seq1 = pF1KE3268.tfa, 1998 bp
seq2 = pF1KE3268/gi568815583r_51838159.tfa (gi568815583r:51838159_52071745), 233587 bp

>pF1KE3268 1998
>gi568815583r:51838159_52071745 (Chr15)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-814  (105242-105997)   100% ->
815-919  (109253-109357)   100% ->
920-1014  (111013-111107)   100% ->
1015-1160  (111702-111847)   100% ->
1161-1245  (112920-113004)   100% ->
1246-1340  (117171-117265)   100% ->
1341-1475  (118483-118617)   100% ->
1476-1611  (119767-119902)   100% ->
1612-1798  (121752-121938)   100% ->
1799-1896  (124357-124454)   100% ->
1897-1998  (133486-133587)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGATATGGAGGATCTCTTCGGGAGCGACGCCGACAGCGAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGATATGGAGGATCTCTTCGGGAGCGACGCCGACAGCGAAGCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGTAAAG         ATTCTGATTCTGGATCTGACTCAGATTCTGATC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGTAAAGGTG...TAGATTCTGATTCTGGATCTGACTCAGATTCTGATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGAGAATGCTGCCTCTGGCAGTAATGCCTCTGGAAGTGAAAGTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105275 AAGAGAATGCTGCCTCTGGCAGTAATGCCTCTGGAAGTGAAAGTGATCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGAAAGAGGTGATTCAGGACAACCAAGTAATAAGGAACTGTTTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105325 GATGAAAGAGGTGATTCAGGACAACCAAGTAATAAGGAACTGTTTGGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACAGTGAGGACGAGGGAGCTTCACATCATAGTGGTAGTGATAATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105375 TGACAGTGAGGACGAGGGAGCTTCACATCATAGTGGTAGTGATAATCACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGAAAGATCAGACAATAGATCAGAAGCTTCTGAGCGTTCTGACCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105425 CTGAAAGATCAGACAATAGATCAGAAGCTTCTGAGCGTTCTGACCATGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACAATGACCCCTCAGATGTAGATCAGCACAGTGGATCAGAAGCCCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105475 GACAATGACCCCTCAGATGTAGATCAGCACAGTGGATCAGAAGCCCCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGATGATGAAGACGAAGGTCATAGATCGGATGGAGGGAGCCATCATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105525 TGATGATGAAGACGAAGGTCATAGATCGGATGGAGGGAGCCATCATTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAGCAGAAGGTTCTGAAAAAGCACATTCAGATGATGAAAAATGGGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105575 AAGCAGAAGGTTCTGAAAAAGCACATTCAGATGATGAAAAATGGGGCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAGATAAAAGTGACCAGTCAGATGATGAAAAGATACAAAATTCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105625 GAAGATAAAAGTGACCAGTCAGATGATGAAAAGATACAAAATTCTGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGAGGAGAGGGCACAAGGATCTGATGAAGATAAGCTGCAGAATTCTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105675 TGAGGAGAGGGCACAAGGATCTGATGAAGATAAGCTGCAGAATTCTGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATGATGAGAAAATGCAGAACACAGATGATGAGGAGAGGCCTCAGCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105725 ATGATGAGAAAATGCAGAACACAGATGATGAGGAGAGGCCTCAGCTTTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GATGATGAGAGACAACAGCTATCTGAGGAGGAAAAGGCTAATTCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105775 GATGATGAGAGACAACAGCTATCTGAGGAGGAAAAGGCTAATTCTGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGAACGGCCGGTAGCTTCTGATAATGATGATGAGAAACAGAATTCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105825 TGAACGGCCGGTAGCTTCTGATAATGATGATGAGAAACAGAATTCTGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATGAAGAACAACCACAGCTGTCTGATGAAGAGAAAATGCAAAATTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105875 ATGAAGAACAACCACAGCTGTCTGATGAAGAGAAAATGCAAAATTCTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GATGAAAGGCCACAGGCCTCAGATGAAGAACACAGGCATTCAGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105925 GATGAAAGGCCACAGGCCTCAGATGAAGAACACAGGCATTCAGATGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGAGGAACAGGATCATAAATCAG         AATCTGCAAGAGGCAGTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105975 AGAGGAACAGGATCATAAATCAGGTA...TAGAATCTGCAAGAGGCAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ATAGTGAAGATGAAGTTTTACGAATGAAACGCAAGAATGCGATTGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109271 ATAGTGAAGATGAAGTTTTACGAATGAAACGCAAGAATGCGATTGCATCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GATTCAGAAGCGGATAGTGACACTGAGGTGCCAAAAG         ATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109321 GATTCAGAAGCGGATAGTGACACTGAGGTGCCAAAAGGTA...AAGATAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TAGTGGAACCATGGATTTATTTGGAGGTGCAGATGATATCTCTTCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111017 TAGTGGAACCATGGATTTATTTGGAGGTGCAGATGATATCTCTTCAGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GTGATGGAGAAGACAAACCACCTACTCCAGGACAGCCTGTT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111067 GTGATGGAGAAGACAAACCACCTACTCCAGGACAGCCTGTTGTA...TAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GATGAAAATGGATTGCCTCAGGATCAACAGGAAGAGGAGCCAATTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111702 GATGAAAATGGATTGCCTCAGGATCAACAGGAAGAGGAGCCAATTCCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GACCAGAATAGAAGTAGAAATACCCAAAGTAAACACTGATTTAGGAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111752 GACCAGAATAGAAGTAGAAATACCCAAAGTAAACACTGATTTAGGAAACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 ACTTATATTTTGTTAAACTGCCCAACTTTCTCAGTGTAGAGCCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 111802 ACTTATATTTTGTTAAACTGCCCAACTTTCTCAGTGTAGAGCCCAGGTA.

