seq1 = pF1KE3359.tfa, 3183 bp
seq2 = pF1KE3359/gi568815597f_153579189.tfa (gi568815597f:153579189_153793411), 214223 bp

>pF1KE3359 3183
>gi568815597f:153579189_153793411 (Chr1)

1-721  (99921-100641)   100% ->
722-921  (101313-101512)   100% ->
922-1035  (101992-102105)   100% ->
1036-1171  (102516-102651)   100% ->
1172-1263  (103310-103401)   100% ->
1264-1399  (104188-104323)   100% ->
1400-1484  (104552-104636)   100% ->
1485-1605  (105776-105896)   100% ->
1606-1680  (106618-106692)   100% ->
1681-1758  (106935-107012)   100% ->
1759-1863  (107458-107562)   100% ->
1864-1935  (107828-107899)   100% ->
1936-2092  (108012-108168)   100% ->
2093-2248  (108446-108601)   100% ->
2249-2417  (108865-109033)   100% ->
2418-2564  (109765-109911)   100% ->
2565-2688  (110000-110123)   100% ->
2689-2757  (110265-110333)   100% ->
2758-2932  (110618-110792)   100% ->
2933-3031  (111096-111194)   100% ->
3032-3123  (113918-114009)   100% ->
3124-3183  (114164-114223)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGGGCCCCGGCGCCCCGCTGGCTCCCGCCTGCGCCTGCTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99921 ATGCCGGGGCCCCGGCGCCCCGCTGGCTCCCGCCTGCGCCTGCTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTGCTGCCGCCGCTGCTGCTGCTGCTCCGGGGCAGCCACGCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99971 CCTGCTGCTGCCGCCGCTGCTGCTGCTGCTCCGGGGCAGCCACGCGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTGACGGTAGCCGTGGTACTGCCGCTGGCCAATACCTCGTACCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100021 ACCTGACGGTAGCCGTGGTACTGCCGCTGGCCAATACCTCGTACCCCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGTGGGCGCGCGTGGGACCCGCCGTGGAGCTGGCCCTGGCCCAGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100071 TCGTGGGCGCGCGTGGGACCCGCCGTGGAGCTGGCCCTGGCCCAGGTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCGCGCCCCGACTTGCTGCCGGGCTGGACGGTCCGCACGGTGCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100121 GGCGCGCCCCGACTTGCTGCCGGGCTGGACGGTCCGCACGGTGCTGGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGCGAAAACGCGCTGGGCGTCTGCTCCGACACCGCAGCGCCCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100171 GCAGCGAAAACGCGCTGGGCGTCTGCTCCGACACCGCAGCGCCCCTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGTGGACCTCAAGTGGGAGCACAACCCCGCTGTGTTCCTGGGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100221 GCGGTGGACCTCAAGTGGGAGCACAACCCCGCTGTGTTCCTGGGCCCCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGCGTGTACGCCGCCGCCCCAGTGGGGCGCTTCACCGCGCACTGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100271 CTGCGTGTACGCCGCCGCCCCAGTGGGGCGCTTCACCGCGCACTGGCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCCGCTGCTGACCGCCGGCGCCCCGGCGCTGGGCTTCGGTGTCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100321 TCCCGCTGCTGACCGCCGGCGCCCCGGCGCTGGGCTTCGGTGTCAAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGTATGCGCTGACCACCCGCGCGGGGCCCAGCTACGCCAAGCTGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100371 GAGTATGCGCTGACCACCCGCGCGGGGCCCAGCTACGCCAAGCTGGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCGTGGCGGCGCTGCACCGACGGCTGGGCTGGGAGCGCCAAGCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100421 CTTCGTGGCGGCGCTGCACCGACGGCTGGGCTGGGAGCGCCAAGCGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTCTACGCCTACCGGCCGGGTGACGAAGAGCACTGCTTCTTCCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100471 TGCTCTACGCCTACCGGCCGGGTGACGAAGAGCACTGCTTCTTCCTCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGGGGCTGTTCATGCGGGTCCGCGACCGCCTCAATATTACGGTGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100521 