seq1 = pF1KE3379.tfa, 3390 bp
seq2 = pF1KE3379/gi568815582f_10777331.tfa (gi568815582f:10777331_11023300), 245970 bp

>pF1KE3379 3390
>gi568815582f:10777331_11023300 (Chr16)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-199  (117952-118098)   100% ->
200-295  (118339-118434)   100% ->
296-358  (121340-121402)   100% ->
359-436  (121595-121672)   100% ->
437-481  (124184-124228)   100% ->
482-628  (124708-124854)   100% ->
629-772  (125328-125471)   100% ->
773-937  (126401-126565)   100% ->
938-1006  (127414-127482)   100% ->
1007-2657  (129169-130819)   99% ->
2658-2816  (131699-131857)   98% ->
2817-2888  (132858-132929)   100% ->
2889-2969  (138240-138320)   100% ->
2970-3062  (139037-139129)   100% ->
3063-3149  (141110-141196)   100% ->
3150-3233  (144837-144920)   100% ->
3234-3317  (145077-145160)   100% ->
3318-3390  (145898-145970)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTTGCCTGGCTCCACGCCCTGCTGGGTCCTACCTGTCAGAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGTTGCCTGGCTCCACGCCCTGCTGGGTCCTACCTGTCAGAGCCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AG         GCAGCTCACAGTGTGCCACCATGGAGTTGGGGCCCCTAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGTA...CAGGCAGCTCACAGTGTGCCACCATGGAGTTGGGGCCCCTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGGTGGCTACCTGGAGCTTCTTAACAGCGATGCTGACCCCCTGTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117991 AAGGTGGCTACCTGGAGCTTCTTAACAGCGATGCTGACCCCCTGTGCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACCACTTCTATGACCAGATGGACCTGGCTGGAGAAGAAGAGATTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118041 TACCACTTCTATGACCAGATGGACCTGGCTGGAGAAGAAGAGATTGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACTCAG         AACCCGACACAGACACCATCAACTGCGACCAGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 118091 CTACTCAGGTG...CAGAACCCGACACAGACACCATCAACTGCGACCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAGCAGGCTGTTGTGTGACATGGAAGGTGATGAAGAGACCAGGGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118372 TCAGCAGGCTGTTGTGTGACATGGAAGGTGATGAAGAGACCAGGGAGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATGCCAATATCG         CGGAACTGGACCAGTATGTCTTCCAGGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 118422 TATGCCAATATCGGTG...CAGCGGAACTGGACCAGTATGTCTTCCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTCCCAGCTGGAGGGCCTGAGCAAGGACATTTTCA         AGCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 121368 CTCCCAGCTGGAGGGCCTGAGCAAGGACATTTTCAGTA...TAGAGCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TAGGACCAGATGAAGTGATCGGTGAGAGTATGGAGATGCCAGCAGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121601 TAGGACCAGATGAAGTGATCGGTGAGAGTATGGAGATGCCAGCAGAAGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGGCAGAAAAGTCAGAAAAGAC         CCTTCCCAGAGGAGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 121651 GGGCAGAAAAGTCAGAAAAGACGTG...CAGCCTTCCCAGAGGAGCTTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGCAGACCTGAAGCACTGGAAGCCAG         CTGAGCCCCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 124203 GGCAGACCTGAAGCACTGGAAGCCAGGTG...CAGCTGAGCCCCCCACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGGTGACTGGCAGTCTCCTAGTGGGACCAGTGAGCGACTGCTCCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124723 TGGTGACTGGCAGTCTCCTAGTGGGACCAGTGAGCGACTGCTCCACCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CCCTGCCTGCCACTGCCTGCGCTGTTCAACCAGGAGCCAGCCTCCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124773 CCCTGCCTGCCACTGCCTGCGCTGTTCAACCAGGAGCCAGCCTCCGGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GATGCGCCTGGAGAAAACCGACCAGATTCCCA         TGCCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 124823 GATGCGCCTGGAGAAAACCGACCAGATTCCCAGTA...CAGTGCCTTTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CCAGTTCCTCGTTGAGCTGCCTGAATCTCCCTGAGGGACCCATCCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125337 