Result of SIM4 for
pF1KE3317
seq1 = pF1KE3317.tfa, 2637 bp
seq2 = pF1KE3317/gi568815588f_27055427.tfa (gi568815588f:27055427_27286533), 231107 bp
>pF1KE3317 2637
>gi568815588f:27055427_27286533 (Chr10)
1-186 (100001-100186) 100% ->
187-324 (103123-103260) 100% ->
325-464 (104193-104332) 100% ->
465-553 (105668-105756) 100% ->
554-660 (109638-109744) 100% ->
661-811 (109963-110113) 100% ->
812-984 (111676-111848) 100% ->
985-2124 (114518-115657) 99% ->
2125-2266 (117692-117833) 100% ->
2267-2380 (125527-125640) 100% ->
2381-2482 (126054-126155) 100% ->
2483-2637 (130953-131107) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGATCCCACCGCGGGAAGCAAGAAGGAGCCTGGAGGAGGCGCGGCGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGATCCCACCGCGGGAAGCAAGAAGGAGCCTGGAGGAGGCGCGGCGAC
50 . : . : . : . : . :
51 TGAGGAGGGCGTGAATAGGATCGCAGTGCCAAAACCGCCCTCCATTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGAGGAGGGCGTGAATAGGATCGCAGTGCCAAAACCGCCCTCCATTGAGG
100 . : . : . : . : . :
101 AATTCAGCATAGTGAAGCCCATTAGCCGGGGCGCCTTCGGGAAAGTGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AATTCAGCATAGTGAAGCCCATTAGCCGGGGCGCCTTCGGGAAAGTGTAT
150 . : . : . : . : . :
151 CTGGGGCAGAAAGGCGGCAAATTGTATGCAGTAAAG GTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
100151 CTGGGGCAGAAAGGCGGCAAATTGTATGCAGTAAAGGTA...CAGGTTGT
200 . : . : . : . : . :
192 TAAAAAAGCAGACATGATCAACAAAAATATGACTCATCAGGTCCAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103128 TAAAAAAGCAGACATGATCAACAAAAATATGACTCATCAGGTCCAAGCTG
250 . : . : . : . : . :
242 AGAGAGATGCACTGGCACTAAGCAAAAGCCCATTCATTGTCCATTTGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103178 AGAGAGATGCACTGGCACTAAGCAAAAGCCCATTCATTGTCCATTTGTAT
300 . : . : . : . : . :
292 TATTCACTGCAGTCTGCAAACAATGTCTACTTG GTAATGGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
103228 TATTCACTGCAGTCTGCAAACAATGTCTACTTGGTG...AAGGTAATGGA
350 . : . : . : . : . :
333 ATATCTTATTGGGGGAGATGTCAAGTCTCTCCTACATATATATGGTTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104201 ATATCTTATTGGGGGAGATGTCAAGTCTCTCCTACATATATATGGTTATT
400 . : . : . : . : . :
383 TTGATGAAGAGATGGCTGTGAAATATATTTCTGAAGTAGCACTGGCTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104251 TTGATGAAGAGATGGCTGTGAAATATATTTCTGAAGTAGCACTGGCTCTA
450 . : . : . : . : . :
433 GACTACCTTCACAGACATGGAATCATCCACAG GGACTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
104301 GACTACCTTCACAGACATGGAATCATCCACAGGTA...CAGGGACTTGAA
500 . : . : . : . : . :
474 ACCGGACAATATGCTTATTTCTAATGAGGGTCATATTAAACTGACGGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105677 ACCGGACAATATGCTTATTTCTAATGAGGGTCATATTAAACTGACGGATT
550 . : . : . : . : . :
524 TTGGCCTTTCAAAAGTTACTTTGAATAGAG ATATTAATATG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
105727 TTGGCCTTTCAAAAGTTACTTTGAATAGAGGTA...TAGATATTAATATG
600 . : . : . : . : . :
565 ATGGATATCCTTACAACACCATCAATGGCAAAACCTAGACAAGATTATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109649 ATGGATATCCTTACAACACCATCAATGGCAAAACCTAGACAAGATTATTC
650 . : . : . : . : . :
