Result of SIM4 for
pF1KE3375
seq1 = pF1KE3375.tfa, 3243 bp
seq2 = pF1KE3375/gi568815584r_70630383.tfa (gi568815584r:70630383_70909171), 278789 bp
>pF1KE3375 3243
>gi568815584r:70630383_70909171 (Chr14)
(complement)
1-406 (100001-100406) 99% ->
407-820 (108092-108505) 100% ->
821-1001 (147990-148170) 100% ->
1002-1150 (159091-159239) 100% ->
1151-1326 (160168-160343) 100% ->
1327-1567 (166581-166821) 100% ->
1568-1690 (169008-169130) 100% ->
1691-1844 (170774-170927) 100% ->
1845-1957 (174674-174786) 100% ->
1958-2761 (175830-176633) 100% ->
2762-3243 (178308-178789) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGAGCCCTCCAGAGCGCTTCTCGGCTGCCTAGCGAGCGCCGCCGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGAGCCCTCCAGAGCGCTTCTCGGCTGCCTAGCGAGCGCCGCCGCTGC
50 . : . : . : . : . :
51 GGCCCCGCCGGGGGAGGATGGAGCAGGGGCCGGGGCCGAGGAGGAGGAGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CGCCCCGCCGGGGGAGGATGGAGCAGGGGCCGGGGCCGAGGAGGAGGAGG
100 . : . : . : . : . :
101 AGGAGGAGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGTGGGCCCCGGGGAGCTGGGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AGGAGGAGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGTGGGCCCCGGGGAGCTGGGCTGC
150 . : . : . : . : . :
151 GACGCGCCGCTGCCCTACTGGACGGCCGTGTTCGAGTACGAGGCGGCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GACGCGCCGCTGCCCTACTGGACGGCCGTGTTCGAGTACGAGGCGGCGGG
200 . : . : . : . : . :
201 CGAGGACGAGCTGACCCTGCGGCTGGGCGACGTGGTGGAGGTGCTGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CGAGGACGAGCTGACCCTGCGGCTGGGCGACGTGGTGGAGGTGCTGTCCA
250 . : . : . : . : . :
251 AGGACTCGCAGGTGTCCGGCGACGAGGGCTGGTGGACCGGGCAGCTGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 AGGACTCGCAGGTGTCCGGCGACGAGGGCTGGTGGACCGGGCAGCTGAAC
300 . : . : . : . : . :
301 CAGCGGGTGGGCATCTTCCCCAGCAACTACGTGACCCCGCGCAGCGCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 CAGCGGGTGGGCATCTTCCCCAGCAACTACGTGACCCCGCGCAGCGCCTT
350 . : . : . : . : . :
351 CTCCAGCCGCTGCCAGCCCGGCGGCGAGGACCCCAGTTGCTACCCGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CTCCAGCCGCTGCCAGCCCGGCGGCGAGGACCCCAGTTGCTACCCGCCCA
400 . : . : . : . : . :
401 TTCAGT TGTTAGAAATTGATTTTGCGGAGCTCACCTTGGAA
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 TTCAGTGTA...CAGTGTTAGAAATTGATTTTGCGGAGCTCACCTTGGAA
450 . : . : . : . : . :
442 GAGATTATTGGCATCGGGGGCTTTGGGAAGGTCTATCGTGCTTTCTGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108127 GAGATTATTGGCATCGGGGGCTTTGGGAAGGTCTATCGTGCTTTCTGGAT
500 . : . : . : . : . :
492 AGGGGATGAGGTTGCTGTGAAAGCAGCTCGCCACGACCCTGATGAGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108177 AGGGGATGAGGTTGCTGTGAAAGCAGCTCGCCACGACCCTGATGAGGACA
550 . : . : . : . : . :
542 TCAGCCAGACCATAGAGAATGTTCGCCAAGAGGCCAAGCTCTTCGCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108227 TCAGCCAGACCATAGAGAATGTTCGCCAAGAGGCCAAGCTCTTCGCCATG
600 . : . : . : . : . :
592 CTGAAGCACCCCAACATCATTGCCCTAAGAGGGGTATGTCTGAAGGAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108277 CTGAAGCACCCCAACATCATTGCCCTAAGAGGGGTATGTCTGAAGGAGCC
650 . : . : . : . : . :
642 CAACCTCTGCTTGGTCATGGAGTTTGCTCGTGGAGGACCTTTGAATAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108327 CAACCTCTGCTTGGTCATGGAGTTTGCTCGTGGAGGACCTTTGAATAGAG
700 . : . : . : . : . :
692 TGTTATCTGGGAAAAGGATTCCCCCAGACATCCTGGTGAATTGGGCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108377 TGTTATCTGGGAAAAGGATTCCCCCAGACATCCTGGTGAATTGGGCTGTG
750 . : . : . : . : . :
