seq1 = pF1KE3369.tfa, 3267 bp
seq2 = pF1KE3369/gi568815594f_54158769.tfa (gi568815594f:54158769_54395269), 236501 bp

>pF1KE3369 3267
>gi568815594f:54158769_54395269 (Chr4)

1-49  (100001-100049)   100% ->
50-367  (102327-102644)   100% ->
368-628  (104899-105159)   100% ->
629-759  (106151-106281)   100% ->
760-931  (108521-108692)   100% ->
932-1121  (108784-108973)   100% ->
1122-1237  (111865-111980)   100% ->
1238-1364  (113626-113752)   100% ->
1365-1558  (114769-114962)   100% ->
1559-1653  (115763-115857)   100% ->
1654-1786  (116073-116205)   99% ->
1787-1891  (118620-118724)   100% ->
1892-2002  (119128-119238)   100% ->
2003-2156  (119594-119747)   100% ->
2157-2323  (121548-121714)   100% ->
2324-2439  (126603-126718)   100% ->
2440-2562  (127073-127195)   100% ->
2563-2674  (128662-128773)   100% ->
2675-2774  (130031-130130)   100% ->
2775-2880  (130241-130346)   100% ->
2881-3122  (131545-131786)   100% ->
3123-3267  (136357-136501)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACTTCCCATCCGGCGTTCCTGGTCTTAGGCTGTCTTCTCACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100001 ATGGGGACTTCCCATCCGGCGTTCCTGGTCTTAGGCTGTCTTCTCACAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50         GGCTGAGCCTAATCCTCTGCCAGCTTTCATTACCCTCTATCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TA...CAGGGCTGAGCCTAATCCTCTGCCAGCTTTCATTACCCTCTATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCCAAATGAAAATGAAAAGGTTGTGCAGCTGAATTCATCCTTTTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102369 TTCCAAATGAAAATGAAAAGGTTGTGCAGCTGAATTCATCCTTTTCTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGATGCTTTGGGGAGAGTGAAGTGAGCTGGCAGTACCCCATGTCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102419 AGATGCTTTGGGGAGAGTGAAGTGAGCTGGCAGTACCCCATGTCTGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAGAGCTCCGATGTGGAAATCAGAAATGAAGAAAACAACAGCGGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102469 AGAGAGCTCCGATGTGGAAATCAGAAATGAAGAAAACAACAGCGGCCTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGTGACGGTCTTGGAAGTGAGCAGTGCCTCGGCGGCCCACACAGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102519 TTGTGACGGTCTTGGAAGTGAGCAGTGCCTCGGCGGCCCACACAGGGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACACTTGCTATTACAACCACACTCAGACAGAAGAGAATGAGCTTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102569 TACACTTGCTATTACAACCACACTCAGACAGAAGAGAATGAGCTTGAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGGCACATTTACATCTATGTGCCAG         ACCCAGATGTAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102619 CAGGCACATTTACATCTATGTGCCAGGTG...CAGACCCAGATGTAGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGTACCTCTAGGAATGACGGATTATTTAGTCATCGTGGAGGATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104914 TTGTACCTCTAGGAATGACGGATTATTTAGTCATCGTGGAGGATGATGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCTGCCATTATACCTTGTCGCACAACTGATCCCGAGACTCCTGTAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104964 TCTGCCATTATACCTTGTCGCACAACTGATCCCGAGACTCCTGTAACCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACACAACAGTGAGGGGGTGGTACCTGCCTCCTACGACAGCAGACAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105014 ACACAACAGTGAGGGGGTGGTACCTGCCTCCTACGACAGCAGACAGGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTAATGGGACCTTCACTGTAGGGCCCTATATCTGTGAGGCCACCGTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105064 TTAATGGGACCTTCACTGTAGGGCCCTATATCTGTGAGGCCACCGTCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGAAAGAAGTTCCAGACCATCCCATTTAATGTTTATGCTTTAAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 105114 GGAAAGAAGTTCCAGACCATCCCATTTAATGTTTATGCTTTAAAAGGTA.