seq1 = pF1KE3543.tfa, 3648 bp
seq2 = pF1KE3543/gi568815587r_8517947.tfa (gi568815587r:8517947_8749888), 231942 bp

>pF1KE3543 3648
>gi568815587r:8517947_8749888 (Chr11)

(complement)

1-157  (99995-100149)   97% ->
158-290  (101341-101473)   100% ->
291-407  (101803-101919)   100% ->
408-522  (103328-103442)   100% ->
523-669  (104002-104148)   100% ->
670-787  (106763-106880)   100% ->
788-1713  (108737-109662)   100% ->
1714-1875  (111074-111235)   100% ->
1876-2395  (124661-125180)   100% ->
2396-2491  (125435-125530)   100% ->
2492-2552  (127013-127073)   100% ->
2553-2727  (128070-128244)   100% ->
2728-3017  (128568-128857)   100% ->
3018-3144  (129317-129443)   100% ->
3145-3219  (129765-129839)   100% ->
3220-3372  (130354-130506)   100% ->
3373-3591  (130921-131139)   100% ->
3592-3648  (131886-131942)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGGAACTGCTCTGAGTGCAAGGAGAAGAGGGCAGCACATATCCT
         | -||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 CTT CCAG AACTGCTCTGAGTGCAAGGAGAAGAGGGCAGCACATATCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCACCTACTGCAATCGCTGGCTGTGCAGCTCTTGCACAGAGGAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100043 CTGCACCTACTGCAATCGCTGGCTGTGCAGCTCTTGCACAGAGGAACACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACACAGCCCTGTCCCCGGGGGCCCATTCTTTCCTCGGGCCCAGAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100093 GACACAGCCCTGTCCCCGGGGGCCCATTCTTTCCTCGGGCCCAGAAGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTCCAG         GAGTGAATGGTGGTCCCGGAGACTTCACCTTGTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100143 TCTCCAGGTA...CAGGAGTGAATGGTGGTCCCGGAGACTTCACCTTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTGTCCTCTACACACACAGGAAGTACTCAAGCTATTCTGTGAGACATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101375 TTGTCCTCTACACACACAGGAAGTACTCAAGCTATTCTGTGAGACATGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATATGCTCACTTGCCATAGCTGCCTAGTGGTGGAACACAAAGAACACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101425 ATATGCTCACTTGCCATAGCTGCCTAGTGGTGGAACACAAAGAACACAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291         GTGCAGACATGTTGAAGAAGTTTTGCAAAACCAGAGGATGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101475 TG...TAGGTGCAGACATGTTGAAGAAGTTTTGCAAAACCAGAGGATGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTGGAAGGTGTGACTACACAGGTGGCACATAAGAAATCCAGTCTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101845 TCTGGAAGGTGTGACTACACAGGTGGCACATAAGAAATCCAGTCTACAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CATCTGCAAAGCAAATTGAGGACAG         GATTTTTGAAGTGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101895 CATCTGCAAAGCAAATTGAGGACAGGTA...CAGGATTTTTGAAGTGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CATCAGCATAGGAAGGTGGAAAACCAGATCAAAATGGCCAAGATGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103344 CATCAGCATAGGAAGGTGGAAAACCAGATCAAAATGGCCAAGATGGTTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATGAATGAGCTGAACAAACAGGCCAATGGGCTAATAGAGGAATTAGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103394 GATGAATGAGCTGAACAAACAGGCCAATGGGCTAATAGAGGAATTAGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    523         GGGATTACTAATGAGAGAAAGCGGAAGCTGGAACAGCAGTTA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103444 TA...CAGGGGATTACTAATGAGAGAAAGCGGAAGCTGGAACAGCAGTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGAGCATCATGGTTCTCAACCGTCAGTTTGAGCATGTGCAGAATTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104044 CAGAGCATCATGGTTCTCAACCGTCAGTTTGAGCATGTGCAGAATTTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAACTGGGCTGTCTGCAGCAAAACCAGTGTCCCTTTTCTTTTCAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104094 CAACTGGGCTGTCTGCAGCAAAACCAGTGTCCCTTTTCTTTTCAGCAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCTG         ATTGTGTTTCAGATGCAGCGATTGCTGGAGACAAGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104144 AGCTGGTA...CAGATTGTGTTTCAGATGCAGCGATTGCTGGAGACAAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGTAACACAGATCCTGGCTCCCCTTGGAGTATCAGATTCACCTGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106799 TGTAACACAGATCCTGGCTCCCCTTGGAGTATCAGATTCACCTGGGAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TAACTTCTGGACCAAGCAGCTAGCTTCTCTTG         GCTGCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 106849 TAACTTCTGGACCAAGCAGCTAGCTTCTCTTGGTG...CAGGCTGCATAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CTACTGAAGGTGGACAAATGTCCAGGGCAGATGCTCCTGCTTATGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108746 CTACTGAAGGTGGACAAATGTCCAGGGCAGATGCTCCTGCTTATGGAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTACAGGGGTCATCACCCTTTTATCAAAGCCACCAGTCTCCAGTGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108796 TTACAGGGGTCATCACCCTTTTATCAAAGCCACCAGTCTCCAGTGGCTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCAAGAGGCTCTTAGCCACCCCTCACACAAGTTCCAGTCTCCAGCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108846 GCAAGAGGCTCTTAGCCACCCCTCACACAAGTTCCAGTCTCCAGCAGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCTCCTCATCTGTGTGCTGCTCCCACTGCTCCCCAGTCTCGCCTTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108896 GCTCCTCATCTGTGTGCTGCTCCCACTGCTCCCCAGTCTCGCCTTCCCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AAAGGCCAGGTCCCCCCACCCAGCATACACCCAGCCCACAGCTTCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108946 AAAGGCCAGGTCCCCCCACCCAGCATACACCCAGCCCACAGCTTCAGGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCCCCCTGAGATGGTGCCCCAGCAGCTGGGGTCTCTGCAGTGCTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108996 GCCCCCTGAGATGGTGCCCCAGCAGCTGGGGTCTCTGCAGTGCTCTGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGCTGCCCAGGGAGAAAGAGCTGGCCTGCAGCCCTCATCCACCAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109046 TGCTGCCCAGGGAGAAAGAGCTGGCCTGCAGCCCTCATCCACCAAAGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CTGCAGCCCTGGCTGGAAACCCAGCCCCCCGTGGAGCAGGAGAGCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109096 CTGCAGCCCTGGCTGGAAACCCAGCCCCCCGTGGAGCAGGAGAGCACATC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CCAGCGGCTGGGGCAGCAGCTGACTTCCCAGCCCGTGTGCATTGTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109146 CCAGCGGCTGGGGCAGCAGCTGACTTCCCAGCCCGTGTGCATTGTCCCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CACAGGATGTTCAGCAAGGAGCCCATGCCCAGCCCACCTTACAGACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109196 CACAGGATGTTCAGCAAGGAGCCCATGCCCAGCCCACCTTACAGACACCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 TCTATCCAAGTCCAGTTTGGCCACCACCAGAAGCTGAAGCTCAGTCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109246 TCTATCCAAGTCCAGTTTGGCCACCACCAGAAGCTGAAGCTCAGTCACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 TCAGCAGCAGCCACAGCAGCAGCTACCACCTCCACCACCACCCCTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109296 TCAGCAGCAGCCACAGCAGCAGCTACCACCTCCACCACCACCCCTCCCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 ATCCCCCACCTCCCCTTCCCCCTCCCCCACAGCAGCCACACCCACCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109346 ATCCCCCACCTCCCCTTCCCCCTCCCCCACAGCAGCCACACCCACCTCTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CCTCCATCCCAGCATCTGGCTTCTAGTCAGCACGAGAGCCCTCCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109396 CCTCCATCCCAGCATCTGGCTTCTAGTCAGCACGAGAGCCCTCCTGGCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 TGCCTGTTCTCAGAACATGGACATAATGCATCACAAGTTTGAGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109446 TGCCTGTTCTCAGAACATGGACATAATGCATCACAAGTTTGAGCTGGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 AAATGCAGAAGGACTTGGAGCTTCTTCTCCAGGCTCAACAGCCCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109496 AAATGCAGAAGGACTTGGAGCTTCTTCTCCAGGCTCAACAGCCCAGCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CAACTGAGTCAGACCAAATCTCCTCAGCATCTTCAGCAAACCATTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109546 CAACTGAGTCAGACCAAATCTCCTCAGCATCTTCAGCAAACCATTGTGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GCAGATCAACTACATCGTGAGGCAGCCAGCACCTGTCCAGTCCCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109596 GCAGATCAACTACATCGTGAGGCAGCCAGCACCTGTCCAGTCCCAGAGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 AGGAGGAGACCCTGCAG         GCTACAGATGAGCCCCCAGCATCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109646 AGGAGGAGACCCTGCAGGTA...CAGGCTACAGATGAGCCCCCAGCATCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CAGGGCTCAAAGCCGGCTCTCCCTCTTGACAAGAATACTGCTGCTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111098 