seq1 = pF1KE3561.tfa, 2778 bp
seq2 = pF1KE3561/gi568815592r_116692145.tfa (gi568815592r:116692145_116929013), 236869 bp

>pF1KE3561 2778
>gi568815592r:116692145_116929013 (Chr6)

(complement)

1-194  (100001-100194)   100% ->
195-498  (119397-119700)   99% ->
499-1335  (121808-122644)   100% ->
1336-1548  (128218-128430)   99% ->
1549-1672  (133179-133302)   100% ->
1673-2778  (135764-136869)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATTCTTAATTATACTAATTACCTGCTTTGTGATTATTCTTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATTCTTAATTATACTAATTACCTGCTTTGTGATTATTCTTGCTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCACAGCCTTGCCAGACCCCTGATGACTTTGTGGCTGCCACTTCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCACAGCCTTGCCAGACCCCTGATGACTTTGTGGCTGCCACTTCTCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACATATCATAATTGGAGGTTTGTTTGCTATTCATGAAAAAATGTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GACATATCATAATTGGAGGTTTGTTTGCTATTCATGAAAAAATGTTGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCAGAAGACTCTCCCAGACGACCACAAATCCAGGAGTGTGTTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100151 TCAGAAGACTCTCCCAGACGACCACAAATCCAGGAGTGTGTTGGGTG...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195    CTTTGAAATATCAGTTTTTCTTCAAACTCTTGCCATGATACACAGCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119394 CAGCTTTGAAATATCAGTTTTTCTTCAAACTCTTGCCATGATACACAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGAGATGATCAACAATTCAACACTCTTATCTGGAGTCAAACTGGGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 119444 TTGAGATGATCAACAATTCAACACTCTTACCTGGAGTCAAACTGGGGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAAATCTATGACACTTGTACAGAAGTCACAGTGGCAATGGCAGCCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119494 GAAATCTATGACACTTGTACAGAAGTCACAGTGGCAATGGCAGCCACTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAGGTTTCTTTCTAAATTCAACTGCTCCAGAGAAACTGTGGAGTTTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119544 GAGGTTTCTTTCTAAATTCAACTGCTCCAGAGAAACTGTGGAGTTTAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTGACTATTCCAGCTACATGCCAAGAGTTAAGGCTGTCATAGGTTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119594 GTGACTATTCCAGCTACATGCCAAGAGTTAAGGCTGTCATAGGTTCTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TACTCAGAAATAACTATGGCTGTCTCCAGGATGTTGAATTTACAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119644 TACTCAGAAATAACTATGGCTGTCTCCAGGATGTTGAATTTACAGCTCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCACAG         GTGGGTTATGAATCAACTGCAGAAATCCTGAGTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119694 GCCACAGGTA...CAGGTGGGTTATGAATCAACTGCAGAAATCCTGAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACAAAATTCGCTTTCCTTCATTTTTACGGACTGTGCCCAGTGACTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121842 ACAAAATTCGCTTTCCTTCATTTTTACGGACTGTGCCCAGTGACTTCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CAAATTAAAGCAATGGCTCACCTGATTCAGAAATCTGGTTGGAACTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121892 CAAATTAAAGCAATGGCTCACCTGATTCAGAAATCTGGTTGGAACTGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGGCATCATAACCACAGATGATGACTATGGACGATTGGCTCTTAACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121942 TGGCATCATAACCACAGATGATGACTATGGACGATTGGCTCTTAACACTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTATAATTCAGGCTGAAGCAAATAACGTGTGCATAGCCTTCAAAGAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121992 TTATAATTCAGGCTGAAGCAAATAACGTGTGCATAGCCTTCAAAGAGGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTTCCAGCCTTTCTTTCAGATAATACCATTGAAGTCAGAATCAATCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122042 CTTCCAGCCTTTCTTTCAGATAATACCATTGAAGTCAGAATCAATCGGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 ACTGAAGAAAATCATTTTAGAAGCCCAGGTTAATGTCATTGTGGTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122092 ACTGAAGAAAATCATTTTAGAAGCCCAGGTTAATGTCATTGTGGTATTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGAGGCAATTCCATGTTTTTGATCTCTTCAATAAAGCCATTGAAATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122142 