742 CAGATTGCCAGAGGGATGAACTACTTACATGATGAGGCAATTGTTCCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108427 CAGATTGCCAGAGGGATGAACTACTTACATGATGAGGCAATTGTTCCCAT
800 . : . : . : . : . :
792 CATCCACCGCGACCTTAAGTCCAGCAACA TATTGATCCTCC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
108477 CATCCACCGCGACCTTAAGTCCAGCAACAGTG...TAGTATTGATCCTCC
850 . : . : . : . : . :
833 AGAAGGTGGAGAATGGAGACCTGAGCAACAAGATTCTGAAGATCACTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148002 AGAAGGTGGAGAATGGAGACCTGAGCAACAAGATTCTGAAGATCACTGAT
900 . : . : . : . : . :
883 TTTGGCCTGGCTCGGGAATGGCACCGAACCACCAAGATGAGTGCGGCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148052 TTTGGCCTGGCTCGGGAATGGCACCGAACCACCAAGATGAGTGCGGCAGG
950 . : . : . : . : . :
933 GACGTATGCTTGGATGGCACCCGAAGTCATCCGGGCCTCCATGTTTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148102 GACGTATGCTTGGATGGCACCCGAAGTCATCCGGGCCTCCATGTTTTCCA
1000 . : . : . : . : . :
983 AAGGCAGTGATGTGTGGAG CTATGGGGTGCTACTTTGGGAG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
148152 AAGGCAGTGATGTGTGGAGGTA...TAGCTATGGGGTGCTACTTTGGGAG
1050 . : . : . : . : . :
1024 TTGCTGACTGGTGAGGTGCCCTTTCGAGGCATTGATGGCTTAGCAGTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159113 TTGCTGACTGGTGAGGTGCCCTTTCGAGGCATTGATGGCTTAGCAGTCGC
1100 . : . : . : . : . :
1074 TTATGGAGTGGCCATGAACAAACTCGCCCTTCCTATTCCTTCTACGTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159163 TTATGGAGTGGCCATGAACAAACTCGCCCTTCCTATTCCTTCTACGTGCC
1150 . : . : . : . : . :
1124 CAGAACCTTTTGCCAAACTCATGGAAG ACTGCTGGAATCCT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
159213 CAGAACCTTTTGCCAAACTCATGGAAGGTA...CAGACTGCTGGAATCCT
1200 . : . : . : . : . :
1165 GATCCCCACTCACGACCATCTTTCACGAATATCCTGGACCAGCTAACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160182 GATCCCCACTCACGACCATCTTTCACGAATATCCTGGACCAGCTAACCAC
1250 . : . : . : . : . :
1215 CATAGAGGAGTCTGGTTTCTTTGAAATGCCCAAGGACTCCTTCCACTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160232 CATAGAGGAGTCTGGTTTCTTTGAAATGCCCAAGGACTCCTTCCACTGCC
1300 . : . : . : . : . :
1265 TGCAGGACAACTGGAAACACGAGATTCAGGAGATGTTTGACCAACTCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160282 TGCAGGACAACTGGAAACACGAGATTCAGGAGATGTTTGACCAACTCAGG
1350 . : . : . : . : . :
1315 GCCAAAGAAAAG GAACTTCGCACCTGGGAGGAGGAGCTGAC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
160332 GCCAAAGAAAAGGTA...CAGGAACTTCGCACCTGGGAGGAGGAGCTGAC
1400 . : . : . : . : . :
1356 GCGGGCTGCACTGCAGCAGAAGAACCAGGAGGAACTGCTGCGGCGTCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166610 GCGGGCTGCACTGCAGCAGAAGAACCAGGAGGAACTGCTGCGGCGTCGGG
1450 . : . : . : . : . :
1406 AGCAGGAGCTGGCCGAGCGGGAGATTGACATCCTGGAACGGGAGCTCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166660 AGCAGGAGCTGGCCGAGCGGGAGATTGACATCCTGGAACGGGAGCTCAAC
1500 . : . : . : . : . :
1456 ATCATCATCCACCAGCTGTGCCAGGAGAAGCCCCGGGTGAAGAAACGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166710 ATCATCATCCACCAGCTGTGCCAGGAGAAGCCCCGGGTGAAGAAACGCAA
1550 . : . : . : . : . :
1506 GGGCAAGTTCAGGAAGAGCCGGCTGAAGCTCAAGGATGGCAACCGCATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166760 GGGCAAGTTCAGGAAGAGCCGGCTGAAGCTCAAGGATGGCAACCGCATCA
1600 . : . : . : . : . :
1556 GCCTCCCTTCTG ATTTCCAGCACAAGTTCACGGTGCAGGCC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
166810 GCCTCCCTTCTGGTC...CAGATTTCCAGCACAAGTTCACGGTGCAGGCC
1650 . : . : . : . : . :
1597 TCCCCTACCATGGATAAAAGGAAGAGTCTTATCAACAGCCGCTCCAGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169037 TCCCCTACCATGGATAAAAGGAAGAGTCTTATCAACAGCCGCTCCAGTCC
1700 . : . : . : . : . :
