seq1 = pF1KE3435.tfa, 2781 bp
seq2 = pF1KE3435/gi568815596r_47708121.tfa (gi568815596r:47708121_48005720), 297600 bp

>pF1KE3435 2781
>gi568815596r:47708121_48005720 (Chr2)

(complement)

1-232  (100001-100232)   100% ->
233-360  (165952-166079)   100% ->
361-442  (166221-166302)   100% ->
443-587  (166718-166862)   100% ->
588-717  (169720-169849)   100% ->
718-801  (170850-170933)   100% ->
802-934  (171010-171142)   100% ->
935-1041  (172651-172757)   100% ->
1042-1153  (172841-172952)   100% ->
1154-1260  (173043-173149)   100% ->
1261-1398  (173235-173372)   100% ->
1399-1616  (182361-182578)   100% ->
1617-1702  (183418-183503)   100% ->
1703-1797  (185265-185359)   100% ->
1798-1920  (186643-186765)   100% ->
1921-2006  (186857-186942)   100% ->
2007-2083  (191854-191930)   100% ->
2084-2227  (192344-192487)   100% ->
2228-2338  (195295-195405)   100% ->
2339-2446  (196014-196121)   100% ->
2447-2555  (196455-196563)   100% ->
2556-2654  (197294-197392)   100% ->
2655-2781  (197474-197600)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTCCGTCCGAGCCGCCAACCGGAGACCCAGGCGAGTGTCGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACTCCGTCCGAGCCGCCAACCGGAGACCCAGGCGAGTGTCGCGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCCCGGTGCAGCAACAGCAGCAGCAGCCCCCGCAGCAGCCGCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCCCGGTGCAGCAACAGCAGCAGCAGCCCCCGCAGCAGCCGCCGCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCGCCCCAGCAGCAGCCGCCCCAGCAGCAGCCTCCGCCGCCGCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCGCCCCAGCAGCAGCCGCCCCAGCAGCAGCCTCCGCCGCCGCCGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCAGCAGCAGCAGCAGCCTCCGCCGCCGCCACCGCCGCCTCCGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCAGCAGCAGCAGCAGCCTCCGCCGCCGCCACCGCCGCCTCCGCCGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCTCAGGAGCGGAACAACGTCGGCGAGCGGG         ATGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100201 GCCTCAGGAGCGGAACAACGTCGGCGAGCGGGGTA...CAGATGATGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCCTGCAGATATGGTTGCAGAAGAATCAGGTCCTGGTGCACAAAATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165961 TGCCTGCAGATATGGTTGCAGAAGAATCAGGTCCTGGTGCACAAAATAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCATACCAACTTCGTAGAAAAACTCTTTTGCCGAAAAGAACAGCGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166011 CCATACCAACTTCGTAGAAAAACTCTTTTGCCGAAAAGAACAGCGTGTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACAAAGAACAGTATGGAG         GGCGCCTCAACTTCAACTACAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 166061 CACAAAGAACAGTATGGAGGTA...AAGGGCGCCTCAACTTCAACTACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAAACTTTGGTCATCGTGCAAAACGTGCAAGAGTGTCTGGAAAATCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166243 AAAACTTTGGTCATCGTGCAAAACGTGCAAGAGTGTCTGGAAAATCACAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATCTATCAG         CAGCACCTGCTGAACAGTATCTTCAGGAGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 166293 GATCTATCAGGTA...TAGCAGCACCTGCTGAACAGTATCTTCAGGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACTGCCAGATGAAGTGGTTCTAAAAATCTTCTCTTACTTGCTGGAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166749 ACTGCCAGATGAAGTGGTTCTAAAAATCTTCTCTTACTTGCTGGAACAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCTTTGTAGAGCAGCTTGTGTATGTAAACGCTTCAGTGAACTTGCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166799 ATCTTTGTAGAGCAGCTTGTGTATGTAAACGCTTCAGTGAACTTGCTAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GATCCAATTTTGTG         GAAACGATTATATATGGAAGTATTTGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 166849 GATCCAATTTTGTGGTA...CAGGAAACGATTATATATGGAAGTATTTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATATACTCGCCCTATGATGCATCCTGAACCTGGAAAATTCTACCAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169747 ATATACTCGCCCTATGATGCATCCTGAACCTGGAAAATTCTACCAGATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATCCAGAAGAGTATGAACATCCAAATCCCTGGAAAGAGAGTTTCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169797 ATCCAGAAGAGTATGAACATCCAAATCCCTGGAAAGAGAGTTTCCAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTG         TATAAAGGTGCACATGTAAAGCCAGGATTTGCTGAACA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169847 TTGGTA...TAGTATAAAGGTGCACATGTAAAGCCAGGATTTGCTGAACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTTCTACAGTAACCCTGCAAGATATAAAGGAAGAGAAAATATGTTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 170888 TTTCTACAGTAACCCTGCAAGATATAAAGGAAGAGAAAATATGTTGGTA.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    802      TATTATGATACTATTGAAGATGCCCTTGGTGGGGTACAAGAGGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170938 ..TAGTATTATGATACTATTGAAGATGCCCTTGGTGGGGTACAAGAGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CATTTTGATGGACTTATCTTTGTTCATTCTGGAATATATACTGATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171055 CATTTTGATGGACTTATCTTTGTTCATTCTGGAATATATACTGATGAATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GATATATATTGAATCTCCAATCACCATGATTGGTGCAG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 171105 GATATATATTGAATCTCCAATCACCATGATTGGTGCAGGTA...CAGCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTGGGAAAGTGGCAGACAAAGTTATAATTGAAAACACTAGAGATTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172654 CTGGGAAAGTGGCAGACAAAGTTATAATTGAAAACACTAGAGATTCAACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTCGTTTTTATGGAAGGCTCTGAAGATGCTTATGTTGGATATATGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172704 TTCGTTTTTATGGAAGGCTCTGAAGATGCTTATGTTGGATATATGACAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AAGG         TTTAACCCTGATGACAAATCTGCACAACACCACAATG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172754 AAGGGTA...CAGTTTAACCCTGATGACAAATCTGCACAACACCACAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CACACCACTGCTTAGAGATTACAGTAAATTGTAGCCCTATTATTGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172878 CACACCACTGCTTAGAGATTACAGTAAATTGTAGCCCTATTATTGATCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TGTATCATCCGAAGTACATGTACAG         TTGGTTCTGCAGTATG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 172928 TGTATCATCCGAAGTACATGTACAGGTT...CAGTTGGTTCTGCAGTATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGTTAGTGGTCAAGGAGCATGTCCCACCATCAAGCACTGTAACATCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173059 TGTTAGTGGTCAAGGAGCATGTCCCACCATCAAGCACTGTAACATCAGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ACTGTGAAAATGTTGGACTATATATAACAGATCATGCACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 173109 ACTGTGAAAATGTTGGACTATATATAACAGATCATGCACAGGTA...TAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGAATATATGAGGATAATGAAATTTCCAATAATGCGTTAGCTGGGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173235 GGAATATATGAGGATAATGAAATTTCCAATAATGCGTTAGCTGGGATTTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGTTAAAAATCATGGAAACCCAATTATTAGACGGAATCATATTCATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173285 GGTTAAAAATCATGGAAACCCAATTATTAGACGGAATCATATTCATCATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GACGTGATGTTGGTGTGTTCACATTTGATCATGGCATG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 173335 GACGTGATGTTGGTGTGTTCACATTTGATCATGGCATGGTA...CAGGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TACTTTGAAAGTTGCAATATACACAGAAATAGGATAGCAGGCTTTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182364 TACTTTGAAAGTTGCAATATACACAGAAATAGGATAGCAGGCTTTGAAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AAAAGCCTATGCTAACCCTACAGTGGTTCGATGTGAAATTCACCATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182414 AAAAGCCTATGCTAACCCTACAGTGGTTCGATGTGAAATTCACCATGGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGACTGGAGGAATATATGTCCATGAAAAAGGAAGAGGACAATTCATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182464 AGACTGGAGGAATATATGTCCATGAAAAAGGAAGAGGACAATTCATAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AATAAAATCTATGCAAACAACTTTGCAGGTGTATGGATTACCTCAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182514 AATAAAATCTATGCAAACAACTTTGCAGGTGTATGGATTACCTCAAATAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TGACCCAACAATAAG         GGGAAATTCTATATTTAATGGAAATC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 182564 TGACCCAACAATAAGGTA...TAGGGGAAATTCTATATTTAATGGAAATC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AAGGAGGAGTTTACATCTTTGGTGATGGACGAGGCCTTATTGAAGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183444 AAGGAGGAGTTTACATCTTTGGTGATGGACGAGGCCTTATTGAAGGAAAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GACATTTATG         GCAATGCATTAGCAGGAATTCAAATTAGGAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 183494 GACATTTATGGTA...TAGGCAATGCATTAGCAGGAATTCAAATTAGGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AAACAGTTGTCCAATTGTTCGGCATAACAAAATTCATGATGGCCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185296 AAACAGTTGTCCAATTGTTCGGCATAACAAAATTCATGATGGCCAGCATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GTGGGATTTATGTG         CATGAAAAGGGACAAGGAGTAATAGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 185346 GTGGGATTTATGTGGTA...TAGCATGAAAAGGGACAAGGAGTAATAGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GAGAATGAAGTTTATAGTAACACTCTAGCTGGAGTCTGGGTGACAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186670 GAGAATGAAGTTTATAGTAACACTCTAGCTGGAGTCTGGGTGACAACTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CAGCACTCCAGTACTGAGAAGAAACCGGATACACAGTGGCAAGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 186720 CAGCACTCCAGTACTGAGAAGAAACCGGATACACAGTGGCAAGCAGGTA.

