Result of SIM4 for
pF1KE3515
seq1 = pF1KE3515.tfa, 2904 bp
seq2 = pF1KE3515/gi568815594f_87907734.tfa (gi568815594f:87907734_88175691), 267958 bp
>pF1KE3515 2904
>gi568815594f:87907734_88175691 (Chr4)
1-595 (100001-100595) 100% ->
596-709 (111725-111838) 100% ->
710-843 (128487-128620) 100% ->
844-1094 (130518-130768) 100% ->
1095-1319 (135500-135724) 100% ->
1320-1548 (138909-139137) 100% ->
1549-1716 (144258-144425) 100% ->
1717-1898 (148353-148534) 100% ->
1899-2019 (150250-150370) 100% ->
2020-2118 (154173-154271) 100% ->
2119-2240 (157641-157762) 100% ->
2241-2358 (158029-158146) 100% ->
2359-2522 (160165-160328) 100% ->
2523-2670 (167079-167226) 100% ->
2671-2904 (167725-167958) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGTGAACTCCAGTCGCGTGCAGCCTCAGCAGCCCGGGGACGCCAAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGTGAACTCCAGTCGCGTGCAGCCTCAGCAGCCCGGGGACGCCAAGCG
50 . : . : . : . : . :
51 GCCGCCCGCGCCCCGCGCGCCGGACCCGGGCCGGCTGATGGCTGGCTGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCCGCCCGCGCCCCGCGCGCCGGACCCGGGCCGGCTGATGGCTGGCTGCG
100 . : . : . : . : . :
101 CGGCCGTGGGCGCCAGCCTCGCCGCCCCGGGCGGCCTCTGCGAGCAGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CGGCCGTGGGCGCCAGCCTCGCCGCCCCGGGCGGCCTCTGCGAGCAGCGG
150 . : . : . : . : . :
151 GGCCTGGAGATCGAGATGCAGCGCATCCGGCAGGCGGCCGCGCGGGACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GGCCTGGAGATCGAGATGCAGCGCATCCGGCAGGCGGCCGCGCGGGACCC
200 . : . : . : . : . :
201 CCCGGCCGGAGCCGCGGCCTCCCCTTCTCCTCCGCTCTCGTCGTGCTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CCCGGCCGGAGCCGCGGCCTCCCCTTCTCCTCCGCTCTCGTCGTGCTCCC
250 . : . : . : . : . :
251 GGCAGGCGTGGAGCCGCGATAACCCCGGCTTCGAGGCCGAGGAGGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GGCAGGCGTGGAGCCGCGATAACCCCGGCTTCGAGGCCGAGGAGGAGGAG
300 . : . : . : . : . :
301 GAGGAGGTGGAAGGGGAAGAAGGCGGAATGGTGGTGGAGATGGACGTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GAGGAGGTGGAAGGGGAAGAAGGCGGAATGGTGGTGGAGATGGACGTAGA
350 . : . : . : . : . :
351 GTGGCGCCCGGGCAGCCGGAGGTCGGCCGCCTCCTCGGCCGTGAGCTCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 GTGGCGCCCGGGCAGCCGGAGGTCGGCCGCCTCCTCGGCCGTGAGCTCCG
400 . : . : . : . : . :
401 TGGGCGCGCGGAGCCGGGGGCTTGGGGGCTACCACGGCGCGGGCCACCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 TGGGCGCGCGGAGCCGGGGGCTTGGGGGCTACCACGGCGCGGGCCACCCG
450 . : . : . : . : . :
451 AGCGGGAGGCGGCGCCGGCGAGAGGACCAGGGCCCGCCGTGCCCCAGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 AGCGGGAGGCGGCGCCGGCGAGAGGACCAGGGCCCGCCGTGCCCCAGCCC
500 . : . : . : . : . :
501 AGTCGGCGGCGGGGACCCGCTGCATCGCCACCTCCCCCTGGAAGGGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 AGTCGGCGGCGGGGACCCGCTGCATCGCCACCTCCCCCTGGAAGGGCAGC
550 . : . : . : . : . :
551 CGCCCCGAGTGGCCTGGGCGGAGAGGCTGGTTCGCGGGCTGCGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
100551 CGCCCCGAGTGGCCTGGGCGGAGAGGCTGGTTCGCGGGCTGCGAGGTA..
600 . : . : . : . : . :
596 GTCTCTGGGGAACAAGACTCATGGAGGAAAGCAGCACTAACCGAGA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 .AAGGTCTCTGGGGAACAAGACTCATGGAGGAAAGCAGCACTAACCGAGA
650 . : . : . : . : . :
642 GAAATACCTTAAAAGTGTTTTACGGGAACTGGTCACATACCTCCTTTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111771 GAAATACCTTAAAAGTGTTTTACGGGAACTGGTCACATACCTCCTTTTTC
700 . : . : . : . : . :
692 TCATAGTCTTGTGCATCT TGACCTACGGCATGATGAGCTCC
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
111821 TCATAGTCTTGTGCATCTGTA...CAGTGACCTACGGCATGATGAGCTCC
750 . : . : . : . : . :
733 AATGTGTACTACTACACCCGGATGATGTCACAGCTCTTCCTAGACACCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128510 AATGTGTACTACTACACCCGGATGATGTCACAGCTCTTCCTAGACACCCC
800 . : . : . : . : . :
783 CGTGTCCAAAACGGAGAAAACTAACTTTAAAACTCTGTCTTCCATGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128560 CGTGTCCAAAACGGAGAAAACTAACTTTAAAACTCTGTCTTCCATGGAAG
850 . : . : . : . : . :
833 ACTTCTGGAAG TTCACAGAAGGCTCCTTATTGGATGGGCTG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
128610 ACTTCTGGAAGGTA...TAGTTCACAGAAGGCTCCTTATTGGATGGGCTG
900 . : . : . : . : . :
874 TACTGGAAGATGCAGCCCAGCAACCAGACTGAAGCTGACAACCGAAGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130548 TACTGGAAGATGCAGCCCAGCAACCAGACTGAAGCTGACAACCGAAGTTT
950 . : . : . : . : . :
924 CATCTTCTATGAGAACCTGCTGTTAGGGGTTCCACGAATACGGCAACTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130598 CATCTTCTATGAGAACCTGCTGTTAGGGGTTCCACGAATACGGCAACTCC
1000 . : . : . : . : . :
974 GAGTCAGAAATGGATCCTGCTCTATCCCCCAGGACTTGAGAGATGAAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130648 GAGTCAGAAATGGATCCTGCTCTATCCCCCAGGACTTGAGAGATGAAATT
1050 . : . : . : . : . :
1024 AAAGAGTGCTATGATGTCTACTCTGTCAGTAGTGAAGATAGGGCTCCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130698 AAAGAGTGCTATGATGTCTACTCTGTCAGTAGTGAAGATAGGGCTCCCTT
1100 . : . : . : . : . :
1074 TGGGCCCCGAAATGGAACCGC TTGGATCTACACAAGTGAAA
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
130748 TGGGCCCCGAAATGGAACCGCGTA...CAGTTGGATCTACACAAGTGAAA
1150 . : . : . : . : . :
1115 AAGACTTGAATGGTAGTAGCCACTGGGGAATCATTGCAACTTATAGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135520 AAGACTTGAATGGTAGTAGCCACTGGGGAATCATTGCAACTTATAGTGGA
1200 . : . : . : . : . :
1165 GCTGGCTATTATCTGGATTTGTCAAGAACAAGAGAGGAAACAGCTGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135570 GCTGGCTATTATCTGGATTTGTCAAGAACAAGAGAGGAAACAGCTGCACA
1250 . : . : . : . : . :
1215 AGTTGCTAGCCTCAAGAAAAATGTCTGGCTGGACCGAGGAACCAGGGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135620 AGTTGCTAGCCTCAAGAAAAATGTCTGGCTGGACCGAGGAACCAGGGCAA
1300 . : . : . : . : . :
1265 CTTTTATTGACTTCTCAGTGTACAACGCCAACATTAACCTGTTCTGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135670 CTTTTATTGACTTCTCAGTGTACAACGCCAACATTAACCTGTTCTGTGTG
1350 . : . : . : . : . :
1315 GTCAG GTTATTGGTTGAATTCCCAGCAACAGGTGGTGTGAT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135720 GTCAGGTG...CAGGTTATTGGTTGAATTCCCAGCAACAGGTGGTGTGAT
1400 . : . : . : . : . :
1356 TCCATCTTGGCAATTTCAGCCTTTAAAGCTGATCCGATATGTCACAACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138945 TCCATCTTGGCAATTTCAGCCTTTAAAGCTGATCCGATATGTCACAACTT
1450 . : . : . : . : . :
1406 TTGATTTCTTCCTGGCAGCCTGTGAGATTATCTTTTGTTTCTTTATCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138995 TTGATTTCTTCCTGGCAGCCTGTGAGATTATCTTTTGTTTCTTTATCTTT
1500 . : . : . : . : . :
1456 TACTATGTGGTGGAAGAGATATTGGAAATTCGCATTCACAAACTACACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139045 TACTATGTGGTGGAAGAGATATTGGAAATTCGCATTCACAAACTACACTA
1550 . : . : . : . : . :
1506 TTTCAGGAGTTTCTGGAATTGTCTGGATGTTGTGATCGTTGTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
139095 TTTCAGGAGTTTCTGGAATTGTCTGGATGTTGTGATCGTTGTGGTA...C
1600 . : . : . : . : . :
1549 CTGTCAGTGGTAGCTATAGGAATTAACATATACAGAACATCAAATGTG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144256 AGCTGTCAGTGGTAGCTATAGGAATTAACATATACAGAACATCAAATGTG
1650 . : . : . : . : . :
1597 GAGGTGCTACTACAGTTTCTGGAAGATCAAAATACTTTCCCCAACTTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144306 GAGGTGCTACTACAGTTTCTGGAAGATCAAAATACTTTCCCCAACTTTGA
1700 . : . : . : . : . :
1647 GCATCTGGCATATTGGCAGATACAGTTCAACAATATAGCTGCTGTCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144356 GCATCTGGCATATTGGCAGATACAGTTCAACAATATAGCTGCTGTCACAG
1750 . : . : . : . : . :
1697 TATTTTTTGTCTGGATTAAG CTCTTCAAATTCATCAATTTT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
144406 TATTTTTTGTCTGGATTAAGGTA...CAGCTCTTCAAATTCATCAATTTT
1800 . : . : . : . : . :
1738 AACAGGACCATGAGCCAGCTCTCGACAACCATGTCTCGATGTGCCAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148374 AACAGGACCATGAGCCAGCTCTCGACAACCATGTCTCGATGTGCCAAAGA
1850 . : . : . : . : . :
1788 CCTGTTTGGCTTTGCTATTATGTTCTTCATTATTTTCCTAGCGTATGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148424 CCTGTTTGGCTTTGCTATTATGTTCTTCATTATTTTCCTAGCGTATGCTC
1900 . : . : . : . : . :
1838 AGTTGGCATACCTTGTCTTTGGCACTCAGGTCGATGACTTCAGTACTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148474 AGTTGGCATACCTTGTCTTTGGCACTCAGGTCGATGACTTCAGTACTTTC
1950 . : . : . : . : . :
1888 CAAGAGTGTAT CTTCACTCAATTCCGTATCATTTTGGGCGA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
148524 CAAGAGTGTATGTA...TAGCTTCACTCAATTCCGTATCATTTTGGGCGA
2000 . : . : . : . : . :
1929 TATCAACTTTGCAGAGATTGAGGAAGCTAATCGAGTTTTGGGACCAATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150280 TATCAACTTTGCAGAGATTGAGGAAGCTAATCGAGTTTTGGGACCAATTT
2050 . : . : . : . : . :
1979 ATTTCACTACATTTGTGTTCTTTATGTTCTTCATTCTTTTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
150330 ATTTCACTACATTTGTGTTCTTTATGTTCTTCATTCTTTTGGTA...CAG
2100 . : . : . : . : . :
2020 AATATGTTTTTGGCTATCATCAATGATACTTACTCTGAAGTGAAATCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154173 AATATGTTTTTGGCTATCATCAATGATACTTACTCTGAAGTGAAATCTGA
2150 . : . : . : . : . :
2070 CTTGGCACAGCAGAAAGCTGAAATGGAACTCTCAGATCTTATCAGAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
154223 CTTGGCACAGCAGAAAGCTGAAATGGAACTCTCAGATCTTATCAGAAAGG
2200 . : . : . : . : . :
2119 GGCTACCATAAAGCTTTGGTCAAACTAAAACTGAAAAAAAAT
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154273 TA...TAGGGCTACCATAAAGCTTTGGTCAAACTAAAACTGAAAAAAAAT
2250 . : . : . : . : . :
2161 ACCGTGGATGACATTTCAGAGAGTCTGCGGCAAGGAGGAGGCAAGTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157683 ACCGTGGATGACATTTCAGAGAGTCTGCGGCAAGGAGGAGGCAAGTTAAA
2300 . : . : . : . : . :
2211 CTTTGACGAACTTCGACAAGATCTCAAAGG GAAGGGCCATA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
157733 CTTTGACGAACTTCGACAAGATCTCAAAGGGTG...CAGGAAGGGCCATA
2350 . : . : . : . : . :
2252 CTGATGCAGAGATTGAGGCAATATTCACAAAGTACGACCAAGATGGAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158040 CTGATGCAGAGATTGAGGCAATATTCACAAAGTACGACCAAGATGGAGAC
2400 . : . : . : . : . :
2302 CAAGAACTGACCGAACATGAACATCAGCAGATGAGAGACGACTTGGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158090 CAAGAACTGACCGAACATGAACATCAGCAGATGAGAGACGACTTGGAGAA
2450 . : . : . : . : . :
2352 AGAGAGG GAGGACCTGGATTTGGATCACAGTTCTTTACCAC
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
158140 AGAGAGGGTG...CAGGAGGACCTGGATTTGGATCACAGTTCTTTACCAC
2500 . : . : . : . : . :
2393 GTCCCATGAGCAGCCGAAGTTTCCCTCGAAGCCTGGATGACTCTGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160199 GTCCCATGAGCAGCCGAAGTTTCCCTCGAAGCCTGGATGACTCTGAGGAG
2550 . : . : . : . : . :
2443 GATGACGATGAAGATAGCGGACATAGCTCCAGAAGGAGGGGAAGCATTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160249 GATGACGATGAAGATAGCGGACATAGCTCCAGAAGGAGGGGAAGCATTTC
2600 . : . : . : . : . :
2493 TAGTGGCGTTTCTTACGAAGAGTTTCAAGT CCTGGTGAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
160299 TAGTGGCGTTTCTTACGAAGAGTTTCAAGTGTA...CAGCCTGGTGAGAC
2650 . : . : . : . : . :
2534 GAGTGGACCGGATGGAGCATTCCATCGGCAGCATAGTGTCCAAGATTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167090 GAGTGGACCGGATGGAGCATTCCATCGGCAGCATAGTGTCCAAGATTGAC
2700 . : . : . : . : . :
2584 GCCGTGATCGTGAAGCTAGAGATTATGGAGCGAGCCAAACTGAAGAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167140 GCCGTGATCGTGAAGCTAGAGATTATGGAGCGAGCCAAACTGAAGAGGAG
2750 . : . : . : . : . :
2634 GGAGGTGCTGGGAAGGCTGTTGGATGGGGTGGCCGAG GATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
167190 GGAGGTGCTGGGAAGGCTGTTGGATGGGGTGGCCGAGGTC...TAGGATG
2800 . : . : . : . : . :
2675 AAAGGCTGGGTCGTGACAGTGAAATCCATAGGGAACAGATGGAACGGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167729 AAAGGCTGGGTCGTGACAGTGAAATCCATAGGGAACAGATGGAACGGCTA
2850 . : . : . : . : . :
2725 GTACGTGAAGAGTTGGAACGCTGGGAATCCGATGATGCAGCTTCCCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167779 GTACGTGAAGAGTTGGAACGCTGGGAATCCGATGATGCAGCTTCCCAGAT
2900 . : . : . : . : . :
2775 CAGTCATGGTTTAGGCACGCCAGTGGGACTAAATGGTCAACCTCGCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167829 CAGTCATGGTTTAGGCACGCCAGTGGGACTAAATGGTCAACCTCGCCCCA
2950 . : . : . : . : . :
2825 GAAGCTCCCGCCCATCTTCCTCCCAATCTACAGAAGGCATGGAAGGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167879 GAAGCTCCCGCCCATCTTCCTCCCAATCTACAGAAGGCATGGAAGGTGCA
3000 . : . : . :
2875 GGTGGAAATGGGAGTTCTAATGTCCACGTA
||||||||||||||||||||||||||||||
167929 GGTGGAAATGGGAGTTCTAATGTCCACGTA