1647 TCCTGCAAGCCCCACCATCATTCCTCGCCTTCGAGCCATCCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
169087 TCCTGCAAGCCCCACCATCATTCCTCGCCTTCGAGCCATCCAGTGTG...
1750 . : . : . : . : . :
1691 TGACACCAGGTGAAAGCAGCAAAACCTGGGGCAGGAGCTCAGTCGTC
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170771 CAGTGACACCAGGTGAAAGCAGCAAAACCTGGGGCAGGAGCTCAGTCGTC
1800 . : . : . : . : . :
1738 CCAAAGGAGGAAGGGGAGGAGGAGGAGAAGAGGGCCCCAAAGAAGAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170821 CCAAAGGAGGAAGGGGAGGAGGAGGAGAAGAGGGCCCCAAAGAAGAAGGG
1850 . : . : . : . : . :
1788 ACGGACGTGGGGGCCAGGGACGCTTGGTCAGAAGGAGCTTGCCTCGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170871 ACGGACGTGGGGGCCAGGGACGCTTGGTCAGAAGGAGCTTGCCTCGGGAG
1900 . : . : . : . : . :
1838 ATGAAGG CCTCAAGTCCCTGGTAGATGGATATAAGCAGTGG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
170921 ATGAAGGGTA...CAGCCTCAAGTCCCTGGTAGATGGATATAAGCAGTGG
1950 . : . : . : . : . :
1879 TCGTCCAGTGCCCCCAACCTGGTGAAGGGCCCAAGGAGTAGCCCGGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174708 TCGTCCAGTGCCCCCAACCTGGTGAAGGGCCCAAGGAGTAGCCCGGCCCT
2000 . : . : . : . : . :
1929 GCCAGGGTTCACCAGCCTTATGGAGATGG AGGATGAGGACA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
174758 GCCAGGGTTCACCAGCCTTATGGAGATGGGTA...CAGAGGATGAGGACA
2050 . : . : . : . : . :
1970 GTGAAGGCCCAGGGAGTGGAGAGAGTCGCCTACAGCATTCACCCAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175842 GTGAAGGCCCAGGGAGTGGAGAGAGTCGCCTACAGCATTCACCCAGCCAG
2100 . : . : . : . : . :
2020 TCCTACCTCTGTATCCCATTCCCTCGTGGAGAGGATGGCGATGGCCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175892 TCCTACCTCTGTATCCCATTCCCTCGTGGAGAGGATGGCGATGGCCCCTC
2150 . : . : . : . : . :
2070 CAGTGATGGAATCCATGAGGAGCCCACCCCAGTCAACTCGGCCACGAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175942 CAGTGATGGAATCCATGAGGAGCCCACCCCAGTCAACTCGGCCACGAGTA
2200 . : . : . : . : . :
2120 CCCCTCAGCTGACGCCAACCAACAGCCTCAAGCGGGGCGGTGCCCACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175992 CCCCTCAGCTGACGCCAACCAACAGCCTCAAGCGGGGCGGTGCCCACCAC
2250 . : . : . : . : . :
2170 CGCCGCTGCGAGGTGGCTCTGCTCGGCTGTGGGGCTGTTCTGGCAGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176042 CGCCGCTGCGAGGTGGCTCTGCTCGGCTGTGGGGCTGTTCTGGCAGCCAC
2300 . : . : . : . : . :
2220 AGGCCTAGGGTTTGACTTGCTGGAAGCTGGCAAGTGCCAGCTGCTTCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176092 AGGCCTAGGGTTTGACTTGCTGGAAGCTGGCAAGTGCCAGCTGCTTCCCC
2350 . : . : . : . : . :
2270 TGGAGGAGCCTGAGCCACCAGCCCGGGAGGAGAAGAAAAGACGGGAGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176142 TGGAGGAGCCTGAGCCACCAGCCCGGGAGGAGAAGAAAAGACGGGAGGGT
2400 . : . : . : . : . :
2320 CTTTTTCAGAGGTCCAGCCGTCCTCGTCGGAGCACCAGCCCCCCATCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176192 CTTTTTCAGAGGTCCAGCCGTCCTCGTCGGAGCACCAGCCCCCCATCCCG
2450 . : . : . : . : . :
2370 AAAGCTTTTCAAGAAGGAGGAGCCCATGCTGTTGCTAGGAGACCCCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176242 AAAGCTTTTCAAGAAGGAGGAGCCCATGCTGTTGCTAGGAGACCCCTCTG
2500 . : . : . : . : . :
