seq1 = pF1KE3428.tfa, 1806 bp
seq2 = pF1KE3428/gi568815594r_17783723.tfa (gi568815594r:17783723_18121686), 337964 bp

>pF1KE3428 1806
>gi568815594r:17783723_18121686 (Chr4)

(complement)

1-154  (99936-100089)   100% ->
155-220  (148802-148867)   100% ->
221-300  (158638-158717)   100% ->
301-430  (159655-159784)   100% ->
431-682  (212342-212593)   100% ->
683-776  (235526-235619)   100% ->
777-1806  (236935-237964)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAAGGGAAGAGAGAGAATGGCCGCTGCCGCCGCCGCTGCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99936 ATGGACAAGGGAAGAGAGAGAATGGCCGCTGCCGCCGCCGCTGCTGCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGCCGCCGCCGCTCAGTGCCGGAGCCCTCGGTGCGCGGCGGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99986 CGCCGCCGCCGCCGCTCAGTGCCGGAGCCCTCGGTGCGCGGCGGAGAGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGATTCCGGCGGGAACTCGACTCTTGGCGCCACCGCCTCATGCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100036 GAGGATTCCGGCGGGAACTCGACTCTTGGCGCCACCGCCTCATGCACTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAG         GTTTTGAGAGTATTTTAGAAGGGCTTTATGGACCACG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100086 GTAGGTA...CAGGTTTTGAGAGTATTTTAGAAGGGCTTTATGGACCACG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTACGAAGAGACCTCAGTTTATTTGAAG         ACTGTGAACCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 148839 GCTACGAAGAGACCTCAGTTTATTTGAAGGTA...AAGACTGTGAACCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGAGCTGACTGACTGGTCTATGGATGAAAAATGTTCATTTTGTAACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158650 AAGAGCTGACTGACTGGTCTATGGATGAAAAATGTTCATTTTGTAACCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGAGAGAAGCAGTCAGT         GATTGTATACCATCTCTTGATTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 158700 CAGAGAGAAGCAGTCAGTGTA...TAGGATTGTATACCATCTCTTGATTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTCACAGTCAACACCAACAGAGGAGCTATCATCTCAGGGCCAGTCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159678 TTCACAGTCAACACCAACAGAGGAGCTATCATCTCAGGGCCAGTCCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGATAAGATTGAATGCCAAGCAGAAAATTACCTAAATGCACTCTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159728 CTGATAAGATTGAATGCCAAGCAGAAAATTACCTAAATGCACTCTTTCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGAAAG         ATCTTCCTCAGAACTGTGATCCTAACATTCCCCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159778 AAGAAAGGTA...TAGATCTTCCTCAGAACTGTGATCCTAACATTCCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGTTGCTCAGGAATTAATGAAAAAGATGATACGTCAATTTGCGATTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212376 AGTTGCTCAGGAATTAATGAAAAAGATGATACGTCAATTTGCGATTGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACATTTCAAAAAGTGGTAAAACTCAAGAGAATAGAAATGGTTCAATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212426 ACATTTCAAAAAGTGGTAAAACTCAAGAGAATAGAAATGGTTCAATTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCAAGTATAGTATGTAAAAGTATCCAAATGAATCAAGCAGAAAACTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212476 CCAAGTATAGTATGTAAAAGTATCCAAATGAATCAAGCAGAAAACTCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCAGGAAGAGCAGGAAGGCCCCTTAGACCTCACTGTGAATCGAATGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212526 TCAGGAAGAGCAGGAAGGCCCCTTAGACCTCACTGTGAATCGAATGCAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AACAAAATACTCAGCAAG         GGGATGGAGTGTTAGATCTCTCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 212576 AACAAAATACTCAGCAAGGTA...TAGGGGATGGAGTGTTAGATCTCTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACAAAGAAAACCAGCATAAAATCTGAAGAGTCATCCATATGTGATCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 235549 ACAAAGAAAACCAGCATAAAATCTGAAGAGTCATCCATATGTGATCCTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTCTGAAAATTCAGTGGCTGG         GAGACTACACAGAAACAGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 235599 TTCTGAAAATTCAGTGGCTGGGTA...CAGGAGACTACACAGAAACAGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGGACTATGTGGAAAGAAGTGCTGAGTTTGCAGATGGTTTGCTCTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236955 