GAGGGGCTGTTCATGCGGGTCCGCGACCGCCTCAATATTACGGTGGACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTGGAGTTCGCCGAGGACGACCTCAGCCACTACACCAGGCTGCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100571 CCTGGAGTTCGCCGAGGACGACCTCAGCCACTACACCAGGCTGCTGCGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCATGCCGCGCAAAGGCCGAG         TTATCTACATCTGCAGCTCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100621 CCATGCCGCGCAAAGGCCGAGGTG...CAGTTATCTACATCTGCAGCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCTGATGCCTTCAGAACCCTCATGCTCCTGGCCCTGGAAGCTGGCTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101333 CCTGATGCCTTCAGAACCCTCATGCTCCTGGCCCTGGAAGCTGGCTTGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGGGGAGGACTACGTTTTCTTCCACCTGGATATCTTTGGGCAAAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101383 TGGGGAGGACTACGTTTTCTTCCACCTGGATATCTTTGGGCAAAGCCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AAGGTGGACAGGGCCCTGCTCCCCGCAGGCCCTGGGAGAGAGGGGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101433 AAGGTGGACAGGGCCCTGCTCCCCGCAGGCCCTGGGAGAGAGGGGATGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CAGGATGTCAGTGCCCGCCAGGCCTTTCAG         GCTGCCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101483 CAGGATGTCAGTGCCCGCCAGGCCTTTCAGGTG...CAGGCTGCCAAAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CATTACATATAAAGACCCAGATAATCCCGAGTACTTGGAATTCCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102003 CATTACATATAAAGACCCAGATAATCCCGAGTACTTGGAATTCCTGAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGTTAAAACACCTGGCCTATGAGCAGTTCAACTTCACCATGGAGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102053 AGTTAAAACACCTGGCCTATGAGCAGTTCAACTTCACCATGGAGGATGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CTG         GTGAACACCATCCCAGCATCCTTCCACGACGGGCTCCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102103 CTGGTA...CAGGTGAACACCATCCCAGCATCCTTCCACGACGGGCTCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GCTCTATATCCAGGCAGTGACGGAGACTCTGGCACATGGGGGAACTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102554 GCTCTATATCCAGGCAGTGACGGAGACTCTGGCACATGGGGGAACTGTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CTGATGGGGAGAACATCACTCAGCGGATGTGGAACCGAAGCTTTCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102604 CTGATGGGGAGAACATCACTCAGCGGATGTGGAACCGAAGCTTTCAAGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1172        GTGTGACAGGATACCTGAAAATTGATAGCAGTGGCGATCGGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102654 C...CAGGTGTGACAGGATACCTGAAAATTGATAGCAGTGGCGATCGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 AACAGACTTCTCCCTCTGGGATATGGATCCCGAGAATGGTGCCTTCAGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103353 AACAGACTTCTCCCTCTGGGATATGGATCCCGAGAATGGTGCCTTCAGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1264         GTTGTACTGAACTACAATGGGACTTCCCAAGAGCTGGTGGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103403 TA...TAGGTTGTACTGAACTACAATGGGACTTCCCAAGAGCTGGTGGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GTGTCGGGGCGCAAACTGAACTGGCCCCTGGGGTACCCTCCTCCTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104230 GTGTCGGGGCGCAAACTGAACTGGCCCCTGGGGTACCCTCCTCCTGACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CCCCAAATGTGGCTTTGACAACGAAGACCCAGCATGCAACCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104280 CCCCAAATGTGGCTTTGACAACGAAGACCCAGCATGCAACCAAGGTG...

