seq1 = pF1KE3522.tfa, 2136 bp
seq2 = pF1KE3522/gi568815586r_95418157.tfa (gi568815586r:95418157_95634256), 216100 bp

>pF1KE3522 2136
>gi568815586r:95418157_95634256 (Chr12)

(complement)

1-1428  (100001-101428)   99% ->
1429-1624  (105255-105450)   100% ->
1625-1733  (109469-109577)   100% ->
1734-1939  (113055-113260)   99% ->
1940-2136  (115904-116100)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTAGCAATGGATACGTGCAAACATGTTGGGCAGCTGCAGCTTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTAGCAATGGATACGTGCAAACATGTTGGGCAGCTGCAGCTTGCTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACCATTCCAGCCTCAACCCTCAGAAATGGCACTGTGTGGACTGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGACCATTCCAGCCTCAACCCTCAGAAATGGCACTGTGTGGACTGCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGACCGAGTCCATTTGGGCTTGCCTTAGCTGCTCCCATGTTGCCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGACCGAGTCCATTTGGGCTTGCCTTAGCTGCTCCCATGTTGCCTGTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGATATATTGAAGAGCATGCACTCAAGCACTTTCAAGAAAGCAGTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGATATATTGAAGAGCATGCACTCAAGCACTTTCAAGAAAGCAGTCATCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTTGCATTGGAGGTGAATGAGATGTACGTTTTTTGTTACCTTTGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTTGCATTGGAGGTGAATGAGATGTACGTTTTTTGTTACCTTTGTGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTATGTTCTGAATGATAACGCAACTGGAGACCTGAAGTTACTACGACGT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTATGTTCTGAATGATAACACAACTGGAGACCTGAAGTTACTACGACGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACATTAAGTGCCATCAAAAGTCAAAATTATCACTGCACAACTCGTAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACATTAAGTGCCATCAAAAGTCAAAATTATCACTGCACAACTCGTAGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGGTTTTTACGGTCCATGGGTACAGGTGATGATTCTTATTTCTTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGGTTTTTACGGTCCATGGGTACAGGTGATGATTCTTATTTCTTACATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGGTGCCCAATCTCTGCTTCAAAGTGAAGATCAACTGTATACTGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGGTGCCCAATCTCTGCTTCAAAGTGAAGATCAACTGTATACTGCTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGGCACAGGAGAAGGATACTAATGGGTAAAATCTTTCGAACATGGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGGCACAGGAGAAGGATACTAATGGGTAAAATCTTTCGAACATGGTTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACAATCACCCATTGGAAGAAAAAAGCAAGAAGAACCATTTCAGGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACAATCACCCATTGGAAGAAAAAAGCAAGAAGAACCATTTCAGGAAAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAGTAGTAAAAAGAGAAGTAAAGAAAAGACGGCAGGAATTGGAGTATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAGTAGTAAAAAGAGAAGTAAAGAAAAGACGGCAGGAATTGGAGTATCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTTAAAGCAGAATTGGAAAGTATGCCTCCAAGAAAGAGTTTACGTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTTAAAGCAGAATTGGAAAGTATGCCTCCAAGAAAGAGTTTACGTTTACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGGGCTCGCTCAGTCGACCATAATAGAAATAGTTTCTGTTCAGGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGGCTCGCTCAGTCGACCATAATAGAAATAGTTTCTGTTCAGGTGCCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CACAAACGCCAGCATCACCAGCAAAAGATAAAGTACTCTCTACCTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CACAAACGCCAGCATCACCAGCAAAAGATAAAGTACTCTCTACCTCAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AATGAAATATCTCAAAAAGTCAGTGACTCCTCAGTTAAACGAAGGCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AATGAAATATCTCAAAAAGTCAGTGACTCCTCAGTTAAACGAAGGCCAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGTAACTCCTGGTGTAACAGGATTGAGAAATTTGGGAAATACTTGCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGTAACTCCTGGTGTAACAGGATTGAGAAATTTGGGAAATACTTGCTATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAATTCTGTTCTTCAGGTATTGAGTCATTTACTTATTTTTCGACAATGT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAATTCTGTTCTTCAGGTGTTGAGTCATTTACTTATTTTTCGACAATGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTTTTAAAGCTTGATCTGAACCAATGGCTGGCTATGACTGCTAGCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTTTTAAAGCTTGATCTGAACCAATGGCTGGCTATGACTGCTAGCGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GACAAGATCTTGTAAGCATCCACCAGTCACAGATACAGTAGTATATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GACAAGATCTTGTAAGCATCCACCAGTCACAGATACAGTAGTATATCAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGAATGAATGTCAGGAAAAAGATACAGGTTTTGTTTGCTCCAGACAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGAATGAATGTCAGGAAAAAGATACAGGTTTTGTTTGCTCCAGACAATCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGTCTGTCATCAGGACTAAGTGGTGGAGCATCAAAAGGTAGAAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGTCTGTCATCAGGACTAAGTGGTGGAGCATCAAAAGGTAGAAAGATGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ACTTATTCAGCCAAAGGAGCCAACTTCACAGTACATTTCTCTTTGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 