AGGACTATGTGGAAAGAAGTGCTGAGTTTGCAGATGGTTTGCTCTCAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCTTTGAAAGACATTCAGTCTGGAGCACTGGACATAAATAAAGCAGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237005 GCTTTGAAAGACATTCAGTCTGGAGCACTGGACATAAATAAAGCAGGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ACTTTATGGCATACCTCAAAAAACTTTACTTCTTCACTTAGAAGCCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237055 ACTTTATGGCATACCTCAAAAAACTTTACTTCTTCACTTAGAAGCCTTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CAGCAGGGAAGCCTGCATCTTTTAAAAACAAAACTCGAGATTTCCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237105 CAGCAGGGAAGCCTGCATCTTTTAAAAACAAAACTCGAGATTTCCATGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGTTATTCATATAAGGACAGTAAAGAAACTTGTGCAGTGCTGCAAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237155 AGTTATTCATATAAGGACAGTAAAGAAACTTGTGCAGTGCTGCAAAAAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGCCTTGTGGGCAAGAGCTCAAGCAGAGCGCACAGAAAAAAGTAAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237205 AGCCTTGTGGGCAAGAGCTCAAGCAGAGCGCACAGAAAAAAGTAAACTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ATCTACTTGAAACCTCAGAAATAAAATTCCCAACAGCTTCCACTTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237255 ATCTACTTGAAACCTCAGAAATAAAATTCCCAACAGCTTCCACTTACCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CATCAGCTAACTCTACAGAAAATGGTCACTCAGTTTAAAGAAAAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237305 CATCAGCTAACTCTACAGAAAATGGTCACTCAGTTTAAAGAAAAAAATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AAGCCTCCAATATGAAACTTCAAATCCTACTGTACAGTTAAAAATTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237355 AAGCCTCCAATATGAAACTTCAAATCCTACTGTACAGTTAAAAATTCCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGCTACGAGTAAGTTCTGTCTCAAAATCACAACCTGATGGTTCTGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237405 AGCTACGAGTAAGTTCTGTCTCAAAATCACAACCTGATGGTTCTGGTCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 TTGGATGTTATGTATCAAGTTTCCAAAACCTCTTCAGTCCTAGAAGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237455 TTGGATGTTATGTATCAAGTTTCCAAAACCTCTTCAGTCCTAGAAGGATC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 AGCTCTCCAAAAACTGAAAAATATACTCCCTAAACAGAACAAAATAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237505 AGCTCTCCAAAAACTGAAAAATATACTCCCTAAACAGAACAAAATAGAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 GTTCTGGGCCTGTAACTCACTCAAGTGTTGACTCTTACTTTCTACATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237555 GTTCTGGGCCTGTAACTCACTCAAGTGTTGACTCTTACTTTCTACATGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GACCTCTCTCCTTTGTGTCTTAATTCTAAAAATGGAACAGTTGATGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237605 GACCTCTCTCCTTTGTGTCTTAATTCTAAAAATGGAACAGTTGATGGAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CTCTGAAAATACTGAAGATGGATTAGATCGAAAAGACAGTAAGCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237655 CTCTGAAAATACTGAAGATGGATTAGATCGAAAAGACAGTAAGCAGCCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 GGAAAAAACGTGGCCGCTATCGGCAATATGATCATGAAATAATGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237705 GGAAAAAACGTGGCCGCTATCGGCAATATGATCATGAAATAATGGAAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GCTATTGCAATGGTAATGAGCGGAAAAATGAGTGTTTCCAAAGCACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237755 GCTATTGCAATGGTAATGAGCGGAAAAATGAGTGTTTCCAAAGCACAAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 AATTTATGGGGTACCTCACAGCACTTTAGAATACAAGGTAAAAGAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237805 AATTTATGGGGTACCTCACAGCACTTTAGAATACAAGGTAAAAGAAAGAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 CTGGAACACTGAAGACTCCTCCGAAGAAGAAACTACGATTACCAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237855 CTGGAACACTGAAGACTCCTCCGAAGAAGAAACTACGATTACCAGACACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 GGGTTATATAATATGACAGATTCAGGGACTGGCAGCTGCAAAAACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237905 GGGTTATATAATATGACAGATTCAGGGACTGGCAGCTGCAAAAACAGCAG

   1850     .    :
   1797 CAAGCCTGTG
        ||||||||||
 237955 CAAGCCTGTG