seq1 = pF1KE3520.tfa, 879 bp
seq2 = pF1KE3520/gi568815588f_99433132.tfa (gi568815588f:99433132_99635602), 202471 bp

>pF1KE3520 879
>gi568815588f:99433132_99635602 (Chr10)

1-358  (100001-100358)   100% ->
359-812  (101854-102307)   100% <-
813-879  (102405-102471)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTTACCAAGCCCGGTCACCTCCACCCCTTTCTCAGTCAAAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTTACCAAGCCCGGTCACCTCCACCCCTTTCTCAGTCAAAGACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGAATCTGGAGCAGCAGCACCAGCACTTCCATGGTGCGCACTTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGAATCTGGAGCAGCAGCACCAGCACTTCCATGGTGCGCACTTGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACTTGGAGCACCACTTCCACTCTGCGCCCTGCATGCTGGCCGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACTTGGAGCACCACTTCCACTCTGCGCCCTGCATGCTGGCCGCCGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGGGACGCAATTTTCTGACGGAGGGGAGGAGGACGAGGAAGACGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGGGACGCAATTTTCTGACGGAGGGGAGGAGGACGAGGAAGACGAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGAAATTGTCCTATTTGAACTCACTAGCCGCAGCAGACGGCCACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGAGAAATTGTCCTATTTGAACTCACTAGCCGCAGCAGACGGCCACGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTCAGGGCTGTGTCCCCAGGGCTATGTCCACACGGTCCTGCGAGACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTCAGGGCTGTGTCCCCAGGGCTATGTCCACACGGTCCTGCGAGACTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGCAGCGAGCCCAAGGAACATGAAGAGGAGCCCGAGGTCGTGAGGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGCAGCGAGCCCAAGGAACATGAAGAGGAGCCCGAGGTCGTGAGGGACCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGCCAAA         AAAGCTGCCAGCTGAAGAAGTCTCTAGAGACGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGCCAAAGTG...CAGAAAGCTGCCAGCTGAAGAAGTCTCTAGAGACGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCGGAGACTGCAAGGCGGCGGAGGAGAGCGAGAGGCCGAAGCCACGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101887 CCGGAGACTGCAAGGCGGCGGAGGAGAGCGAGAGGCCGAAGCCACGCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGCCGGAAGCCCCGGGTCCTCTTCTCGCAAGCCCAGGTCTTCGAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101937 CGCCGGAAGCCCCGGGTCCTCTTCTCGCAAGCCCAGGTCTTCGAGCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACGCAGGTTCAAGCAGCAGCGGTACCTGTCGGCACCCGAGCGCGAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101987 ACGCAGGTTCAAGCAGCAGCGGTACCTGTCGGCACCCGAGCGCGAGCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCGCCAGCAGCCTGAAGCTCACATCCACTCAGGTGAAAATCTGGTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102037 TCGCCAGCAGCCTGAAGCTCACATCCACTCAGGTGAAAATCTGGTTCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AATCGCAGGTACAAGTGCAAGAGACAGCGGCAGGACAAGTCTCTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102087 AATCGCAGGTACAAGTGCAAGAGACAGCGGCAGGACAAGTCTCTGGAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGGCGCACACGCGCCCCCGCCGCCGCCGCGCCGCGTGGCTGTCCCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102137 TGGCGCACACGCGCCCCCGCCGCCGCCGCGCCGCGTGGCTGTCCCGGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGGTGCGGGACGGCAAGCCGTGCGTCACGCCCAGCGCGCAGGCCTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102187 TGGTGCGGGACGGCAAGCCGTGCGTCACGCCCAGCGCGCAGGCCTACGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCGCCCTACAGCGTGGGCGCCAGCGCCTACTCCTACAACAGCTTCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102237 GCGCCCTACAGCGTGGGCGCCAGCGCCTACTCCTACAACAGCTTCCCCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CTACGGCTATGGGAACTCGGC         GGCGGGACCTCCGCGGCGAC
        |||||||||||||||||||||<<<...<<<||||||||||||||||||||
 102287 CTACGGCTATGGGAACTCGGCCGC...GGCGGCGGGACCTCCGCGGCGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    833 CACTGCCATGCAGCCCGCCTGCAGCGCGGCCGGAGGCGGCCCCTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102425 CACTGCCATGCAGCCCGCCTGCAGCGCGGCCGGAGGCGGCCCCTTTG