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1400    ATCACCTTTCCACCCTGGAGGTGCTGGCTTTGGTGGGCAGCCTCTCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104549 CAGATCACCTTTCCACCCTGGAGGTGCTGGCTTTGGTGGGCAGCCTCTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 TTGCTCGGCATTCTGATTGTCTCCTTCTTCATATACAG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104599 TTGCTCGGCATTCTGATTGTCTCCTTCTTCATATACAGGTG...CAGGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GATGCAGCTGGAGAAGGAACTGGCCTCGGAGCTGTGGCGGGTGCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105779 GATGCAGCTGGAGAAGGAACTGGCCTCGGAGCTGTGGCGGGTGCGCTGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 AGGACGTTGAGCCCAGTAGCCTTGAGAGGCACCTGCGGAGTGCAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105829 AGGACGTTGAGCCCAGTAGCCTTGAGAGGCACCTGCGGAGTGCAGGCAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 CGGCTGACCCTGAGCGGG         AGAGGCTCCAATTACGGCTCCCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105879 CGGCTGACCCTGAGCGGGGTA...CAGAGAGGCTCCAATTACGGCTCCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GCTAACCACAGAGGGCCAGTTCCAAGTCTTTGCCAAGACAGCATATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106641 GCTAACCACAGAGGGCCAGTTCCAAGTCTTTGCCAAGACAGCATATTATA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 AG         GGCAACCTCGTGGCTGTGAAACGTGTGAACCGTAAACGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106691 AGGTG...CAGGGCAACCTCGTGGCTGTGAAACGTGTGAACCGTAAACGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 ATTGAGCTGACACGAAAAGTCCTGTTTGAACTGAAGCAT         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106974 ATTGAGCTGACACGAAAAGTCCTGTTTGAACTGAAGCATGTA...CAGAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GCGGGATGTGCAGAATGAACACCTGACCAGGTTTGTGGGAGCCTGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107460 GCGGGATGTGCAGAATGAACACCTGACCAGGTTTGTGGGAGCCTGCACCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 ACCCCCCCAATATCTGCATCCTCACAGAGTACTGTCCCCGTGGGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107510 ACCCCCCCAATATCTGCATCCTCACAGAGTACTGTCCCCGTGGGAGCCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CAG         GACATTCTGGAGAATGAGAGCATCACCCTGGACTGGAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107560 CAGGTG...CAGGACATTCTGGAGAATGAGAGCATCACCCTGGACTGGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GTTCCGGTACTCACTCACCAATGACATCGTCAAG         GGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107866 GTTCCGGTACTCACTCACCAATGACATCGTCAAGGTA...CAGGGCATGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TGTTTCTACACAATGGGGCTATCTGTTCCCATGGGAACCTCAAGTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108019 TGTTTCTACACAATGGGGCTATCTGTTCCCATGGGAACCTCAAGTCATCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 AACTGCGTGGTAGATGGGCGCTTTGTGCTCAAGATCACCGACTATGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108069 AACTGCGTGGTAGATGGGCGCTTTGTGCTCAAGATCACCGACTATGGGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GGAGAGCTTCAGGGACCTGGACCCAGAGCAAGGACACACCGTTTATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108119 GGAGAGCTTCAGGGACCTGGACCCAGAGCAAGGACACACCGTTTATGCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093          AAAAGCTGTGGACGGCCCCTGAGCTCCTGCGAATGGCTTCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108169 GTG...CAGAAAAGCTGTGGACGGCCCCTGAGCTCCTGCGAATGGCTTCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 CCCCCTGTGCGGGGCTCCCAGGCTGGTGACGTATACAGCTTTGGGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108487 CCCCCTGTGCGGGGCTCCCAGGCTGGTGACGTATACAGCTTTGGGATCAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CCTTCAGGAGATTGCCCTGAGGAGTGGGGTCTTCCACGTGGAAGGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108537 CCTTCAGGAGATTGCCCTGAGGAGTGGGGTCTTCCACGTGGAAGGTTTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 ACCTGAGCCCCAAAG         AGATCATCGAGCGGGTGACTCGGGGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 108587 ACCTGAGCCCCAAAGGTG...CAGAGATCATCGAGCGGGTGACTCGGGGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GAGCAGCCCCCCTTCCGGCCCTCCCTGGCCCTGCAGAGTCACCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108891 GAGCAGCCCCCCTTCCGGCCCTCCCTGGCCCTGCAGAGTCACCTGGAGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 GTTGGGGCTGCTCATGCAGCGGTGCTGGGCTGAGGACCCACAGGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108941 GTTGGGGCTGCTCATGCAGCGGTGCTGGGCTGAGGACCCACAGGAGAGGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 CACCATTCCAGCAGATCCGCCTGACGTTGCGCAAATTTAACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108991 CACCATTCCAGCAGATCCGCCTGACGTTGCGCAAATTTAACAGGTC...C