2420 CCTCCCTGACGCTGCTCTCCCTCTCCTCCATCTCCGAGTGCAACTCCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176292 CCTCCCTGACGCTGCTCTCCCTCTCCTCCATCTCCGAGTGCAACTCCACA
2550 . : . : . : . : . :
2470 CGCTCCCTGCTGCGCTCCGACAGCGATGAAATTGTCGTGTATGAGATGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176342 CGCTCCCTGCTGCGCTCCGACAGCGATGAAATTGTCGTGTATGAGATGCC
2600 . : . : . : . : . :
2520 AGTCAGCCCAGTCGAGGCCCCTCCCCTGAGTCCATGTACCCACAACCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176392 AGTCAGCCCAGTCGAGGCCCCTCCCCTGAGTCCATGTACCCACAACCCCC
2650 . : . : . : . : . :
2570 TGGTCAATGTCCGAGTAGAGCGCTTCAAACGAGATCCTAACCAATCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176442 TGGTCAATGTCCGAGTAGAGCGCTTCAAACGAGATCCTAACCAATCTCTG
2700 . : . : . : . : . :
2620 ACTCCCACCCATGTCACCCTCACCACCCCCTCGCAGCCCAGCAGTCACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176492 ACTCCCACCCATGTCACCCTCACCACCCCCTCGCAGCCCAGCAGTCACCG
2750 . : . : . : . : . :
2670 GCGGACTCCTTCTGATGGGGCCCTTAAGCCAGAGACTCTCCTAGCCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176542 GCGGACTCCTTCTGATGGGGCCCTTAAGCCAGAGACTCTCCTAGCCAGCA
2800 . : . : . : . : . :
2720 GGAGCCCCTCCAGCAATGGGTTGAGCCCCAGTCCTGGAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
176592 GGAGCCCCTCCAGCAATGGGTTGAGCCCCAGTCCTGGAGCAGGTG...CA
2850 . : . : . : . : . :
2762 GAATGTTGAAAACCCCCAGTCCCAGCCGAGACCCAGGTGAATTCCCCCG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178307 GGAATGTTGAAAACCCCCAGTCCCAGCCGAGACCCAGGTGAATTCCCCCG
2900 . : . : . : . : . :
2811 TCTCCCTGACCCCAATGTGGTCTTCCCCCCAACCCCAAGGCGCTGGAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178357 TCTCCCTGACCCCAATGTGGTCTTCCCCCCAACCCCAAGGCGCTGGAACA
2950 . : . : . : . : . :
2861 CTCAGCAGGACTCTACCTTGGAGAGACCCAAGACTCTGGAGTTTCTGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178407 CTCAGCAGGACTCTACCTTGGAGAGACCCAAGACTCTGGAGTTTCTGCCT
3000 . : . : . : . : . :
2911 CGGCCGCGTCCTTCTGCCAACCGGCAACGGCTGGACCCTTGGTGGTTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178457 CGGCCGCGTCCTTCTGCCAACCGGCAACGGCTGGACCCTTGGTGGTTTGT
3050 . : . : . : . : . :
2961 GTCCCCCAGCCATGCCCGCAGCACCTCCCCAGCCAACAGCTCCAGCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178507 GTCCCCCAGCCATGCCCGCAGCACCTCCCCAGCCAACAGCTCCAGCACAG
3100 . : . : . : . : . :
3011 AGACGCCCAGCAACCTGGACTCCTGCTTTGCTAGCAGTAGCAGCACTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178557 AGACGCCCAGCAACCTGGACTCCTGCTTTGCTAGCAGTAGCAGCACTGTA
3150 . : . : . : . : . :
3061 GAGGAGCGGCCTGGACTTCCAGCCCTGCTCCCGTTCCAGGCAGGGCCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178607 GAGGAGCGGCCTGGACTTCCAGCCCTGCTCCCGTTCCAGGCAGGGCCGCT
3200 . : . : . : . : . :
3111 GCCCCCGACTGAGCGGACGCTCCTGGACCTGGATGCAGAGGGGCAGAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178657 GCCCCCGACTGAGCGGACGCTCCTGGACCTGGATGCAGAGGGGCAGAGTC
3250 . : . : . : . : . :
3161 AGGACAGCACCGTGCCGCTGTGCAGAGCGGAACTGAACACACACAGGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178707 AGGACAGCACCGTGCCGCTGTGCAGAGCGGAACTGAACACACACAGGCCT
3300 . : . : . :
3211 GCCCCTTATGAGATCCAGCAGGAGTTCTGGTCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||
178757 GCCCCTTATGAGATCCAGCAGGAGTTCTGGTCT