seq1 = pF1KE3607.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KE3607/gi568815581r_28614646.tfa (gi568815581r:28614646_28817266), 202621 bp

>pF1KE3607 753
>gi568815581r:28614646_28817266 (Chr17)

(complement)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-146  (100273-100364)   100% ->
147-212  (101209-101274)   100% ->
213-314  (101366-101467)   100% ->
315-379  (101562-101626)   100% ->
380-431  (101760-101811)   100% ->
432-489  (101991-102048)   100% ->
490-580  (102145-102235)   100% ->
581-688  (102367-102474)   100% ->
689-753  (102557-102621)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACATTCTGGCACCCGTGCGGAGGGATCGCGTCCTGGCGGAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACATTCTGGCACCCGTGCGGAGGGATCGCGTCCTGGCGGAGCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAG         TGCCTGAGGAAGGAGGCCGCTTTGCACGGGCACAAAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGTA...AAGTGCCTGAGGAAGGAGGCCGCTTTGCACGGGCACAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTTCCACCCCCGCGTCACCTGCGCCTGCCAGGAGCACCGGACAGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100310 ACTTCCACCCCCGCGTCACCTGCGCCTGCCAGGAGCACCGGACAGGCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGG         ATTTAAGATCTCCAAGGTCATTGTGGTGGGGGACCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100360 GTGGGGTG...CAGATTTAAGATCTCCAAGGTCATTGTGGTGGGGGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTCGGTGGGGAAGACTTGCCTCATTAATAG         GTTCTGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101245 GTCGGTGGGGAAGACTTGCCTCATTAATAGGTA...CAGGTTCTGCAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACACCTTTGATAAGAATTACAAGGCCACCATTGGAGTGGACTTCGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101377 ACACCTTTGATAAGAATTACAAGGCCACCATTGGAGTGGACTTCGAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAACGATTTGAGGTGCTGGGCATTCCCTTCAGTTTGCAGCT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101427 GAACGATTTGAGGTGCTGGGCATTCCCTTCAGTTTGCAGCTGTG...CAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TTGGGATACCGCTGGGCAGGAGAGGTTCAAATGCATTGCATCAACCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101562 TTGGGATACCGCTGGGCAGGAGAGGTTCAAATGCATTGCATCAACCTACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATAGAGGAGCTCAAG         CCATCATCATTGTCTTCAACCTGAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101612 ATAGAGGAGCTCAAGGTA...CAGCCATCATCATTGTCTTCAACCTGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GATGTGGCATCTCTGGAACATACCAA         GCAGTGGCTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101786 GATGTGGCATCTCTGGAACATACCAAGTA...CAGGCAGTGGCTGGCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TGCCCTGAAGGAGAATGACCCTTCCAGTGTGCTTCTCTTCCTT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102006 TGCCCTGAAGGAGAATGACCCTTCCAGTGTGCTTCTCTTCCTTGTA...C

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    490   ACCCCTGCTCAGTATGCGCTGATGGAGAAAGACGCCCTCCAGGTGGCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102143 AGACCCCTGCTCAGTATGCGCTGATGGAGAAAGACGCCCTCCAGGTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 CAGGAGATGAAGGCTGAGTACTGGGCAGTCTCATCTCTCACTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102193 CAGGAGATGAAGGCTGAGTACTGGGCAGTCTCATCTCTCACTGGTG...C

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    581   GTGAGAATGTCCGAGAATTCTTCTTCCGTGTGGCAGCACTGACCTTTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102365 AGGTGAGAATGTCCGAGAATTCTTCTTCCGTGTGGCAGCACTGACCTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 AGGCCAATGTGCTGGCTGAGCTGGAGAAATCGGGGGCTCGACGCATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102415 AGGCCAATGTGCTGGCTGAGCTGGAGAAATCGGGGGCTCGACGCATTGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GATGTTGTCC         GCATCAACAGTGATGACAGCAACCTCTACCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102465 GATGTTGTCCGTG...TAGGCATCAACAGTGATGACAGCAACCTCTACCT

    800     .    :    .    :    .    :
    720 AACTGCCAGCAAGAAGAAGCCCACATGTTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102588 AACTGCCAGCAAGAAGAAGCCCACATGTTGCCCA