seq1 = pF1KE3304.tfa, 2385 bp
seq2 = pF1KE3304/gi568815588r_95506765.tfa (gi568815588r:95506765_95753377), 246613 bp

>pF1KE3304 2385
>gi568815588r:95506765_95753377 (Chr10)

(complement)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-303  (110172-110386)   100% ->
304-453  (115942-116091)   100% ->
454-558  (116181-116285)   100% ->
559-717  (119729-119887)   100% ->
718-808  (120329-120419)   100% ->
809-933  (124886-125010)   100% ->
934-1078  (125792-125936)   100% ->
1079-1152  (126602-126675)   100% ->
1153-1246  (127923-128016)   100% ->
1247-1467  (132127-132347)   100% ->
1468-1605  (136764-136901)   100% ->
1606-1801  (139217-139412)   100% ->
1802-1923  (139515-139636)   100% ->
1924-2110  (141936-142122)   100% ->
2111-2206  (143086-143181)   100% ->
2207-2385  (146435-146613)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGAGTCAAGTTTACCGCTGTGGGTTCCAGCCCTTCAACCAACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGAGTCAAGTTTACCGCTGTGGGTTCCAGCCCTTCAACCAACATCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGCCCTGGGTCAAGTGTACAACCGTCTTCAGATCTC         ATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 TCTGCCCTGGGTCAAGTGTACAACCGTCTTCAGATCTCGTA...CAGATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTATCCAGCCTTCAGTCATCAGACATGTTCGTTCTTGGAGCAACATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110175 GTATCCAGCCTTCAGTCATCAGACATGTTCGTTCTTGGAGCAACATCCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTATCACTGTACCCCTCAGTCGTACACATGGCAAGTCCTTCGCCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110225 TTTATCACTGTACCCCTCAGTCGTACACATGGCAAGTCCTTCGCCCACCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGTGAGCTGAAGCATGCCAAGAGAATCGTGGTGAAGCTCGGCAGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110275 CAGTGAGCTGAAGCATGCCAAGAGAATCGTGGTGAAGCTCGGCAGTGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGTGACCCGAGGGGATGAATGTGGCCTGGCCCTGGGGCGCTTGGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110325 TGGTGACCCGAGGGGATGAATGTGGCCTGGCCCTGGGGCGCTTGGCATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTGTTGAGCAG         GTATCAGTGCTGCAGAATCAGGGCAGAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 110375 ATTGTTGAGCAGGTG...CAGGTATCAGTGCTGCAGAATCAGGGCAGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATGATGCTGGTGACCAGTGGAGCCGTAGCCTTTGGCAAACAACGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115971 GATGATGCTGGTGACCAGTGGAGCCGTAGCCTTTGGCAAACAACGCTTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCATGAGATCCTTCTGTCTCAGAGCGTGCGGCAGGCCCTCCACTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116021 GCCATGAGATCCTTCTGTCTCAGAGCGTGCGGCAGGCCCTCCACTCGGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGAACCAGCTGAAAGAAATG         GCAATTCCAGTCTTAGAGGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 116071 CAGAACCAGCTGAAAGAAATGGTG...CAGGCAATTCCAGTCTTAGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACGAGCCTGTGCAGCTGCCGGACAGAGTGGGCTGATGGCCTTGTATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116201 ACGAGCCTGTGCAGCTGCCGGACAGAGTGGGCTGATGGCCTTGTATGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTATGTTTACCCAGTACAGCATCTGTGCTGCCCAG         ATTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 116251 CTATGTTTACCCAGTACAGCATCTGTGCTGCCCAGGTG...TAGATTTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGACCAATTTGGATTTCCATGATGAGCAGAAGCGCCGGAACCTCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119735 GTGACCAATTTGGATTTCCATGATGAGCAGAAGCGCCGGAACCTCAATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AACACTTCATGAACTCCTTAGAATGAACATTGTCCCCATTGTCAACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119785 AACACTTCATGAACTCCTTAGAATGAACATTGTCCCCATTGTCAACACAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGATGCTGTTGTCCCCCCAGCTGAGCCCAACAGTGACCTGCAGGGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119835 