seq1 = pF1KE3380.tfa, 3396 bp
seq2 = pF1KE3380/gi568815589f_4921988.tfa (gi568815589f:4921988_5226788), 304801 bp

>pF1KE3380 3396
>gi568815589f:4921988_5226788 (Chr9)

1-226  (100001-100226)   100% ->
227-350  (107796-107919)   100% ->
351-468  (122416-122533)   100% ->
469-614  (128699-128844)   99% ->
615-936  (132576-132897)   100% ->
937-1056  (133682-133801)   100% ->
1057-1214  (142896-143053)   100% ->
1215-1326  (144691-144802)   99% ->
1327-1513  (147035-147221)   100% ->
1514-1641  (147938-148065)   100% ->
1642-1776  (150505-150639)   100% ->
1777-1864  (151711-151798)   100% ->
1865-1992  (155466-155593)   100% ->
1993-2131  (156319-156457)   100% ->
2132-2283  (158242-158393)   100% ->
2284-2434  (158546-158696)   100% ->
2435-2571  (159738-159874)   99% ->
2572-2761  (167687-167876)   100% ->
2762-2886  (168459-168583)   100% ->
2887-3059  (168752-168924)   100% ->
3060-3177  (201017-201134)   100% ->
3178-3291  (204346-204459)   100% ->
3292-3396  (204697-204801)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAATGGCCTGCCTTACGATGACAGAAATGGAGGGAACATCCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAATGGCCTGCCTTACGATGACAGAAATGGAGGGAACATCCACCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTATATATCAGAATGGTGATATTTCTGGAAATGCCAATTCTATGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTATATATCAGAATGGTGATATTTCTGGAAATGCCAATTCTATGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAATAGATCCAGTTCTTCAGGTGTATCTTTACCATTCCCTTGGGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAATAGATCCAGTTCTTCAGGTGTATCTTTACCATTCCCTTGGGAAATCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGCAGATTATCTGACCTTTCCATCTGGGGAGTATGTTGCAGAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGCAGATTATCTGACCTTTCCATCTGGGGAGTATGTTGCAGAAGAAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGTATTGCTGCTTCTAAAGCTTGTG         GTATCACACCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100201 CTGTATTGCTGCTTCTAAAGCTTGTGGTA...TAGGTATCACACCTGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATCATAATATGTTTGCTTTAATGAGTGAAACAGAAAGGATCTGGTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107811 ATCATAATATGTTTGCTTTAATGAGTGAAACAGAAAGGATCTGGTATCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCAACCATGTCTTCCATATAGATGAGTCAACCAGGCATAATGTACTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107861 CCCAACCATGTCTTCCATATAGATGAGTCAACCAGGCATAATGTACTCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGAATAAG         ATTTTACTTTCCTCGTTGGTATTGCAGTGGCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 107911 CAGAATAAGGTA...TAGATTTTACTTTCCTCGTTGGTATTGCAGTGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAACAGAGCCTATCGGCATGGAATATCTCGAGGTGCTGAAGCTCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122448 GCAACAGAGCCTATCGGCATGGAATATCTCGAGGTGCTGAAGCTCCTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTTGATGACTTTGTCATGTCTTACCTCTTTGCTCAG         TGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 122498 CTTGATGACTTTGTCATGTCTTACCTCTTTGCTCAGGTA...TAGTGGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCATGATTTTGTGCATGGATGGATAAAAGTACCTGTGACTCATGAAACAC
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128704 GCATGATTTTGTGCACGGATGGATAAAAGTACCTGTGACTCATGAAACAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGAAGAATGTCTTGGGATGGCAGTGTTAGATATGATGAGAATAGCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128754 AGGAAGAATGTCTTGGGATGGCAGTGTTAGATATGATGAGAATAGCCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAAACGATCAAACCCCACTGGCCATCTATAACTCTATCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 128804 GAAAACGATCAAACCCCACTGGCCATCTATAACTCTATCAGGTA...TAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTACAAGACATTCTTACCAAAATGTATTCGAGCAAAGATCCAAGACTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132576 CTACAAGACATTCTTACCAAAATGTATTCGAGCAAAGATCCAAGACTATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATATTTTGACAAGGAAGCGAATAAGGTACAGATTTCGCAGATTTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132626 