seq1 = pF1KE3611.tfa, 285 bp
seq2 = pF1KE3611/gi568815581r_43841142.tfa (gi568815581r:43841142_44041654), 200513 bp

>pF1KE3611 285
>gi568815581r:43841142_44041654 (Chr17)

(complement)

1-191  (100001-100191)   99% ->
192-263  (100441-100512)   100% ->
264-285  (100703-100724)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCGCACGCCTCTGCCTCTCCCTGCTGCTCCTGTCCACCTGCGT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCCGCACGCCTCTGCCTCTCCCTGCTGCTCCTGTCCACCTGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTCTGTTACTACAGCCACTGCTGGGTGCCCAGGGAGCCCCACTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTCTGTTACTACAGCCACTGCTGGGTGCCCAGGGAGCCCCACTGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGTGTACCCAGGGGACAATGCCACACCAGAGCAGATGGCCCAGTATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGTGTACCCAGGGGACAATGCCACACCAGAGCAGATGGCCCAGTATGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGATCTCCGTAGATACATCAACATGCTGACCAGGCCTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100151 GCTGATCTCCGTAGATACATCAACATGCTGACCAGGCCTAGGTG...CAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTATGGGAAAAGACACAAAGAGGACACGCTGGCCTTCTCGGAGTGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100441 GTATGGGAAAAGACACAAAGAGGACACGCTGGCCTTCTCGGAGTGGGGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCCGCATGCTGCTGTCCCCAG         GGAGCTCAGCCCGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100491 CCCCGCATGCTGCTGTCCCCAGGTG...CAGGGAGCTCAGCCCGCTGGAC

    300 
    283 TTA
        |||
 100722 TTA