seq1 = pF1KE3267.tfa, 1986 bp
seq2 = pF1KE3267/gi568815593r_7759438.tfa (gi568815593r:7759438_7968083), 208646 bp

>pF1KE3267 1986
>gi568815593r:7759438_7968083 (Chr5)

(complement)

1-1438  (100001-101438)   99% ->
1439-1524  (102101-102186)   100% ->
1525-1699  (105087-105261)   100% ->
1700-1769  (106432-106501)   100% ->
1770-1884  (106821-106935)   100% ->
1885-1986  (108545-108646)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATTAATCACCTTGAGGAAGAACCTTTATCGTTTATCTGATTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATTAATCACCTTGAGGAAGAACCTTTATCGTTTATCTGATTTTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGCATAGAGCTCTGGCTGCTTTAAAAAATAAACCTCTAAATCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGCATAGAGCTCTGGCTGCTTTAAAAAATAAACCTCTAAATCATGTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAAGGTAGTCAAGGAGCGTCTGTGCCCTTGGTTGTGTTCACGACAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAAGGTAGTCAAGGAGCGTCTGTGCCCTTGGTTGTGTTCACGACAACCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCCTTTCGGGGTCAGATTCCATCATGCCCATTGTAAAAAGTTTCATTC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCCTTTCGGGGTCAAATTCCATCATGCCCATTGTAAAAAGTTTCATTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAAAATGGAAATGACCTTCATCCACTCGGTGGACCAGTGTTCTCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAAAATGGAAATGACCTTCATCCACTCGGTGGACCAGTGTTCTCTCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TATCTGACTGCGACAGGCTTGAACAAAATGTTAAAAATGAGGAGAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TATCTGACTGCGACAGGCTTGAACAAAATGTTAAAAATGAGGAGAGTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTTTACAGGAGACTGAGCAACTTGACTTCATCAGAAGAAGTGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTTTTACAGGAGACTGAGCAACTTGACTTCATCAGAAGAAGTGCTAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTATAAGCACGATGGAAACCCTGCCTGACACTATGGCAGCAGGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTATAAGCACGATGGAAACCCTGCCTGACACTATGGCAGCAGGAGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TACAACGAATTTGTGAAGTGGAAAAAAAGGATGGTGATCAAGGGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TACAACGAATTTGTGAAGTGGAAAAAAAGGATGGTGATCAAGGGCTGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAAGAAATACTGGAGAATAGCATCTTTCAAGCTTTATGCTTTCAGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAAGAAATACTGGAGAATAGCATCTTTCAAGCTTTATGCTTTCAGTTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAAGGAGCCCTCACAGCTGTCAAACACTAGTTTAGTGACTGCTTTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAAGGAGCCCTCACAGCTGTCAAACACTAGTTTAGTGACTGCTTTGCAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCTGATTCTGTTGCATGTGGATCCTCAAAGTAGCCTGTTGCTGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCTGATTCTGTTGCATGTGGATCCTCAAAGTAGCCTGTTGCTGAACCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGCAGAATGCCAAAATCGTCTCAGAAAAGGTGGCATGGAAGTTCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGCAGAATGCCAAAATCGTCTCAGAAAAGGTGGCATGGAAGTTCGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCTTTGTATTCTTGGGGAAAGTCTGATTACACTGCACAGTTCAGGTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCTTTGTATTCTTGGGGAAAGTCTGATTACACTGCACAGTTCAGGTTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGACACTAGAACTCATTATAAATCAACTTCAAGGTGAAAAATTGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGACACTAGAACTCATTATAAATCAACTTCAAGGTGAAAAATTGGAAACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTACCCCGGAGGATATTGTGGCCCTTTATAGAATCTTGCAGGCATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTACCCCGGAGGATATTGTGGCCCTTTATAGAATCTTGCAGGCATGTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAAAAAGTGGATGAACACCAAACATTTTTAAATAAGATAAACAACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGAAAAAGTGGATGAACACCAAACATTTTTAAATAAGATAAACAACTTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCTATCAATAGTTTCCAACCTGAGTCCTAAATTGATTAGCCAAATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCTATCAATAGTTTCCAACCTGAGTCCTAAATTGATTAGCCAAATGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACTGCCCTGGTGGTTCTTGATCAAAGTCAAGCATTTCCTCTGATTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACTGCCCTGGTGGTTCTTGATCAAAGTCAAGCATTTCCTCTGATTATAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ATTGGGCAAATATGTCGTGAGGCATGTCCCACATTTCACTAACGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ATTGGGCAAATATGTCGTGAGGCATGTCCCACATTTCACTAACGAGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTAGGAGAGTCTTGGAGGCGTTCATATATTTTGGGCACCATGACACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTAGGAGAGTCTTGGAGGCGTTCATATATTTTGGGCACCATGACACATTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTACAAAAGCCCTAGAGCATCGTGTAGCTGCGGTGTGCCTCACGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTTACAAAAGCCCTAGAGCATCGTGTAGCTGCGGTGTGCCTCACGTTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TCCTGAAGTTGTCTGCAGGGTCATGGAGTACTGCAGTAGAGAACTGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCCTGAAGTTGTCTGCAGGGTCATGGAGTACTGCAGTAGAGAACTGATTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTTCAAAACCCATCCTCAATGCAGTGGCAGAAACTTTTGTTTGCCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTTCAAAACCCATCCTCAATGCAGTGGCAGAAACTTTTGTTTGCCAAACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAAAAATTTTCACCTCGTCAGATTTCTGCGTTAATGGAACCATTTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 101201 GAAAAATTTTCACCTCGTCAGATTTCTGCCTTAATGGAACCATTTGGGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ACTCAATTATTTGCCACCAAATGCCTCTGCTTTATTTAGAAAGCTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ACTCAATTATTTGCCACCAAATGCCTCTGCTTTATTTAGAAAGCTGGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACGTGCTATTCACTCATTTCAATTATTTTCCACCCAAATCATTATTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACGTGCTATTCACTCATTTCAATTATTTTCCACCCAAATCATTATTGAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CTTCTTCATTCATGTTCACTTAATGAATGCCATCCAGTCAACTTTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CTTCTTCATTCATGTTCACTTAATGAATGCCATCCAGTCAACTTTCTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AAAAATATTCAAGCCTCTTTTCCTTCAACGGCTGCAAG         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101401 AAAAATATTCAAGCCTCTTTTCCTTCAACGGCTGCAAGGTG...CAGGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 AAGAATCTCATTTGGACACATTGAGTCGGGCACAACTGACCCAACTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102104 AAGAATCTCATTTGGACACATTGAGTCGGGCACAACTGACCCAACTTTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 TTAGCCTCAGTCCTGGAATGCCCTTTCTATAAG         GGTCCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102154 TTAGCCTCAGTCCTGGAATGCCCTTTCTATAAGGTA...TAGGGTCCAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 ACTCCTTCCTAAATATCAAGTGAAGTCATTTCTTACCCCATGCTGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105095 ACTCCTTCCTAAATATCAAGTGAAGTCATTTCTTACCCCATGCTGTTCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 TGGAGACCCCTGTGGATTCTCAGCTTTATAGATATGTGAAGATTGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105145 TGGAGACCCCTGTGGATTCTCAGCTTTATAGATATGTGAAGATTGGGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 ACTAACCTTTTAGGAGCAAGATTATATTTTGCTCCAAAAGTGTTGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105195 ACTAACCTTTTAGGAGCAAGATTATATTTTGCTCCAAAAGTGTTGACACC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 CTATTGTTATACAATAG         ATGTTGAAATTAAATTAGATGAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105245 CTATTGTTATACAATAGGTA...CAGATGTTGAAATTAAATTAGATGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 AAGGATTTGTATTGCCATCCACAGCTAATGAAGATATCCATAAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 106456 AAGGATTTGTATTGCCATCCACAGCTAATGAAGATATCCATAAAAGGTA.

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770      GATAGCACTGTGTATTGATGGTCCAAAAAGGTTTTGCTCCAATAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106506 ..CAGGATAGCACTGTGTATTGATGGTCCAAAAAGGTTTTGCTCCAATAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 CAAACACTTACTGGGGAAAGAAGCTATTAAACAAAGACACCTACAGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106866 CAAACACTTACTGGGGAAAGAAGCTATTAAACAAAGACACCTACAGTTAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 TCGGTTATCAAGTTGTTCAG         ATCCCCTATCATGAGATTGGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106916 TCGGTTATCAAGTTGTTCAGGTA...CAGATCCCCTATCATGAGATTGGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 ATGCTAAAATCAAGACGTGAATTGGTGGAATATTTACAAAGAAAACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108566 ATGCTAAAATCAAGACGTGAATTGGTGGAATATTTACAAAGAAAACTGTT

   2000     .    :    .    :    .    :
   1956 TTCTCAAAACACTGTTCATTGGTTGCAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 108616 TTCTCAAAACACTGTTCATTGGTTGCAAGAA