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629      CAACATCAGAGCTGGATCTAGAAATGGAAGCTCTTAAAACCGTGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105164 ..TAGCAACATCAGAGCTGGATCTAGAAATGGAAGCTCTTAAAACCGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATAAGTCAGGGGAAACGATTGTGGTCACCTGTGCTGTTTTTAACAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106196 ATAAGTCAGGGGAAACGATTGTGGTCACCTGTGCTGTTTTTAACAATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTGGTTGACCTTCAATGGACTTACCCTGGAGAAGTG         AAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106246 GTGGTTGACCTTCAATGGACTTACCCTGGAGAAGTGGTA...TAGAAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAAAGGCATCACAATGCTGGAAGAAATCAAAGTCCCATCCATCAAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108526 CAAAGGCATCACAATGCTGGAAGAAATCAAAGTCCCATCCATCAAATTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGTACACTTTGACGGTCCCCGAGGCCACGGTGAAAGACAGTGGAGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108576 TGTACACTTTGACGGTCCCCGAGGCCACGGTGAAAGACAGTGGAGATTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GAATGTGCTGCCCGCCAGGCTACCAGGGAGGTCAAAGAAATGAAGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108626 GAATGTGCTGCCCGCCAGGCTACCAGGGAGGTCAAAGAAATGAAGAAAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CACTATTTCTGTCCATG         AGAAAGGTTTCATTGAAATCAAAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108676 CACTATTTCTGTCCATGGTA...CAGAGAAAGGTTTCATTGAAATCAAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCACCTTCAGCCAGTTGGAAGCTGTCAACCTGCATGAAGTCAAACATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108808 CCACCTTCAGCCAGTTGGAAGCTGTCAACCTGCATGAAGTCAAACATTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GTTGTAGAGGTGCGGGCCTACCCACCTCCCAGGATATCCTGGCTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108858 GTTGTAGAGGTGCGGGCCTACCCACCTCCCAGGATATCCTGGCTGAAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAATCTGACTCTGATTGAAAATCTCACTGAGATCACCACTGATGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108908 CAATCTGACTCTGATTGAAAATCTCACTGAGATCACCACTGATGTGGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGATTCAGGAAATAAG         GTATCGAAGCAAATTAAAGCTGATC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 108958 AGATTCAGGAAATAAGGTA...AAGGTATCGAAGCAAATTAAAGCTGATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CGTGCTAAGGAAGAAGACAGTGGCCATTATACTATTGTAGCTCAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111890 CGTGCTAAGGAAGAAGACAGTGGCCATTATACTATTGTAGCTCAAAATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AGATGCTGTGAAGAGCTATACTTTTGAACTGTTAACTCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111940 AGATGCTGTGAAGAGCTATACTTTTGAACTGTTAACTCAAGGTA...CAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTCCTTCATCCATTCTGGACTTGGTCGATGATCACCATGGCTCAACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113626 TTCCTTCATCCATTCTGGACTTGGTCGATGATCACCATGGCTCAACTGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GGACAGACGGTGAGGTGCACAGCTGAAGGCACGCCGCTTCCTGATATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113676 GGACAGACGGTGAGGTGCACAGCTGAAGGCACGCCGCTTCCTGATATTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GTGGATGATATGCAAAGATATTAAGAA         ATGTAATAATGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 113726 GTGGATGATATGCAAAGATATTAAGAAGTA...TAGATGTAATAATGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CTTCCTGGACTATTTTGGCCAACAATGTCTCAAACATCATCACGGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114783 CTTCCTGGACTATTTTGGCCAACAATGTCTCAAACATCATCACGGAGATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CACTCCCGAGACAGGAGTACCGTGGAGGGCCGTGTGACTTTCGCCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114833 CACTCCCGAGACAGGAGTACCGTGGAGGGCCGTGTGACTTTCGCCAAAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GGAGGAGACCATCGCCGTGCGATGCCTGGCTAAGAATCTCCTTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114883 GGAGGAGACCATCGCCGTGCGATGCCTGGCTAAGAATCTCCTTGGAGCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 AGAACCGAGAGCTGAAGCTGGTGGCTCCCA         CCCTGCGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 