seq1 = pF1KE3511.tfa, 1191 bp
seq2 = pF1KE3511/gi568815583r_43673119.tfa (gi568815583r:43673119_43876901), 203783 bp

>pF1KE3511 1191
>gi568815583r:43673119_43876901 (Chr15)

(complement)

1-132  (100001-100132)   100% ->
133-168  (100358-100393)   100% ->
169-281  (100751-100863)   100% ->
282-483  (100979-101180)   100% ->
484-569  (101292-101377)   100% ->
570-645  (101521-101596)   100% ->
646-823  (102129-102306)   100% ->
824-866  (102384-102426)   100% ->
867-1038  (102549-102720)   100% ->
1039-1083  (103554-103598)   100% ->
1084-1191  (103676-103783)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGCTCCAGGAGCCTCTGAGAGGACAGCTCCGGCTCTGCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGCTCCAGGAGCCTCTGAGAGGACAGCTCCGGCTCTGCTTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAAGCTGCCCGGACTAGCCTCTTACTGCTCAGGCTCAACGACGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAAGCTGCCCGGACTAGCCTCTTACTGCTCAGGCTCAACGACGCTGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCGGGCGCTGCAAGAGTGTCAGCGGCAACAG         GTACGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100101 TGCGGGCGCTGCAAGAGTGTCAGCGGCAACAGGTA...CAGGTACGGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGATTGCTTTCCAAGGCCACCGAGGG         TATCTGAGACTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100367 GTGATTGCTTTCCAAGGCCACCGAGGGGTA...CAGTATCTGAGACTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGGCCCTGGTTGGTCCTGCCTCTTCTCCTTCATAGTGTCCCAGTGTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100765 AGGCCCTGGTTGGTCCTGCCTCTTCTCCTTCATAGTGTCCCAGTGTTGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGAGGGCGCTGGTGGTAGCTTGGACCTTGTGTGCCAACGCTTCCTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100815 AGGAGGGCGCTGGTGGTAGCTTGGACCTTGTGTGCCAACGCTTCCTCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282         GTCTGGGCCTAACAGCCTCCACTGCCTGGGCTCACTCAGGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100865 TG...CAGGTCTGGGCCTAACAGCCTCCACTGCCTGGGCTCACTCAGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGCCTCATTATTTGGGCAGCCATGGATTCTATCCCAGCCCCATCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101021 GCGCCTCATTATTTGGGCAGCCATGGATTCTATCCCAGCCCCATCATCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCAGGGACACAACCTGACTGAAGATGCCAGACATCCTGAGAGTTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101071 TTCAGGGACACAACCTGACTGAAGATGCCAGACATCCTGAGAGTTGGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACACAGGAGGCTATTCTGAAGGAGATGCAGTATCACAGCCACAGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101121 AACACAGGAGGCTATTCTGAAGGAGATGCAGTATCACAGCCACAGATGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACTAGAGGAG         GTGTCAGTGTCAGATCCACTGGCAAGCAACC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101171 ACTAGAGGAGGTG...CAGGTGTCAGTGTCAGATCCACTGGCAAGCAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGGACAGTCACTCCCAGGATCCTCAAGGGAGCACATGGCACAGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101323 AAGGACAGTCACTCCCAGGATCCTCAAGGGAGCACATGGCACAGTGGGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGAG         AAGCCAGACCCATGTTCCAAACAGAGAACCTGTTCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101373 GTGAGGTA...TAGAAGCCAGACCCATGTTCCAAACAGAGAACCTGTTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGCACTGCCTTCCTCTGCCAGCCGGAAACGTCTGGACAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101557 GGCACTGCCTTCCTCTGCCAGCCGGAAACGTCTGGACAAGGTA...CAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AACGTTCAGTGCCTGTAGCCACTGTAGAACTGGAAGAAAAGAGGTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102130 AACGTTCAGTGCCTGTAGCCACTGTAGAACTGGAAGAAAAGAGGTTCAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACTCTGCCTTTAGTGCCAAGCCCCCTACAAGGCCTGACCAATCAGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102180 ACTCTGCCTTTAGTGCCAAGCCCCCTACAAGGCCTGACCAATCAGGATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACAAGAGGGAGAAGATTGGGAGCAAGAAGATGAGGACATGGACCCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102230 ACAAGAGGGAGAAGATTGGGAGCAAGAAGATGAGGACATGGACCCCAGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TAGAACACAGTTCCTCAGTTCAAGAAG         ATTCTGAATCCCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102280 TAGAACACAGTTCCTCAGTTCAAGAAGGTG...TAGATTCTGAATCCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGTCCTGAAGATATACCAGACTACCTCCT         GCAATACAGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102398 AGTCCTGAAGATATACCAGACTACCTCCTGTG...CAGGCAATACAGGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CATCCACAGTGCAGAACAGCAACATGCCTATGAGCAGGACTTTGAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102561 CATCCACAGTGCAGAACAGCAACATGCCTATGAGCAGGACTTTGAGACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATTATGCTGAATACCGCATCCTGCATGCCCGTGTTGGGACTGCAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102611 ATTATGCTGAATACCGCATCCTGCATGCCCGTGTTGGGACTGCAAGCCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGGTTCATAGAGCTGGGAGCAGAGATTAAAAGAGTTCGGCGAGGAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102661 AGGTTCATAGAGCTGGGAGCAGAGATTAAAAGAGTTCGGCGAGGAACTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AGAATACAAG         GTCCTGGAAGACAAGATAATCCAGGAATATA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102711 AGAATACAAGGTA...CAGGTCCTGGAAGACAAGATAATCCAGGAATATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AAAAGTTCAGGAAG         CAGTACCCAAGTTACAGAGAAGAAAAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103585 AAAAGTTCAGGAAGGTA...CAGCAGTACCCAAGTTACAGAGAAGAAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CGTCGCTGTGAGTACCTTCACCAGAAATTGTCCCACATTAAAGGTCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103703 CGTCGCTGTGAGTACCTTCACCAGAAATTGTCCCACATTAAAGGTCTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :
   1161 CCTGGAGTTTGAGGAAAAGAACAGGGGCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 103753 CCTGGAGTTTGAGGAAAAGAACAGGGGCAGC