seq1 = pF1KE3525.tfa, 747 bp
seq2 = pF1KE3525/gi568815591r_26093305.tfa (gi568815591r:26093305_26297734), 204430 bp

>pF1KE3525 747
>gi568815591r:26093305_26297734 (Chr7)

(complement)

1-117  (99997-100113)   98% ->
118-264  (100274-100420)   100% ->
265-475  (100718-100928)   100% ->
476-555  (101077-101157)   93% ->
556-678  (104041-104160)   97% ->
679-747  (104362-104430)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTATTGGTGGCTTAAG
         || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 TTGCAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTATTGGTGGCTTAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTTGAGGAACTACTACGAACAATGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 CTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTTGAGGAACTACTACGAACAATGGGGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTTACAGACTGTGTG         GTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100097 AGCTTACAGACTGTGTGGTA...AAGGTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGATCAAGAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAGGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100298 AGATCAAGAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAGGTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATTGATGGGAGAGTAGTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 TGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATTGATGGGAGAGTAGTTGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAAAACGTGCTGTAGCAAGAGAG         GAATCTGGAAAACCAGGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100398 CAAAACGTGCTGTAGCAAGAGAGGTA...TAGGAATCTGGAAAACCAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTCATGTAACTGTGAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100736 GCTCATGTAACTGTGAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATGGAAAAATTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100786 TGAGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATGGAAAAATTGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCATTGAGATAATTACTGATAGGCAGTCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100836 CCATTGAGATAATTACTGATAGGCAGTCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTGTTACTTTTGATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100886 TTTGTTACTTTTGATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTATGTA...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    476   TGCAGAAATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAGAAAGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101075 AGTGCAGAAATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAGAAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTTTGTCTAGACAAGAAATGCAGGAGGACCTG          GAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||| |  | |->>>...>>>--|-||||
 101125 CTTTGTCTAGACAAGAAATGCAGGAAGTTCAGAGTT...TAG  G TGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    564 AATTTTGGAGGTAGCCCCGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104046 AATTTTGGAGGTAGCCCCGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    614 TGGAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACGGAGGTGGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104096 TGGAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACGGAGGTGGTTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    664 ACAACTATGGAGGAG         GAAATTATGGAAGTGGAAATTACAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104146 ACAACTATGGAGGAGGTA...TAGGAAATTATGGAAGTGGAAATTACAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :
    705 GATTTTGGAAATTATAACCAGCAACCTTCTAACTACGGTCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104388 GATTTTGGAAATTATAACCAGCAACCTTCTAACTACGGTCCAA