seq1 = pF1KE3634.tfa, 351 bp
seq2 = pF1KE3634/gi568815591r_43914603.tfa (gi568815591r:43914603_44119112), 204510 bp

>pF1KE3634 351
>gi568815591r:43914603_44119112 (Chr7)

(complement)

1-53  (100000-100052)   98% ->
54-143  (102590-102679)   100% ->
144-321  (104334-104510)   95%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGCCCCTCCAGCCTTCGAGTCGTTCTTGCTCTTCGAGGGCGAGAA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 GTGAACGCCCCTCCAGCCTTCGAGTCGTTCTTGCTCTTCGAGGGCGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAA         GATCACCATTAACAAGGACACCAAGGTACCCAATGCCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100050 GAAGTA...TAGGATCACCATTAACAAGGACACCAAGGTACCCAATGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTTTATTCACCATCAACAAAGAAGACCACACACTGGGAAACATCATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102628 GTTTATTCACCATCAACAAAGAAGACCACACACTGGGAAACATCATTAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TC          ACAACTCCTAAAAGACCCGCAAGTGCTATTTGCTGGCT
        ||>>>...>>>-   |--|||||| |||||||||||||||||||||||||
 102678 TCGTA...CAGTGTGA  CCTAAAGGACCCGCAAGTGCTATTTGCTGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    182 ACAAAGTCCCCCACCCCTTGGAGCACAAGATCATCATCCGAGTGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104371 ACAAAGTCCCCCACCCCTTGGAGCACAAGATCATCATCCGAGTGCAGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232 ACGCCGGACTACAGCCCCCAGGAAGCCTTTACCAACGCCATCACCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104421 ACGCCGGACTACAGCCCCCAGGAAGCCTTTACCAACGCCATCACCGACCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :
    282 CATCAGTGAGCTGTCCCTGCTGGAGGAGCGCTTTCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 104471 CATCAGTGAGCTGTCCCTGCTGGAGGAGCGCTTCCGGGTG