seq1 = pF1KE3534.tfa, 1923 bp
seq2 = pF1KE3534/gi568815584f_73391018.tfa (gi568815584f:73391018_73592940), 201923 bp

>pF1KE3534 1923
>gi568815584f:73391018_73592940 (Chr14)

1-1923  (100001-101923)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGGGCTCCAGGCCAGTGCAGGGCCGTTGAGGCGCGGGCGGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100001 ATGGATGGGCTCCAGGCCAGTGCAGGGCCGTTGAGGCGCGGGCGGCCGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCCGGCGCAAGCCCCAGCCACACAGCGGGTCGGTCCTGGCCCTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCCGGCGCAAGCCCCAGCCACACAGCGGGTCGGTCCTGGCCCTGCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAGGTCCAGGAAGATACGAAAGCAGCTGCGAAGTGTTGTATCCCGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAGGTCCAGGAAGATACGAAAGCAGCTGCGAAGTGTTGTATCCCGCATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGCGCTGAGGACGCAGACGCTGCCTAGCGAGAACTCGGAGGAATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCAGCGCTGAGGACGCAGACGCTGCCTAGCGAGAACTCGGAGGAATCGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGGAGTCGACGGCCGACGACCTGGGGGACGCGCTACCCGGTGGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTGGAGTCGACGGCCGACGACCTGGGGGACGCGCTACCCGGTGGGGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGTGGCGGCCGTCCCGGACGCAGCCCGGCGAGAGCCATACGGCCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGTGGCGGCCGTCCCGGACGCAGCCCGGCGAGAGCCATACGGCCACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGCCCGCAGAGCTGCTGGAGGCCTCGCCCGCCGCGCGCTCCCTGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGCCCGCAGAGCTGCTGGAGGCCTCGCCCGCCGCGCGCTCCCTGCAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCGTCGGCGCGCCTGGTGCCCGCTTCCGCGCCGCCCGCGCGCCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCGTCGGCGCGCCTGGTGCCCGCTTCCGCGCCGCCCGCGCGCCTGGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGTGCCCGCCGCGCCGGTCCGGGTGGTGGAGACCTCGGCCCTGCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGTGCCCGCCGCGCCGGTCCGGGTGGTGGAGACCTCGGCCCTGCTGTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCGCGCAACACTTAGCGGCCGTCCAGTCGTCCGGGGCCCCTGCGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACCGCGCAACACTTAGCGGCCGTCCAGTCGTCCGGGGCCCCTGCGACGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTCGGGGCCGCAGGTGGATAACACGGGTGGGGAGCCGGCCTGGGACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTCGGGGCCGCAGGTGGATAACACGGGTGGGGAGCCGGCCTGGGACTCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGCTGCGGCGCGTCTTGGCCGAGCTGAACCGCATCCCCAGCAGCCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGCTGCGGCGCGTCTTGGCCGAGCTGAACCGCATCCCCAGCAGCCGGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGAGCGGCCCGCCTCTTTGAGTGGCTCATCGCGCCCATGCCGCCAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGAGCGGCCCGCCTCTTTGAGTGGCTCATCGCGCCCATGCCGCCAGATCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTCTACCGGCGCCTATGGGAGCGCGAGGCGGTGCTGGTGCGGCGGCAGG
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTTTACCGGCGCCTATGGGAGCGCGAGGCGGTGCTGGTGCGGCGGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCACACCTACTACCAGGGACTTTTCTCTACCGCTGACCTGGATTCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCACACCTACTACCAGGGACTTTTCTCTACCGCTGACCTGGATTCGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGCGCAACGAGGAGGTGCAGTTCGGCCAGCATTTGGACGCCGCTCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGCGCAACGAGGAGGTGCAGTTCGGCCAGCATTTGGACGCCGCTCGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATCAACGGACGACGCGAGACCCTGAACCCACCCGGCCGCGCGCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATCAACGGACGACGCGAGACCCTGAACCCACCCGGCCGCGCGCTGCCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGCCGCGTGGTCCCTGTACCAGGCCGGCTGCTCCCTGCGTCTCCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCGCCGCGTGGTCCCTGTACCAGGCCGGCTGCTCCCTGCGTCTCCTCTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCGCAGGCTTTCTCTACTACTGTGTGGCAGTTTTTGGCTGTGCTTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCGCAGGCTTTCTCTACTACTGTGTGGCAGTTTTTGGCTGTGCTTCAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCAGTTTGGAAGCATGGCAGGCTCCAACGTTTACCTCACGCCCCCTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAGTTTGGAAGCATGGCAGGCTCCAACGTTTACCTCACGCCCCCTAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CGCAGGGCTTTGCCCCCCACTACGACGACATCGAGGCCTTCGTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CGCAGGGCTTTGCCCCCCACTACGACGACATCGAGGCCTTCGTGCTGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTGGAAGGTAGGAAACTCTGGCGTGTATACCGACCCCGAGCCCCAACCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 101051 CTGGAAGGTAGGAAACTCTGGCGTGTATACCGACCCCGAGTCCCAACCGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGAACTGGCTCTGACATCCAGCCCCAACTTCAGTCAGGACGACCTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGAACTGGCTCTGACATCCAGCCCCAACTTCAGTCAGGACGACCTCGGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGCCGGTGCTGCAGACCGTGCTGGAACCTGGAGATTTGCTGTATTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGCCGGTGCTGCAGACCGTGCTGGAACCTGGAGATTTGCTGTATTTTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CGGGGCTTCATTCACCAAGCTGAATGCCAGGATGGAGTCCACTCTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CGGGGCTTCATTCACCAAGCTGAATGCCAGGATGGAGTCCACTCTCTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCTCACCTTGTCCACGTACCAGCGCAATACCTGGGGTGACTTCTTAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCTCACCTTGTCCACGTACCAGCGCAATACCTGGGGTGACTTCTTAGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCATACTGCCTCTGGCAGTGCAGGCTGCAATGGAAGAAAATGTGGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCATACTGCCTCTGGCAGTGCAGGCTGCAATGGAAGAAAATGTGGAGTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CGGAGGGGTCTGCCCCGAGACTTCATGGATTACATGGGGGCCCAGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CGGAGGGGTCTGCCCCGAGACTTCATGGATTACATGGGGGCCCAGCATTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AGATTCTAAGGATCCGCGAAGAACCGCTTTCATGGAGAAGGTGCGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AGATTCTAAGGATCCGCGAAGAACCGCTTTCATGGAGAAGGTGCGGGTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGGTTGCCCGCCTGGGACACTTTGCTCCTGTTGATGCTGTGGCCGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGGTTGCCCGCCTGGGACACTTTGCTCCTGTTGATGCTGTGGCCGACCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CGAGCCAAAGACTTCATTCACGATTCTCTGCCCCCTGTTTTGACTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CGAGCCAAAGACTTCATTCACGATTCTCTGCCCCCTGTTTTGACTGATAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGAGAGGGCACTAAGTGTTTACGGGCTTCCAATTCGCTGGGAGGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGAGAGGGCACTAAGTGTTTACGGGCTTCCAATTCGCTGGGAGGCTGGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AACCTGTAAACGTGGGGGCCCAGTTGACAACAGAAACAGAAGTCCATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AACCTGTAAACGTGGGGGCCCAGTTGACAACAGAAACAGAAGTCCATATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CTTCAGGATGGGATAGCTCGGCTGGTGGGTGAGGGGGGCCATTTGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CTTCAGGATGGGATAGCTCGGCTGGTGGGTGAGGGGGGCCATTTGTTTCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CTATTACACAGTGGAAAACTCCCGTGTGTATCATCTGGAAGAACCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CTATTACACAGTGGAAAACTCCCGTGTGTATCATCTGGAAGAACCCAAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GCTTGGAAATATACCCCCAGCAAGCTGATGCCATGGAACTGTTGCTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GCTTGGAAATATACCCCCAGCAAGCTGATGCCATGGAACTGTTGCTTGGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TCTTATCCAGAGTTTGTGAGAGTGGGGGACCTGCCCTGTGACAGTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TCTTATCCAGAGTTTGTGAGAGTGGGGGACCTGCCCTGTGACAGTGTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGACCAGCTGTCCTTGGCAACCACGTTGTATGATAAGGGGCTGCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GGACCAGCTGTCCTTGGCAACCACGTTGTATGATAAGGGGCTGCTGCTCA

   1900     .    :    .    :
   1901 CTAAGATGCCTCTAGCCCTAAAT
        |||||||||||||||||||||||
 101901 CTAAGATGCCTCTAGCCCTAAAT