Result of SIM4 for
pF1KE3363
seq1 = pF1KE3363.tfa, 3210 bp
seq2 = pF1KE3363/gi568815592f_42976489.tfa (gi568815592f:42976489_43260878), 284390 bp
>pF1KE3363 3210
>gi568815592f:42976489_43260878 (Chr6)
1-79 (100001-100079) 100% ->
80-367 (152489-152776) 100% ->
368-470 (153239-153341) 100% ->
471-661 (153742-153932) 100% ->
662-812 (154023-154173) 100% ->
813-961 (155528-155676) 100% ->
962-1228 (155933-156199) 100% ->
1229-1362 (162361-162494) 100% ->
1363-1498 (162648-162783) 100% ->
1499-1618 (162918-163037) 100% ->
1619-1768 (165180-165329) 100% ->
1769-1919 (165443-165593) 99% ->
1920-2047 (165684-165811) 100% ->
2048-2251 (166929-167132) 100% ->
2252-2407 (167963-168118) 100% ->
2408-2640 (168712-168944) 100% ->
2641-2721 (170130-170210) 100% ->
2722-2873 (182329-182480) 100% ->
2874-3052 (183300-183478) 100% ->
3053-3210 (184233-184390) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGAGCTGCGCGGGGATCCCCGGCCAGACCCCGCCGGTTGCCTCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGGAGCTGCGCGGGGATCCCCGGCCAGACCCCGCCGGTTGCCTCTGCT
50 . : . : . : . : . :
51 CAGCGTCCTGCTGCTGCCGCTGCTGGGCG GTACCCAGACAG
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
100051 CAGCGTCCTGCTGCTGCCGCTGCTGGGCGGTG...CAGGTACCCAGACAG
100 . : . : . : . : . :
92 CCATTGTCTTCATCAAGCAGCCGTCCTCCCAGGATGCACTGCAGGGGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152501 CCATTGTCTTCATCAAGCAGCCGTCCTCCCAGGATGCACTGCAGGGGCGC
150 . : . : . : . : . :
142 CGGGCGCTGCTTCGCTGTGAGGTTGAGGCTCCGGGCCCGGTACATGTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152551 CGGGCGCTGCTTCGCTGTGAGGTTGAGGCTCCGGGCCCGGTACATGTGTA
200 . : . : . : . : . :
192 CTGGCTGCTCGATGGGGCCCCTGTCCAGGACACGGAGCGGCGTTTCGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152601 CTGGCTGCTCGATGGGGCCCCTGTCCAGGACACGGAGCGGCGTTTCGCCC
250 . : . : . : . : . :
242 AGGGCAGCAGCCTGAGCTTTGCAGCTGTGGACCGGCTGCAGGACTCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152651 AGGGCAGCAGCCTGAGCTTTGCAGCTGTGGACCGGCTGCAGGACTCTGGC
300 . : . : . : . : . :
292 ACCTTCCAGTGTGTGGCTCGGGATGATGTCACTGGAGAAGAAGCCCGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152701 ACCTTCCAGTGTGTGGCTCGGGATGATGTCACTGGAGAAGAAGCCCGCAG
350 . : . : . : . : . :
342 TGCCAACGCCTCCTTCAACATCAAAT GGATTGAGGCAGGTC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
152751 TGCCAACGCCTCCTTCAACATCAAATGTG...CAGGGATTGAGGCAGGTC
400 . : . : . : . : . :
383 CTGTGGTCCTGAAGCATCCAGCCTCGGAAGCTGAGATCCAGCCACAGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153254 CTGTGGTCCTGAAGCATCCAGCCTCGGAAGCTGAGATCCAGCCACAGACC
450 . : . : . : . : . :
433 CAGGTCACACTTCGTTGCCACATTGATGGGCACCCTCG GCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
153304 CAGGTCACACTTCGTTGCCACATTGATGGGCACCCTCGGTA...CAGGCC