CCAGTTCCTCGTTGAGCTGCCTGAATCTCCCTGAGGGACCCATCCAGTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GTCCCCACCATCTCCACTCTGCCCCATGGGCTCTGGCAAATCTCTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125387 GTCCCCACCATCTCCACTCTGCCCCATGGGCTCTGGCAAATCTCTGAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGGAACAGGGGTCTCCAGTATATTCATCTACCATG         GTGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 125437 TGGAACAGGGGTCTCCAGTATATTCATCTACCATGGTG...TAGGTGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGCCCCAGGCCAGCCAAGTACCCCCTCCCAGTGGATTCACTGTCCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126407 TGCCCCAGGCCAGCCAAGTACCCCCTCCCAGTGGATTCACTGTCCACGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CTCCCAACATCTCCAGACCGGCCAGGCTCCACCAGCCCCTTCGCTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126457 CTCCCAACATCTCCAGACCGGCCAGGCTCCACCAGCCCCTTCGCTCCATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGCCACTGACCTGCCCAGCATGCCTGAACCTGCCCTGACCTCCCGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126507 AGCCACTGACCTGCCCAGCATGCCTGAACCTGCCCTGACCTCCCGAGCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACATGACAG         AGCACAAGACGTCCCCCACCCAATGCCCGGCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 126557 ACATGACAGGTA...CAGAGCACAAGACGTCCCCCACCCAATGCCCGGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GCTGGAGAGGTCTCCAACAAGCTTCCAAAATGGCCTG         AGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 127446 GCTGGAGAGGTCTCCAACAAGCTTCCAAAATGGCCTGGTG...CAGAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GGTGGAGCAGTTCTACCGCTCACTGCAGGACACGTATGGTGCCGAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129173 GGTGGAGCAGTTCTACCGCTCACTGCAGGACACGTATGGTGCCGAGCCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 CAGGCCCGGATGGCATCCTAGTGGAGGTGGATCTGGTGCAGGCCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129223 CAGGCCCGGATGGCATCCTAGTGGAGGTGGATCTGGTGCAGGCCAGGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GAGAGGAGCAGCAGCAAGAGCCTGGAGCGGGAACTGGCCACCCCGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129273 GAGAGGAGCAGCAGCAAGAGCCTGGAGCGGGAACTGGCCACCCCGGACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGCAGAACGGCAGCTGGCCCAAGGAGGCCTGGCTGAGGTGCTGTTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129323 GGCAGAACGGCAGCTGGCCCAAGGAGGCCTGGCTGAGGTGCTGTTGGCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CCAAGGAGCACCGGCGGCCGCGTGAGACACGAGTGATTGCTGTGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129373 CCAAGGAGCACCGGCGGCCGCGTGAGACACGAGTGATTGCTGTGCTGGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAAGCTGGTCAGGGCAAGAGCTATTGGGCTGGGGCAGTGAGCCGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129423 AAAGCTGGTCAGGGCAAGAGCTATTGGGCTGGGGCAGTGAGCCGGGCCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGCTTGTGGCCGGCTTCCCCAGTACGACTTTGTCTTCTCTGTCCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129473 GGCTTGTGGCCGGCTTCCCCAGTACGACTTTGTCTTCTCTGTCCCCTGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATTGCTTGAACCGTCCGGGGGATGCCTATGGCCTGCAGGATCTGCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129523 ATTGCTTGAACCGTCCGGGGGATGCCTATGGCCTGCAGGATCTGCTCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TCCCTGGGCCCACAGCCACTCGTGGCGGCCGATGAGGTTTTCAGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129573 TCCCTGGGCCCACAGCCACTCGTGGCGGCCGATGAGGTTTTCAGCCACAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CTTGAAGAGACCTGACCGCGTTCTGCTCATCCTAGACGGCTTCGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129623 CTTGAAGAGACCTGACCGCGTTCTGCTCATCCTAGACGGCTTCGAGGAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGGAAGCGCAAGATGGCTTCCTGCACAGCACGTGCGGACCGGCACCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129673 TGGAAGCGCAAGATGGCTTCCTGCACAGCACGTGCGGACCGGCACCGGCG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GAGCCCTGCTCCCTCCGGGGGCTGCTGGCCGGCCTTTTCCAGAAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129723 