615 AAGAACCCCAGGACAAGTGTTATCGCTTATCAGCTCGTTGGGATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
109699 AAGAACCCCAGGACAAGTGTTATCGCTTATCAGCTCGTTGGGATTTGTA.
700 . : . : . : . : . :
661 AACACACCAATTGCAGAAAAAAATCAAGACCCTGCAAACATCCTT
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109749 ..TAGAACACACCAATTGCAGAAAAAAATCAAGACCCTGCAAACATCCTT
750 . : . : . : . : . :
706 TCAGCCTGTCTGTCTGAAACATCACAGCTTTCTCAAGGACTCGTATGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110008 TCAGCCTGTCTGTCTGAAACATCACAGCTTTCTCAAGGACTCGTATGCCC
800 . : . : . : . : . :
756 TATGTCTGTAGATCAAAAGGACACTACGCCTTATTCTAGCAAATTACTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110058 TATGTCTGTAGATCAAAAGGACACTACGCCTTATTCTAGCAAATTACTAA
850 . : . : . : . : . :
806 AATCAT GTCTTGAAACAGTTGCCTCCAACCCAGGAATGCCT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
110108 AATCATGTG...TAGGTCTTGAAACAGTTGCCTCCAACCCAGGAATGCCT
900 . : . : . : . : . :
847 GTGAAGTGTCTAACTTCTAATTTACTCCAGTCTAGGAAAAGGCTGGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111711 GTGAAGTGTCTAACTTCTAATTTACTCCAGTCTAGGAAAAGGCTGGCCAC
950 . : . : . : . : . :
897 ATCCAGTGCCAGTAGTCAATCCCACACCTTCATATCCAGTGTGGAATCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111761 ATCCAGTGCCAGTAGTCAATCCCACACCTTCATATCCAGTGTGGAATCAG
1000 . : . : . : . : . :
947 AATGCCACAGCAGTCCCAAATGGGAAAAAGATTGCCAG GAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
111811 AATGCCACAGCAGTCCCAAATGGGAAAAAGATTGCCAGGTT...TAGGAA
1050 . : . : . : . : . :
988 AGTGATGAAGCATTGGGCCCAACAATGATGAGTTGGAATGCAGTTGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114521 AGTGATGAAGCATTGGGCCCAACAATGATGAGTTGGAATGCAGTTGAAAA
1100 . : . : . : . : . :
1038 GTTATGCGCAAAATCTGCAAATGCCATTGAGACGAAAGGTTTCAATAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114571 GTTATGCGCAAAATCTGCAAATGCCATTGAGACGAAAGGTTTCAATAAAA
1150 . : . : . : . : . :
1088 AGGATCTGGAGTTAGCTCTTTCTCCCATTCATAACAGCAGTGCCCTTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114621 AGGATCTGGAGTTAGCTCTTTCTCCCATTCATAACAGCAGTGCCCTTCCC
1200 . : . : . : . : . :
1138 ACCACTGGACGCTCTTGTGTAAACCTCGCTAAAAAATGCTTCTCTGGGGA
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
114671 ACCACTGGACGCTCTTGTGTAAACCTTGCTAAAAAATGCTTCTCTGGGGA
1250 . : . : . : . : . :
1188 AGTTTCTTGGGAAGCAGTAGAACTGGATGTAAATAATATAAATATGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114721 AGTTTCTTGGGAAGCAGTAGAACTGGATGTAAATAATATAAATATGGACA
1300 . : . : . : . : . :
1238 CTGACACAAGTCAGTTAGGTTTCCATCAGTCAAATCAGTGGGCTGTGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114771 CTGACACAAGTCAGTTAGGTTTCCATCAGTCAAATCAGTGGGCTGTGGAT
1350 . : . : . : . : . :
1288 TCTGGTGGGATATCTGAAGAGCACCTTGGGAAAAGAAGTTTAAAAAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114821 TCTGGTGGGATATCTGAAGAGCACCTTGGGAAAAGAAGTTTAAAAAGAAA
1400 . : . : . : . : . :
1338 TTTTGAGTTGGTTGACTCCAGTCCTTGTAAAAAAATTATACAGAATAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114871 TTTTGAGTTGGTTGACTCCAGTCCTTGTAAAAAAATTATACAGAATAAAA
1450 . : . : . : . : . :
1388 AAACTTGTGTAGAGTATAAGCATAACGAAATGACAAATTGTTATACAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114921 AAACTTGTGTAGAGTATAAGCATAACGAAATGACAAATTGTTATACAAAT
1500 . : . : . : . : . :
1438 CAAAATACAGGCTTAACAGTTGAAGTGCAGGACCTTAAGCTATCAGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114971 CAAAATACAGGCTTAACAGTTGAAGTGCAGGACCTTAAGCTATCAGTGCA
1550 . : . : . : . : . :
1488 CAAAAGTCAACAAAATGACTGTGCTAATAAGGAGAACATTGTCAATTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115021 CAAAAGTCAACAAAATGACTGTGCTAATAAGGAGAACATTGTCAATTCTT
1600 . : . : . : . : . :
1538 TTACTGATAAACAACAAACACCAGAAAAATTACCTATACCAATGATAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115071 TTACTGATAAACAACAAACACCAGAAAAATTACCTATACCAATGATAGCA
1650 . : . : . : . : . :
1588 AAAAACCTTATGTGTGAACTCGATGAAGACTGTGAAAAGAATAGTAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115121 AAAAACCTTATGTGTGAACTCGATGAAGACTGTGAAAAGAATAGTAAGAG