TGAGGCAATTCCATGTTTTTGATCTCTTCAATAAAGCCATTGAAATGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ATAAATAAGATGTGGATTGCTAGTGATAATTGGTCAACTGCCACCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122192 ATAAATAAGATGTGGATTGCTAGTGATAATTGGTCAACTGCCACCAAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TACCACCATTCCTAATGTTAAAAAGATTGGCAAAGTTGTAGGGTTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122242 TACCACCATTCCTAATGTTAAAAAGATTGGCAAAGTTGTAGGGTTTGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TTAGAAGAGGGAATATATCCTCTTTCCATTCCTTTCTTCAAAATCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122292 TTAGAAGAGGGAATATATCCTCTTTCCATTCCTTTCTTCAAAATCTGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TTGCTTCCCAGTGACAGTCACAAACTCTTACATGAATATGCCATGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122342 TTGCTTCCCAGTGACAGTCACAAACTCTTACATGAATATGCCATGCATTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 ATCTGCCTGCGCATATGTCAAGGACACTGATTTGAGTCAATGCATATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122392 ATCTGCCTGCGCATATGTCAAGGACACTGATTTGAGTCAATGCATATTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ATCATTCTCAAAGGACTTTGGCCTACAAGGCTAACAAGGCTATAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122442 ATCATTCTCAAAGGACTTTGGCCTACAAGGCTAACAAGGCTATAGAAAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 AACTTCGTCATGAGAAATGACTTCCTCTGGGACTATGCTGAGCCAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122492 AACTTCGTCATGAGAAATGACTTCCTCTGGGACTATGCTGAGCCAGGACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CATTCATAGTATTCAGCTTGCAGTGTTTGCCCTTGGTTATGCCATTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122542 CATTCATAGTATTCAGCTTGCAGTGTTTGCCCTTGGTTATGCCATTCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 ATCTGTGTCAAGCTCGTGACTGTCAGAACCCCAACGCCTTTCAACCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122592 ATCTGTGTCAAGCTCGTGACTGTCAGAACCCCAACGCCTTTCAACCATGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GAG         TTACTTGGTGTGCTAAAAAATGTGACATTCACTGATGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122642 GAGGTA...TAGTTACTTGGTGTGCTAAAAAATGTGACATTCACTGATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 ATGGAATTCATTTCATTTTGATGCTCATGGGGATTTAAATACTGGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 128256 ATGGAATTCATTTCATTTTGATGCTCACGGGGATTTAAATACTGGATATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 ATGTTGTGCTCTGGAAGGAGATCAATGGACACATGACTGTCACTAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128306 ATGTTGTGCTCTGGAAGGAGATCAATGGACACATGACTGTCACTAAGATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GCAGAATATGACCTACAGAATGATGTCTTCATCATCCCAGATCAGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128356 GCAGAATATGACCTACAGAATGATGTCTTCATCATCCCAGATCAGGAAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 AAAAAATGAGTTCAGGAATCTTAAG         CAAATTCAATCTAAAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 128406 AAAAAATGAGTTCAGGAATCTTAAGGTA...TAGCAAATTCAATCTAAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 GCTCCAAGGAATGCAGTCCTGGGCAAATGAAGAAAACTACAAGAAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133195 GCTCCAAGGAATGCAGTCCTGGGCAAATGAAGAAAACTACAAGAAGTCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 CACATCTGTTGCTATGAATGTCAGAACTGTCCTGAAAATCATTACACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133245 CACATCTGTTGCTATGAATGTCAGAACTGTCCTGAAAATCATTACACTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 TCAGACAG         ATATGCCTCACTGCCTTTTATGCAACAACAAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 133295 TCAGACAGGTA...TAGATATGCCTCACTGCCTTTTATGCAACAACAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 CTCACTGGGCCCCTGTTAGGAGCACTATGTGCTTTGAAAAGGAAGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135797 CTCACTGGGCCCCTGTTAGGAGCACTATGTGCTTTGAAAAGGAAGTGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 TATCTCAACTGGAATGACTCCTTGGCCATCCTACTCCTGATTCTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135847 TATCTCAACTGGAATGACTCCTTGGCCATCCTACTCCTGATTCTCTCCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 ACTGGGAATCATATTTGTTCTGGTTGTTGGCATAATATTTACAAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135897 ACTGGGAATCATATTTGTTCTGGTTGTTGGCATAATATTTACAAGAAACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 TGAACACACCTGTTGTGAAATCATCCGGGGGATTAAGAGTCTGCTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135947 TGAACACACCTGTTGTGAAATCATCCGGGGGATTAAGAGTCTGCTATGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 ATCCTTCTCTGTCATTTCCTCAATTTTGCCAGCACGAGCTTTTTCATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135997 ATCCTTCTCTGTCATTTCCTCAATTTTGCCAGCACGAGCTTTTTCATTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 AGAACCACAAGACTTCACATGTAAAACCAGGCAGACAATGTTTGGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136047 AGAACCACAAGACTTCACATGTAAAACCAGGCAGACAATGTTTGGAGTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 GCTTTACTCTTTGCATCTCCTGCATTTTGACGAAGTCTCTGAAAATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136097 GCTTTACTCTTTGCATCTCCTGCATTTTGACGAAGTCTCTGAAAATTTTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 CTAGCTTTCAGCTTTGATCCCAAATTACAGAAATTTCTGAAGTGCCTCTA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136147 CTAGCCTTCAGCTTTGATCCCAAATTACAGAAATTTCTGAAGTGCCTCTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 TAGACCGATCCTTATTATCTTCACTTGCACGGGCATCCAGGTTGTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136197 TAGACCGATCCTTATTATCTTCACTTGCACGGGCATCCAGGTTGTCATTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 GCACACTCTGGCTAATCTTTGCAGCACCTACTGTAGAGGTGAATGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136247 GCACACTCTGGCTAATCTTTGCAGCACCTACTGTAGAGGTGAATGTCTCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 TTGCCCAGAGTCATCATCCTGGAGTGTGAGGAGGGATCCATACTTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136297 TTGCCCAGAGTCATCATCCTGGAGTGTGAGGAGGGATCCATACTTGCATT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 TGGCACCATGCTGGGCTACATTGCCATCCTGGCCTTCATTTGCTTCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136347 TGGCACCATGCTGGGCTACATTGCCATCCTGGCCTTCATTTGCTTCATAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 TTGCTTTCAAAGGCAAATATGAGAATTACAATGAAGCCAAATTCATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136397 TTGCTTTCAAAGGCAAATATGAGAATTACAATGAAGCCAAATTCATTACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2356 TTTGGCATGCTCATTTACTTCATAGCTTGGATCACATTCATCCCTATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136447 TTTGGCATGCTCATTTACTTCATAGCTTGGATCACATTCATCCCTATCTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 TGCTACCACATTTGGCAAATATGTACCGGCTGTGGAGATTATTGTCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 136497 TGCTACCACATTTGGCAAATATGTACCAGCTGTGGAGATTATTGTCATAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2456 TAATATCTAACTATGGAATCCTGTATTGCACATTCATCCCCAAATGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136547 TAATATCTAACTATGGAATCCTGTATTGCACATTCATCCCCAAATGCTAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2506 GTTATTATTTGTAAGCAAGAGATTAACACAAAGTCTGCCTTTCTCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136597 GTTATTATTTGTAAGCAAGAGATTAACACAAAGTCTGCCTTTCTCAAGAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2556 GATCTACAGTTATTCTTCCCATAGTGTGAGCAGCATTGCCCTGAGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136647 GATCTACAGTTATTCTTCCCATAGTGTGAGCAGCATTGCCCTGAGTCCTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2606 CTTCACTGGACTCCATGAGCGGCAATGTCACAATGACCAATCCCAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136697 CTTCACTGGACTCCATGAGCGGCAATGTCACAATGACCAATCCCAGCTCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2656 AGTGGCAAGTCTGCAACCTGGCAGAAAAGCAAAGATCTTCAGGCACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136747 AGTGGCAAGTCTGCAACCTGGCAGAAAAGCAAAGATCTTCAGGCACAAGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2706 ATTTGCACACATATGCAGGGAAAATGCCACAAGTGTATCTAAAACTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136797 ATTTGCACACATATGCAGGGAAAATGCCACAAGTGTATCTAAAACTTTGC

   2800     .    :    .    :
   2756 CTCGAAAAAGAATGTCAAGTATA
        |||||||||||||||||||||||
 136847 CTCGAAAAAGAATGTCAAGTATA