Result of SIM4 for
pF1KE3330
seq1 = pF1KE3330.tfa, 2829 bp
seq2 = pF1KE3330/gi568815589r_91623665.tfa (gi568815589r:91623665_92049963), 426299 bp
>pF1KE3330 2829
>gi568815589r:91623665_92049963 (Chr9)
(complement)
1-97 (100001-100097) 100% ->
98-175 (274146-274223) 100% ->
176-463 (292405-292692) 100% ->
464-494 (293863-293893) 100% ->
495-622 (312446-312573) 100% ->
623-937 (316528-316842) 99% ->
938-1183 (318809-319054) 100% ->
1184-1386 (323221-323423) 100% ->
1387-2829 (324857-326299) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCCGGGGCTCGGCGCTCCCGCGGCGGCCGCTGCTGTGCATCCCGGC
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100001 ATGGCCCGGGGCTCGGCGCTCCCGCGGCGGCCGCTGCTGTGCATCCCGGC
50 . : . : . : . : . :
51 CGTCTGGGCGGCCGCCGCGCTTCTGCTCTCAGTGTCCCGGACTTCAG
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100051 CGTCTGGGCGGCCGCCGCGCTTCTGCTCTCAGTGTCCCGGACTTCAGGTA
100 . : . : . : . : . :
98 GTGAAGTGGAGGTTCTGGATCCGAACGACCCTTTAGGACCCCTT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ...CAGGTGAAGTGGAGGTTCTGGATCCGAACGACCCTTTAGGACCCCTT
150 . : . : . : . : . :
142 GATGGGCAGGACGGCCCGATTCCAACTCTGAAAG GTTACTT
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274190 GATGGGCAGGACGGCCCGATTCCAACTCTGAAAGGTG...CAGGTTACTT
200 . : . : . : . : . :
183 TCTGAATTTTCTGGAGCCAGTAAACAATATCACCATTGTCCAAGGCCAGA
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292412 TCTGAATTTTCTGGAGCCAGTAAACAATATCACCATTGTCCAAGGCCAGA
250 . : . : . : . : . :
233 CGGCAATTCTGCACTGCAAGGTGGCAGGAAACCCACCCCCTAACGTGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
292462 CGGCAATTCTGCACTGCAAGGTGGCAGGAAACCCACCCCCTAACGTGCGG
300 . : . : . : . : . :
283 TGGCTAAAGAATGATGCCCCGGTGGTGCAGGAGCCGCGGCGGATCATCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
292512 TGGCTAAAGAATGATGCCCCGGTGGTGCAGGAGCCGCGGCGGATCATCAT
350 . : . : . : . : . :
333 CCGGAAGACAGAATATGGTTCACGACTGCGAATCCAGGACCTGGACACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
292562 CCGGAAGACAGAATATGGTTCACGACTGCGAATCCAGGACCTGGACACGA
400 . : . : . : . : . :
383 CAGACACTGGCTACTACCAGTGCGTGGCCACCAACGGGATGAAGACCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
292612 CAGACACTGGCTACTACCAGTGCGTGGCCACCAACGGGATGAAGACCATT
450 . : . : . : . : . :
433 ACCGCCACTGGCGTCCTGTTTGTGCGGCTGG GTCCAACGCA
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292662 ACCGCCACTGGCGTCCTGTTTGTGCGGCTGGGTG...TAGGTCCAACGCA
500 . : . : . : . : . :
474 CAGCCCAAATCATAACTTTCA GGATGATTACCACGAGGATG
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
293873 CAGCCCAAATCATAACTTTCAGTA...CAGGGATGATTACCACGAGGATG
550 . : . : . : . : . :
515 GGTTCTGCCAGCCTTACCGGGGAATTGCCTGTGCACGCTTCATTGGCAAC
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312466 GGTTCTGCCAGCCTTACCGGGGAATTGCCTGTGCACGCTTCATTGGCAAC
600 . : . : . : . : . :
565 CGGACCATTTATGTGGACTCGCTTCAGATGCAGGGGGAGATTGAAAACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