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2418   GGAGAACAGCAGCAACATCCTGGACAACCTGCTGTCCCGCATGGAGCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109763 AGGGAGAACAGCAGCAACATCCTGGACAACCTGCTGTCCCGCATGGAGCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 GTACGCGAACAATCTGGAGGAACTGGTGGAGGAGCGGACCCAGGCATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109813 GTACGCGAACAATCTGGAGGAACTGGTGGAGGAGCGGACCCAGGCATACC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 TGGAGGAGAAGCGCAAGGCTGAGGCCCTGCTCTACCAGATCCTGCCTCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109863 TGGAGGAGAAGCGCAAGGCTGAGGCCCTGCTCTACCAGATCCTGCCTCAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2565         CTCAGTGGCTGAGCAGCTGAAGCGTGGGGAGACGGTGCAGGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109913 TG...TAGCTCAGTGGCTGAGCAGCTGAAGCGTGGGGAGACGGTGCAGGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 CGAAGCCTTTGACAGTGTTACCATCTACTTCAGTGACATTGTGGGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110042 CGAAGCCTTTGACAGTGTTACCATCTACTTCAGTGACATTGTGGGTTTCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 CAGCGCTGTCGGCGGAGAGCACACCCATGCAG         GTGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110092 CAGCGCTGTCGGCGGAGAGCACACCCATGCAGGTA...CAGGTGGTGACC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 CTGCTCAATGACCTGTACACTTGCTTTGATGCTGTCATAGACAACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110274 CTGCTCAATGACCTGTACACTTGCTTTGATGCTGTCATAGACAACTTTGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 TGTGTACAAG         GTGGAGACAATTGGCGATGCCTACATGGTGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 110324 TGTGTACAAGGTG...CAGGTGGAGACAATTGGCGATGCCTACATGGTGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 TGTCAGGGCTCCCTGTGCGGAACGGGCGGCTACACGCCTGCGAGGTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110649 TGTCAGGGCTCCCTGTGCGGAACGGGCGGCTACACGCCTGCGAGGTAGCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 CGCATGGCCCTGGCACTGCTGGATGCTGTGCGCTCCTTCCGAATCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110699 CGCATGGCCCTGGCACTGCTGGATGCTGTGCGCTCCTTCCGAATCCGCCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 CCGGCCCCAGGAGCAGCTGCGCTTGCGCATTGGCATCCACACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 110749 CCGGCCCCAGGAGCAGCTGCGCTTGCGCATTGGCATCCACACAGGTA...

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2933    GACCTGTGTGTGCTGGAGTGGTGGGACTGAAGATGCCCCGTTACTGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111093 CAGGACCTGTGTGTGCTGGAGTGGTGGGACTGAAGATGCCCCGTTACTGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 CTCTTTGGGGATACAGTCAACACAGCCTCAAGAATGGAGTCTAATGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111143 CTCTTTGGGGATACAGTCAACACAGCCTCAAGAATGGAGTCTAATGGGGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 AG         CCCTGAAGATCCACTTGTCTTCTGAGACCAAGGCTGTCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111193 AGGTA...CAGCCCTGAAGATCCACTTGTCTTCTGAGACCAAGGCTGTCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 TGGAGGAGTTTGGTGGTTTCGAGCTGGAGCTTCGAGGGGATGTAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113957 TGGAGGAGTTTGGTGGTTTCGAGCTGGAGCTTCGAGGGGATGTAGAAATG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 AAG         GGCAAAGGCAAGGTTCGGACCTACTGGCTCCTTGGGGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114007 AAGGTA...CAGGGCAAAGGCAAGGTTCGGACCTACTGGCTCCTTGGGGA

   3350     .    :    .    :
   3162 GAGGGGGAGTAGCACCCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||
 114202 GAGGGGGAGTAGCACCCGAGGC