seq1 = pF1KE3610.tfa, 1092 bp
seq2 = pF1KE3610/gi568815586r_7589881.tfa (gi568815586r:7589881_7795728), 205848 bp

>pF1KE3610 1092
>gi568815586r:7589881_7795728 (Chr12)

(complement)

1-268  (100001-100268)   100% ->
269-1092  (105025-105848)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTCGTTTCTTGCCAGATTTGGCTTTCAGCTTCCTGTTAATTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTCGTTTCTTGCCAGATTTGGCTTTCAGCTTCCTGTTAATTCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGGGCCAGGCAGTCCAATTTCAAGAATATGTCTTTCTCCAATTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGGGCCAGGCAGTCCAATTTCAAGAATATGTCTTTCTCCAATTTCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTAGATAAGGCGCCTTCACCCCAGAAGTTCCAACCTGTGCCTTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTAGATAAGGCGCCTTCACCCCAGAAGTTCCAACCTGTGCCTTATATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGAAGAAAATTTTCCAGGATCGCGAGGCAGCAGCGACCACTGGGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGAAGAAAATTTTCCAGGATCGCGAGGCAGCAGCGACCACTGGGGTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGAGACTTATGCTACGTAAAGGAGCTGGGCGTCCGCGGGAATGTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGAGACTTATGCTACGTAAAGGAGCTGGGCGTCCGCGGGAATGTACTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTTCTCCCAGACCAAG         GTTTCTTTCTTTACCCAAAGAAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTTCTCCCAGACCAAGGTA...TAGGTTTCTTTCTTTACCCAAAGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTTCCCAAGCTTCCTCCTGCCTGCAGAAGCTCCTCTACTTTAACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105048 ATTTCCCAAGCTTCCTCCTGCCTGCAGAAGCTCCTCTACTTTAACCTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGCCATCAAAGAAAGGGAACAGTTGACATTGGCCCAGCTGGGCCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105098 TGCCATCAAAGAAAGGGAACAGTTGACATTGGCCCAGCTGGGCCTGGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGGGCCCAATTCTTACTATAACCTGGGACCAGAGCTGGAACTGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105148 TGGGGCCCAATTCTTACTATAACCTGGGACCAGAGCTGGAACTGGCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTCCTGGTTCAGGAGCCTCATGTGTGGGGCCAGACCACCCCTAAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105198 TTCCTGGTTCAGGAGCCTCATGTGTGGGGCCAGACCACCCCTAAGCCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TAAAATGTTTGTGTTGCGGTCAGTCCCATGGCCACAAGGTGCTGTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105248 TAAAATGTTTGTGTTGCGGTCAGTCCCATGGCCACAAGGTGCTGTTCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCAACCTGCTGGATGTAGCTAAGGATTGGAATGACAACCCCCGGAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105298 TCAACCTGCTGGATGTAGCTAAGGATTGGAATGACAACCCCCGGAAAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TTCGGGTTATTCCTGGAGATACTGGTCAAAGAAGATAGAGACTCAAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 105348 TTCGGGTTATTCCTGGAGATACTGGTCAAAGAAGATAGAGACTCAGGGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAATTTTCAGCCTGAAGACACCTGTGCCAGACTAAGATGCTCCCTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105398 GAATTTTCAGCCTGAAGACACCTGTGCCAGACTAAGATGCTCCCTTCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTTCCCTGCTGGTGGTGACTCTCAACCCTGATCAGTGCCACCCTTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105448 CTTCCCTGCTGGTGGTGACTCTCAACCCTGATCAGTGCCACCCTTCTCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAAAGGAGAGCAGCCATCCCTGTCCCCAAGCTTTCTTGTAAGAACCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105498 AAAAGGAGAGCAGCCATCCCTGTCCCCAAGCTTTCTTGTAAGAACCTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCACCGTCACCAGCTATTCATTAACTTCCGGGACCTGGGTTGGCACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105548 CCACCGTCACCAGCTATTCATTAACTTCCGGGACCTGGGTTGGCACAAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGATCATTGCCCCCAAGGGGTTCATGGCAAATTACTGCCATGGAGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105598 GGATCATTGCCCCCAAGGGGTTCATGGCAAATTACTGCCATGGAGAGTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CCCTTCTCACTGACCATCTCTCTCAACAGCTCCAATTATGCTTTCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105648 CCCTTCTCACTGACCATCTCTCTCAACAGCTCCAATTATGCTTTCATGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AGCCCTGATGCATGCCGTTGACCCAGAGATCCCCCAGGCTGTGTGTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105698 AGCCCTGATGCATGCCGTTGACCCAGAGATCCCCCAGGCTGTGTGTATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCACCAAGCTGTCTCCCATTTCCATGCTCTACCAGGACAATAATGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105748 CCACCAAGCTGTCTCCCATTTCCATGCTCTACCAGGACAATAATGACAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTCATTCTACGACATTATGAAGACATGGTAGTCGATGAATGTGGGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105798 GTCATTCTACGACATTATGAAGACATGGTAGTCGATGAATGTGGGTGTGG

   1100 
   1092 G
        |
 105848 G