Result of SIM4 for
pF1KE3501
seq1 = pF1KE3501.tfa, 3666 bp
seq2 = pF1KE3501/gi568815590r_66534504.tfa (gi568815590r:66534504_66766917), 232414 bp
>pF1KE3501 3666
>gi568815590r:66534504_66766917 (Chr8)
(complement)
1-2710 (99960-102669) 99% ->
2711-2797 (115374-115460) 100% ->
2798-3666 (131546-132414) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCTCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGTTGCCGCCGCCACCTCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
99960 ATGTCTCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGTTGCCGCCGCCACCTCCTCC
50 . : . : . : . : . :
51 CCCTGAGGCTCCACAGACTCCGTCGTCCTTGGCGTCGGCGGCTGCTTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100010 CCCTGAGGCTCCACAGACTCCGTCGTCCTTGGCGTCGGCGGCTGCTTCGG
100 . : . : . : . : . :
101 GGGGGCTTTTGAAGCGGAGAGACCGGAGAATCCTTTCCGGGAGCTGCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100060 GGGGGCTTTTGAAGCGGAGAGACCGGAGAATCCTTTCCGGGAGCTGCCCG
150 . : . : . : . : . :
151 GATCCGAAGTGTCAGGCGCGTCTATTTTTCCCGGCCTCCGGTTCTGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100110 GATCCGAAGTGTCAGGCGCGTCTATTTTTCCCGGCCTCCGGTTCTGTCAG
200 . : . : . : . : . :
201 CATCGAGTGTACCGAGTGCGGCCAGCGGCACGAGCAGCAACAGCTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100160 CATCGAGTGTACCGAGTGCGGCCAGCGGCACGAGCAGCAACAGCTGCTGG
250 . : . : . : . : . :
251 GGGTTGAGGAGGTGACCGACCCGGACGTAGTGCTACACAACCTGCTGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100210 GGGTTGAGGAGGTGACCGACCCGGACGTAGTGCTACACAACCTGCTGCGG
300 . : . : . : . : . :
301 AACGCGCTGCTCGGGGTTACGGGGGCACCCAAGAAGAACACGGAACTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100260 AACGCGCTGCTCGGGGTTACGGGGGCACCCAAGAAGAACACGGAACTGGT
350 . : . : . : . : . :
351 AAAGGTGATGGGCCTTTCCAACTATCACTGCAAATTGTTGTCGCCCATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100310 AAAGGTGATGGGCCTTTCCAACTATCACTGCAAATTGTTGTCGCCCATAT
400 . : . : . : . : . :
401 TAGCTCGCTATGGAATGGACAAACAGACAGGCCGGGCCAAGCTTCTCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100360 TAGCTCGCTATGGAATGGACAAACAGACAGGCCGGGCCAAGCTTCTCCGG
450 . : . : . : . : . :
451 GACATGAACCAGGGCGAACTGTTCGATTGCGCCTTACTGGGTGACCGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100410 GACATGAACCAGGGCGAACTGTTCGATTGCGCCTTACTGGGTGACCGCGC
500 . : . : . : . : . :
501 CTTCCCCATAGAACCAGAGCATGTTAACACTGTGGGCTATGGCAAGGACC
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100460 CTTCCTCATAGAACCAGAGCATGTTAACACTGTGGGCTATGGCAAGGACC
550 . : . : . : . : . :
551 GCTCCGGAAGCCTCCTGTATTTGCATGACACTCTGGAGGACATTAAGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100510 GCTCCGGAAGCCTCCTGTATTTGCATGACACTCTGGAGGACATTAAGCGG
600 . : . : . : . : . :
601 GCCAATAAAAGCCAGGAATGTCTCATTCCAGTGCATGTGGACGGGGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100560 GCCAATAAAAGCCAGGAATGTCTCATTCCAGTGCATGTGGACGGGGATGG
650 . : . : . : . : . :
651 ACACTGCTTGGTGCATGCTGTGTCTCGGGCTCTAGTAGGCCGAGAGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100610 ACACTGCTTGGTGCATGCTGTGTCTCGGGCTCTAGTAGGCCGAGAGCTCT
700 . : . : . : . : . :
701 TCTGGCATGCCTTAAGAGAGAATCTTAAACAGCACTTTCAGCAGCACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100660 TCTGGCATGCCTTAAGAGAGAATCTTAAACAGCACTTTCAGCAGCACCTG
750 . : . : . : . : . :
751 GCCCGATATCAAGCTCTGTTCCATGACTTCATTGATGCTGCTGAGTGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100710 GCCCGATATCAAGCTCTGTTCCATGACTTCATTGATGCTGCTGAGTGGGA
800 . : . : . : . : . :
801 GGACATTATCAATGAGTGTGACCCTCTGTTTGTACCACCTGAGGGTGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100760 GGACATTATCAATGAGTGTGACCCTCTGTTTGTACCACCTGAGGGTGTTC
850 . : . : . : . : . :
851 CCTTGGGCCTGAGGAATATCCACATATTTGGTCTTGCCAATGTGCTACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100810 CCTTGGGCCTGAGGAATATCCACATATTTGGTCTTGCCAATGTGCTACAT
900 . : . : . : . : . :
901 CGTCCTATTATTCTGTTAGATTCCCTCAGTGGCATGAGAAGCTCTGGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100860 CGTCCTATTATTCTGTTAGATTCCCTCAGTGGCATGAGAAGCTCTGGTGA
950 . : . : . : . : . :
951 TTATTCAGCCACCTTTCTACCTGGGCTCATCCCTGCAGAGAAGTGCACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100910 TTATTCAGCCACCTTTCTACCTGGGCTCATCCCTGCAGAGAAGTGCACTG
1000 . : . : . : . : . :
1001 GGAAAGATGGTCATTTGAACAAACCAATCTGTATTGCATGGAGCAGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100960 GGAAAGATGGTCATTTGAACAAACCAATCTGTATTGCATGGAGCAGCTCC
1050 . : . : . : . : . :
1051 GGTAGAAACCATTATATCCCCTTGGTAGGCATAAAAGGGGCTGCTTTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101010 GGTAGAAACCATTATATCCCCTTGGTAGGCATAAAAGGGGCTGCTTTGCC
1100 . : . : . : . : . :
1101 CAAACTGCCTATGAATTTGCTTCCTAAAGCATGGGGTGTGCCTCAGGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101060 CAAACTGCCTATGAATTTGCTTCCTAAAGCATGGGGTGTGCCTCAGGACC
1150 . : . : . : . : . :
1151 TTATTAAAAAGTACATAAAACTTGAAGAGGATGGTGGTTGTGTTATTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101110 TTATTAAAAAGTACATAAAACTTGAAGAGGATGGTGGTTGTGTTATTGGA
1200 . : . : . : . : . :
1201 GGTGACAGAAGTTTGCAAGATAAATACTTACTTAGGCTTGTTGCTGCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101160 GGTGACAGAAGTTTGCAAGATAAATACTTACTTAGGCTTGTTGCTGCTAT
1250 . : . : . : . : . :
1251 GGAAGAAGTCTTTATGGACAAACATGGTATCCATCCTAGTTTGGTTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101210 GGAAGAAGTCTTTATGGACAAACATGGTATCCATCCTAGTTTGGTTGCTG
1300 . : . : . : . : . :
1301 ATGTCCATCGGTATTTCTACAGAAGGACTGGAGTGATAGGAGTTCAGCCT
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101260 ATGTCCATCAGTATTTCTACAGAAGGACTGGAGTGATAGGAGTTCAGCCT
1350 . : . : . : . : . :
1351 GAGGAAGTCACAGCAGCTGCTAAAAAAGCAGTAATGGATAATCGCCTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101310 GAGGAAGTCACAGCAGCTGCTAAAAAAGCAGTAATGGATAATCGCCTTCA
1400 . : . : . : . : . :