500 . : . : . : . : . :
474 CACCTACCAATGGTTCCGAGATGGGACCCCCCTTTCTGATGGTCAGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153745 CACCTACCAATGGTTCCGAGATGGGACCCCCCTTTCTGATGGTCAGAGCA
550 . : . : . : . : . :
524 ACCACACAGTCAGCAGCAAGGAGCGGAACCTGACGCTCCGGCCAGCTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153795 ACCACACAGTCAGCAGCAAGGAGCGGAACCTGACGCTCCGGCCAGCTGGT
600 . : . : . : . : . :
574 CCTGAGCATAGTGGGCTGTATTCCTGCTGCGCCCACAGTGCTTTTGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153845 CCTGAGCATAGTGGGCTGTATTCCTGCTGCGCCCACAGTGCTTTTGGCCA
650 . : . : . : . : . :
624 GGCTTGCAGCAGCCAGAACTTCACCTTGAGCATTGCTG ATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
153895 GGCTTGCAGCAGCCAGAACTTCACCTTGAGCATTGCTGGTG...CAGATG
700 . : . : . : . : . :
665 AAAGCTTTGCCAGGGTGGTGCTGGCACCCCAGGACGTGGTAGTAGCGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154026 AAAGCTTTGCCAGGGTGGTGCTGGCACCCCAGGACGTGGTAGTAGCGAGG
750 . : . : . : . : . :
715 TATGAGGAGGCCATGTTCCATTGCCAGTTCTCAGCCCAGCCACCCCCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154076 TATGAGGAGGCCATGTTCCATTGCCAGTTCTCAGCCCAGCCACCCCCGAG
800 . : . : . : . : . :
765 CCTGCAGTGGCTCTTTGAGGATGAGACTCCCATCACTAACCGCAGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
154126 CCTGCAGTGGCTCTTTGAGGATGAGACTCCCATCACTAACCGCAGTCGGT
850 . : . : . : . : . :
813 CCCCCCACACCTCCGCAGAGCCACAGTGTTTGCCAACGGGTCT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154176 A...CAGCCCCCCACACCTCCGCAGAGCCACAGTGTTTGCCAACGGGTCT
900 . : . : . : . : . :
856 CTGCTGCTGACCCAGGTCCGGCCACGCAATGCAGGGATCTACCGCTGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155571 CTGCTGCTGACCCAGGTCCGGCCACGCAATGCAGGGATCTACCGCTGCAT
950 . : . : . : . : . :
906 TGGCCAGGGGCAGAGGGGCCCACCCATCATCCTGGAAGCCACACTTCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155621 TGGCCAGGGGCAGAGGGGCCCACCCATCATCCTGGAAGCCACACTTCACC
1000 . : . : . : . : . :
956 TAGCAG AGATTGAAGACATGCCGCTATTTGAGCCACGGGTG
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
155671 TAGCAGGTG...CAGAGATTGAAGACATGCCGCTATTTGAGCCACGGGTG
1050 . : . : . : . : . :
997 TTTACAGCTGGCAGCGAGGAGCGTGTGACCTGCCTTCCCCCCAAGGGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155968 TTTACAGCTGGCAGCGAGGAGCGTGTGACCTGCCTTCCCCCCAAGGGTCT
1100 . : . : . : . : . :
1047 GCCAGAGCCCAGCGTGTGGTGGGAGCACGCGGGAGTCCGGCTGCCCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156018 GCCAGAGCCCAGCGTGTGGTGGGAGCACGCGGGAGTCCGGCTGCCCACCC
1150 . : . : . : . : . :
1097 ATGGCAGGGTCTACCAGAAGGGCCACGAGCTGGTGTTGGCCAATATTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156068 ATGGCAGGGTCTACCAGAAGGGCCACGAGCTGGTGTTGGCCAATATTGCT
1200 . : . : . : . : . :