ATATTTTGACAAGGAAGCGAATAAGGTACAGATTTCGCAGATTTATTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CAATTCAGCCAATGCAAAGCCACTGCCAGAAACTTGAAACTTAAGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132676 CAATTCAGCCAATGCAAAGCCACTGCCAGAAACTTGAAACTTAAGTATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TATAAATCTGGAAACTCTGCAGTCTGCCTTCTACACAGAGAAATTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132726 TATAAATCTGGAAACTCTGCAGTCTGCCTTCTACACAGAGAAATTTGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TAAAAGAACCTGGAAGTGGTCCTTCAGGTGAGGAGATTTTTGCAACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132776 TAAAAGAACCTGGAAGTGGTCCTTCAGGTGAGGAGATTTTTGCAACCATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATAATAACTGGAAACGGTGGAATTCAGTGGTCAAGAGGGAAACATAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132826 ATAATAACTGGAAACGGTGGAATTCAGTGGTCAAGAGGGAAACATAAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AAGTGAGACACTGACAGAACAG         GATTTACAGTTATATTGCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 132876 AAGTGAGACACTGACAGAACAGGTA...TAGGATTTACAGTTATATTGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATTTTCCTAATATTATTGATGTCAGTATTAAGCAAGCAAACCAAGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133701 ATTTTCCTAATATTATTGATGTCAGTATTAAGCAAGCAAACCAAGAGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TCAAATGAAAGCCGAGTTGTAACTATCCATAAGCAAGATGGTAAAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133751 TCAAATGAAAGCCGAGTTGTAACTATCCATAAGCAAGATGGTAAAAATCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 G         GAAATTGAACTTAGCTCATTAAGGGAAGCTTTGTCTTTCG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133801 GGTA...TAGGAAATTGAACTTAGCTCATTAAGGGAAGCTTTGTCTTTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGTCATTAATTGATGGATATTATAGATTAACTGCAGATGCACATCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142936 TGTCATTAATTGATGGATATTATAGATTAACTGCAGATGCACATCATTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CTCTGTAAAGAAGTAGCACCTCCAGCCGTGCTTGAAAATATACAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142986 CTCTGTAAAGAAGTAGCACCTCCAGCCGTGCTTGAAAATATACAAAGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CTGTCATGGCCCAATTTC         GATGGATTTTGCCATTAGTAAAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 143036 CTGTCATGGCCCAATTTCGTG...TAGGATGGATTTTGCCATTAGTAAAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGAAGAAAGCAGGTAATCAGACTGGACTGTATGTACTTCGATGCAGCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 144714 TGAAGAAAGCAGGTAATCAGACTGGACTGTATGTACTTCGATGCAGTCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 AAGGACTTTAATAAATATTTTTTGACTTTTGCTGTCGAG         CG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 144764 AAGGACTTTAATAAATATTTTTTGACTTTTGCTGTCGAGGTT...CAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AGAAAATGTCATTGAATATAAACACTGTTTGATTACAAAAAATGAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147037 AGAAAATGTCATTGAATATAAACACTGTTTGATTACAAAAAATGAGAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AAGAGTACAACCTCAGTGGGACAAAGAAGAACTTCAGCAGTCTTAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147087 AAGAGTACAACCTCAGTGGGACAAAGAAGAACTTCAGCAGTCTTAAAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CTTTTGAATTGTTACCAGATGGAAACTGTTCGCTCAGACAATATAATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147137 CTTTTGAATTGTTACCAGATGGAAACTGTTCGCTCAGACAATATAATTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CCAGTTTACTAAATGCTGTCCCCCAAAGCCAAAAG         ATAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 147187 CCAGTTTACTAAATGCTGTCCCCCAAAGCCAAAAGGTA...CAGATAAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CAAACCTTCTAGTCTTCAGAACGAATGGTGTTTCTGATGTACCAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147944 CAAACCTTCTAGTCTTCAGAACGAATGGTGTTTCTGATGTACCAACCTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CCAACATTACAGAGGCCTACTCATATGAACCAAATGGTGTTTCACAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147994 CCAACATTACAGAGGCCTACTCATATGAACCAAATGGTGTTTCACAAAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CAGAAATGAAGATTTGATATTT         AATGAAAGCCTTGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 148044 CAGAAATGAAGATTTGATATTTGTA...AAGAATGAAAGCCTTGGCCAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GCACTTTTACAAAGATTTTTAAAGGCGTACGAAGAGAAGTAGGAGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150524 GCACTTTTACAAAGATTTTTAAAGGCGTACGAAGAGAAGTAGGAGACTAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GGTCAACTGCATGAAACAGAAGTTCTTTTAAAAGTTCTGGATAAAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150574 GGTCAACTGCATGAAACAGAAGTTCTTTTAAAAGTTCTGGATAAAGCACA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CAGAAACTATTCAGAG         TCTTTCTTTGAAGCAGCAAGTATGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 150624 CAGAAACTATTCAGAGGTG...TAGTCTTTCTTTGAAGCAGCAAGTATGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGAGCAAGCTTTCTCACAAGCATTTGGTTTTAAATTATGGAGTATGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151736 TGAGCAAGCTTTCTCACAAGCATTTGGTTTTAAATTATGGAGTATGTGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TGTGGAGACGAGA         ATATTCTGGTTCAGGAGTTTGTAAAATT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 151786 TGTGGAGACGAGAGTA...CAGATATTCTGGTTCAGGAGTTTGTAAAATT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TGGATCACTAGATACATATCTGAAAAAGAATAAAAATTGTATAAATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155494 TGGATCACTAGATACATATCTGAAAAAGAATAAAAATTGTATAAATATAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TATGGAAACTTGAAGTTGCTAAACAGTTGGCATGGGCCATGCATTTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155544 TATGGAAACTTGAAGTTGCTAAACAGTTGGCATGGGCCATGCATTTTCTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993          GAAGAAAACACCCTTATTCATGGGAATGTATGTGCCAAAAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155594 GTA...TAGGAAGAAAACACCCTTATTCATGGGAATGTATGTGCCAAAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TATTCTGCTTATCAGAGAAGAAGACAGGAAGACAGGAAATCCTCCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156360 TATTCTGCTTATCAGAGAAGAAGACAGGAAGACAGGAAATCCTCCTTTCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 TCAAACTTAGTGATCCTGGCATTAGTATTACAGTTTTGCCAAAGGACA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 156410 TCAAACTTAGTGATCCTGGCATTAGTATTACAGTTTTGCCAAAGGACAGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2132        TTCTTCAGGAGAGAATACCATGGGTACCACCTGAATGCATTGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156460 A...AAGTTCTTCAGGAGAGAATACCATGGGTACCACCTGAATGCATTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 AAATCCTAAAAATTTAAATTTGGCAACAGACAAATGGAGTTTTGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158285 AAATCCTAAAAATTTAAATTTGGCAACAGACAAATGGAGTTTTGGTACCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CTTTGTGGGAAATCTGCAGTGGAGGAGATAAACCTCTAAGTGCTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158335 CTTTGTGGGAAATCTGCAGTGGAGGAGATAAACCTCTAAGTGCTCTGGAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 TCTCAAAGA         AAGCTACAATTTTATGAAGATAGGCATCAGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 158385 TCTCAAAGAGTA...TAGAAGCTACAATTTTATGAAGATAGGCATCAGCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 TCCTGCACCAAAGTGGGCAGAATTAGCAAACCTTATAAATAATTGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158578 TCCTGCACCAAAGTGGGCAGAATTAGCAAACCTTATAAATAATTGTATGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 ATTATGAACCAGATTTCAGGCCTTCTTTCAGAGCCATCATACGAGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158628 ATTATGAACCAGATTTCAGGCCTTCTTTCAGAGCCATCATACGAGATCTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 AACAGTTTGTTTACTCCAG         ATTATGAACTATTAACAGAAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 158678 AACAGTTTGTTTACTCCAGGTA...CAGATTATGAACTATTAACAGAAAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 TGACATGTTACCAAATATGAGGATAGGTGCCCTAGGGTTTTCTGGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 159760 TGACATGTTACCAAATATGAGGATAGGTGCCCTGGGGTTTTCTGGTGCCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TTGAAGACCGGGATCCTACACAGTTTGAAGAGAGACATTTGAAATTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159810 TTGAAGACCGGGATCCTACACAGTTTGAAGAGAGACATTTGAAATTTCTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 CAGCAACTTGGCAAG         GGTAATTTTGGGAGTGTGGAGATGTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 159860 CAGCAACTTGGCAAGGTA...TAGGGTAATTTTGGGAGTGTGGAGATGTG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 CCGGTATGACCCTCTACAGGACAACACTGGGGAGGTGGTCGCTGTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167713 CCGGTATGACCCTCTACAGGACAACACTGGGGAGGTGGTCGCTGTAAAAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 AGCTTCAGCATAGTACTGAAGAGCACCTAAGAGACTTTGAAAGGGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167763 AGCTTCAGCATAGTACTGAAGAGCACCTAAGAGACTTTGAAAGGGAAATT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GAAATCCTGAAATCCCTACAGCATGACAACATTGTAAAGTACAAGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167813 GAAATCCTGAAATCCCTACAGCATGACAACATTGTAAAGTACAAGGGAGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 GTGCTACAGTGCTG         GTCGGCGTAATCTAAAATTAATTATGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 167863 GTGCTACAGTGCTGGTA...AAGGTCGGCGTAATCTAAAATTAATTATGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 AATATTTACCATATGGAAGTTTACGAGACTATCTTCAAAAACATAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168486 AATATTTACCATATGGAAGTTTACGAGACTATCTTCAAAAACATAAAGAA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 CGGATAGATCACATAAAACTTCTGCAGTACACATCTCAGATATGCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 168536 CGGATAGATCACATAAAACTTCTGCAGTACACATCTCAGATATGCAAGGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2887        GGTATGGAGTATCTTGGTACAAAAAGGTATATCCACAGGGATC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168586 A...TAGGGTATGGAGTATCTTGGTACAAAAAGGTATATCCACAGGGATC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2930 TGGCAACGAGAAATATATTGGTGGAGAACGAGAACAGAGTTAAAATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168795 TGGCAACGAGAAATATATTGGTGGAGAACGAGAACAGAGTTAAAATTGGA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 GATTTTGGGTTAACCAAAGTCTTGCCACAAGACAAAGAATACTATAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168845 GATTTTGGGTTAACCAAAGTCTTGCCACAAGACAAAGAATACTATAAAGT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 AAAAGAACCTGGTGAAAGTCCCATATTCTG         GTATGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 168895 AAAAGAACCTGGTGAAAGTCCCATATTCTGGTG...CAGGTATGCTCCAG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 AATCACTGACAGAGAGCAAGTTTTCTGTGGCCTCAGATGTTTGGAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201028 AATCACTGACAGAGAGCAAGTTTTCTGTGGCCTCAGATGTTTGGAGCTTT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 GGAGTGGTTCTGTATGAACTTTTCACATACATTGAGAAGAGTAAAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201078 GGAGTGGTTCTGTATGAACTTTTCACATACATTGAGAAGAGTAAAAGTCC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3171 ACCAGCG         GAATTTATGCGTATGATTGGCAATGACAAACAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201128 ACCAGCGGTC...TAGGAATTTATGCGTATGATTGGCAATGACAAACAAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3212 GACAGATGATCGTGTTCCATTTGATAGAACTTTTGAAGAATAATGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204380 GACAGATGATCGTGTTCCATTTGATAGAACTTTTGAAGAATAATGGAAGA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3262 TTACCAAGACCAGATGGATGCCCAGATGAG         ATCTATATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 204430 TTACCAAGACCAGATGGATGCCCAGATGAGGTA...CAGATCTATATGAT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3303 CATGACAGAATGCTGGAACAATAATGTAAATCAACGCCCCTCCTTTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204708 CATGACAGAATGCTGGAACAATAATGTAAATCAACGCCCCTCCTTTAGGG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :
   3353 ATCTAGCTCTTCGAGTGGATCAAATAAGGGATAACATGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204758 ATCTAGCTCTTCGAGTGGATCAAATAAGGGATAACATGGCTGGA