114933 AGAACCGAGAGCTGAAGCTGGTGGCTCCCAGTG...TAGCCCTGCGTTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GAACTCACGGTGGCTGCTGCAGTCCTGGTGCTGTTGGTGATTGTGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115774 GAACTCACGGTGGCTGCTGCAGTCCTGGTGCTGTTGGTGATTGTGATCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CTCACTTATTGTCCTGGTTGTCATTTGGAAACAG         AAACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 115824 CTCACTTATTGTCCTGGTTGTCATTTGGAAACAGGTA...TAGAAACCGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GGTATGAAATTCGCTGGAGGGTCATTGAATCAATCAGCCCGGATGGACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 116080 GGTATGAAATTCGCTGGAGGGTCATTGAATCAATCAGCCCAGATGGACAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GAATATATTTATGTGGACCCGATGCAGCTGCCTTATGACTCAAGATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116130 GAATATATTTATGTGGACCCGATGCAGCTGCCTTATGACTCAAGATGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GTTTCCAAGAGATGGACTAGTGCTTG         GTCGGGTCTTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 116180 GTTTCCAAGAGATGGACTAGTGCTTGGTA...CAGGTCGGGTCTTGGGGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CTGGAGCGTTTGGGAAGGTGGTTGAAGGAACAGCCTATGGATTAAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118635 CTGGAGCGTTTGGGAAGGTGGTTGAAGGAACAGCCTATGGATTAAGCCGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TCCCAACCTGTCATGAAAGTTGCAGTGAAGATGCTAAAAC         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 118685 TCCCAACCTGTCATGAAAGTTGCAGTGAAGATGCTAAAACGTA...CAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CACGGCCAGATCCAGTGAAAAACAAGCTCTCATGTCTGAACTGAAGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119129 CACGGCCAGATCCAGTGAAAAACAAGCTCTCATGTCTGAACTGAAGATAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TGACTCACCTGGGGCCACATTTGAACATTGTAAACTTGCTGGGAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119179 TGACTCACCTGGGGCCACATTTGAACATTGTAAACTTGCTGGGAGCCTGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 ACCAAGTCAG         GCCCCATTTACATCATCACAGAGTATTGCTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 119229 ACCAAGTCAGGTG...TAGGCCCCATTTACATCATCACAGAGTATTGCTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CTATGGAGATTTGGTCAACTATTTGCATAAGAATAGGGATAGCTTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119625 CTATGGAGATTTGGTCAACTATTTGCATAAGAATAGGGATAGCTTCCTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GCCACCACCCAGAGAAGCCAAAGAAAGAGCTGGATATCTTTGGATTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119675 GCCACCACCCAGAGAAGCCAAAGAAAGAGCTGGATATCTTTGGATTGAAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 CCTGCTGATGAAAGCACACGGAG         CTATGTTATTTTATCTTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 119725 CCTGCTGATGAAAGCACACGGAGGTG...CAGCTATGTTATTTTATCTTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 TGAAAACAATGGTGACTACATGGACATGAAGCAGGCTGATACTACACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121566 TGAAAACAATGGTGACTACATGGACATGAAGCAGGCTGATACTACACAGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 ATGTCCCCATGCTAGAAAGGAAAGAGGTTTCTAAATATTCCGACATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121616 ATGTCCCCATGCTAGAAAGGAAAGAGGTTTCTAAATATTCCGACATCCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 AGATCACTCTATGATCGTCCAGCCTCATATAAGAAGAAATCTATGTTAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 121666 AGATCACTCTATGATCGTCCAGCCTCATATAAGAAGAAATCTATGTTAGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2324         ACTCAGAAGTCAAAAACCTCCTTTCAGATGATAACTCAGAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121716 TA...CAGACTCAGAAGTCAAAAACCTCCTTTCAGATGATAACTCAGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 GCCTTACTTTATTGGATTTGTTGAGCTTCACCTATCAAGTTGCCCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126645 GCCTTACTTTATTGGATTTGTTGAGCTTCACCTATCAAGTTGCCCGAGGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 