ATGATGCTGTTGTCCCCCCAGCTGAGCCCAACAGTGACCTGCAGGGGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAT         GTTATTAGTGTTAAAGATAATGATAGCCTGGCTGCCCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119885 AATGTG...TAGGTTATTAGTGTTAAAGATAATGATAGCCTGGCTGCCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACTGGCTGTGGAAATGAAAACTGATCTCTTGATTGTTCTTTCAGATGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120367 ACTGGCTGTGGAAATGAAAACTGATCTCTTGATTGTTCTTTCAGATGTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAG         GCCTTTTTGACAGCCCCCCAGGTTCAGATGATGCAAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120417 AAGGTA...TAGGCCTTTTTGACAGCCCCCCAGGTTCAGATGATGCAAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTTATTGATATATTTTATCCCGGAGATCAGCAGTCTGTGACATTTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124924 CTTATTGATATATTTTATCCCGGAGATCAGCAGTCTGTGACATTTGGAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAAGTCTAGAGTGGGAATGGGTGGCATGGAAGCCAAG         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 124974 CAAGTCTAGAGTGGGAATGGGTGGCATGGAAGCCAAGGTA...TAGGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGCAGCCCTCTGGGCTTTGCAAGGTGGCACTTCTGTTGTTATTGCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125796 AAGCAGCCCTCTGGGCTTTGCAAGGTGGCACTTCTGTTGTTATTGCCAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGAACCCACCCAAAGGTGTCTGGGCACGTCATCACAGACATTGTGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125846 GGAACCCACCCAAAGGTGTCTGGGCACGTCATCACAGACATTGTGGAGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAAGAAAGTTGGTACCTTCTTTTCAGAAGTAAAGCCTGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 125896 GAAGAAAGTTGGTACCTTCTTTTCAGAAGTAAAGCCTGCAGGTA...CAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCCCTACTGTTGAGCAGCAGGGAGAAATGGCGCGATCTGGAGGAAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126602 GCCCTACTGTTGAGCAGCAGGGAGAAATGGCGCGATCTGGAGGAAGGATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTGGCCACCTTGGAACCTGAGCAG         AGAGCAGAAATTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 126652 TTGGCCACCTTGGAACCTGAGCAGGTA...TAGAGAGCAGAAATTATCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TCATCTGGCTGATCTGTTGACGGACCAGCGTGATGAGATCCTGTTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127940 TCATCTGGCTGATCTGTTGACGGACCAGCGTGATGAGATCCTGTTAGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ACAAAAAAGACTTGGAGGAGGCAGAGG         GGAGACTTGCAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 127990 ACAAAAAAGACTTGGAGGAGGCAGAGGGTA...CAGGGAGACTTGCAGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CCTCTGCTGAAACGTTTAAGCCTCTCCACATCCAAATTGAACAGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132141 CCTCTGCTGAAACGTTTAAGCCTCTCCACATCCAAATTGAACAGCCTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CATCGGTCTGCGACAGATCGCAGCCTCCTCCCAGGACAGCGTGGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132191 CATCGGTCTGCGACAGATCGCAGCCTCCTCCCAGGACAGCGTGGGACGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTTTGCGCCGCACCCGAATCGCCAAAAACTTGGAACTGGAACAAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132241 TTTTGCGCCGCACCCGAATCGCCAAAAACTTGGAACTGGAACAAGTGACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTCCCAATTGGAGTTCTGCTGGTGATCTTTGAATCTCGTCCTGACTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132291 GTCCCAATTGGAGTTCTGCTGGTGATCTTTGAATCTCGTCCTGACTGTCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 ACCCCAG         GTGGCAGCTTTGGCTATCGCAAGTGGCAATGGCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132341 ACCCCAGGTG...CAGGTGGCAGCTTTGGCTATCGCAAGTGGCAATGGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TGTTACTCAAAGGAGGGAAGGAGGCTGCACACAGCAACCGGATTCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136798 