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161      ACCTTTTGATCCTCAGTATTATGAAGATGAATTTGAAGATGAAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111852 ..TAGACCTTTTGATCCTCAGTATTATGAAGATGAATTTGAAGATGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 AATGCTGGATGAAGAAGGTAGAACCAGGTTAAAATTAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112965 AATGCTGGATGAAGAAGGTAGAACCAGGTTAAAATTAAAGGTA...CAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TAGAAAATACTATAAGATGGAGGATACGCCGAGATGAAGAAGGAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117172 TAGAAAATACTATAAGATGGAGGATACGCCGAGATGAAGAAGGAAATGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ATTAAAGAAAGCAATGCTCGGATAGTCAAGTGGTCAGATGGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 117222 ATTAAAGAAAGCAATGCTCGGATAGTCAAGTGGTCAGATGGAAGGTG...

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1341    CATGTCCCTGCATTTAGGCAATGAAGTGTTTGATGTGTACAAAGCCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118480 CAGCATGTCCCTGCATTTAGGCAATGAAGTGTTTGATGTGTACAAAGCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CACTGCAGGGCGACCACAATCATCTTTTTATAAGACAAGGTACTGGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118530 CACTGCAGGGCGACCACAATCATCTTTTTATAAGACAAGGTACTGGTCTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CAGGGACAAGCAGTCTTTAAAACGAAACTCACCTTCAG         ACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 118580 CAGGGACAAGCAGTCTTTAAAACGAAACTCACCTTCAGGTA...CAGACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TCACTCTACGGACAGTGCCACACATAGAAAGATGACTCTGTCACTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119770 TCACTCTACGGACAGTGCCACACATAGAAAGATGACTCTGTCACTTGCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 ATAGGTGTTCAAAGACACAGAAGATTAGAATCTTGCCAATGGCTGGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119820 ATAGGTGTTCAAAGACACAGAAGATTAGAATCTTGCCAATGGCTGGTCGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GATCCTGAATGCCAACGCACAGAAATGATTAAG         AAAGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 119870 GATCCTGAATGCCAACGCACAGAAATGATTAAGGTA...CAGAAAGAAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AGAACGTTTGAGGGCTTCCATACGTAGGGAATCTCAGCAGCGCCGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121760 AGAACGTTTGAGGGCTTCCATACGTAGGGAATCTCAGCAGCGCCGAATGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 GAGAGAAACAGCACCAGCGGGGGCTGAGCGCCAGTTACCTGGAACCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121810 GAGAGAAACAGCACCAGCGGGGGCTGAGCGCCAGTTACCTGGAACCTGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 CGATACGATGAGGAGGAGGAAGGCGAGGAGTCCATCAGCTTGGCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121860 CGATACGATGAGGAGGAGGAAGGCGAGGAGTCCATCAGCTTGGCTGCCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TAAAAACCGATATAAAGGGGGCATTCGAG         AGGAACGAGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 121910 TAAAAACCGATATAAAGGGGGCATTCGAGGTG...CAGAGGAACGAGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 GAATCTATTCATCAGACAGTGATGAGGGATCAGAAGAAGATAAAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124369 GAATCTATTCATCAGACAGTGATGAGGGATCAGAAGAAGATAAAGCTCAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 AGATTACTCAAAGCAAAGAAACTTACCAGTGATGAG         GAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 124419 AGATTACTCAAAGCAAAGAAACTTACCAGTGATGAGGTA...TAGGAAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TGAACCTTCCGGAAAGAGAAAAGCAGAAGATGATGATAAAGCAAATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133491 TGAACCTTCCGGAAAGAGAAAAGCAGAAGATGATGATAAAGCAAATAAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1952 AGCATAAGAAGTATGTGATCAGCGATGAAGAGGAAGAAGATGATGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133541 AGCATAAGAAGTATGTGATCAGCGATGAAGAGGAAGAAGATGATGAT