ATGGAGTTTTTGGCTTCAAAAAAT         TGTGTCCACCGTGATCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 126695 ATGGAGTTTTTGGCTTCAAAAAATGTA...CAGTGTGTCCACCGTGATCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 GGCTGCTCGCAACGTCCTCCTGGCACAAGGAAAAATTGTGAAGATCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127090 GGCTGCTCGCAACGTCCTCCTGGCACAAGGAAAAATTGTGAAGATCTGTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 ACTTTGGCCTGGCCAGAGACATCATGCATGATTCGAACTATGTGTCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127140 ACTTTGGCCTGGCCAGAGACATCATGCATGATTCGAACTATGTGTCGAAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 GGCAGT         ACCTTTCTGCCCGTGAAGTGGATGGCTCCTGAGAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127190 GGCAGTGTA...CAGACCTTTCTGCCCGTGAAGTGGATGGCTCCTGAGAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 CATCTTTGACAACCTCTACACCACACTGAGTGATGTCTGGTCTTATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128697 CATCTTTGACAACCTCTACACCACACTGAGTGATGTCTGGTCTTATGGCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 TTCTGCTCTGGGAGATCTTTTCCCTTG         GTGGCACCCCTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 128747 TTCTGCTCTGGGAGATCTTTTCCCTTGGTA...TAGGTGGCACCCCTTAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 CCCGGCATGATGGTGGATTCTACTTTCTACAATAAGATCAAGAGTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130045 CCCGGCATGATGGTGGATTCTACTTTCTACAATAAGATCAAGAGTGGGTA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 CCGGATGGCCAAGCCTGACCACGCTACCAGTGAAGT         CTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 130095 CCGGATGGCCAAGCCTGACCACGCTACCAGTGAAGTGTG...CAGCTACG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 AGATCATGGTGAAATGCTGGAACAGTGAGCCGGAGAAGAGACCCTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130246 AGATCATGGTGAAATGCTGGAACAGTGAGCCGGAGAAGAGACCCTCCTTT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 TACCACCTGAGTGAGATTGTGGAGAATCTGCTGCCTGGACAATATAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130296 TACCACCTGAGTGAGATTGTGGAGAATCTGCTGCCTGGACAATATAAAAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 G         AGTTATGAAAAAATTCACCTGGACTTCCTGAAGAGTGACC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130346 GGTG...TAGAGTTATGAAAAAATTCACCTGGACTTCCTGAAGAGTGACC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 ATCCTGCTGTGGCACGCATGCGTGTGGACTCAGACAATGCATACATTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131585 ATCCTGCTGTGGCACGCATGCGTGTGGACTCAGACAATGCATACATTGGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 GTCACCTACAAAAACGAGGAAGACAAGCTGAAGGACTGGGAGGGTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131635 GTCACCTACAAAAACGAGGAAGACAAGCTGAAGGACTGGGAGGGTGGTCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 GGATGAGCAGAGACTGAGCGCTGACAGTGGCTACATCATTCCTCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131685 GGATGAGCAGAGACTGAGCGCTGACAGTGGCTACATCATTCCTCTGCCTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 ACATTGACCCTGTCCCTGAGGAGGAGGACCTGGGCAAGAGGAACAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131735 ACATTGACCCTGTCCCTGAGGAGGAGGACCTGGGCAAGAGGAACAGACAC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 AG         CTCGCAGACCTCTGAAGAGAGTGCCATTGAGACGGGTTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131785 AGGTA...CAGCTCGCAGACCTCTGAAGAGAGTGCCATTGAGACGGGTTC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3162 CAGCAGTTCCACCTTCATCAAGAGAGAGGACGAGACCATTGAAGACATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136396 CAGCAGTTCCACCTTCATCAAGAGAGAGGACGAGACCATTGAAGACATCG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3212 ACATGATGGACGACATCGGCATAGACTCTTCAGACCTGGTGGAAGACAGC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136446 ACATGATGGATGACATCGGCATAGACTCTTCAGACCTGGTGGAAGACAGC

   3450     .
   3262 TTCCTG
        ||||||
 136496 TTCCTG