1401 CAAATGTTTGCTCTGTGGTGCCCTTTCTGAACTTCATGTTCCTCCAGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101360 CAAATGTTTGCTCTGTGGTGCCCTTTCTGAACTTCATGTTCCTCCAGAGT
1450 . : . : . : . : . :
1451 GGTTGGCTCCTGGAGGGAAATTGTATAACCTGGCAAAAAGTACTCATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101410 GGTTGGCTCCTGGAGGGAAATTGTATAACCTGGCAAAAAGTACTCATGGA
1500 . : . : . : . : . :
1501 CAGCTGAGGACTGACAAAAATTACAGCTTTCCCTTGAACAATTTGGTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101460 CAGCTGAGGACTGACAAAAATTACAGCTTTCCCTTGAACAATTTGGTTTG
1550 . : . : . : . : . :
1551 CTCATATGATTCAGTGAAAGATGTTCTGGTACCAGACTATGGAATGAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101510 CTCATATGATTCAGTGAAAGATGTTCTGGTACCAGACTATGGAATGAGTA
1600 . : . : . : . : . :
1601 ACCTAACAGCTTGTAATTGGTGCCATGGCACATCTGTGCGAAAGGTCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101560 ACCTAACAGCTTGTAATTGGTGCCATGGCACATCTGTGCGAAAGGTCAGA
1650 . : . : . : . : . :
1651 GGAGATGGGTCTATTGTGTATTTGGATGGAGACAGAACTAATTCTAGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101610 GGAGATGGGTCTATTGTGTATTTGGATGGAGACAGAACTAATTCTAGGTC
1700 . : . : . : . : . :
1701 CACTGGTGGCAAATGTGGTTGTGGATTCAAACACTTTTGGGATGGTAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101660 CACTGGTGGCAAATGTGGTTGTGGATTCAAACACTTTTGGGATGGTAAGG
1750 . : . : . : . : . :
1751 AGTATGACAATCTACCAGAAGCTTTCCCTATTACTTTAGAATGGGGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101710 AGTATGACAATCTACCAGAAGCTTTCCCTATTACTTTAGAATGGGGTGGA
1800 . : . : . : . : . :
1801 AGAGTGGTCAGAGAAACAGTATATTGGTTCCAGTATGAAAGTGATTCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101760 AGAGTGGTCAGAGAAACAGTATATTGGTTCCAGTATGAAAGTGATTCATC
1850 . : . : . : . : . :
1851 TTTGAATAGTAATGTTTACGATGTTGCAATGAAACTTGTTACCAAGCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101810 TTTGAATAGTAATGTTTACGATGTTGCAATGAAACTTGTTACCAAGCACT
1900 . : . : . : . : . :
1901 TTCCAGGTGAATTTGGGAGTGAAATCCTAGTTCAGAAAGTTGTCCACACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101860 TTCCAGGTGAATTTGGGAGTGAAATCCTAGTTCAGAAAGTTGTCCACACT
1950 . : . : . : . : . :
1951 ATATTGCATCAGACTGCCAAAAAGAATCCCGATGATTATACTCCTGTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101910 ATATTGCATCAGACTGCCAAAAAGAATCCCGATGATTATACTCCTGTAAA
2000 . : . : . : . : . :
2001 TATAGATGGTGCTCATGCCCAAAGAGTTGGAGATGTTCAAGGACAAGAAT
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
101960 TATAGATGGTGCTCACGCCCAAAGAGTTGGAGATGTTCAAGGACAAGAAT
2050 . : . : . : . : . :
2051 CAGAGTCTCAGCTCCCAACTAAAATTATTCTTACTGGACAGAAAACAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102010 CAGAGTCTCAGCTCCCAACTAAAATTATTCTTACTGGACAGAAAACAAAA
2100 . : . : . : . : . :
2101 ACTTTGCACAAGGAGGAGTTAAACATGAGTAAAACTGAAAGAACTATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102060 ACTTTGCACAAGGAGGAGTTAAACATGAGTAAAACTGAAAGAACTATTCA
2150 . : . : . : . : . :
