seq1 = pF1KE3432.tfa, 2424 bp
seq2 = pF1KE3432/gi568815586r_6456996.tfa (gi568815586r:6456996_6667918), 210923 bp

>pF1KE3432 2424
>gi568815586r:6456996_6667918 (Chr12)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-149  (101097-101142)   100% ->
150-238  (101302-101390)   100% ->
239-462  (101595-101818)   99% ->
463-518  (103973-104028)   100% ->
519-678  (104148-104307)   100% ->
679-876  (104407-104604)   100% ->
877-966  (104749-104838)   100% ->
967-1054  (105948-106035)   100% ->
1055-1195  (106115-106255)   100% ->
1196-1335  (106849-106988)   100% ->
1336-1425  (107132-107221)   100% ->
1426-1548  (107350-107472)   100% ->
1549-1777  (107593-107821)   100% ->
1778-2424  (110277-110923)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCGCAAGTTGGACCCTACGAAGGAGAAGCGGGGGCCAGGCCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCGCAAGTTGGACCCTACGAAGGAGAAGCGGGGGCCAGGCCGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCGGAAGCAGAAGGGTGCCGAGACAGAACTCGTCAGATTCTTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCGGAAGCAGAAGGGTGCCGAGACAGAACTCGTCAGATTCTTGCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAG         TAAGTGACGAAAATTCCAAGAGGCTGTCTAGTCGTGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGTA...CAGTAAGTGACGAAAATTCCAAGAGGCTGTCTAGTCGTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGAAAGAG         GGCAGCCAAGAGGAGATTGGGCTCTGTTGAAGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101135 CGAAAGAGGTA...CAGGGCAGCCAAGAGGAGATTGGGCTCTGTTGAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCTAAGACAAATAAGTCTCCTGAGGCCAAACCATTGCCTGGAAAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101335 CCCTAAGACAAATAAGTCTCCTGAGGCCAAACCATTGCCTGGAAAGCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAAAAG         GAGCTGTCCAGACAGCTGGTAAGAAGGGACCCCAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101385 CAAAAGGTC...CAGGAGCTGTCCAGACAGCTGGTAAGAAGGGACCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCCCTATTTAATGCTCCTCGAGGCAAGAAGCGCCCAGCACCTGGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101630 TCCCTATTTAATGCTCCTCGAGGCAAGAAGCGCCCAGCACCTGGCAGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAGGAAGAGGAGGAGGAAGACTCTGAAGAAGATGGTATGGTGAACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101680 TGAGGAAGAGGAGGAGGAAGACTCTGAAGAAGATGGTATGGTGAACCACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGACCTCTGGGGCTCCGAGGACGATGCTGATATGGTAGATGACTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 101730 GGGACCTCTGGGGCTCCGAGGACGATGCTGATACGGTAGATGACTATGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTGACTCCAACTCTGAGGATGAGGAGGAAGGTGAAGCG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101780 GCTGACTCCAACTCTGAGGATGAGGAGGAAGGTGAAGCGGTG...CAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCTGCCCATTGAAAGAGCTGCTCGGAAGCAGAAGGCCCGGGAAGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103975 GCTGCCCATTGAAAGAGCTGCTCGGAAGCAGAAGGCCCGGGAAGCTGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTGG         GATCCAGTGGAGTGAAGAGGAGACCGAGGACGAGGAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104025 CTGGGTG...TAGGATCCAGTGGAGTGAAGAGGAGACCGAGGACGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAGAGAAAGAAGTGACCCCTGAGTCAGGCCCCCCAAAGGTGGAAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104185 GAAGAGAAAGAAGTGACCCCTGAGTCAGGCCCCCCAAAGGTGGAAGAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGATGGGGGCCTGCAGATCAATGTGGATGAGGAACCATTTGTGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104235 AGATGGGGGCCTGCAGATCAATGTGGATGAGGAACCATTTGTGCTGCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTGCTGGGGAGATGGAGCAGGAT         GCCCAGGCTCCAGACCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104285 CTGCTGGGGAGATGGAGCAGGATATC...CATGCCCAGGCTCCAGACCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAACGAGTTCACAAGCGGATCCAGGATATTGTGGGAATTCTGCGTGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104425 CAACGAGTTCACAAGCGGATCCAGGATATTGTGGGAATTCTGCGTGATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGGGGCTCAGCGGGAGGAAGGGCGGTCTCGTTCTGAATACCTGAACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104475 TGGGGCTCAGCGGGAGGAAGGGCGGTCTCGTTCTGAATACCTGAACCGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCAAGAAGGATCTGGCCATTTACTACTCCTATGGAGACTTCCTGCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104525 