1700 . : . : . : . : . :
1638 GGACTACTTAAGTTCTAGTTTTCTATGTTCTGATGATGATAGAGCTTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115171 GGACTACTTAAGTTCTAGTTTTCTATGTTCTGATGATGATAGAGCTTCTA
1750 . : . : . : . : . :
1688 AAAATATTTCTATGAACTCTGATTCATCTTTTCCTGGAATTTCTATAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115221 AAAATATTTCTATGAACTCTGATTCATCTTTTCCTGGAATTTCTATAATG
1800 . : . : . : . : . :
1738 GAAAGTCCATTAGAAAGTCAGCCCTTAGATTCAGATAGAAGCATCAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115271 GAAAGTCCATTAGAAAGTCAGCCCTTAGATTCAGATAGAAGCATCAAAGA
1850 . : . : . : . : . :
1788 ATCCTCTTTTGAAGAATCAAATATTGAAGATCCACTTATTGTAACACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115321 ATCCTCTTTTGAAGAATCAAATATTGAAGATCCACTTATTGTAACACCAG
1900 . : . : . : . : . :
1838 ATTGCCAAGAAAAGACCTCAGCAAAAGGTGTCGAGAACCCTGCTGTACAA
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
115371 ATTGCCAAGAAAAGACCTCACCAAAAGGTGTCGAGAACCCTGCTGTACAA
1950 . : . : . : . : . :
1888 GAGAGTAACCAAAAAATGTTAGGTCCTCCTCTGGAGGTGCTGAAAACGTT
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
115421 GAGAGTAACCAAAAAATGTTAGGTCCTCCTTTGGAGGTGCTGAAAACGTT
2000 . : . : . : . : . :
1938 AGCCTCTAAAAGAAATGCTGTTGCTTTTCGAAGTTTTAACAGTCATATTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115471 AGCCTCTAAAAGAAATGCTGTTGCTTTTCGAAGTTTTAACAGTCATATTA
2050 . : . : . : . : . :
1988 ATGCATCCAATAACTCAGAACCATCCAGAATGAACATGACTTCTTTAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115521 ATGCATCCAATAACTCAGAACCATCCAGAATGAACATGACTTCTTTAGAT
2100 . : . : . : . : . :
2038 GCAATGGATATTTCGTGTGCCTACAGTGGTTCATATCCCATGGCTATAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115571 GCAATGGATATTTCGTGTGCCTACAGTGGTTCATATCCCATGGCTATAAC
2150 . : . : . : . : . :
2088 CCCTACTCAAAAAAGAAGATCCTGTATGCCACATCAG CAGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
115621 CCCTACTCAAAAAAGAAGATCCTGTATGCCACATCAGGTA...TAGCAGA
2200 . : . : . : . : . :
2129 CCCCAAATCAGATCAAGTCGGGAACTCCATACCGAACTCCGAAGAGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117696 CCCCAAATCAGATCAAGTCGGGAACTCCATACCGAACTCCGAAGAGTGTG
2250 . : . : . : . : . :
2179 AGAAGAGGGGTGGCCCCCGTTGATGATGGGCGAATTCTAGGAACCCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117746 AGAAGAGGGGTGGCCCCCGTTGATGATGGGCGAATTCTAGGAACCCCAGA
2300 . : . : . : . : . :
2229 CTACCTTGCACCTGAGCTGTTACTAGGCAGGGCCCATG GTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
117796 CTACCTTGCACCTGAGCTGTTACTAGGCAGGGCCCATGGTA...CAGGTC
2350 . : . : . : . : . :
2270 CTGCGGTAGACTGGTGGGCACTTGGAGTTTGCTTGTTTGAATTTCTAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125530 CTGCGGTAGACTGGTGGGCACTTGGAGTTTGCTTGTTTGAATTTCTAACA
2400 . : . : . : . : . :
2320 GGAATTCCCCCTTTCAATGATGAAACACCACAACAAGTATTCCAGAATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125580 GGAATTCCCCCTTTCAATGATGAAACACCACAACAAGTATTCCAGAATAT
2450 . : . : . : . : . :
2370 TCTGAAAAGAG ATATCCCTTGGCCAGAAGGTGAAGAAAAGT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
125630 TCTGAAAAGAGGTG...TAGATATCCCTTGGCCAGAAGGTGAAGAAAAGT
2500 . : . : . : . : . :
2411 TATCTGATAATGCTCAAAGTGCAGTAGAAATACTTTTAACCATTGATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126084 TATCTGATAATGCTCAAAGTGCAGTAGAAATACTTTTAACCATTGATGAT
2550 . : . : . : . : . :
2461 ACAAAGAGAGCTGGAATGAAAG AGCTAAAACGTCATCCTCT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
126134 ACAAAGAGAGCTGGAATGAAAGGTA...AAGAGCTAAAACGTCATCCTCT
2600 . : . : . : . : . :
2502 CTTCAGTGATGTGGACTGGGAAAATCTGCAGCATCAGACTATGCCTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130972 CTTCAGTGATGTGGACTGGGAAAATCTGCAGCATCAGACTATGCCTTTCA
2650 . : . : . : . : . :
2552 TCCCCCAGCCAGATGATGAAACAGATACCTCCTATTTTGAAGCCAGGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131022 TCCCCCAGCCAGATGATGAAACAGATACCTCCTATTTTGAAGCCAGGAAT
2700 . : . : . : .
2602 ACTGCTCAGCACCTGACTGTATCTGGATTTAGTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131072 ACTGCTCAGCACCTGACTGTATCTGGATTTAGTCTG