2151 ACAGAATATTACGGAACAGGCTTCTGTAATGCAGAAACGGAAAACAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102110 ACAGAATATTACGGAACAGGCTTCTGTAATGCAGAAACGGAAAACAGAGA
2200 . : . : . : . : . :
2201 AGTTAAAACAAGAACAAAAAGGGCAACCCAGGACTGTTTCTCCCAGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102160 AGTTAAAACAAGAACAAAAAGGGCAACCCAGGACTGTTTCTCCCAGTACC
2250 . : . : . : . : . :
2251 ATTCGTGATGGTCCATCCTCTGCACCTGCTACACCTACCAAGGCTCCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102210 ATTCGTGATGGTCCATCCTCTGCACCTGCTACACCTACCAAGGCTCCCTA
2300 . : . : . : . : . :
2301 TTCACCGACAACTTCTAAGGAGAAGAAGATCCGAATCACAACTAATGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102260 TTCACCGACAACTTCTAAGGAGAAGAAGATCCGAATCACAACTAATGATG
2350 . : . : . : . : . :
2351 GACGACAGTCCATGGTTACCCTTAAGTCTTCAACAACCTTTTTTGAACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102310 GACGACAGTCCATGGTTACCCTTAAGTCTTCAACAACCTTTTTTGAACTT
2400 . : . : . : . : . :
2401 CAGGAAAGTATAGCCAGAGAATTCAACATTCCTCCATATTTACAGTGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102360 CAGGAAAGTATAGCCAGAGAATTCAACATTCCTCCATATTTACAGTGTAT
2450 . : . : . : . : . :
2451 TCGATACGGGTTTCCTCCTAAAGAGTTAATGCCACCACAGGCAGGAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102410 TCGATACGGGTTTCCTCCTAAAGAGTTAATGCCACCACAGGCAGGAATGG
2500 . : . : . : . : . :
2501 AAAAGGAACCAGTTCCTTTACAGCATGGCGACAGAATTACAATAGAAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102460 AAAAGGAACCAGTTCCTTTACAGCATGGCGACAGAATTACAATAGAAATT
2550 . : . : . : . : . :
2551 CTAAAAAGTAAAGCTGAAGGTGGTCAGTCTGCTGCAGCACACTCAGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102510 CTAAAAAGTAAAGCTGAAGGTGGTCAGTCTGCTGCAGCACACTCAGCCCA
2600 . : . : . : . : . :
2601 CACTGTGAAACAAGAAGATATTGCTGTTACTGGTAAACTGTCATCTAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102560 CACTGTGAAACAAGAAGATATTGCTGTTACTGGTAAACTGTCATCTAAGG
2650 . : . : . : . : . :
2651 AACTTCAGGAGCAAGCTGAAAAAGAAATGTACTCCTTGTGTCTTTTAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102610 AACTTCAGGAGCAAGCTGAAAAAGAAATGTACTCCTTGTGTCTTTTAGCA
2700 . : . : . : . : . :
2701 ACATTAATGG GAGAAGATGTATGGTCTTATGCAAAGGGACT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
102660 ACATTAATGGGTA...CAGGAGAAGATGTATGGTCTTATGCAAAGGGACT
2750 . : . : . : . : . :
2742 TCCTCACATGTTTCAGCAGGGTGGTGTATTCTACAGTATTATGAAGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115405 TCCTCACATGTTTCAGCAGGGTGGTGTATTCTACAGTATTATGAAGAAAA
2800 . : . : . : . : . :
2792 CCATGG GTATGGCTGATGGCAAGCATTGTACTTTTCCACAT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
115455 CCATGGGTA...TAGGTATGGCTGATGGCAAGCATTGTACTTTTCCACAT
2850 . : . : . : . : . :
2833 CTGCCTGGCAAAACCTTTGTCTATAATGCTTCTGAAGATAGACTGGAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131581 CTGCCTGGCAAAACCTTTGTCTATAATGCTTCTGAAGATAGACTGGAATT
2900 . : . : . : . : . :
2883 GTGTGTGGATGCTGCAGGACATTTCCCCATTGGTCCTGATGTTGAAGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131631 GTGTGTGGATGCTGCAGGACATTTCCCCATTGGTCCTGATGTTGAAGATT