TCAAGAAGGATCTGGCCATTTACTACTCCTATGGAGACTTCCTGCTTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAGCTCATGGACCTCTTCCCTCTGTCTGAG         CTGGTGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104575 AAGCTCATGGACCTCTTCCCTCTGTCTGAGGTA...CAGCTGGTGGAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTTAGAAGCTAATGAGGTGCCTCGGCCCGTCACCCTCCGGACCAATACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104760 CTTAGAAGCTAATGAGGTGCCTCGGCCCGTCACCCTCCGGACCAATACCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGAAAACCCGACGCCGAGACCTTGCACAG         GCTCTAATCAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104810 TGAAAACCCGACGCCGAGACCTTGCACAGGTG...CAGGCTCTAATCAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CGTGGGGTTAACCTGGATCCCCTGGGCAAGTGGTCAAAGACTGGACTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105960 CGTGGGGTTAACCTGGATCCCCTGGGCAAGTGGTCAAAGACTGGACTAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGTGTATGATTCTTCTGTGCCCATTG         GTGCTACCCCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106010 GGTGTATGATTCTTCTGTGCCCATTGGTA...CAGGTGCTACCCCCGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ACCTGGCTGGGCACTACATGCTGCAGGGAGCCTCCAGCATGTTGCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106130 ACCTGGCTGGGCACTACATGCTGCAGGGAGCCTCCAGCATGTTGCCCGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ATGGCCTTGGCACCCCAGGAACATGAGCGGATCCTGGACATGTGTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106180 ATGGCCTTGGCACCCCAGGAACATGAGCGGATCCTGGACATGTGTTGTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCCTGGAGGAAAGACCAGCTACATGG         CCCAGCTGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106230 CCCTGGAGGAAAGACCAGCTACATGGGTA...TAGCCCAGCTGATGAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ACACGGGTGTGATCCTTGCCAATGACGCCAATGCTGAGCGGCTCAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106864 ACACGGGTGTGATCCTTGCCAATGACGCCAATGCTGAGCGGCTCAAGAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GTTGTGGGCAACTTGCATCGGCTGGGAGTCACCAACACCATTATCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106914 GTTGTGGGCAACTTGCATCGGCTGGGAGTCACCAACACCATTATCAGCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTATGATGGGCGCCAGTTCCCCAAG         GTGGTGGGGGGCTTTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106964 CTATGATGGGCGCCAGTTCCCCAAGGTG...CAGGTGGTGGGGGGCTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ACCGAGTACTGCTGGATGCTCCCTGCAGTGGCACTGGGGTCATCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107148 ACCGAGTACTGCTGGATGCTCCCTGCAGTGGCACTGGGGTCATCTCCAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GATCCAGCCGTGAAGACTAACAAG         GATGAGAAGGACATCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 107198 GATCCAGCCGTGAAGACTAACAAGGTG...CAGGATGAGAAGGACATCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GCGCTGTGCTCACCTCCAGAAGGAGTTGCTCCTGAGTGCTATTGACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107367 GCGCTGTGCTCACCTCCAGAAGGAGTTGCTCCTGAGTGCTATTGACTCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TCAATGCGACCTCCAAGACAGGAGGCTACCTGGTTTACTGCACCTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107417 TCAATGCGACCTCCAAGACAGGAGGCTACCTGGTTTACTGCACCTGTTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 ATCACA         GTAGAAGAGAATGAGTGGGTGGTAGACTATGCTCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107467 ATCACAGTG...CAGGTAGAAGAGAATGAGTGGGTGGTAGACTATGCTCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GAAAAAGAGGAATGTGCGACTGGTGCCCACGGGCCTAGACTTTGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107628 GAAAAAGAGGAATGTGCGACTGGTGCCCACGGGCCTAGACTTTGGCCAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AAGGTTTTACCCGCTTTCGAGAAAGGCGCTTCCACCCCAGTCTGCGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107678 AAGGTTTTACCCGCTTTCGAGAAAGGCGCTTCCACCCCAGTCTGCGTTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ACCCGACGCTTCTACCCTCATACCCACAATATGGATGGGTTCTTCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107728 ACCCGACGCTTCTACCCTCATACCCACAATATGGATGGGTTCTTCATTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CAAGTTCAAGAAATTTTCCAATTCTATCCCTCAGTCCCAGACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 107778 CAAGTTCAAGAAATTTTCCAATTCTATCCCTCAGTCCCAGACAGGTA...