1147 GAAAGTGATGCTGGTGTCTACACCTGCCACGCGGCCAACCTGGCTGGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156118 GAAAGTGATGCTGGTGTCTACACCTGCCACGCGGCCAACCTGGCTGGTCA
1250 . : . : . : . : . :
1197 GCGGAGACAGGATGTCAACATCACTGTGGCCA CTGTGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
156168 GCGGAGACAGGATGTCAACATCACTGTGGCCAGTG...TAGCTGTGCCCT
1300 . : . : . : . : . :
1238 CCTGGCTGAAGAAGCCCCAAGACAGCCAGCTGGAGGAGGGCAAACCCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162370 CCTGGCTGAAGAAGCCCCAAGACAGCCAGCTGGAGGAGGGCAAACCCGGC
1350 . : . : . : . : . :
1288 TACTTGGATTGCCTGACCCAGGCCACACCAAAACCTACAGTTGTCTGGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162420 TACTTGGATTGCCTGACCCAGGCCACACCAAAACCTACAGTTGTCTGGTA
1400 . : . : . : . : . :
1338 CAGAAACCAGATGCTCATCTCAGAG GACTCACGGTTCGAGG
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
162470 CAGAAACCAGATGCTCATCTCAGAGGTG...CAGGACTCACGGTTCGAGG
1450 . : . : . : . : . :
1379 TCTTCAAGAATGGGACCTTGCGCATCAACAGCGTGGAGGTGTATGATGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162664 TCTTCAAGAATGGGACCTTGCGCATCAACAGCGTGGAGGTGTATGATGGG
1500 . : . : . : . : . :
1429 ACATGGTACCGTTGTATGAGCAGCACCCCAGCCGGCAGCATCGAGGCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162714 ACATGGTACCGTTGTATGAGCAGCACCCCAGCCGGCAGCATCGAGGCGCA
1550 . : . : . : . : . :
1479 AGCCCGTGTCCAAGTGCTGG AAAAGCTCAAGTTCACACCAC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
162764 AGCCCGTGTCCAAGTGCTGGGTG...CAGAAAAGCTCAAGTTCACACCAC
1600 . : . : . : . : . :
1520 CACCCCAGCCACAGCAGTGCATGGAGTTTGACAAGGAGGCCACGGTGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162939 CACCCCAGCCACAGCAGTGCATGGAGTTTGACAAGGAGGCCACGGTGCCC
1650 . : . : . : . : . :
1570 TGTTCAGCCACAGGCCGAGAGAAGCCCACTATTAAGTGGGAACGGGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
162989 TGTTCAGCCACAGGCCGAGAGAAGCCCACTATTAAGTGGGAACGGGCAGG
1700 . : . : . : . : . :
1619 ATGGGAGCAGCCTCCCAGAGTGGGTGACAGACAACGCTGGGA
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163039 TG...CAGATGGGAGCAGCCTCCCAGAGTGGGTGACAGACAACGCTGGGA
1750 . : . : . : . : . :
1661 CCCTGCATTTTGCCCGGGTGACTCGAGATGACGCTGGCAACTACACTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165222 CCCTGCATTTTGCCCGGGTGACTCGAGATGACGCTGGCAACTACACTTGC
1800 . : . : . : . : . :
1711 ATTGCCTCCAACGGGCCGCAGGGCCAGATTCGTGCCCATGTCCAGCTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165272 ATTGCCTCCAACGGGCCGCAGGGCCAGATTCGTGCCCATGTCCAGCTCAC
1850 . : . : . : . : . :
1761 TGTGGCAG TTTTTATCACCTTCAAAGTGGAACCAGAGCGTA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
165322 TGTGGCAGGTG...CAGTTTTTATCACCTTCAAAGTGGAACCAGAGCGTA
1900 . : . : . : . : . :
1802 CGACTGTGTACCAGGGCCACACAGCCCTACTGCAGTGCGAGGCCCAGGGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165476 CGACTGTGTACCAGGGCCACACAGCCCTACTGCAGTGCGAGGCCCAGGGG