CAGGGCTCAAAGCCGGCTCTCCCTCTTGACAAGAATACTGCTGCTGCCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 GCCCCAGGCGTCTGGGGAAGAAACCCCTCTCAGTGTCCCCCCAGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111148 GCCCCAGGCGTCTGGGGAAGAAACCCCTCTCAGTGTCCCCCCAGTGGACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 GCACCATCCAGCACTCCTCTCCAAATGTGGTGAGAAAG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111198 GCACCATCCAGCACTCCTCTCCAAATGTGGTGAGAAAGGTA...CAGCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 TCCACCTCGCTGAGCATCATGGGCTTTTCCAACACTCTGGAGATGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124664 TCCACCTCGCTGAGCATCATGGGCTTTTCCAACACTCTGGAGATGGAGTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 GTCATCTACCAGGTTGGAGAGGCCCCTAGAGCCACAGATCCAGAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124714 GTCATCTACCAGGTTGGAGAGGCCCCTAGAGCCACAGATCCAGAGTGTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 GCAACCTGACAGCTGGTGCCCCCCAGGCAGTACCAAGCCTGCTGAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124764 GCAACCTGACAGCTGGTGCCCCCCAGGCAGTACCAAGCCTGCTGAGTGCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 CCCCCCAAAATGGTGTCCAGCCTGACAAGTGTTCAAAACCAGGCCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124814 CCCCCCAAAATGGTGTCCAGCCTGACAAGTGTTCAAAACCAGGCCATGCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 CAGCCTGACAACCAGTCACCTACAGACTGTGCCCAGCCTTGTGCATAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124864 CAGCCTGACAACCAGTCACCTACAGACTGTGCCCAGCCTTGTGCATAGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 CATTCCAGTCCATGCCCAACCTGATAAGTGACTCCCCTCAGGCTATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124914 CATTCCAGTCCATGCCCAACCTGATAAGTGACTCCCCTCAGGCTATGGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 AGCCTGGCAAGTGATCACCCTCAGGCTGGGCCCAGCCTAATGTCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124964 AGCCTGGCAAGTGATCACCCTCAGGCTGGGCCCAGCCTAATGTCTGGTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 CACCCAGGCTGTGCCGAGTCTGGCAACTTGTCCTCTGCAGAGCATCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125014 CACCCAGGCTGTGCCGAGTCTGGCAACTTGTCCTCTGCAGAGCATCCCTC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 CAGTTTCTGACATGCAGCCAGAAACTGGGTCCAGCTCCAGTTCTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125064 CAGTTTCTGACATGCAGCCAGAAACTGGGTCCAGCTCCAGTTCTGGCCGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 ACTTCAGGGAGCCTGTGTCCCAGAGATGGGGCTGATCCCTCCCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125114 ACTTCAGGGAGCCTGTGTCCCAGAGATGGGGCTGATCCCTCCCTGGAGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 TGCTCTGTGTAAGGTAA         AACTGGAGGAGCCAATTAACCTCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 125164 TGCTCTGTGTAAGGTAAGTC...CAGAACTGGAGGAGCCAATTAACCTCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 CTGTGAAGAAACCTCCACTGGCGCCAGTGGTCAGCACGTCTACAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125459 CTGTGAAGAAACCTCCACTGGCGCCAGTGGTCAGCACGTCTACAGCTCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 CAGCAGTACCAGAACCCAAAAG         AGTGTGAGAATTTTGAACA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 125509 CAGCAGTACCAGAACCCAAAAGGTG...TAGAGTGTGAGAATTTTGAACA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2511 AGGAGCCCTAGAGCTGGATGCAAAAGAGAACCAGAGCATCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 127032 AGGAGCCCTAGAGCTGGATGCAAAAGAGAACCAGAGCATCAGGTA...CA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2553  AGCCTTCAATAGTGAGCATAAGATTCCCTATGTGCGACTGGAGCGACTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128069 GAGCCTTCAATAGTGAGCATAAGATTCCCTATGTGCGACTGGAGCGACTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 AAGATCTGTGCTGCCTCCTCAGGAGAGATGCCTGTGTTCAAACTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128119 AAGATCTGTGCTGCCTCCTCAGGAGAGATGCCTGTGTTCAAACTGAAGCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 ACAGAAGAATGATCAGGATGGGAGCTTCCTGCTGATCATCGAGTGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128169 ACAGAAGAATGATCAGGATGGGAGCTTCCTGCTGATCATCGAGTGTGGCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 CTGAGTCCTCCAGCATGTCCATTAAG         GTCAGCCAGGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 