312516 CGGACCATTTATGTGGACTCGCTTCAGATGCAGGGGGAGATTGAAAACCG
650 . : . : . : . : . :
615 AATCACAG CGGCCTTCACCATGATCGGCACGTCTACGCACC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
312566 AATCACAGGTA...CAGCGGCCTTCACCATGATCGGCACGTCTACGCACC
700 . : . : . : . : . :
656 TGTCGGACCAGTGCTCACAGTTCGCCATCCCATCCTTCTGCCACTTCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
316561 TGTCGGACCAGTGCTCACAGTTCGCCATCCCATCCTTCTGCCACTTCGTG
750 . : . : . : . : . :
706 TTTCCTCTGTGCGACGCGCGCTCCCGGGCACCCAAGCCGCGTGAGCTGTG
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
316611 TTTCCTCTGTGCGACGCGCGCTCCCGGACACCCAAGCCGCGTGAGCTGTG
800 . : . : . : . : . :
756 CCGCGACGAGTGCGAGGTGCTGGAGAGCGACCTGTGCCGCCAGGAGTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
316661 CCGCGACGAGTGCGAGGTGCTGGAGAGCGACCTGTGCCGCCAGGAGTACA
850 . : . : . : . : . :
806 CCATCGCCCGCTCCAACCCGCTCATCCTCATGCGGCTTCAGCTGCCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
316711 CCATCGCCCGCTCCAACCCGCTCATCCTCATGCGGCTTCAGCTGCCCAAG
900 . : . : . : . : . :
856 TGTGAGGCGCTGCCCATGCCTGAGAGCCCCGACGCTGCCAACTGCATGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
316761 TGTGAGGCGCTGCCCATGCCTGAGAGCCCCGACGCTGCCAACTGCATGCG
950 . : . : . : . : . :
906 CATTGGCATCCCAGCCGAGAGGCTGGGCCGCT ACCATCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
316811 CATTGGCATCCCAGCCGAGAGGCTGGGCCGCTGTG...CAGACCATCAGT
1000 . : . : . : . : . :
947 GCTATAACGGCTCAGGCATGGATTACAGAGGAACGGCAAGCACCACCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
318818 GCTATAACGGCTCAGGCATGGATTACAGAGGAACGGCAAGCACCACCAAG
1050 . : . : . : . : . :
997 TCAGGCCACCAGTGCCAGCCGTGGGCCCTGCAGCACCCCCACAGCCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
318868 TCAGGCCACCAGTGCCAGCCGTGGGCCCTGCAGCACCCCCACAGCCACCA
1100 . : . : . : . : . :
1047 CCTGTCCAGCACAGACTTCCCTGAGCTTGGAGGGGGGCACGCCTACTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
318918 CCTGTCCAGCACAGACTTCCCTGAGCTTGGAGGGGGGCACGCCTACTGCC
1150 . : . : . : . : . :
1097 GGAACCCCGGAGGCCAGATGGAGGGCCCCTGGTGCTTTACGCAGAATAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
318968 GGAACCCCGGAGGCCAGATGGAGGGCCCCTGGTGCTTTACGCAGAATAAA
1200 . : . : . : . : . :
1147 AACGTACGCATGGAACTGTGTGACGTACCCTCGTGTA GTCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
319018 AACGTACGCATGGAACTGTGTGACGTACCCTCGTGTAGTA...CAGGTCC
1250 . : . : . : . : . :
1188 CCGAGACAGCAGCAAGATGGGGATTCTGTACATCTTGGTCCCCAGCATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
323225 CCGAGACAGCAGCAAGATGGGGATTCTGTACATCTTGGTCCCCAGCATCG
1300 . : . : . : . : . :
1238 CAATTCCACTGGTCATCGCTTGCCTTTTCTTCTTGGTTTGCATGTGCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
323275 CAATTCCACTGGTCATCGCTTGCCTTTTCTTCTTGGTTTGCATGTGCCGG
1350 . : . : . : . : . :
1288 AATAAGCAGAAGGCATCTGCGTCCACACCGCAGCGGCGACAGCTGATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