1950 . : . : . : . : . :
1852 GACCCCAAGCCGCTGATTCAGTGGAAAGGCAAGGACCGCATCCTGGACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165526 GACCCCAAGCCGCTGATTCAGTGGAAAGGCAAGGACCGCATCCTGGACCC
2000 . : . : . : . : . :
1902 CACCAAGCTGGGACCCAG GATGCACATCTTCCAGAATGGCT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
165576 CACCAAGCTGGGACCCAGGTA...CAGGATGCACATCTTCCAGAATGGCT
2050 . : . : . : . : . :
1943 CCCTGGTGATCCATGACGTGGCCCCTGAGGACTCAGGCCGCTACACCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165707 CCCTGGTGATCCATGACGTGGCCCCTGAGGACTCAGGCCGCTACACCTGC
2100 . : . : . : . : . :
1993 ATTGCAGGCAACAGCTGCAACATCAAGCACACGGAGGCCCCCCTCTATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165757 ATTGCAGGCAACAGCTGCAACATCAAGCACACGGAGGCCCCCCTCTATGT
2150 . : . : . : . : . :
2043 CGTGG ACAAGCCTGTGCCGGAGGAGTCGGAGGGCCCTGGCA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165807 CGTGGGTA...CAGACAAGCCTGTGCCGGAGGAGTCGGAGGGCCCTGGCA
2200 . : . : . : . : . :
2084 GCCCTCCCCCCTACAAGATGATCCAGACCATTGGGTTGTCGGTGGGTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166965 GCCCTCCCCCCTACAAGATGATCCAGACCATTGGGTTGTCGGTGGGTGCC
2250 . : . : . : . : . :
2134 GCTGTGGCCTACATCATTGCCGTGCTGGGCCTCATGTTCTACTGCAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167015 GCTGTGGCCTACATCATTGCCGTGCTGGGCCTCATGTTCTACTGCAAGAA
2300 . : . : . : . : . :
2184 GCGCTGCAAAGCCAAGCGGCTGCAGAAGCAGCCCGAGGGCGAGGAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167065 GCGCTGCAAAGCCAAGCGGCTGCAGAAGCAGCCCGAGGGCGAGGAGCCAG
2350 . : . : . : . : . :
2234 AGATGGAATGCCTCAACG GTGGGCCTTTGCAGAACGGGCAG
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
167115 AGATGGAATGCCTCAACGGTG...CAGGTGGGCCTTTGCAGAACGGGCAG
2400 . : . : . : . : . :
2275 CCCTCAGCAGAGATCCAAGAAGAAGTGGCCTTGACCAGCTTGGGCTCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167986 CCCTCAGCAGAGATCCAAGAAGAAGTGGCCTTGACCAGCTTGGGCTCCGG
2450 . : . : . : . : . :
2325 CCCCGCGGCCACCAACAAACGCCACAGCACAAGTGATAAGATGCACTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168036 CCCCGCGGCCACCAACAAACGCCACAGCACAAGTGATAAGATGCACTTCC
2500 . : . : . : . : . :
2375 CACGGTCTAGCCTGCAGCCCATCACCACGCTGG GGAAGAGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
168086 CACGGTCTAGCCTGCAGCCCATCACCACGCTGGGTA...CAGGGAAGAGT
2550 . : . : . : . : . :
2416 GAGTTTGGGGAGGTGTTCCTGGCAAAGGCTCAGGGCTTGGAGGAGGGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168720 GAGTTTGGGGAGGTGTTCCTGGCAAAGGCTCAGGGCTTGGAGGAGGGAGT
2600 . : . : . : . : . :
2466 GGCAGAGACCCTGGTACTTGTGAAGAGCCTGCAGAGCAAGGATGAGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168770 GGCAGAGACCCTGGTACTTGTGAAGAGCCTGCAGAGCAAGGATGAGCAGC
2650 . : . : . : . : . :
