seq1 = pF1KE3592.tfa, 744 bp
seq2 = pF1KE3592/gi568815582f_66479608.tfa (gi568815582f:66479608_66688116), 208509 bp

>pF1KE3592 744
>gi568815582f:66479608_66688116 (Chr16)

1-285  (100001-100285)   100% ->
286-444  (100419-100577)   100% ->
445-546  (107390-107491)   100% ->
547-744  (108312-108509)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACCTAAGGCGGCAAAGGGGGCCAAGCCAGAGCCAGCACCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACCTAAGGCGGCAAAGGGGGCCAAGCCAGAGCCAGCACCAGCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCTCCACCCGGGGCCAAACCCGAGGAAGACAAGAAGGACGGTAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCTCCACCCGGGGCCAAACCCGAGGAAGACAAGAAGGACGGTAAGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATCGGACAAACCTCAAAAGGCGGTGCAGGACCATAAGGAGCCATCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATCGGACAAACCTCAAAAGGCGGTGCAGGACCATAAGGAGCCATCGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAACCTCAAAAGGCGGTGCAGCCCAAGCACGAAGTGGGCACGAGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAACCTCAAAAGGCGGTGCAGCCCAAGCACGAAGTGGGCACGAGGAGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGTCGCCGCTACCGGTGGGAATTAAAAGACAGCAATAAAGAGTTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTGTCGCCGCTACCGGTGGGAATTAAAAGACAGCAATAAAGAGTTCTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTTGGGGCACGCTGAGATCAAGATTCGGAGTTTG         GGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100251 TCTTGGGGCACGCTGAGATCAAGATTCGGAGTTTGGTG...CAGGGCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTAATAGCTGCAATGATACTGTTGTCCTCACTCACCGTGCACCCCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100425 CTAATAGCTGCAATGATACTGTTGTCCTCACTCACCGTGCACCCCATCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAGGCTTATCATCACCATGGAGATATCCTTCTTCAGCTTCTTCATCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100475 GAGGCTTATCATCACCATGGAGATATCCTTCTTCAGCTTCTTCATCTTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGTACAGCTTTGCCATTCATAGATACATACCCTTCATCCTGTGGCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100525 TGTACAGCTTTGCCATTCATAGATACATACCCTTCATCCTGTGGCCCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCT         GACCTCTTCAACGACCTGATTGCTTGTGCGTTCCTTGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100575 TCTGTA...CAGGACCTCTTCAACGACCTGATTGCTTGTGCGTTCCTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGGAGCCGTGGTCTTTGCTGTGAGAAGTCGGCGATCCATGAATCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107428 GGGAGCCGTGGTCTTTGCTGTGAGAAGTCGGCGATCCATGAATCTCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACTTACTTGCTGTG         ATCCTTATTGGTGCGGCTGGAGTTTTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107478 ACTTACTTGCTGTGGTG...CAGATCCTTATTGGTGCGGCTGGAGTTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCTTTTATCGATGTGTGTCTTCAAAGAAACCACTTCAGAGGCAAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108339 GCTTTTATCGATGTGTGTCTTCAAAGAAACCACTTCAGAGGCAAGAAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAAAAAGCATATGCTGGTTCCTCCTCCAGGAAAGGAAAAAGGACCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108389 CAAAAAGCATATGCTGGTTCCTCCTCCAGGAAAGGAAAAAGGACCCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGGCAAGGGACCAGAACCCGCCAAGCCACCAGAACCTGGCAAGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108439 AGGGCAAGGGACCAGAACCCGCCAAGCCACCAGAACCTGGCAAGCCACCA

    750     .    :    .    :
    724 GGGCCAGCAAAGGGAAAGAAA
        |||||||||||||||||||||
 108489 GGGCCAGCAAAGGGAAAGAAA