seq1 = pF1KE3636.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KE3636/gi568815591f_102296412.tfa (gi568815591f:102296412_102525108), 228697 bp

>pF1KE3636 552
>gi568815591f:102296412_102525108 (Chr7)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-205  (101209-101287)   100% ->
206-306  (103137-103237)   100% ->
307-392  (108187-108272)   98% ->
393-457  (111023-111087)   100% ->
458-552  (128603-128697)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAGCCCAGCCGCCTCCTCGGTGCGACCACCGAGGCCCAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAGCCCAGCCGCCTCCTCGGTGCGACCACCGAGGCCCAAGAAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCAGACGCTCGTCATCCCCAAGAATGCGGCGGAGGAGCAGAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCAGACGCTCGTCATCCCCAAGAATGCGGCGGAGGAGCAGAAGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGGAGCGGCTCATGAAGAACCCG         GACAAAGCAGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 AGCTGGAGCGGCTCATGAAGAACCCGGTG...CAGGACAAAGCAGTTCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTCCAGAGAAAATGAGTGAATGGGCACCTCGACCTCCCCCAGAATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101224 ATTCCAGAGAAAATGAGTGAATGGGCACCTCGACCTCCCCCAGAATTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGAGATGTCATGG         GTTCAAGTGCTGGGGCCGGCAGTGGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101274 CCGAGATGTCATGGGTA...CAGGTTCAAGTGCTGGGGCCGGCAGTGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTTCCACGTGTACAGACATCTGCGCCGGAGAGAATATCAGCGACAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103164 AGTTCCACGTGTACAGACATCTGCGCCGGAGAGAATATCAGCGACAGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACATGGATGCCATGGCTGAGAAG         CAAAAATTGTATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| |||||||
 103214 TACATGGATGCCATGGCTGAGAAGGTC...CAGCAAAAATTGGATGCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTTTCAGAAAAGACTGGAAAAGAATAAAATTGCTGCAGAGGAGCAGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108204 GTTTCAGAAAAGACTGGAAAAGAATAAAATTGCTGCAGAGGAGCAGACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAAAGCGCCGGAAGAAGCG         CCAGAAGTTAAAAGAGAAGAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108254 CAAAGCGCCGGAAGAAGCGGTA...TAGCCAGAAGTTAAAAGAGAAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTACTGGCAAAGAAGATGAAACTTGAACAGAAGAAACAAGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111045 TTACTGGCAAAGAAGATGAAACTTGAACAGAAGAAACAAGAAGGTG...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    458   GACCCGGTCAGCCCAAGGAGCAGGGGTCCAGCAGCTCTGCGGAGGCAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128601 AGGACCCGGTCAGCCCAAGGAGCAGGGGTCCAGCAGCTCTGCGGAGGCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    506 CTGGAACAGAGGAGGAGGAGGAAGTGCCCAGTTTCACCATGGGGCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128651 CTGGAACAGAGGAGGAGGAGGAAGTGCCCAGTTTCACCATGGGGCGA