TGTTACTCAAAGGAGGGAAGGAGGCTGCACACAGCAACCGGATTCTCCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTCCTGACCCAGGAGGCTCTCTCAATCCATGGAGTCAAGGAGGCCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136848 CTCCTGACCCAGGAGGCTCTCTCAATCCATGGAGTCAAGGAGGCCGTGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ACTG         GTGAATACCAGAGAAGAAGTTGAAGATCTTTGCCGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136898 ACTGGTA...AAGGTGAATACCAGAGAAGAAGTTGAAGATCTTTGCCGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TAGACAAAATGATAGATCTGATCATTCCACGTGGCTCTTCCCAGCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139254 TAGACAAAATGATAGATCTGATCATTCCACGTGGCTCTTCCCAGCTGGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AGAGACATCCAGAAAGCTGCTAAGGGGATTCCAGTGATGGGGCACAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139304 AGAGACATCCAGAAAGCTGCTAAGGGGATTCCAGTGATGGGGCACAGCGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AGGGATCTGTCACATGTATGTGGATTCCGAGGCCAGTGTTGATAAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139354 AGGGATCTGTCACATGTATGTGGATTCCGAGGCCAGTGTTGATAAGGTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CCAGGCTAG         TCAGAGACTCTAAATGTGAATATCCAGCTGCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 139404 CCAGGCTAGGTG...CAGTCAGAGACTCTAAATGTGAATATCCAGCTGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TGTAATGCTTTGGAGACTTTGTTAATCCACCGGGATCTGCTCAGGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139547 TGTAATGCTTTGGAGACTTTGTTAATCCACCGGGATCTGCTCAGGACACC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 ATTATTTGACCAGATCATTGATATGCTGAGAGTGGAACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 139597 ATTATTTGACCAGATCATTGATATGCTGAGAGTGGAACAGGTA...CAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TAAAAATTCATGCAGGCCCCAAATTTGCCTCCTATCTGACCTTCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141937 TAAAAATTCATGCAGGCCCCAAATTTGCCTCCTATCTGACCTTCAGCCCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TCCGAAGTGAAGTCACTCCGAACTGAGTATGGGGACCTGGAATTATGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141987 TCCGAAGTGAAGTCACTCCGAACTGAGTATGGGGACCTGGAATTATGCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TGAAGTAGTGGACAACGTTCAGGATGCCATTGACCACATCCACAAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142037 TGAAGTAGTGGACAACGTTCAGGATGCCATTGACCACATCCACAAGTATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GCAGCTCCCACACGGATGTCATCGTCACAGAGGACG         AAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 142087 GCAGCTCCCACACGGATGTCATCGTCACAGAGGACGGTC...CAGAAAAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 ACAGCGGAGTTCTTCCTGCAGCACGTAGACAGTGCCTGTGTGTTCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143091 ACAGCGGAGTTCTTCCTGCAGCACGTAGACAGTGCCTGTGTGTTCTGGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TGCCAGCACTCGCTTTTCTGATGGTTACCGCTTTGGACTGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 143141 TGCCAGCACTCGCTTTTCTGATGGTTACCGCTTTGGACTGGGTA...CAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 GAGCTGAAGTGGGAATCAGTACATCGAGAATCCACGCCCGGGGACCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146435 GAGCTGAAGTGGGAATCAGTACATCGAGAATCCACGCCCGGGGACCAGTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 GGACTTGAGGGACTGCTTACTACTAAGTGGCTGCTGCGAGGGAAGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146485 GGACTTGAGGGACTGCTTACTACTAAGTGGCTGCTGCGAGGGAAGGACCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CGTGGTCTCAGATTTCTCAGAGCATGGAAGTTTAAAATATCTTCATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146535 CGTGGTCTCAGATTTCTCAGAGCATGGAAGTTTAAAATATCTTCATGAGA

   2500     .    :    .    :    .
   2357 ACCTCCCTATTCCTCAGAGAAACACCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 146585 ACCTCCCTATTCCTCAGAGAAACACCAAC