323325 AATAAGCAGAAGGCATCTGCGTCCACACCGCAGCGGCGACAGCTGATGGC
1400 . : . : . : . : . :
1338 CTCGCCCAGCCAAGACATGGAAATGCCCCTCATTAACCAGCACAAACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
323375 CTCGCCCAGCCAAGACATGGAAATGCCCCTCATTAACCAGCACAAACAGG
1450 . : . : . : . : . :
1387 GCCAAACTCAAAGAGATCAGCCTGTCTGCGGTGAGGTTCATG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
323425 TC...CAGGCCAAACTCAAAGAGATCAGCCTGTCTGCGGTGAGGTTCATG
1500 . : . : . : . : . :
1429 GAGGAGCTGGGAGAGGACCGGTTTGGGAAAGTCTACAAAGGTCACCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
324899 GAGGAGCTGGGAGAGGACCGGTTTGGGAAAGTCTACAAAGGTCACCTGTT
1550 . : . : . : . : . :
1479 CGGCCCTGCCCCGGGGGAGCAGACCCAGGCTGTGGCCATCAAAACGCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
324949 CGGCCCTGCCCCGGGGGAGCAGACCCAGGCTGTGGCCATCAAAACGCTGA
1600 . : . : . : . : . :
1529 AGGACAAAGCGGAGGGGCCCCTGCGGGAGGAGTTCCGGCATGAGGCTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
324999 AGGACAAAGCGGAGGGGCCCCTGCGGGAGGAGTTCCGGCATGAGGCTATG
1650 . : . : . : . : . :
1579 CTGCGAGCACGGCTGCAACACCCCAACGTCGTCTGCCTGCTGGGCGTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325049 CTGCGAGCACGGCTGCAACACCCCAACGTCGTCTGCCTGCTGGGCGTGGT
1700 . : . : . : . : . :
1629 GACCAAGGACCAGCCCCTGAGCATGATCTTCAGCTACTGTTCGCACGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325099 GACCAAGGACCAGCCCCTGAGCATGATCTTCAGCTACTGTTCGCACGGCG
1750 . : . : . : . : . :
1679 ACCTCCACGAATTCCTGGTCATGCGCTCGCCGCACTCGGACGTGGGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325149 ACCTCCACGAATTCCTGGTCATGCGCTCGCCGCACTCGGACGTGGGCAGC
1800 . : . : . : . : . :
1729 ACCGATGATGACCGCACGGTGAAGTCCGCCCTGGAGCCCCCCGACTTCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325199 ACCGATGATGACCGCACGGTGAAGTCCGCCCTGGAGCCCCCCGACTTCGT
1850 . : . : . : . : . :
1779 GCACCTTGTGGCACAGATCGCGGCGGGGATGGAGTACCTATCCAGCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325249 GCACCTTGTGGCACAGATCGCGGCGGGGATGGAGTACCTATCCAGCCACC
1900 . : . : . : . : . :
1829 ACGTGGTTCACAAGGACCTGGCCACCCGCAATGTGCTAGTGTACGACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325299 ACGTGGTTCACAAGGACCTGGCCACCCGCAATGTGCTAGTGTACGACAAG
1950 . : . : . : . : . :
1879 CTGAACGTGAAGATCTCAGACTTGGGCCTCTTCCGAGAGGTGTATGCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325349 CTGAACGTGAAGATCTCAGACTTGGGCCTCTTCCGAGAGGTGTATGCCGC
2000 . : . : . : . : . :
1929 CGATTACTACAAGCTGCTGGGGAACTCGCTGCTGCCTATCCGCTGGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325399 CGATTACTACAAGCTGCTGGGGAACTCGCTGCTGCCTATCCGCTGGATGG
2050 . : . : . : . : . :
1979 CCCCAGAGGCCATCATGTACGGCAAGTTCTCCATCGACTCAGACATCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325449 CCCCAGAGGCCATCATGTACGGCAAGTTCTCCATCGACTCAGACATCTGG
2100 . : . : . : . : . :
2029 TCCTACGGTGTGGTCCTGTGGGAGGTCTTCAGCTACGGCCTGCAGCCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325499 TCCTACGGTGTGGTCCTGTGGGAGGTCTTCAGCTACGGCCTGCAGCCCTA