GAGCCCTGCTCCCTCCGGGGGCTGCTGGCCGGCCTTTTCCAGAAGAAGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GCTCCGAGGTTGCACCCTCCTCCTCACAGCCCGGCCCCGGGGCCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129773 GCTCCGAGGTTGCACCCTCCTCCTCACAGCCCGGCCCCGGGGCCGCCTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TCCAGAGCCTGAGCAAGGCCGACGCCCTATTTGAGCTGTCCGGCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129823 TCCAGAGCCTGAGCAAGGCCGACGCCCTATTTGAGCTGTCCGGCTTCTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 ATGGAGCAGGCCCAGGCATACGTGATGCGCTACTTTGAGAGCTCAGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129873 ATGGAGCAGGCCCAGGCATACGTGATGCGCTACTTTGAGAGCTCAGGGAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GACAGAGCACCAAGACAGAGCCCTGACGCTCCTCCGGGACCGGCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129923 GACAGAGCACCAAGACAGAGCCCTGACGCTCCTCCGGGACCGGCCACTTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TTCTCAGTCACAGCCACAGCCCTACTTTGTGCCGGGCAGTGTGCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129973 TTCTCAGTCACAGCCACAGCCCTACTTTGTGCCGGGCAGTGTGCCAGCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 TCAGAGGCCCTGCTGGAGCTTGGGGAGGACGCCAAGCTGCCCTCCACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130023 TCAGAGGCCCTGCTGGAGCTTGGGGAGGACGCCAAGCTGCCCTCCACGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CACGGGACTCTATGTCGGCCTGCTGGGCCGTGCAGCCCTCGACAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130073 CACGGGACTCTATGTCGGCCTGCTGGGCCGTGCAGCCCTCGACAGCCCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 CCGGGGCCCTGGCAGAGCTGGCCAAGCTGGCCTGGGAGCTGGGCCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130123 CCGGGGCCCTGGCAGAGCTGGCCAAGCTGGCCTGGGAGCTGGGCCGCAGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 CATCAAAGTACCCTACAGGAGGACCAGTTCCCATCCGCAGACGTGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130173 CATCAAAGTACCCTACAGGAGGACCAGTTCCCATCCGCAGACGTGAGGAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 CTGGGCGATGGCCAAAGGCTTAGTCCAACACCCACCGCGGGCCGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130223 CTGGGCGATGGCCAAAGGCTTAGTCCAACACCCACCGCGGGCCGCAGAGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 CCGAGCTGGCCTTCCCCAGCTTCCTCCTGCAATGCTTCCTGGGGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130273 CCGAGCTGGCCTTCCCCAGCTTCCTCCTGCAATGCTTCCTGGGGGCCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 TGGCTGGCTCTGAGTGGCGAAATCAAGGACAAGGAGCTCCCGCAGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130323 TGGCTGGCTCTGAGTGGCGAAATCAAGGACAAGGAGCTCCCGCAGTACCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 AGCATTGACCCCAAGGAAGAAGAGGCCCTATGACAACTGGCTGGAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130373 AGCATTGACCCCAAGGAAGAAGAGGCCCTATGACAACTGGCTGGAGGGCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 TGCCACGCTTTCTGGCTGGGCTGATCTTCCAGCCTCCCGCCCGCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130423 TGCCACGCTTTCTGGCTGGGCTGATCTTCCAGCCTCCCGCCCGCTGCCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 GGAGCCCTACTCGGGCCATCTGCGGCTGCCTCGGTGGACAGGAAGCAGAA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 130473 GGAGCCCTACTCGGGCCATCGGCGGCTGCCTCGGTGGACAGGAAGCAGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 GGTGCTTGCGAGGTACCTGAAGCGGCTGCAGCCGGGGACACTGCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130523 GGTGCTTGCGAGGTACCTGAAGCGGCTGCAGCCGGGGACACTGCGGGCGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2411 GGCAGCTGCTGGAGCTGCTGCACTGCGCCCACGAGGCCGAGGAGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130573 GGCAGCTGCTGGAGCTGCTGCACTGCGCCCACGAGGCCGAGGAGGCTGGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2461 ATTTGGCAGCACGTGGTACAGGAGCTCCCCGGCCGCCTCTCTTTTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130623 ATTTGGCAGCACGTGGTACAGGAGCTCCCCGGCCGCCTCTCTTTTCTGGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2511 CACCCGCCTCACGCCTCCTGATGCACATGTACTGGGCAAGGCCTTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130673 CACCCGCCTCACGCCTCCTGATGCACATGTACTGGGCAAGGCCTTGGAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2561 CGGCGGGCCAAGACTTCTCCCTGGACCTCCGCAGCACTGGCATTTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130723 CGGCGGGCCAAGACTTCTCCCTGGACCTCCGCAGCACTGGCATTTGCCCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2611 TCTGGATTGGGGAGCCTCGTGGGACTCAGCTGTGTCACCCGTTTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 130773 TCTGGATTGGGGAGCCTCGTGGGACTCAGCTGTGTCACCCGTTTCAGGTG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2658       GGCTGCCTTGAGCGACACAGTGGCGCTGTGGGAGTCCCTGCGGC
        ...>>>|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
 130823 ...CAGGGCTGCCTTGAGCGACACGGTGGCGCTGTGGGAGTCCCTGCAGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 AGCATGGGGAGACCAAGCTACTTCAGGCAGCAGAGGAGAAGTTCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131743 AGCATGGGGAGACCAAGCTACTTCAGGCAGCAGAGGAGAAGTTCACCATC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 GAGCCTTTCAAAGCCAAGTCCCTGAAGGATGTGGAAGACCTGGGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131793 GAGCCTTTCAAAGCCAAGTCCCTGAAGGATGTGGAAGACCTGGGAAAGCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2802 TGTGCAGACTCAGAG         GACGAGAAGTTCCTCGGAAGACACAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 131843 TGTGCAGACTCAGAGGTG...CAGGACGAGAAGTTCCTCGGAAGACACAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2843 CTGGGGAGCTCCCTGCTGTTCGGGACCTAAAGAAACTGGAGTTTGC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 132884 CTGGGGAGCTCCCTGCTGTTCGGGACCTAAAGAAACTGGAGTTTGCGTA.

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889      GCTGGGCCCTGTCTCAGGCCCCCAGGCTTTCCCCAAACTGGTGCG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132934 ..TAGGCTGGGCCCTGTCTCAGGCCCCCAGGCTTTCCCCAAACTGGTGCG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2934 GATCCTCACGGCCTTTTCCTCCCTGCAGCATCTGGA         CCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 138285 GATCCTCACGGCCTTTTCCTCCCTGCAGCATCTGGAGTG...CAGCCTGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2975 ATGCGCTGAGTGAGAACAAGATCGGGGACGAGGGTGTCTCGCAGCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139042 ATGCGCTGAGTGAGAACAAGATCGGGGACGAGGGTGTCTCGCAGCTCTCA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3025 GCCACCTTCCCCCAGCTGAAGTCCTTGGAAACCCTCAA         TCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 139092 GCCACCTTCCCCCAGCTGAAGTCCTTGGAAACCCTCAAGTG...CAGTCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3066 GTCCCAGAACAACATCACTGACCTGGGTGCCTACAAACTCGCCGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141113 GTCCCAGAACAACATCACTGACCTGGGTGCCTACAAACTCGCCGAGGCCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3116 TGCCTTCGCTCGCTGCATCCCTGCTCAGGCTAAG         CTTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 141163 TGCCTTCGCTCGCTGCATCCCTGCTCAGGCTAAGGTG...CAGCTTGTAC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3157 AATAACTGCATCTGCGACGTGGGAGCCGAGAGCTTGGCTCGTGTGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144844 AATAACTGCATCTGCGACGTGGGAGCCGAGAGCTTGGCTCGTGTGCTTCC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3207 GGACATGGTGTCCCTCCGGGTGATGGA         CGTCCAGTACAACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 144894 GGACATGGTGTCCCTCCGGGTGATGGAGTG...CAGCGTCCAGTACAACA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 AGTTCACGGCTGCCGGGGCCCAGCAGCTCGCTGCCAGCCTTCGGAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145091 AGTTCACGGCTGCCGGGGCCCAGCAGCTCGCTGCCAGCCTTCGGAGGTGT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3298 CCTCATGTGGAGACGCTGGC         GATGTGGACGCCCACCATCCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 145141 CCTCATGTGGAGACGCTGGCGTA...CAGGATGTGGACGCCCACCATCCC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3339 ATTCAGTGTCCAGGAACACCTGCAACAACAGGATTCACGGATCAGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145919 ATTCAGTGTCCAGGAACACCTGCAACAACAGGATTCACGGATCAGCCTGA

   3550 
   3389 GA
        ||
 145969 GA