128219 CTGAGTCCTCCAGCATGTCCATTAAGGTA...AAGGTCAGCCAGGACAGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2743 CTGTCTGAGGCCACCCAGGCCCCAGGTCTGGAGGGAAGAAAGGTCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128583 CTGTCTGAGGCCACCCAGGCCCCAGGTCTGGAGGGAAGAAAGGTCACTGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2793 CACTTCTTTGGCTGGGCAGCGGCCACCAGAAGTGGAGGGCACATCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128633 CACTTCTTTGGCTGGGCAGCGGCCACCAGAAGTGGAGGGCACATCTCCTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2843 AAGAACACAGACTCATTCCTCGAACCCCAGGAGCCAAGAAGGGCCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128683 AAGAACACAGACTCATTCCTCGAACCCCAGGAGCCAAGAAGGGCCCCCCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2893 GCCCCAATAGAGAATGAGGACTTCTGTGCTGTTTGCCTCAATGGCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128733 GCCCCAATAGAGAATGAGGACTTCTGTGCTGTTTGCCTCAATGGCGGAGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2943 GTTACTGTGCTGTGACCGCTGCCCCAAAGTGTTCCACCTCTCCTGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128783 GTTACTGTGCTGTGACCGCTGCCCCAAAGTGTTCCACCTCTCCTGCCATG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2993 TGCCAGCCTTGCTCAGCTTCCCAGG         GGGAGAGTGGGTGTGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 128833 TGCCAGCCTTGCTCAGCTTCCCAGGGTG...CAGGGGAGAGTGGGTGTGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3034 ACCTTGTGCCGCAGCCTGACCCAGCCCGAGATGGAGTACGACTGTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129333 ACCTTGTGCCGCAGCCTGACCCAGCCCGAGATGGAGTACGACTGTGAGAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3084 TGCCTGCTATAACCAGCCTGGAATGCGGGCATCTCCTGGCCTAAGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129383 TGCCTGCTATAACCAGCCTGGAATGCGGGCATCTCCTGGCCTAAGCATGT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3134 ATGACCAGAAG         AAGTGTGAGAAGCTGGTATTGTCCTTGTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 129433 ATGACCAGAAGGTA...CAGAAGTGTGAGAAGCTGGTATTGTCCTTGTGC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3175 TGCAATAACCTCAGCCTGCCCTTCCATGAACCTGTCAGCCCCCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 129795 TGCAATAACCTCAGCCTGCCCTTCCATGAACCTGTCAGCCCCCTGGTA..

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3220     GCCCGGCATTATTACCAGATTATCAAGAGGCCCATGGACCTGTCAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129845 .AAGGCCCGGCATTATTACCAGATTATCAAGAGGCCCATGGACCTGTCAA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3266 TCATCCGGAGGAAGCTGCAAAAGAAGGACCCAGCTCACTATACCACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130400 TCATCCGGAGGAAGCTGCAAAAGAAGGACCCAGCTCACTATACCACCCCA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3316 GAGGAGGTGGTATCAGATGTGCGCCTCATGTTCTGGAACTGTGCTAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130450 GAGGAGGTGGTATCAGATGTGCGCCTCATGTTCTGGAACTGTGCTAAGTT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3366 CAATTAT         CCTGACTCCGAGGTTGCAGAGGCTGGCCGCTGCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130500 CAATTATGTA...CAGCCTGACTCCGAGGTTGCAGAGGCTGGCCGCTGCC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3407 TGGAAGTGTTCTTTGAGGGCTGGTTGAAGGAGATCTACCCGGAGAAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130955 TGGAAGTGTTCTTTGAGGGCTGGTTGAAGGAGATCTACCCGGAGAAACGG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3457 TTTGCCCAGCCAAGGCAGGAGGACTCAGACTCCGAGGAGGTGTCTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131005 TTTGCCCAGCCAAGGCAGGAGGACTCAGACTCCGAGGAGGTGTCTAGTGA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3507 GAGTGGATGTTCCACTCCCCAGGGCTTCCCGTGGCCTCCCTACATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131055 GAGTGGATGTTCCACTCCCCAGGGCTTCCCGTGGCCTCCCTACATGCAGG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3557 AGGGCATCCAACCCAAGAGGCGGCGACGACATATG         GAGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 131105 AGGGCATCCAACCCAAGAGGCGGCGACGACATATGGTA...CAGGAGAAT

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3598 GAAAGAGCAAAAAGAATGTCATTTCGCCTGGCCAACAGCATCTCTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131892 GAAAGAGCAAAAAGAATGTCATTTCGCCTGGCCAACAGCATCTCTCAGGT

   3800 
   3648 G
        |
 131942 G