seq1 = pF1KE3632.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE3632/gi568815592r_79816677.tfa (gi568815592r:79816677_80047279), 230603 bp

>pF1KE3632 942
>gi568815592r:79816677_80047279 (Chr6)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-288  (120899-121086)   99% ->
289-369  (122248-122328)   100% ->
370-541  (125484-125655)   100% ->
542-669  (127733-127860)   100% ->
670-942  (130397-130669)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTCCTGGACTCGGAGCCGGGTAGTGTCCTAAACGTAGTGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTCCTGGACTCGGAGCCGGGTAGTGTCCTAAACGTAGTGTCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCACTCAACGACACGGTAGAGTTCTACCGCTGGACCTGGTCCATCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCACTCAACGACACGGTAGAGTTCTACCGCTGGACCTGGTCCATCGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          ATAAGCGTGTGGAAAATTGGCCTCTGATGCGGTCTCCTTGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100101 GTA...TAGATAAGCGTGTGGAAAATTGGCCTCTGATGCAGTCTCCTTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTACACTAAGTATAAGCACTCTTTATCTCCTGTTTGTGTGGCTGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120940 CCTACACTAAGTATAAGCACTCTTTATCTCCTGTTTGTGTGGCTGGGTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAATGGATGAAGGACCGAGAACCTTTTCAGATGCGTCTAGTGCTCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120990 AAAATGGATGAAGGACCGAGAACCTTTTCAGATGCGTCTAGTGCTCATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTATAATTTTGGGATGGTTTTGCTTAACCTCTTTATCTTCAGAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 121040 TCTATAATTTTGGGATGGTTTTGCTTAACCTCTTTATCTTCAGAGAGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       TTATTCATGGGATCATATAATGCGGGATATAGCTATATTTGCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121090 ...CAGTTATTCATGGGATCATATAATGCGGGATATAGCTATATTTGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAGTGTGGATTATTCTAATAATGTTCATGAAGTCAGG         ATAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 122292 GAGTGTGGATTATTCTAATAATGTTCATGAAGTCAGGGTA...CAGATAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGCTGCTCTGTGGTGGTACTTTGTATCTAAAGGAGTTGAGTATTTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125488 CTGCTGCTCTGTGGTGGTACTTTGTATCTAAAGGAGTTGAGTATTTGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACAGTGTTTTTTATTCTGAGAAAGAAAAACAACCAAGTTTCTTTCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125538 ACAGTGTTTTTTATTCTGAGAAAGAAAAACAACCAAGTTTCTTTCCTTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTGTATCATCACTGTACGATGTTTACCTTGTGGTGGATTGGAATTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125588 TGTGTATCATCACTGTACGATGTTTACCTTGTGGTGGATTGGAATTAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGGTTGCAGGAGGACAAG         CATTTTTTGGAGCCCAGTTGAAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 125638 GGGTTGCAGGAGGACAAGGTG...AAGCATTTTTTGGAGCCCAGTTGAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCCTTTATCCATGTGATTATGTACTCATACTATGGGTTAACTGCATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127756 TCCTTTATCCATGTGATTATGTACTCATACTATGGGTTAACTGCATTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCATGGATTCAGAAATATCTTTGGTGGAAACGATACCTGACTATGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127806 CCCATGGATTCAGAAATATCTTTGGTGGAAACGATACCTGACTATGTTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AACTG         ATTCAATTCCATGTGACCATTGGGCACACAGCACTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 127856 AACTGGTG...CAGATTCAATTCCATGTGACCATTGGGCACACGGCACTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCTCTTTACACTGACTGCCCCTTCCCCAAATGGATGCACTGGGCTCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130433 TCTCTTTACACTGACTGCCCCTTCCCCAAATGGATGCACTGGGCTCTAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGCCTATGCAATCAGCTTCATATTTCTCTTTCTTAACTTCTACATTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130483 TGCCTATGCAATCAGCTTCATATTTCTCTTTCTTAACTTCTACATTCGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CATACAAAGAGCCTAAGAAACCAAAAGCTGGAAAAACAGCCATGAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130533 CATACAAAGAGCCTAAGAAACCAAAAGCTGGAAAAACAGCCATGAATGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATTTCAGCAAATGGTGTGAGCAAATCAGAAAAACAACTCATGATAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130583 ATTTCAGCAAATGGTGTGAGCAAATCAGAAAAACAACTCATGATAGAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .
    906 TGGAAAAAAGCAGAAAAATGGAAAAGCAAAAGGAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130633 TGGAAAAAAGCAGAAAAATGGAAAAGCAAAAGGAGAT