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1778    GAAATTCTGAAACAGCCACACCTACAAATGTAGACTTGCCTCAGGTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110274 CAGGAAATTCTGAAACAGCCACACCTACAAATGTAGACTTGCCTCAGGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 ATCCCCAAGTCTGAGAACAGCAGCCAGCCAGCCAAGAAAGCCAAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110324 ATCCCCAAGTCTGAGAACAGCAGCCAGCCAGCCAAGAAAGCCAAGGGGGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TGCAAAGACAAAGCAGCAGCTGCAGAAACAGCAACATCCCAAGAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110374 TGCAAAGACAAAGCAGCAGCTGCAGAAACAGCAACATCCCAAGAAGGCCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CCTTCCAGAAGCTGAATGGCATCTCCAAAGGGGCAGACTCAGAATTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110424 CCTTCCAGAAGCTGAATGGCATCTCCAAAGGGGCAGACTCAGAATTGTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ACTGTACCTTCTGTCACAAAGACCCAAGCTTCCTCCAGCTTCCAGGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110474 ACTGTACCTTCTGTCACAAAGACCCAAGCTTCCTCCAGCTTCCAGGATAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CAGTCAGCCAGCTGGAAAAGCCGAAGGGATCAGGGAGCCAAAGGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110524 CAGTCAGCCAGCTGGAAAAGCCGAAGGGATCAGGGAGCCAAAGGTGACTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GGAAGCTAAAGCAACGATCACCTAAATTACAGTCCTCCAAGAAAGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110574 GGAAGCTAAAGCAACGATCACCTAAATTACAGTCCTCCAAGAAAGTTGCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 TTCCTCAGGCAGAATGCCCCTCCCAAGGGCACAGACACACAAACACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110624 TTCCTCAGGCAGAATGCCCCTCCCAAGGGCACAGACACACAAACACCGGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 TGTGTTATCCCCATCCAAGACTCAGGCCACCCTGAAACCTAAGGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110674 TGTGTTATCCCCATCCAAGACTCAGGCCACCCTGAAACCTAAGGACCATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 ATCAGCCCCTTGGAAGGGCCAAGGGGGTTGAGAAGCAGCAGTTGCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110724 ATCAGCCCCTTGGAAGGGCCAAGGGGGTTGAGAAGCAGCAGTTGCCAGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CAGCCTTTTGAGAAAGCTGCCTTCCAGAAACAGAATGATACCCCCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110774 CAGCCTTTTGAGAAAGCTGCCTTCCAGAAACAGAATGATACCCCCAAGGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 GCCTCAGCCTCCCACTGTGTCTCCCATCCGTTCCAGCCGCCCCCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110824 GCCTCAGCCTCCCACTGTGTCTCCCATCCGTTCCAGCCGCCCCCCACCAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 CAAAGAGGAAGAAATCTCAGTCCAGGGGCAACAGCCAGCTGCTGCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110874 CAAAGAGGAAGAAATCTCAGTCCAGGGGCAACAGCCAGCTGCTGCTATCT