seq1 = pF1KE3427.tfa, 1806 bp
seq2 = pF1KE3427/gi568815597r_118784735.tfa (gi568815597r:118784735_119087795), 303061 bp

>pF1KE3427 1806
>gi568815597r:118784735_119087795 (Chr1)

(complement)

1-205  (100001-100205)   100% ->
206-419  (155964-156177)   100% ->
420-521  (161185-161286)   100% ->
522-693  (162979-163150)   100% ->
694-861  (164193-164360)   100% ->
862-926  (173617-173681)   100% ->
927-1024  (188671-188768)   100% ->
1025-1806  (202280-203061)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGAAAGGAGAAGATCTGCAGTCGCCCTGAGCTCGCGAGCACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGAAAGGAGAAGATCTGCAGTCGCCCTGAGCTCGCGAGCACATGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCTCCGTTGAAGCCTTGATCGGCTCAAATAAAAAACGGAAACTGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCTCCGTTGAAGCCTTGATCGGCTCAAATAAAAAACGGAAACTGCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGGGAGGAGAAGGGGCTGGACCTGTCTATGGAGGCGCTGAGCCCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGGGAGGAGAAGGGGCTGGACCTGTCTATGGAGGCGCTGAGCCCCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCCACTCGGAGACACGGAGGACGCGGCGGCACACGGCCTGGAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCCACTCGGAGACACGGAGGACGCGGCGGCACACGGCCTGGAGCCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGG         ATTCTGAGCAGAGCACTGGTTCAGATTCTGAGGTCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCGGGTG...CAGATTCTGAGCAGAGCACTGGTTCAGATTCTGAGGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACTGAGCGGACTTCCTGCTCCTTCAGTACTCACACTGACCTGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156000 TCACTGAGCGGACTTCCTGCTCCTTCAGTACTCACACTGACCTGGCCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGTGCTGCAGGCCCTGTGCCTGCTGCCATGTCTTCCATGGAGGAGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156050 GGTGCTGCAGGCCCTGTGCCTGCTGCCATGTCTTCCATGGAGGAGATTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTGGAGCTGCAATGTGCTGACCTCTGGAAGCGGTTCCATGATATTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156100 GGTGGAGCTGCAATGTGCTGACCTCTGGAAGCGGTTCCATGATATTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGAAATGATCATCACCAAAGCAGGCAG         GAGGATGTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 156150 CTGAAATGATCATCACCAAAGCAGGCAGGTA...TAGGAGGATGTTTCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCATGAGAGTGAAAATCACTGGCCTAGATCCACATCAGCAGTACTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161198 GCCATGAGAGTGAAAATCACTGGCCTAGATCCACATCAGCAGTACTACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCAATGGACATTGTGCCTGTGGACAATAAAAGATACAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 161248 AGCAATGGACATTGTGCCTGTGGACAATAAAAGATACAGGTA...CAGAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGTGTATCATAGCTCCAAGTGGATGGTGGCTGGCAATGCTGATTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162981 ATGTGTATCATAGCTCCAAGTGGATGGTGGCTGGCAATGCTGATTCCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTGCCCCCAAGAGTTTATATACACCCTGATTCTCTAGCTTCTGGAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163031 GTGCCCCCAAGAGTTTATATACACCCTGATTCTCTAGCTTCTGGAGACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGGATGAGACAGGTGGTCAGTTTTGACAAACTCAAGCTTACCAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163081 CTGGATGAGACAGGTGGTCAGTTTTGACAAACTCAAGCTTACCAACAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGTTGGATGATCAAGGACAT         ATCATTCTGCACTCTATGCAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 163131 AGTTGGATGATCAAGGACATGTG...CAGATCATTCTGCACTCTATGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAATACCAGCCTCGAGTTCATGTGATTCGCAAAGACTTCAGCAGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164214 AAATACCAGCCTCGAGTTCATGTGATTCGCAAAGACTTCAGCAGTGACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TTCACCCACTAAGCCTGTTCCTGTTGGGGATGGGGTGAAAACGTTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164264 TTCACCCACTAAGCCTGTTCCTGTTGGGGATGGGGTGAAAACGTTCAACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TTCCTGAGACTGTGTTCACCACAGTTACGGCCTATCAGAATCAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 164314 TTCCTGAGACTGTGTTCACCACAGTTACGGCCTATCAGAATCAGCAGGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    862       ATTACCAGATTAAAAATTGACCGAAACCCTTTTGCTAAAGGATT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164364 ...CAGATTACCAGATTAAAAATTGACCGAAACCCTTTTGCTAAAGGATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAGAGATTCTGGGAGAAACAG         AACTGGACTTGAAGCCATCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 173661 CAGAGATTCTGGGAGAAACAGGTA...CAGAACTGGACTTGAAGCCATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGGAGACATATGCATTCTGGAGACCTCCTGTGCGCACACTCACCTTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188691 TGGAGACATATGCATTCTGGAGACCTCCTGTGCGCACACTCACCTTCGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GACTTCACCACCATGCAGAAGCAGCAAG         GAGGCAGCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 188741 GACTTCACCACCATGCAGAAGCAGCAAGGTA...CAGGAGGCAGCACAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACTTCCCCAACCACCTCCAGCACTGGGACACCATCCCCTTCGGCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202293 CACTTCCCCAACCACCTCCAGCACTGGGACACCATCCCCTTCGGCTTCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTCATCTTTTATCTCCATCCTGTTCTCCTCCAACTTTTCATCTGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202343 CTCATCTTTTATCTCCATCCTGTTCTCCTCCAACTTTTCATCTGGCCCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AACACTTTCAATGTGGGCTGCCGAGAAAGCCAGCTGTGTAATCTAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202393 AACACTTTCAATGTGGGCTGCCGAGAAAGCCAGCTGTGTAATCTAAACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CTCTGATTATCCACCATGTGCCCGAAGCAACATGGCTGCCTTGCAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202443 CTCTGATTATCCACCATGTGCCCGAAGCAACATGGCTGCCTTGCAGAGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACCCAGGGCTGAGTGACAGTGGCTACAACAGGCTTCAGAGTGGCACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202493 ACCCAGGGCTGAGTGACAGTGGCTACAACAGGCTTCAGAGTGGCACCACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TCAGCCACTCAGCCCTCTGAAACCTTCATGCCTCAGAGGACTCCATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202543 TCAGCCACTCAGCCCTCTGAAACCTTCATGCCTCAGAGGACTCCATCCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GATCTCAGGAATACCAACTCCTCCCTCGTTGCCTGGCAACAGCAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202593 GATCTCAGGAATACCAACTCCTCCCTCGTTGCCTGGCAACAGCAAGATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 AAGCCTACGGTGGCCAGCTGGGGTCCTTTCCCACTTCCCAGTTTCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202643 AAGCCTACGGTGGCCAGCTGGGGTCCTTTCCCACTTCCCAGTTTCAGTAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GTCATGCAGGCAGGCAATGCTGCCTCCAGCTCCTCATCACCACACATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202693 GTCATGCAGGCAGGCAATGCTGCCTCCAGCTCCTCATCACCACACATGTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CGGGGGCAGCCACATGCAGCAGAGCTCCTACAATGCCTTCTCCCTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202743 CGGGGGCAGCCACATGCAGCAGAGCTCCTACAATGCCTTCTCCCTTCACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 ACCCTTACAACCTGTATGGATACAATTTCCCCACTTCCCCTAGGCTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202793 ACCCTTACAACCTGTATGGATACAATTTCCCCACTTCCCCTAGGCTAGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 GCAAGCCCGGAAAAACTGAGCGCCTCTCAAAGCACTTTACTCTGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202843 GCAAGCCCGGAAAAACTGAGCGCCTCTCAAAGCACTTTACTCTGTTCTTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 TCCTTCCAACGGGGCCTTTGGAGAGAGGCAGTACCTGCCGTCAGGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202893 TCCTTCCAACGGGGCCTTTGGAGAGAGGCAGTACCTGCCGTCAGGGATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AGCACAGCATGCACATGATTAGCCCTTCACCCAATAACCAACAGGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202943 AGCACAGCATGCACATGATTAGCCCTTCACCCAATAACCAACAGGCAACC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 AACACTTGTGATGGCCGGCAGTATGGGGCAGTTCCAGGCTCCTCCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202993 AACACTTGTGATGGCCGGCAGTATGGGGCAGTTCCAGGCTCCTCCTCCCA

   1850     .    :    .
   1788 GATGTCCGTGCACATGGTT
        |||||||||||||||||||
 203043 GATGTCCGTGCACATGGTT