Result of SIM4 for
pF1KE3542
seq1 = pF1KE3542.tfa, 3390 bp
seq2 = pF1KE3542/gi568815595f_96714624.tfa (gi568815595f:96714624_97848698), 1134075 bp
>pF1KE3542 3390
>gi568815595f:96714624_97848698 (Chr3)
1-385 (100001-100385) 100% ->
386-450 (152202-152266) 100% ->
451-1114 (272707-273370) 100% ->
1115-1270 (511641-511796) 100% ->
1271-1606 (529329-529664) 100% ->
1607-1731 (690527-690651) 100% ->
1732-1894 (733945-734107) 100% ->
1895-2003 (760729-760837) 100% ->
2004-2074 (764671-764741) 100% ->
2075-2200 (769311-769436) 100% ->
2201-2386 (817735-817920) 100% ->
2387-2512 (877989-878114) 100% ->
2513-2574 (896170-896231) 100% ->
2575-2784 (923250-923459) 100% ->
2785-2934 (1005638-1005787) 100% ->
2935-3128 (1021302-1021495) 100% ->
3129-3278 (1032800-1032949) 100% ->
3279-3390 (1033964-1034075) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGC
50 . : . : . : . : . :
51 AGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGCACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 AGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGCACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCT
100 . : . : . : . : . :
101 CGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCCCT
150 . : . : . : . : . :
151 GCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAA
200 . : . : . : . : . :
201 GGACCCCCATCCTACCCAGAACACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GGACCCCCATCCTACCCAGAACACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTT
250 . : . : . : . : . :
251 TAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGAAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 TAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGAAGTC
300 . : . : . : . : . :
301 CGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 CGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTG
350 . : . : . : . : . :
351 GCCAGGCGACTGCAGTCACGTCTCCAACAACCAAG TTGTGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
100351 GCCAGGCGACTGCAGTCACGTCTCCAACAACCAAGGTA...CAGTTGTGT
400 . : . : . : . : . :
392 TGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152208 TGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCA
450 . : . : . : . : . :
442 TTAAATGGG TGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
152258 TTAAATGGGGTA...CAGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAA
500 . : . : . : . : . :
483 TAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAATGGAACCAAACCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
272739 TAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAATGGAACCAAACCAAA
550 . : . : . : . : . :
533 ACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
272789 ACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATT
600 . : . : . : . : . :
583 TATGTGGAAATGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
272839 TATGTGGAAATGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGT
650 . : . : . : . : . :
633 CTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTTTATATGGAATCAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
272889 CTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTTTATATGGAATCAGATG
700 . : . : . : . : . :
683 AGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
272939 AGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACA
750 . : . : . : . : . :
733 ATTGCTGCTGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
272989 ATTGCTGCTGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCT
800 . : . : . : . : . :
783 CAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGCCTATAGAAAGGAAAGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
273039 CAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGCCTATAGAAAGGAAAGGAT
850 . : . : . : . : . :
833 TTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
273089 TTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTC
900 . : . : . : . : . :
883 CGTGTTTTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
273139 CGTGTTTTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTT
950 . : . : . : . : . :
933 TCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTCCTCTTTGGTTGAAGTACGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
273189 TCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTCCTCTTTGGTTGAAGTACGGG
1000 . : . : . : . : . :
983 GTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
273239 GTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGT
1050 . : . : . : . : . :
1033 GGAGCTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
273289 GGAGCTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTAC
1100 . : . : . : . : . :
1083 AGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGCCATG CTTGCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
273339 AGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGCCATGGTA...CAGCTTGCAGAC
1150 . : . : . : . : . :
1124 CAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
511650 CAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCT
1200 . : . : . : . : . :
1174 CCACACAGTTTAACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
511700 CCACACAGTTTAACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAA
1250 . : . : . : . : . :
1224 GGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTATGGCATGTACCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
511750 GGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTATGGCATGTACCAGTA
1300 . : . : . : . : . :
1271 GGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
511800 ...TAGGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAA
1350 . : . : . : . : . :
1315 ACAGCCCTTATTTTGGAATGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
529373 ACAGCCCTTATTTTGGAATGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAA
1400 . : . : . : . : . :
1365 AGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGACACCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
529423 AGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGACACCAGCC
1450 . : . : . : . : . :
1415 AGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
529473 AGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGC
1500 . : . : . : . : . :
1465 CTGATCAACAATTCCGTGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
529523 CTGATCAACAATTCCGTGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTA
1550 . : . : . : . : . :
1515 CACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTGAGTTTTTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
529573 CACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTGAGTTTTTCTC
1600 . : . : . : . : . :
1565 CCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