2516 AGCAGCTGGACTTCCGGAGGGAGTTGGAGATGTTTGGGAAGCTGAACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168820 AGCAGCTGGACTTCCGGAGGGAGTTGGAGATGTTTGGGAAGCTGAACCAC
2700 . : . : . : . : . :
2566 GCCAACGTGGTGCGGCTCCTGGGGCTGTGCCGGGAGGCTGAGCCCCACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168870 GCCAACGTGGTGCGGCTCCTGGGGCTGTGCCGGGAGGCTGAGCCCCACTA
2750 . : . : . : . : . :
2616 CATGGTGCTGGAATATGTGGATCTG GGAGACCTCAAGCAGT
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
168920 CATGGTGCTGGAATATGTGGATCTGGTA...TAGGGAGACCTCAAGCAGT
2800 . : . : . : . : . :
2657 TCCTGAGGATTTCCAAGAGCAAGGATGAAAAATTGAAGTCACAGCCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170146 TCCTGAGGATTTCCAAGAGCAAGGATGAAAAATTGAAGTCACAGCCCCTC
2850 . : . : . : . : . :
2707 AGCACCAAGCAGAAG GTGGCCCTATGCACCCAGGTAGCCCT
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
170196 AGCACCAAGCAGAAGGTG...CAGGTGGCCCTATGCACCCAGGTAGCCCT
2900 . : . : . : . : . :
2748 GGGCATGGAGCACCTGTCCAACAACCGCTTTGTGCATAAGGACTTGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182355 GGGCATGGAGCACCTGTCCAACAACCGCTTTGTGCATAAGGACTTGGCTG
2950 . : . : . : . : . :
2798 CGCGTAACTGCCTGGTCAGTGCCCAGAGACAAGTGAAGGTGTCTGCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182405 CGCGTAACTGCCTGGTCAGTGCCCAGAGACAAGTGAAGGTGTCTGCCCTG
3000 . : . : . : . : . :
2848 GGCCTCAGCAAGGATGTGTACAACAG TGAGTACTACCACTT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
182455 GGCCTCAGCAAGGATGTGTACAACAGGTA...CAGTGAGTACTACCACTT
3050 . : . : . : . : . :
2889 CCGCCAGGCCTGGGTGCCGCTGCGCTGGATGTCCCCCGAGGCCATCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183315 CCGCCAGGCCTGGGTGCCGCTGCGCTGGATGTCCCCCGAGGCCATCCTGG
3100 . : . : . : . : . :
2939 AGGGTGACTTCTCTACCAAGTCTGATGTCTGGGCCTTCGGTGTGCTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183365 AGGGTGACTTCTCTACCAAGTCTGATGTCTGGGCCTTCGGTGTGCTGATG
3150 . : . : . : . : . :
2989 TGGGAAGTGTTTACACATGGAGAGATGCCCCATGGTGGGCAGGCAGATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183415 TGGGAAGTGTTTACACATGGAGAGATGCCCCATGGTGGGCAGGCAGATGA
3200 . : . : . : . : . :
3039 TGAAGTACTGGCAG ATTTGCAGGCTGGGAAGGCTAGACTTC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
183465 TGAAGTACTGGCAGGTA...CAGATTTGCAGGCTGGGAAGGCTAGACTTC
3250 . : . : . : . : . :
3080 CTCAGCCCGAGGGCTGCCCTTCCAAACTCTATCGGCTGATGCAGCGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184260 CTCAGCCCGAGGGCTGCCCTTCCAAACTCTATCGGCTGATGCAGCGCTGC
3300 . : . : . : . : . :
3130 TGGGCCCTCAGCCCCAAGGACCGGCCCTCCTTCAGTGAGATTGCCAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184310 TGGGCCCTCAGCCCCAAGGACCGGCCCTCCTTCAGTGAGATTGCCAGCGC
3350 . : . : . :
3180 CCTGGGAGACAGCACCGTGGACAGCAAGCCG
|||||||||||||||||||||||||||||||
184360 CCTGGGAGACAGCACCGTGGACAGCAAGCCG