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1921      GTTGGTGTTTATTTTTATGACAATGGACATGGAGTGCTAGAAGAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186770 ..TAGGTTGGTGTTTATTTTTATGACAATGGACATGGAGTGCTAGAAGAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AATGATATCTATAATCATATGTATTCAGGGGTTCAGATAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 186902 AATGATATCTATAATCATATGTATTCAGGGGTTCAGATAAGGTA...CAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 GACTGGAAGCAACCCCAAAATTAGACGCAACAAAATCTGGGGAGGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191854 GACTGGAAGCAACCCCAAAATTAGACGCAACAAAATCTGGGGAGGACAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 ATGGTGGAATTCTAGTTTATAATTCTG         GTCTAGGCTGTATA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 191904 ATGGTGGAATTCTAGTTTATAATTCTGGTA...TAGGTCTAGGCTGTATA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAAGACAATGAAATATTTGACAATGCAATGGCTGGAGTCTGGATTAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192358 GAAGACAATGAAATATTTGACAATGCAATGGCTGGAGTCTGGATTAAGAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 AGATAGTAATCCTACACTAAGAAGAAATAAAATCCATGATGGAAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192408 AGATAGTAATCCTACACTAAGAAGAAATAAAATCCATGATGGAAGAGATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 GTGGCATCTGTATATTTAATGGGGGTCGAG         GTCTCCTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 192458 GTGGCATCTGTATATTTAATGGGGGTCGAGGTA...TAGGTCTCCTTGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GAAAATGATATTTTCAGGAATGCTCAAGCAGGTGTTCTCATCAGCACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195306 GAAAATGATATTTTCAGGAATGCTCAAGCAGGTGTTCTCATCAGCACTAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 TAGTCATCCAATCTTAAGGAAAAACAGAATATTTGATGGATTTGCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195356 TAGTCATCCAATCTTAAGGAAAAACAGAATATTTGATGGATTTGCCGCAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339          GTATTGAAATTACAAATCACGCAACTGCAACACTAGAAGGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195406 GTT...CAGGTATTGAAATTACAAATCACGCAACTGCAACACTAGAAGGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 AATCAGATTTTTAACAACCGGTTTGGAGGCTTATTTTTAGCATCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196055 AATCAGATTTTTAACAACCGGTTTGGAGGCTTATTTTTAGCATCTGGTGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 TAATGTGACAATGAAAG         ATAACAAAATAATGAACAATCAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 196105 TAATGTGACAATGAAAGGTA...CAGATAACAAAATAATGAACAATCAAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 ATGCCATAGAAAAGGCTGTTAGTAGAGGCCAATGTTTATATAAAATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196479 ATGCCATAGAAAAGGCTGTTAGTAGAGGCCAATGTTTATATAAAATATCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 AGTTATACCAGCTATCCCATGCATGATTTCTACAG         ATGTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 196529 AGTTATACCAGCTATCCCATGCATGATTTCTACAGGTA...TAGATGTCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 TACTTGTAACACCACAGATCGAAATGCCATATGTGTGAACTGCATTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197300 TACTTGTAACACCACAGATCGAAATGCCATATGTGTGAACTGCATTAAGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 AGTGCCATCAGGGACATGATGTAGAGTTTATTAGACATGATAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 197350 AGTGCCATCAGGGACATGATGTAGAGTTTATTAGACATGATAGGTA...T

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2655   GTTTTTCTGTGACTGTGGTGCTGGAACACTGTCTAATCCTTGTACATT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197472 AGGTTTTTCTGTGACTGTGGTGCTGGAACACTGTCTAATCCTTGTACATT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 AGCTGGTGAGCCTACACATGATACAGATACACTATATGACTCTGCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197522 AGCTGGTGAGCCTACACATGATACAGATACACTATATGACTCTGCTCCAC

   2950     .    :    .    :    .
   2753 CTATAGAATCTAATACATTGCAGCACAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 197572 CTATAGAATCTAATACATTGCAGCACAAC