seq1 = pF1KE3402.tfa, 447 bp
seq2 = pF1KE3402/gi568815579f_11787924.tfa (gi568815579f:11787924_12004886), 216963 bp

>pF1KE3402 447
>gi568815579f:11787924_12004886 (Chr19)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-148  (115692-115776)   100% ->
149-209  (115982-116042)   100% ->
210-447  (116726-116963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTGCTGTAGTCACAGGAGGTGTAGAGAGGACCCCGGGACATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTGCTGTAGTCACAGGAGGTGTAGAGAGGACCCCGGGACATCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGCCAGGAAATG         GAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGCCAGGAAATGGTG...CAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAGGAAACTCTACAAGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115720 AGAGGAAACTCTACAAGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTGTAG         GAAAAAGTTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115770 TCTGTAGGTA...TAGGAAAAAGTTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAG         GAGTCTCATAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 116016 GTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGTA...CAGGAGTCTCATAGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116740 AGAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAGGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116790 CAGGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AATAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116840 AATAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCCTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116890 CATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCCTATGAG

    450     .    :    .    :
    424 TATCAGGAATATGGACCGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||
 116940 TATCAGGAATATGGACCGAAGCCA