seq1 = pF1KE3620.tfa, 669 bp
seq2 = pF1KE3620/gi568815586r_31515771.tfa (gi568815586r:31515771_31716439), 200669 bp

>pF1KE3620 669
>gi568815586r:31515771_31716439 (Chr12)

(complement)

1-669  (100001-100669)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCCAAACTCCTGCGCGCGGTCATCCTCGGGCCGCCCGGCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCCAAACTCCTGCGCGCGGTCATCCTCGGGCCGCCCGGCTCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGGGCACCGTGTGCCAGAGGATCGCCCAGAACTTTGGTCTCCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGGGCACCGTGTGCCAGAGGATCGCCCAGAACTTTGGTCTCCAGCATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCAGCGGCCACTTCTTGCGGGAGAACATCAAGGCCAGCACCGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCAGCGGCCACTTCTTGCGGGAGAACATCAAGGCCAGCACCGAAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTGAGATGGCAAAGCAGTATATAGAGAAAAGTCTTTTGGTTCCAGACCA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTGAGGTGGCAAAGCAGTATATAGAGAAAAGTCTTTTGGTTCCAGACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGATCACACGCCTAATGATGTCCGAGTTGGAGAACAGGCGTGGCCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100201 TGTGATCACACGCCTAATGATGTCCGAGTTGGAGAATAGGCGTGGCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTGGCTCCTTGATGGTTTTCCTAGGACATTAGGACAAGCCGAAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100251 ACTGGCTCCTTGATGGTTTTCCTAGGACATTAGGACAAGCCGAGGCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACAAAATCTGTGAAGTGGATCTAGTGATCAGTTTGAATATTCCATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACAAAATCTGTGAAGTGGATCTAGTGATCAGTTTGAATATTCCATTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AACACTTAAAGATCGTCTCAGCCGCCGTTGGATTCACCCTCCTAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AACACTTAAAGATCGTCTCAGCCGCCGTTGGATTCACCCTCCTAGCGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGTATATAACCTGGACTTCAATCCACCTCATGTACATGGTATTGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGTATATAACCTGGACTTCAATCCACCTCATGTACATGGTATTGATGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCACTGGTGAACCGTTAGTCCAGCAGGAGGATGATAAACCCGAAGCAGT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCACTGGTGAACCATTAGTCCAGCAGGAGGATGATAAACCCGAAGCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCTGCCAGGCTAAGACAGTACAAAGACGTGGCAAAGCCAGTCATTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100501 TGCTGCCAGGCTAAGACAGTACAAAGACGCGGCAAAGCCAGTCATTGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TATACAAGAGCCGAGGAGTGCTCCACCAATTTTCCGGAACGGAGACGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TATACAAGAGCCGAGGAGTGCTCCACCAATTTTCCGGAACGGAGACGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAAATCTGGCCCTACGTTTACACACTTTTCTCAAACAAGATCACACCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAATCTGGCCCTACGTTTACACACTTTTCTCAAACAAGATCACACCTAT

    650     .    :    .
    651 TCAGTCCAAAGAAGCATAT
        |||||||||||||||||||
 100651 TCAGTCCAAAGAAGCATAT