ACTTATTCAGCCAAAGGAGCCAACTTCACAGTACATTTCTCTTTGTCATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AATTGCATACTTTGTTCCAAGTCATGTGGTCTGGAAAGTGGGCGTTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AATTGCATACTTTGTTCCAAGTCATGTGGTCTGGAAAGTGGGCGTTGGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TCACCATTTGCTATGCTACACTCAGTGTGGAGACTCATTCCTGCCTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TCACCATTTGCTATGCTACACTCAGTGTGGAGACTCATTCCTGCCTTTCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGGTTACGCCCAACAAGACGCTCAGGAATTTCTTTGTGAACTTTTAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGGTTACGCCCAACAAGACGCTCAGGAATTTCTTTGTGAACTTTTAGATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AAATACAACGTGAATTAGAGACAACTGGTACCAGTTTACCAGCTCTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AAATACAACGTGAATTAGAGACAACTGGTACCAGTTTACCAGCTCTTATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CCCACTTCTCAAAGGAAACTCATCAAACAAGTTCTGAATGTTGTAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCCACTTCTCAAAGGAAACTCATCAAACAAGTTCTGAATGTTGTAAATAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CATTTTTCATGGACAACTTCTTAGTCAG         GTTACATGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101401 CATTTTTCATGGACAACTTCTTAGTCAGGTA...CAGGTTACATGTCTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CATGTGACAACAAATCAAATACCATAGAACCTTTCTGGGACTTGTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105268 CATGTGACAACAAATCAAATACCATAGAACCTTTCTGGGACTTGTCATTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GAGTTTCCAGAAAGGTATCAATGCAGTGGAAAAGATATTGCTTCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105318 GAGTTTCCAGAAAGGTATCAATGCAGTGGAAAAGATATTGCTTCCCAGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 ATGTCTGGTTACTGAAATGTTGGCCAAATTTACAGAAACTGAAGCTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105368 ATGTCTGGTTACTGAAATGTTGGCCAAATTTACAGAAACTGAAGCTTTAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AAGGAAAAATCTACGTATGTGACCAGTGTAACT         CAAAGCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105418 AAGGAAAAATCTACGTATGTGACCAGTGTAACTGTG...CAGCAAAGCGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 AGAAGGTTTTCCTCCAAACCAGTTGTACTCACAGAAGCCCAGAAACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109477 AGAAGGTTTTCCTCCAAACCAGTTGTACTCACAGAAGCCCAGAAACAACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 TATGATATGCCACCTACCTCAGGTTCTCAGACTGCACCTCAAACGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109527 TATGATATGCCACCTACCTCAGGTTCTCAGACTGCACCTCAAACGATTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 G         GTGGTCAGGACGTAATAACCGAGAGAAGATTGGTGTTCAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109577 GGTC...CAGGTGGTCAGGACGTAATAACCGAGAGAAGATTGGTGTTCAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GTTGGCTTTGAGGAAATCTTAAACATGGAGCCCTATTGCTGCAGGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113095 GTTGGCTTTGAGGAAATCTTAAACATGGAGCCCTATTGCTGCAGGGAGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CCTGAAATCCCTCAGACCAGAATGCTTTATCTATGACTTGTCCGCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113145 CCTGAAATCCCTCAGACCAGAATGCTTTATCTATGACTTGTCCGCGGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 TGATGCACCATGGGAAAGGATTTGGATCAGGGCACTACACTGCCTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 113195 TGATGCACCATGGGAAAGGATTTGGCTCAGGGCACTACACTGCCTACTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 TATAATTCTGAAGGAG         GGTTCTGGGTACACTGCAATGATTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113245 TATAATTCTGAAGGAGGTA...TAGGGTTCTGGGTACACTGCAATGATTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 CAAACTAAGCATGTGCACTATGGACGAAGTATGCAAGGCTCAAGCTTATA
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 115929 CAAACTAAGCATGTGCACTATGGATGAAGTATGCAAGGCTCAAGCTTATA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 TCTTGTTTTATACCCAACGAGTTACTGAGAATGGACATTCTAAACTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115979 TCTTGTTTTATACCCAACGAGTTACTGAGAATGGACATTCTAAACTTTTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065 CCTCCAGAGCTCCTGTTGGGGAGCCAACATCCCAATGAAGACGCTGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116029 CCTCCAGAGCTCCTGTTGGGGAGCCAACATCCCAATGAAGACGCTGATAC

   2150     .    :    .    :
   2115 CTCGTCTAATGAAATCCTTAGC
        ||||||||||||||||||||||
 116079 CTCGTCTAATGAAATCCTTAGC