seq1 = pF1KE3308.tfa, 2409 bp
seq2 = pF1KE3308/gi568815591r_14049134.tfa (gi568815591r:14049134_14941263), 892130 bp

>pF1KE3308 2409
>gi568815591r:14049134_14941263 (Chr7)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-147  (183533-183609)   100% ->
148-168  (187316-187336)   100% ->
169-322  (205070-205223)   100% ->
323-466  (222579-222722)   100% ->
467-516  (239534-239583)   100% ->
517-591  (243095-243169)   100% ->
592-711  (247070-247189)   100% ->
712-829  (255902-256019)   100% ->
830-918  (258423-258511)   100% ->
919-1035  (258595-258711)   100% ->
1036-1134  (268237-268335)   100% ->
1135-1167  (310996-311028)   100% ->
1168-1284  (319770-319886)   100% ->
1285-1358  (327851-327924)   100% ->
1359-1433  (333756-333830)   100% ->
1434-1519  (358127-358212)   100% ->
1520-1609  (360313-360402)   100% ->
1610-1770  (366892-367052)   100% ->
1771-1835  (463039-463103)   100% ->
1836-1926  (595873-595963)   100% ->
1927-2122  (602554-602749)   100% ->
2123-2243  (763113-763233)   100% ->
2244-2304  (764365-764425)   100% ->
2305-2409  (792026-792130)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTTCAGAAATATGCTGAGT         ATTCTACAAAGAAATTAAAGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 ACTTCAGAAATATGCTGAGTGTA...TAGATTCTACAAAGAAATTAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183554 ATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGGG         AAACAAGACATTCTTAACCAA         ACAAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 183604 GAAGGGGTA...CAGAAACAAGACATTCTTAACCAAGTA...CAGACAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 AGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205075 AGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205125 TTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 205175 CCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323         GTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGGACTA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205225 TA...CAGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGGACTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222621 CTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222671 GTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GT         TTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222721 GTGTA...TAGTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGGACAGCTCG         GAGCTAGAAAATATCATCAGTCAGATGATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 239573 TGGACAGCTCGGTA...CAGGAGCTAGAAAATATCATCAGTCAGATGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 243125 CATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAGTA..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592     ATCCTCCATGAAATGATGGAAGAAATTGACTATGATCATGATGGAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243175 .CAGATCCTCCATGAAATGATGGAAGAAATTGACTATGATCATGATGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGAGGAATGACAACGATTCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247116 CCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGAGGAATGACAACGATTCCACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAAT         AACGTGAAGGATGATGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 247166 CTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATGTA...CAGAACGTGAAGGATGATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 ACAGCACGTGTGGCGACTGAAGCACTTTAACAAACCTGCCTATTGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255919 ACAGCACGTGTGGCGACTGAAGCACTTTAACAAACCTGCCTATTGCAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TTTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAGGGCCTCTGCTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255969 TTTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAGGGCCTCTGCTGTTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 T         TCTGCAAGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256019 TGTG...CAGTCTGCAAGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 ACCTCCCTCTTGCATCAAGACCTATGTGAAGTCCAAAAGGAACACTGAT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 258463 ACCTCCCTCTTGCATCAAGACCTATGTGAAGTCCAAAAGGAACACTGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    919         GTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258513 TA...TAGGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 TGTGATAAGTGCCACAAAACTGTTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258637 TGTGATAAGTGCCACAAAACTGTTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACA         CTGCATAATAAATGTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 258687 GCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACAGTG...TAGCTGCATAATAAATGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 CTTCTCATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268253 CTTCTCATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 TTACCACCCACAACAATCTGTCCAGTGGTACTG         ACTCTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 268303 TTACCACCCACAACAATCTGTCCAGTGGTACTGGTG...CAGACTCTGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 CACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAG         GAAAGACAATCAACAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 311004 CACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGTG...CAGGAAAGACAATCAACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 TGAAAAAGGAAAAGAGTGGTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 319786 TGAAAAAGGAAAAGAGTGGTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 AATAAAATGCAAAGAGCCAACTCTGTTACTGTAGATGGACAAGGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 319836 AATAAAATGCAAAGAGCCAACTCTGTTACTGTAGATGGACAAGGCCTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 G         GTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 319886 GGTA...TAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TGAACCCCAAAAGTGGTGGAAAACAAGGAGAACG         AATTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 327891 TGAACCCCAAAAGTGGTGGAAAACAAGGAGAACGGTA...TAGAATTTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 AGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333763 AGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 AAATGGACCAATGCCAGG         GTTAAACTTTTTCCGTGATGTTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 333813 AAATGGACCAATGCCAGGGTA...CAGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 CTGACTTCAGAGTGTTAGCCTGTGGTGGAGATGGAACCGTGGGCTGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 358150 CTGACTTCAGAGTGTTAGCCTGTGGTGGAGATGGAACCGTGGGCTGGGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 TTGGATTGCATAG         AAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 358200 TTGGATTGCATAGGTA...CAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1548 AGTTGCGATTCTGCCTCTTGGGACTGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 360341 AGTTGCGATTCTGCCTCTTGGGACTGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 GATGGGGAGGAG         GTTACGAAGGTGAGAATCTGATGAAAATT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 360391 GATGGGGAGGAGGTA...TAGGTTACGAAGGTGAGAATCTGATGAAAATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1639 CTAAAAGACATTGAAAACAGCACAGAAATCATGTTGGACAGGTGGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 366921 CTAAAAGACATTGAAAACAGCACAGAAATCATGTTGGACAGGTGGAAGTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1689 TGAAGTCATACCTAATGACAAAGATGAGAAAGGAGACCCAGTGCCTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 366971 TGAAGTCATACCTAATGACAAAGATGAGAAAGGAGACCCAGTGCCTTACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 GTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTG         GATGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 367021 GTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGGTA...TAGGATGCCTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1780 ATTGCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCCAGAGAAATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 463048 ATTGCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCCAGAGAAATTCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1830 CAGTAG         AATGAAGAACAAATTTTGGTATTTTGAGTTTGGCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 463098 CAGTAGGTA...CAGAATGAAGAACAAATTTTGGTATTTTGAGTTTGGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1871 CATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 595908 CATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1921 ATAGAA         TGTGATGGAGTACAGATAGATTTAATAAACATCTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 595958 ATAGAAGTA...CAGTGTGATGGAGTACAGATAGATTTAATAAACATCTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1962 TCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 602589 TCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2012 ATCTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 602639 ATCTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2062 AAAGGGTCTGACAAAAGGACCACCGTCACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 602689 AAAGGGTCTGACAAAAGGACCACCGTCACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2112 TGCAAGTCAAG         ATCTCAGTGACCAGCTGCTGGAGGTGGTCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 602739 TGCAAGTCAAGGTC...CAGATCTCAGTGACCAGCTGCTGGAGGTGGTCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2153 GCTTGGAAGGAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 763143 GCTTGGAAGGAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2203 GCTGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTGCGTGGTCATCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 763193 GCTGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTGCGTGGTCATCAGGTA...CAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2244 GACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 764365 GACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGATGCAGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2294 CCCCATGCACA         ATAAAAATTACACACAAGAACCAAGCCCCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 764415 CCCCATGCACAGTG...TAGATAAAAATTACACACAAGAACCAAGCCCCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2335 ATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCGGTTTATTCTGCTCCCTCGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 792056 ATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCGGTTTATTCTGCTCCCTCGTCAA

   2600     .    :    .    :    .
   2385 AAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||
 792106 AAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA