seq1 = pF1KE3275.tfa, 2064 bp
seq2 = pF1KE3275/gi568815576f_25465041.tfa (gi568815576f:25465041_25822447), 357407 bp

>pF1KE3275 2064
>gi568815576f:25465041_25822447 (Chr22)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-190  (139337-139413)   100% ->
191-264  (179552-179625)   100% ->
265-366  (196536-196637)   100% ->
367-441  (198590-198664)   100% ->
442-503  (202699-202760)   100% ->
504-555  (207256-207307)   100% ->
556-647  (209397-209488)   100% ->
648-747  (213776-213875)   100% ->
748-826  (220130-220208)   100% ->
827-957  (222497-222627)   100% ->
958-1052  (225149-225243)   100% ->
1053-1160  (230067-230174)   99% ->
1161-1227  (238470-238536)   100% ->
1228-1328  (239069-239169)   100% ->
1329-1395  (244858-244924)   100% ->
1396-1491  (246028-246123)   100% ->
1492-1654  (249368-249530)   100% ->
1655-1791  (253205-253341)   100% ->
1792-1905  (256244-256357)   100% ->
1906-2064  (257249-257407)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACCTGGAGGCTGTGCTGGCCGATGTCAGTTACCTGATGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACCTGGAGGCTGTGCTGGCCGATGTCAGTTACCTGATGGCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGAAGAGCAAGGCGACCCCGGCCGCCCGCGCCAGCAAGAGGATCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGAAGAGCAAGGCGACCCCGGCCGCCCGCGCCAGCAAGAGGATCGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCGGAGCCCAG         TATCCGGAGTGTGATGCAGAAGTACCTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCGGAGCCCAGGTA...CAGTATCCGGAGTGTGATGCAGAAGTACCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGAGAGAAATGAAATAACCTTTGACAAGATTTTCAATCAGAAAATTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 139365 GCAGAGAGAAATGAAATAACCTTTGACAAGATTTTCAATCAGAAAATTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         GTTTCTTGCTATTTAAAGATTTTTGTTTGAATGAAATTAATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139415 TA...TAGGTTTCTTGCTATTTAAAGATTTTTGTTTGAATGAAATTAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGCTGTACCTCAGGTGAAGTTTTATGAAGAG         ATAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 179594 AAGCTGTACCTCAGGTGAAGTTTTATGAAGAGGTA...TAGATAAAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TATGAAAAACTTGATAATGAGGAAGACCGCCTTTGCAGAAGTCGACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196545 TATGAAAAACTTGATAATGAGGAAGACCGCCTTTGCAGAAGTCGACAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTATGATGCCTACATCATGAAGGAACTTCTTTCCTGTTCACAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 196595 TTATGATGCCTACATCATGAAGGAACTTCTTTCCTGTTCACATGTA...T

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    367   CCTTTCTCAAAGCAAGCTGTAGAACACGTACAAAGTCATTTATCCAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198588 AGCCTTTCTCAAAGCAAGCTGTAGAACACGTACAAAGTCATTTATCCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAACAAGTGACATCAACTCTTTTTCAG         CCATACATAGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 198638 AAACAAGTGACATCAACTCTTTTTCAGGTA...CAGCCATACATAGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AATTTGTGAAAGCCTTCGAGGTGACATTTTTCAAAAATTTATGGAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 202713 AATTTGTGAAAGCCTTCGAGGTGACATTTTTCAAAAATTTATGGAAAGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    504        TGACAAGTTCACTAGATTTTGTCAGTGGAAAAACGTTGAATTA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202763 A...TAGTGACAAGTTCACTAGATTTTGTCAGTGGAAAAACGTTGAATTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AATATCCAT         TTGACCATGAATGAGTTCAGTGTGCATAGGAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 207299 AATATCCATGTG...CAGTTGACCATGAATGAGTTCAGTGTGCATAGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TATTGGACGAGGAGGATTCGGGGAAGTTTATGGTTGCAGGAAAGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209429 TATTGGACGAGGAGGATTCGGGGAAGTTTATGGTTGCAGGAAAGCAGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CTGGAAAAAT         GTATGCAATGAAATGCTTAGATAAGAAGAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 209479 CTGGAAAAATGTA...TAGGTATGCAATGAAATGCTTAGATAAGAAGAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 ATCAAAATGAAACAAGGAGAAACATTAGCCTTAAATGAAAGAATCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213807 ATCAAAATGAAACAAGGAGAAACATTAGCCTTAAATGAAAGAATCATGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GTCTCTTGTCAGCACAGGA         GACTGTCCTTTCATTGTATGTA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 213857 GTCTCTTGTCAGCACAGGAGTA...TAGGACTGTCCTTTCATTGTATGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 TGACCTATGCCTTCCATACCCCAGATAAACTCTGCTTCATCCTGGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220152 TGACCTATGCCTTCCATACCCCAGATAAACTCTGCTTCATCCTGGATCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 ATGAACG         GGGGCGATTTGCACTACCACCTTTCACAACACGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220202 ATGAACGGTA...CAGGGGGCGATTTGCACTACCACCTTTCACAACACGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TGTGTTCTCTGAGAAGGAGATGCGGTTTTATGCCACTGAAATCATTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222531 TGTGTTCTCTGAGAAGGAGATGCGGTTTTATGCCACTGAAATCATTCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 GTCTGGAACACATGCACAATCGGTTTGTTGTCTACAGAGATTTGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 222581 GTCTGGAACACATGCACAATCGGTTTGTTGTCTACAGAGATTTGAAGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    958       CCAGCAAATATTCTCTTGGATGAACATGGACACGCAAGAATATC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222631 ...TAGCCAGCAAATATTCTCTTGGATGAACATGGACACGCAAGAATATC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 AGATCTTGGTCTTGCCTGCGATTTTTCCAAAAAGAAGCCTCATGCGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225193 AGATCTTGGTCTTGCCTGCGATTTTTCCAAAAAGAAGCCTCATGCGAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 T         TGGTACCCATGGGTACATGGCTCCCGAGGTGCTGCAGAAG
        |>>>...>>>||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225243 TGTA...TAGTGGCACCCATGGGTACATGGCTCCCGAGGTGCTGCAGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 GGGACGGCCTATGACAGCAGTGCCGACTGGTTCTCCCTGGGCTGCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230107 GGGACGGCCTATGACAGCAGTGCCGACTGGTTCTCCCTGGGCTGCATGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 TTTCAAACTTCTGAGAGG         TCACAGCCCTTTCAGACAACATA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 230157 TTTCAAACTTCTGAGAGGGTG...CAGTCACAGCCCTTTCAGACAACATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 AAACCAAAGACAAGCATGAAATTGACCGAATGACACTCACCGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 238493 AAACCAAAGACAAGCATGAAATTGACCGAATGACACTCACCGTGGTA...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1228    AATGTGGAACTTCCAGACACCTTCTCTCCTGAACTGAAGTCCCTTTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239066 CAGAATGTGGAACTTCCAGACACCTTCTCTCCTGAACTGAAGTCCCTTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 GGAGGGCTTGCTTCAGCGAGACGTTAGCAAGCGGCTGGGCTGTCACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239116 GGAGGGCTTGCTTCAGCGAGACGTTAGCAAGCGGCTGGGCTGTCACGGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 GCGG         CTCACAGGAAGTAAAAGAGCACAGCTTTTTCAAAGGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239166 GCGGGTA...CAGCTCACAGGAAGTAAAAGAGCACAGCTTTTTCAAAGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 GTTGACTGGCAGCATGTCTACTTACAAAAG         TACCCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 244895 GTTGACTGGCAGCATGTCTACTTACAAAAGGTA...CAGTACCCACCACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1407 CTTGATTCCTCCCCGGGGAGAAGTCAATGCTGCTGATGCCTTTGATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246039 CTTGATTCCTCCCCGGGGAGAAGTCAATGCTGCTGATGCCTTTGATATTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 GCTCATTTGATGAAGAGGATACCAAAGGGATTAAG         CTACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 246089 GCTCATTTGATGAAGAGGATACCAAAGGGATTAAGGTA...CAGCTACTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1498 GATTGCGACCAAGAACTCTACAAGAACTTCCCTTTGGTCATCTCTGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249374 GATTGCGACCAAGAACTCTACAAGAACTTCCCTTTGGTCATCTCTGAACG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1548 CTGGCAGCAAGAAGTAACGGAAACAGTTTATGAAGCAGTAAATGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249424 CTGGCAGCAAGAAGTAACGGAAACAGTTTATGAAGCAGTAAATGCAGACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 CAGATAAAATCGAGGCCAGGAAGAGAGCTAAAAATAAGCAACTTGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249474 CAGATAAAATCGAGGCCAGGAAGAGAGCTAAAAATAAGCAACTTGGCCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 GAAGAAG         ATTACGCTCTGGGGAAGGACTGTATTATGCACGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249524 GAAGAAGGTA...CAGATTACGCTCTGGGGAAGGACTGTATTATGCACGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1689 GTACATGCTGAAACTGGGAAACCCATTTCTGACTCAGTGGCAGCGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253239 GTACATGCTGAAACTGGGAAACCCATTTCTGACTCAGTGGCAGCGTCGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 ATTTTTACCTCTTTCCAAATAGACTTGAATGGAGAGGAGAGGGAGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253289 ATTTTTACCTCTTTCCAAATAGACTTGAATGGAGAGGAGAGGGAGAGTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 CGG         CAAAATTTACTGACAATGGAACAGATTCTCTCTGTGGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253339 CGGGTA...TAGCAAAATTTACTGACAATGGAACAGATTCTCTCTGTGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1830 AGAAACTCAAATTAAAGACAAAAAATGCATTTTGTTCAGAATAAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256282 AGAAACTCAAATTAAAGACAAAAAATGCATTTTGTTCAGAATAAAAGGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 GGAAACAATTTGTCTTGCAATGTGAG         AGTGATCCAGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 256332 GGAAACAATTTGTCTTGCAATGTGAGGTG...CAGAGTGATCCAGAGTTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1921 GTGCAGTGGAAGAAAGAGTTGAACGAAACCTTCAAGGAGGCCCAGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257264 GTGCAGTGGAAGAAAGAGTTGAACGAAACCTTCAAGGAGGCCCAGCGGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1971 ATTGCGTCGTGCCCCGAAGTTCCTCAACAAACCTCGGTCAGGTACTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257314 ATTGCGTCGTGCCCCGAAGTTCCTCAACAAACCTCGGTCAGGTACTGTGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 AGCTCCCAAAGCCATCCCTCTGTCACAGAAACAGCAACGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257364 AGCTCCCAAAGCCATCCCTCTGTCACAGAAACAGCAACGGCCTC