGGCAGTGACGCTGACGAGGACGATGAGGACCGGGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCATGGCCGTCACAGCGGTAACCGCCACAGCTGCCAGCGACAGGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116411 TCATGGCCGTCACAGCGGTAACCGCCACAGCTGCCAGCGACAGGATGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCGACTCAGACTCAGACAAGAGTAGCGACAACAGTGGCCTGAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116461 AGCGACTCAGACTCAGACAAGAGTAGCGACAACAGTGGCCTGAAGAGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GACGCCTGCGCTAAAG         ATGTCGGTCTCGAAACGAGCCCGAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 116511 GACGCCTGCGCTAAAGGTA...CAGATGTCGGTCTCGAAACGAGCCCGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGCCTCCAGCGACCTGGATCAGGCCAGCGTGTCCCCATCCGAAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119241 AGGCCTCCAGCGACCTGGATCAGGCCAGCGTGTCCCCATCCGAAGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACTCGGAAAGCTCATCTGAGTCGGAGAAGACCAGCGACCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 119291 AACTCGGAAAGCTCATCTGAGTCGGAGAAGACCAGCGACCAGGTG...CA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    607  GACTTCACACCTGAGAAGAAAGCAGCGGTCCGGGCGCCACGGAGGGGCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119413 GGACTTCACACCTGAGAAGAAAGCAGCGGTCCGGGCGCCACGGAGGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTCTGGGGGGACGGAAAAAAAAG         AAGGCGCCGTCAGCCTCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| |||||||||
 119463 CTCTGGGGGGACGGAAAAAAAAGGTA...CAGAAGGCGCCATCAGCCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GACTCCGACTCCAAGGCCGATTCGGACGGGGCCAAGCCTGAGCCGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121371 GACTCCGACTCCAAGGCCGATTCGGACGGGGCCAAGCCTGAGCCGGTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATGGCGCGGTCGGCGTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121421 CATGGCGCGGTCGGCGTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCGATGTGTCTGTGAAGAAGCCTCCGAGGGGCAGGAAGCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 121471 CCGATGTGTCTGTGAAGAAGCCTCCGAGGGGCAGGAAGCCAGGTA...TA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    839  CGGAGAAGCCTCTCCCGAAGCCGCGAGGGCGGAAACCGAAGCCTGAACG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121631 GCGGAGAAGCCTCTCCCGAAGCCGCGAGGGCGGAAACCGAAGCCTGAACG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCCTCCGTCCAGCTCCAGCAGTGACAG         TGACAGCGACGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 121681 GCCTCCGTCCAGCTCCAGCAGTGACAGGTG...CAGTGACAGCGACGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGGACCGCATCAGTGAGTGGAAGCGGCGGGACGAGGCGCGGAGGCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121830 TGGACCGCATCAGTGAGTGGAAGCGGCGGGACGAGGCGCGGAGGCGCGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTGGAGGCCCGGCGGCGGCGAGAGCAGGAGGAGGAGCTGCGGCGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121880 CTGGAGGCCCGGCGGCGGCGAGAGCAGGAGGAGGAGCTGCGGCGCCTGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGAGCAGGAGAAGGAGGAGAAGGAGCGGAGGCGCGAGCGGGCCGACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121930 GGAGCAGGAGAAGGAGGAGAAGGAGCGGAGGCGCGAGCGGGCCGACCGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GGGAGGCTGAGCGGGGCAGCGGCGGCAGCAGCGGGGACGAGCTCAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121980 GGGAGGCTGAGCGGGGCAGCGGCGGCAGCAGCGGGGACGAGCTCAGGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GACGATGAGCCCGTCAAGAAGCGGGGACGCAAGGGCCGGGGCCGGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122030 GACGATGAGCCCGTCAAGAAGCGGGGACGCAAGGGCCGGGGCCGGGGTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCCGTCCTCCTCTGACTCCGAGCCCGAGGCCGAGCTGGAGAGAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 122080 CCCGTCCTCCTCTGACTCCGAGCCCGAGGCCGAGCTGGAGAGAGAGGTG.

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1225      GCCAAGAAATCAGCGAAGAAGCCGCAGTCCTCAAGCACAGAGCCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122130 ..TAGGCCAAGAAATCAGCGAAGAAGCCGCAGTCCTCAAGCACAGAGCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GCCAGGAAACCTGGCCAGAAGGAGAAGAGAGTGCGGCCCGAGGAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123997 GCCAGGAAACCTGGCCAGAAGGAGAAGAGAGTGCGGCCCGAGGAGAAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACAAGCCAA         GCCCGTGAAGGTGGAGCGGACCCGGAAGCGGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 124047 ACAAGCCAAGTG...CAGGCCCGTGAAGGTGGAGCGGACCCGGAAGCGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CCGAGGGCTTCTCGATGGACAGGAAGGTAGAGAAGAAGAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 125640 CCGAGGGCTTCTCGATGGACAGGAAGGTAGAGAAGAAGAAAGGTG...CA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1403  AGCCCTCCGTGGAGGAGAAGCTGCAGAAGCTGCACAGTGAGATCAAGTT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125955 GAGCCCTCCGTGGAGGAGAAGCTGCAGAAGCTGCACAGTGAGATCAAGTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGCCCTAAAGGTCGACAGCCCG         GACGTGAAGAGGTGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 126005 TGCCCTAAAGGTCGACAGCCCGGTA...CAGGACGTGAAGAGGTGCCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 ATGCCCTAGAGGAGCTGGGAACCCTGCAGGTGACCTCTCAGATCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126483 ATGCCCTAGAGGAGCTGGGAACCCTGCAGGTGACCTCTCAGATCCTCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AAGAACACAGACGTGGTGGCCACCTTGAAGAAG         ATTCGCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 126533 AAGAACACAGACGTGGTGGCCACCTTGAAGAAGGTA...CAGATTCGCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TTACAAAGCGAACAAGGACGTAATGGAGAAGGCAGCAGAAGTCTATACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127149 TTACAAAGCGAACAAGGACGTAATGGAGAAGGCAGCAGAAGTCTATACCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 GGCTCAAGTCGCGGGTCCTCGGCCCAAAGATCGAGGCGGTGCAGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127199 GGCTCAAGTCGCGGGTCCTCGGCCCAAAGATCGAGGCGGTGCAGAAAGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AACAAGGCTGGGATGGAGAAGGAGAAGGCCGAGGAGAAGCTGGCCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127249 AACAAGGCTGGGATGGAGAAGGAGAAGGCCGAGGAGAAGCTGGCCGGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GGAGCTGGCCGGGGAGGAGGCCCCCCAGGAGAAGGCGGAGGACAAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127299 GGAGCTGGCCGGGGAGGAGGCCCCCCAGGAGAAGGCGGAGGACAAGCCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GCACCG         ATCTCTCAGCCCCAGTGAATGGCGAGGCCACATCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127349 GCACCGGTG...CAGATCTCTCAGCCCCAGTGAATGGCGAGGCCACATCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CAGAAGGGGGAGAGCGCAGAGGACAAGGAGCACGAGGAGGGTCGGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128876 CAGAAGGGGGAGAGCGCAGAGGACAAGGAGCACGAGGAGGGTCGGGACTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GGAGGAGGGGCCAAGGTGTGGCTCCTCTGAAGACCTGCACGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 128926 GGAGGAGGGGCCAAGGTGTGGCTCCTCTGAAGACCTGCACGAGTG...CA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1917  CGTACGGGAGGGTCCCGACCTGGACAGGCCTGGGAGCGACCGGCAGGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129563 GCGTACGGGAGGGTCCCGACCTGGACAGGCCTGGGAGCGACCGGCAGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1966 CGCGAGAGGGCACGGGGGGACTCGGAGGCCCTGGACGAGGAGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129613 CGCGAGAGGGCACGGGGGGACTCGGAGGCCCTGGACGAGGAGAGC