seq1 = pF1KE3401.tfa, 447 bp
seq2 = pF1KE3401/gi568815578r_5192391.tfa (gi568815578r:5192391_5392807), 200417 bp

>pF1KE3401 447
>gi568815578r:5192391_5392807 (Chr20)

(complement)

24-447  (99993-100417)   96%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     24 TTCA AAAGAACTTAGTGATTTGGCCCGTGACCCTCCAGCACAATGTTCT
        || |-|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99993 TTAATAAGGAACTTAGTGATTTGGCCCGTGACCCTCCAGCACAATGTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     73 GCAGGTCCAGTTGGGGATGATATGTTTCATTGGCAAGCCACAATTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100043 GCAGGTCCAGTTGGGGATGATATGTTTCACTGGCAAGCCACAATTATGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    123 ACCTAATGACAGCCCATATCAAGGCGGTGTATTCTTTTTGACAATTCATT
        |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
 100093 ACCTCATGACAGACCATATCAAGGCGGTGTATTCTTTTGGACAATTCGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    173 TTCCTACAGACTACCCCTTCAAACCACCTAAGGTTGCATTTACAACAAGA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100143 TTCCTACAGACTACCCCTTCAAACCATCTAAGGTTGCATTTACAACAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    223 ATTTATCATCCAAATATTAACAGTAATGGCAGCATTTGTCTCGATATTCT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||
 100193 ATTTATCACCCAAATATTAACAGTAATGGCAGCATTTTTCTTGACATTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    273 AAGATCACAGTGGTCGCCTGCTTTAACAATTTCTAAAGTTCTTTTATCCA
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100243 AAGATCACAGTGGTCGCCTGCTTTAACACTTTCTAAAGTTCTTTTATCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323 TTTGTTCACTGCTATGTGATCCAAACCCAGATGACCCCCTAGTGCCAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100293 TTTGTTCACTGCTATGTGATCCAAACCCAGATGATCCCCTAGTGCCAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    373 ATTGCACGGATCTATAAAACAGACAGAGATAAGTACAACAGAATATCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100343 ATTGCACGGATCTATAAAACAGACAGAGATAAGTACAACAGAATATCTCG

    400     .    :    .    :    .
    423 GGAATGGACTCAGAAGTATGCCATG
        |||||||||||||||||||||||||
 100393 GGAATGGACTCAGAAGTATGCCATG