529623 CCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGGTA...CA
1650 . : . : . : . : . :
1607 CACCTTCCCTGATAGGTGTGGTAAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
690526 GCACCTTCCCTGATAGGTGTGGTAAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAG
1700 . : . : . : . : . :
1656 CATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
690576 CATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTCTGG
1750 . : . : . : . : . :
1706 ACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAA GAACATGAGCAGCTG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
690626 ACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGTA...CAGGAACATGAGCAGCTG
1800 . : . : . : . : . :
1747 ACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
733960 ACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCT
1850 . : . : . : . : . :
1797 TAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
734010 TAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAG
1900 . : . : . : . : . :
1847 GATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
734060 GATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAAGT
1950 . : . : . : . : . :
1895 CTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGC
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
734110 A...CAGCTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGC
2000 . : . : . : . : . :
1938 CACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
760772 CACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCT
2050 . : . : . : . : . :
1988 TCTTGATCACTGGGAG ATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
760822 TCTTGATCACTGGGAGGTA...AAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAG
2100 . : . : . : . : . :
2029 ATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
764696 ATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTGTA.
2150 . : . : . : . : . :
2075 TGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
764746 ..CAGTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATG
2200 . : . : . : . : . :
2120 AAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
769356 AAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCA
2250 . : . : . : . : . :
2170 AGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAG GTGAATTTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
769406 AGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTA...AAGGTGAATTTGG
2300 . : . : . : . : . :
2211 AGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817745 AGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAG
2350 . : . : . : . : . :
2261 TTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817795 TTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGAT
2400 . : . : . : . : . :
2311 TTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
817845 TTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCAT
2450 . : . : . : . : . :
2361 TCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAA GATCCTTCCCGGCCA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
817895 TCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGTA...AAGGATCCTTCCCGGCCA
2500 . : . : . : . : . :
2402 TTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
878004 TTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAAT
2550 . : . : . : . : . :
2452 AGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
878054 AGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAG
2600 . : . : . : . : . :
2502 GATTCCTGCTG GCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
878104 GATTCCTGCTGGTA...CAGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA
2650 . : . : . : . : . :
2543 TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGG AAGCATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
896200 TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGGTG...CAGAAGCATGAT
2700 . : . : . : . : . :
2584 GGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
923259 GGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATC
2750 . : . : . : . : . :
2634 AGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
923309 AGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGG
2800 . : . : . : . : . :
2684 CTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
923359 CTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTT
2850 . : . : . : . : . :
2734 GGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
923409 GGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAAC
2900 . : . : . : . : . :
2784 T GGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
923459 TGTA...CAGGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCA
2950 . : . : . : . : . :
2825 TCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1005678 TCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATT
3000 . : . : . : . : . :
2875 GTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1005728 GTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTC
3050 . : . : . : . : . :
2925 TAACCAAGAT GTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGAC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
1005778 TAACCAAGATGTA...TAGGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGAC
3100 . : . : . : . : . :
2966 TTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021333 TTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCAC
3150 . : . : . : . : . :
3016 TGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021383 TGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAG
3200 . : . : . : . : . :
3066 CTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021433 CTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGG
3250 . : . : . : . : . :
3116 AGGACATCCTTGT AATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCG
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
1021483 AGGACATCCTTGTGTA...CAGAATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCG
3300 . : . : . : . : . :
3157 GAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1032828 GAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGAT
3350 . : . : . : . : . :
3207 GGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1032878 GGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACC
3400 . : . : . : . : . :
3257 TGATTTCAAGAATGAGCATTGA TGACATTAGAAGAATTGGA
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
1032928 TGATTTCAAGAATGAGCATTGAGTA...CAGTGACATTAGAAGAATTGGA
3450 . : . : . : . : . :
3298 GTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1033983 GTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTT
3500 . : . : . : . :
3348 ACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1034033 ACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA