Result of SIM4 for
pF1KE3526
seq1 = pF1KE3526.tfa, 3108 bp
seq2 = pF1KE3526/gi568815589f_121657023.tfa (gi568815589f:121657023_121882401), 225379 bp
>pF1KE3526 3108
>gi568815589f:121657023_121882401 (Chr9)
1-144 (100001-100144) 100% ->
145-243 (101876-101974) 100% ->
244-798 (102863-103417) 100% ->
799-943 (106483-106627) 100% ->
944-1088 (106713-106857) 100% ->
1089-1325 (109472-109708) 100% ->
1326-1527 (111410-111611) 100% ->
1528-1706 (113524-113702) 100% ->
1707-2595 (115585-116473) 100% ->
2596-2748 (117238-117390) 100% ->
2749-2942 (119176-119369) 100% ->
2943-3030 (124442-124529) 100% ->
3031-3108 (125309-125388) 96%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAG
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100001 ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAG
50 . : . : . : . : . :
51 CAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCA
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100051 CAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCA
100 . : . : . : . : . :
101 AGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAG
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100101 AGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTG...
150 . : . : . : . : . :
145 GTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGC
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101873 CAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGC
200 . : . : . : . : . :
192 TGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACA
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101923 TGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACA
250 . : . : . : . : . :
242 AG GACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGG
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101973 AGGTA...CAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGG
300 . : . : . : . : . :
283 GTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCT
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102902 GTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCT
350 . : . : . : . : . :
333 GTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGG
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102952 GTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGG
400 . : . : . : . : . :
383 ACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTG
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103002 ACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTG
450 . : . : . : . : . :
433 CGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAA
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103052 CGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAA
500 . : . : . : . : . :
483 GGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGG
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103102 GGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGG
550 . : . : . : . : . :
533 CCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCC
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103152 CCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCC
600 . : . : . : . : . :
583 AAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103202 AAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCA
650 . : . : . : . : . :
633 AACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103252 AACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACA
700 . : . : . : . : . :
683 TCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103302 TCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGT
750 . : . : . : . : . :
733 GCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAG
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103352 GCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAG
800 . : . : . : . : . :
783 CACGGGCAAGGTGAAG GACTTCCTGACAGACCTGATGATGT
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
103402 CACGGGCAAGGTGAAGGTG...CAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGT
850 . : . : . : . : . :
824 CAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106508 CAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAAC
900 . : . : . : . : . :
874 ACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106558 ACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAA
950 . : . : . : . : . :
924 GTACCTGCAGGACGCCCTAG GTGAGTTCATCAAAGCGCTGT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
106608 GTACCTGCAGGACGCCCTAGGTA...TAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGT
1000 . : . : . : . : . :
965 ATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106734 ATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCT
1050 . : . : . : . : . :
1015 GACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106784 GACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTT
1100 . : . : . : . : . :
1065 CTGCAAGATCATCAACTCCTACTG TGTCTTCCCACGGGAGT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
106834 CTGCAAGATCATCAACTCCTACTGGTC...CAGTGTCTTCCCACGGGAGT
1150 . : . : . : . : . :
1106 TGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109489 TGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGC
1200 . : . : . : . : . :
1156 CCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109539 CCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCT
1250 . : . : . : . : . :
1206 CTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109589 CTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACC
1300 . : . : . : . : . :
1256 CTGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109639 CTGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAG
1350 . : . : . : . : . :
1306 AACCTGGCCAACTTTGCCAA ATTTGGCAGCAAGGAGGAATA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
109689 AACCTGGCCAACTTTGCCAAGTG...CAGATTTGGCAGCAAGGAGGAATA
1400 . : . : . : . : . :
1347 CATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGC
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111431 CATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGC
1450 . : . : . : . : . :
1397 GCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGC
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111481 GCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGC
1500 . : . : . : . : . :
1447 TTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACT
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111531 TTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACT
1550 . : . : . : . : . :
1497 GCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAG AGCATAGTAT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
111581 GCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGGTG...CAGAGCATAGTAT
1600 . : . : . : . : . :
1538 CCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113534 CCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTG
1650 . : . : . : . : . :
1588 AGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCAC
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113584 AGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCAC
1700 . : . : . : . : . :
1638 ACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGA
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113634 ACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGA
1750 . : . : . : . : . :
1688 TTGAGAACGATCTTTCCGG TCTGATAGATTTCACCCGGTTA
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113684 TTGAGAACGATCTTTCCGGGTA...CAGTCTGATAGATTTCACCCGGTTA
1800 . : . : . : . : . :
1729 CCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTC
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115607 CCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTC
1850 . : . : . : . : . :
1779 CGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACG
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115657 CGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACG
1900 . : . : . : . : . :
1829 AGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGAC
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115707 AGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGAC
1950 . : . : . : . : . :
1879 CTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCC
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115757 CTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCC
2000 . : . : . : . : . :
1929 CGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCG
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115807 CGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCG
2050 . : . : . : . : . :
1979 GGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115857 GGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTG
2100 . : . : . : . : . :
2029 CGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCC
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115907 CGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCC
2150 . : . : . : . : . :
2079 AGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115957 AGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACC
2200 . : . : . : . : . :
2129 AGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGC
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116007 AGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGC
2250 . : . : . : . : . :
2179 TCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116057 TCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGC
2300 . : . : . : . : . :
2229 GGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116107 GGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTC
2350 . : . : . : . : . :
2279 GGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116157 GGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGC
2400 . : . : . : . : . :
2329 GGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116207 GGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGAT
2450 . : . : . : . : . :
2379 CGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116257 CGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCC
2500 . : . : . : . : . :
2429 GGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116307 GGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGC
2550 . : . : . : . : . :
2479 GGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116357 GGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCT
2600 . : . : . : . : . :
2529 GAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116407 GAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCAC
2650 . : . : . : . : . :
2579 GGGCAGTGCACAAGCAG GGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAAT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
116457 GGGCAGTGCACAAGCAGGTC...TAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAAT
2700 . : . : . : . : . :
2620 GCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117262 GCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTT
2750 . : . : . : . : . :
2670 AGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117312 AGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGA
2800 . : . : . : . : . :
2720 GTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAG GACCTGGCGGTG
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
117362 GTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGTA...TAGGACCTGGCGGTG
2850 . : . : . : . : . :
2761 CTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119188 CTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGAC
2900 . : . : . : . : . :
2811 CCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119238 CCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACC
2950 . : . : . : . : . :
2861 AGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119288 AGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGAC
3000 . : . : . : . : . :
2911 AAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAG GTTGATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
119338 AAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTG...TAGGTTGATGTC
3050 . : . : . : . : . :
2952 CGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124451 CGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGG
3100 . : . : . : . : . :
3002 ACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAG GAGAAGCGCATT
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
124501 ACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGTG...CAGGAGAAGCGCATT
3150 . : . : . : . : . :
3043 GCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125321 GCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCT
3200 . : .
3093 GAAAGAGAG TA TGCAT
|||||||||-||- ||||
125371 GAAAGAGAGGTACAGCAT