2950 . : . : . : . : . :
2933 TAGTTAAAGAGGCTGTAAGTCAGGTTCGAGCAGAGGCTACTACAAGAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131681 TAGTTAAAGAGGCTGTAAGTCAGGTTCGAGCAGAGGCTACTACAAGAAGT
3000 . : . : . : . : . :
2983 AGGGAATCAAGTCCCTCACATGGGCTATTAAAACTAGGTAGTGGTGGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131731 AGGGAATCAAGTCCCTCACATGGGCTATTAAAACTAGGTAGTGGTGGAGT
3050 . : . : . : . : . :
3033 AGTGAAAAAGAAATCTGAGCAACTTCATAACGTAACTGCCTTTCAGGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131781 AGTGAAAAAGAAATCTGAGCAACTTCATAACGTAACTGCCTTTCAGGGAA
3100 . : . : . : . : . :
3083 AAGGGCATTCTTTAGGAACTGCATCTGGTAACCCACACCTTGATCCAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131831 AAGGGCATTCTTTAGGAACTGCATCTGGTAACCCACACCTTGATCCAAGA
3150 . : . : . : . : . :
3133 GCTAGGGAGACTTCAGTTGTAAGAAAGCATAATACAGGGACAGACTTTAG
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131881 GCTAGGGAAACTTCAGTTGTAAGAAAGCATAATACAGGGACAGACTTTAG
3200 . : . : . : . : . :
3183 TAATAGTTCCACTAAAACAGAGCCTTCTGTATTCACAGCTTCTTCTAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131931 TAATAGTTCCACTAAAACAGAGCCTTCTGTATTCACAGCTTCTTCTAGTA
3250 . : . : . : . : . :
3233 ATAGTGAGCTTATTCGAATAGCTCCTGGAGTAGTAACAATGAGAGACGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131981 ATAGTGAGCTTATTCGAATAGCTCCTGGAGTAGTAACAATGAGAGACGGC
3300 . : . : . : . : . :
3283 AGGCAGCTTGATCCTGATTTGGTTGAGGCCCAGCGAAAAAAATTGCAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132031 AGGCAGCTTGATCCTGATTTGGTTGAGGCCCAGCGAAAAAAATTGCAGGA
3350 . : . : . : . : . :
3333 AATGGTTTCTTCTATTCAGGCTTCAATGGACAGGCACCTTCGGGATCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132081 AATGGTTTCTTCTATTCAGGCTTCAATGGACAGGCACCTTCGGGATCAAA
3400 . : . : . : . : . :
3383 GTACAGAGCAGTCACCATCTGATCTTCCTCAAAGGAAAACAGAAGTTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132131 GTACAGAGCAGTCACCATCTGATCTTCCTCAAAGGAAAACAGAAGTTGTG
3450 . : . : . : . : . :
3433 AGTTCTTCTGCAAAGTCTGGGAGTCTTCAGACTGGTTTGCCTGAATCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132181 AGTTCTTCTGCAAAGTCTGGGAGTCTTCAGACTGGTTTGCCTGAATCTTT
3500 . : . : . : . : . :
3483 TCCTTTAACTGGTGGTACTGAAAATTTGAATACAGAAACAACTGATGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132231 TCCTTTAACTGGTGGTACTGAAAATTTGAATACAGAAACAACTGATGGCT
3550 . : . : . : . : . :
3533 GTGTAGCAGATGCACTGGGAGCAGCCTTTGCCACAAGGTCAAAAGCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132281 GTGTAGCAGATGCACTGGGAGCAGCCTTTGCCACAAGGTCAAAAGCACAA
3600 . : . : . : . : . :
3583 AGGGGAAATTCCGTGGAGGAGCTTGAAGAGATGGATAGTCAAGATGCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132331 AGGGGAAATTCCGTGGAGGAGCTTGAAGAGATGGATAGTCAAGATGCTGA
3650 . : . : . :
3633 GATGACTAACACAACTGAGCCAATGGATCACTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||
132381 GATGACTAACACAACTGAGCCAATGGATCACTCT