Result of SIM4 for pF1KE3620

seq1 = pF1KE3620.tfa, 669 bp
seq2 = pF1KE3620/gi568815597f_65048408.tfa (gi568815597f:65048408_65326174), 277767 bp

>pF1KE3620 669
>gi568815597f:65048408_65326174 (Chr1)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-265  (142303-142422)   100% ->
266-438  (170347-170519)   100% ->
439-557  (176345-176463)   100% ->
558-669  (177656-177767)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCCAAACTCCTGCGCGCGGTCATCCTCGGGCCGCCCGGCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCCAAACTCCTGCGCGCGGTCATCCTCGGGCCGCCCGGCTCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGGGCACCGTGTGCCAGAGGATCGCCCAGAACTTTGGTCTCCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGGGCACCGTGTGCCAGAGGATCGCCCAGAACTTTGGTCTCCAGCATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCAGCGGCCACTTCTTGCGGGAGAACATCAAGGCCAGCACCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 TCTCCAGCGGCCACTTCTTGCGGGAGAACATCAAGGCCAGCACCGGTG..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     AAGTTGGTGAGATGGCAAAGCAGTATATAGAGAAAAGTCTTTTGGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .TAGAAGTTGGTGAGATGGCAAAGCAGTATATAGAGAAAAGTCTTTTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCAGACCATGTGATCACACGCCTAATGATGTCCGAGTTGGAGAACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142349 TCCAGACCATGTGATCACACGCCTAATGATGTCCGAGTTGGAGAACAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTGGCCAGCACTGGCTCCTTGATG         GTTTTCCTAGGACATTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 142399 GTGGCCAGCACTGGCTCCTTGATGGTG...TAGGTTTTCCTAGGACATTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGACAAGCCGAAGCCCTGGACAAAATCTGTGAAGTGGATCTAGTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170364 GGACAAGCCGAAGCCCTGGACAAAATCTGTGAAGTGGATCTAGTGATCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTGAATATTCCATTTGAAACACTTAAAGATCGTCTCAGCCGCCGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170414 TTTGAATATTCCATTTGAAACACTTAAAGATCGTCTCAGCCGCCGTTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCACCCTCCTAGCGGAAGGGTATATAACCTGGACTTCAATCCACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170464 TTCACCCTCCTAGCGGAAGGGTATATAACCTGGACTTCAATCCACCTCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTACAT         GGTATTGATGACGTCACTGGTGAACCGTTAGTCCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170514 GTACATGTA...TAGGGTATTGATGACGTCACTGGTGAACCGTTAGTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCAGGAGGATGATAAACCCGAAGCAGTTGCTGCCAGGCTAAGACAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176380 GCAGGAGGATGATAAACCCGAAGCAGTTGCTGCCAGGCTAAGACAGTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGACGTGGCAAAGCCAGTCATTGAATTATACAA         GAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 176430 AAGACGTGGCAAAGCCAGTCATTGAATTATACAAGTG...CAGGAGCCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGAGTGCTCCACCAATTTTCCGGAACGGAGACGAACAAAATCTGGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177663 GGAGTGCTCCACCAATTTTCCGGAACGGAGACGAACAAAATCTGGCCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTTTACACACTTTTCTCAAACAAGATCACACCTATTCAGTCCAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177713 CGTTTACACACTTTTCTCAAACAAGATCACACCTATTCAGTCCAAAGAAG

    700     .
    665 CATAT
        |||||
 177763 CATAT

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