2150 . : . : . : . : . :
2079 CTGCGGGTATTCCAACCAGGATGTGGTGGAGATGATCCGGAACCGGCAGG
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325549 CTGCGGGTACTCCAACCAGGATGTGGTGGAGATGATCCGGAACCGGCAGG
2200 . : . : . : . : . :
2129 TGCTGCCTTGCCCCGATGACTGTCCCGCCTGGGTGTATGCCCTCATGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325599 TGCTGCCTTGCCCCGATGACTGTCCCGCCTGGGTGTATGCCCTCATGATC
2250 . : . : . : . : . :
2179 GAGTGCTGGAACGAGTTCCCCAGCCGGCGGCCCCGCTTCAAGGACATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325649 GAGTGCTGGAACGAGTTCCCCAGCCGGCGGCCCCGCTTCAAGGACATCCA
2300 . : . : . : . : . :
2229 CAGCCGGCTCCGAGCCTGGGGCAACCTTTCCAACTACAACAGCTCGGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325699 CAGCCGGCTCCGAGCCTGGGGCAACCTTTCCAACTACAACAGCTCGGCGC
2350 . : . : . : . : . :
2279 AGACCTCGGGGGCCAGCAACACCACGCAGACCAGCTCCCTGAGCACCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325749 AGACCTCGGGGGCCAGCAACACCACGCAGACCAGCTCCCTGAGCACCAGC
2400 . : . : . : . : . :
2329 CCAGTGAGCAATGTGAGCAACGCCCGCTACGTGGGGCCCAAGCAGAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325799 CCAGTGAGCAATGTGAGCAACGCCCGCTACGTGGGGCCCAAGCAGAAGGC
2450 . : . : . : . : . :
2379 CCCGCCCTTCCCACAGCCCCAGTTCATCCCCATGAAGGGCCAGATCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325849 CCCGCCCTTCCCACAGCCCCAGTTCATCCCCATGAAGGGCCAGATCAGAC
2500 . : . : . : . : . :
2429 CCATGGTGCCCCCGCCGCAGCTCTACATCCCCGTCAACGGCTACCAGCCG
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
325899 CCATGGTGCCCCCGCCGCAGCTCTACGTCCCCGTCAACGGCTACCAGCCG
2550 . : . : . : . : . :
2479 GTGCCGGCCTATGGGGCCTACCTGCCCAACTTCTACCCGGTGCAGATCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325949 GTGCCGGCCTATGGGGCCTACCTGCCCAACTTCTACCCGGTGCAGATCCC
2600 . : . : . : . : . :
2529 AATGCAGATGGCCCCGCAGCAGGTGCCTCCTCAGATGGTCCCCAAGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325999 AATGCAGATGGCCCCGCAGCAGGTGCCTCCTCAGATGGTCCCCAAGCCCA
2650 . : . : . : . : . :
2579 GCTCACACCACAGTGGCAGTGGCTCCACCAGCACAGGCTACGTCACCACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
326049 GCTCACACCACAGTGGCAGTGGCTCCACCAGCACAGGCTACGTCACCACG
2700 . : . : . : . : . :
2629 GCCCCCTCCAACACATCCATGGCAGACAGGGCAGCCCTGCTCTCAGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
326099 GCCCCCTCCAACACATCCATGGCAGACAGGGCAGCCCTGCTCTCAGAGGG
2750 . : . : . : . : . :
2679 CGCTGATGACACACAGAACGCCCCAGAAGATGGGGCCCAGAGCACCGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
326149 CGCTGATGACACACAGAACGCCCCAGAAGATGGGGCCCAGAGCACCGTGC
2800 . : . : . : . : . :
2729 AGGAAGCAGAGGAGGAGGAGGAAGGCTCTGTCCCAGAGACTGAGCTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
326199 AGGAAGCAGAGGAGGAGGAGGAAGGCTCTGTCCCAGAGACTGAGCTGCTG
2850 . : . : . : . : . :
2779 GGGGACTGTGACACTCTGCAGGTGGACGAGGCCCAAGTCCAGCTGGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
326249 GGGGACTGTGACACTCTGCAGGTGGACGAGGCCCAAGTCCAGCTGGAAGC
2900
2829 T
|
326299 T