seq1 = pF1KE3264.tfa, 1929 bp
seq2 = pF1KE3264/gi568815582r_56262912.tfa (gi568815582r:56262912_56525327), 262416 bp

>pF1KE3264 1929
>gi568815582r:56262912_56525327 (Chr16)

(complement)

1-255  (100001-100255)   100% ->
256-348  (110984-111076)   100% ->
349-513  (115740-115904)   100% ->
514-666  (117212-117364)   100% ->
667-707  (120084-120124)   100% ->
708-840  (120287-120419)   100% ->
841-974  (122210-122343)   100% ->
975-1085  (123485-123595)   100% ->
1086-1276  (135953-136143)   100% ->
1277-1380  (139306-139409)   100% ->
1381-1515  (156001-156135)   100% ->
1516-1599  (157801-157884)   100% ->
1600-1784  (161223-161407)   100% ->
1785-1929  (162272-162416)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCTGCTCTTCCTCGAGCGCTTCCCCTGGCCCAGCCTCCGCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCTGCTCTTCCTCGAGCGCTTCCCCTGGCCCAGCCTCCGCACCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACGGGCCTCAGCGGCCTGGCCCTGCTGGGCACCATCATCAGCGCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACGGGCCTCAGCGGCCTGGCCCTGCTGGGCACCATCATCAGCGCCTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCGCTCAGCCAGCCCGAGGCCGGCCCCGGCGAGCCGGACCAGCTAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCGCTCAGCCAGCCCGAGGCCGGCCCCGGCGAGCCGGACCAGCTAACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTCGCTGCAGCCTGAGCCGCCGGCGCCCGCCCGGCCGAGCGCCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTCGCTGCAGCCTGAGCCGCCGGCGCCCGCCCGGCCGAGCGCCGGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACCCCGGGCCCGCGATGTGGCCCAGTACCTGCTCTCAGACAGCCTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACCCCGGGCCCGCGATGTGGCCCAGTACCTGCTCTCAGACAGCCTCTTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTGG         GTTCTAGTAAATACCGCTTGCTGTGTTTTGATGTTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTGGGTG...CAGGTTCTAGTAAATACCGCTTGCTGTGTTTTGATGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGCTAAGCTCATCCAGTGTATTGTGTTTGGCCCTCTTCGAGTGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111020 GTGGCTAAGCTCATCCAGTGTATTGTGTTTGGCCCTCTTCGAGTGAGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAGACAG         CATCTCAAAGACAAATTTTGGAATTTTATTTTCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111070 GAGACAGGTA...TAGCATCTCAAAGACAAATTTTGGAATTTTATTTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAAGTTCATTTTCATCTTTGGTGTGCTGAATGTCCAGACAGTGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115774 ACAAGTTCATTTTCATCTTTGGTGTGCTGAATGTCCAGACAGTGGAAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGGTCATGTGGTGCCTCTGGTTTGCCGGACTTGTCTTTCTGCACCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115824 GTGGTCATGTGGTGCCTCTGGTTTGCCGGACTTGTCTTTCTGCACCTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGTTCAGCTCTGCAAGGATCGATTTGAATAT         CTTTCCTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 115874 GGTTCAGCTCTGCAAGGATCGATTTGAATATGTG...CAGCTTTCCTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGCCCACCACGCCGATGAGCAGCCACGGTCGAGTCCTGTCCCTGTTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117222 CGCCCACCACGCCGATGAGCAGCCACGGTCGAGTCCTGTCCCTGTTGGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCATGCTGCTTTCCTGCTGTGGACTGGCGGCCGTCTGCTCCATCACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117272 GCCATGCTGCTTTCCTGCTGTGGACTGGCGGCCGTCTGCTCCATCACCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTACACCCACGGAATGCACACCTTGGCTTTCATGGCTGCAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 117322 CTACACCCACGGAATGCACACCTTGGCTTTCATGGCTGCAGAGGTG...T

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    667   TCTCTTCTTGTGACAGTGAGGACTGCTCATGTGATTTTACG       
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 120082 AGTCTCTTCTTGTGACAGTGAGGACTGCTCATGTGATTTTACGGTG...C

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    708   ATACGTAATTCACCTCTGGGACCTCAACCACGAAGGGACGTGGGAAGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120285 AGATACGTAATTCACCTCTGGGACCTCAACCACGAAGGGACGTGGGAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AAAGGGGACGTATGTCTATTACACAGACTTTGTCATGGAGCTCACTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120335 AAAGGGGACGTATGTCTATTACACAGACTTTGTCATGGAGCTCACTCTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGTCCCTGGACCTCATGCACCATATTCACATGTTG         TTATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 120385 TGTCCCTGGACCTCATGCACCATATTCACATGTTGGTA...AAGTTATTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGCAACATCTGGTTATCCATGGCCAGCCTGGTCATCTTTATGCAGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122216 GGCAACATCTGGTTATCCATGGCCAGCCTGGTCATCTTTATGCAGCTGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTACCTGTTTCATGAGGTGCAACGTCGAATTCGTCGGCACAAGAACTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122266 TTACCTGTTTCATGAGGTGCAACGTCGAATTCGTCGGCACAAGAACTATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TACGTGTGGTTGGAAACATGGAGGCCAG         GTTTGCAGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 122316 TACGTGTGGTTGGAAACATGGAGGCCAGGTA...CAGGTTTGCAGTTGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACTCCAGAGGAGCTGGCTGTCAACAATGACGACTGTGCCATCTGTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123498 ACTCCAGAGGAGCTGGCTGTCAACAATGACGACTGTGCCATCTGTTGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTCCATGCAGGCTGCGCGGAAACTGCCCTGTGGACATCTTTTCCACAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 123548 CTCCATGCAGGCTGCGCGGAAACTGCCCTGTGGACATCTTTTCCACAAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1086        CTCCTGTCTTCGTTCCTGGCTAGAACAAGACACCTCCTGTCCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123598 A...TAGCTCCTGTCTTCGTTCCTGGCTAGAACAAGACACCTCCTGTCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ACATGCAGAATGTCTCTTAATATTGCCGACAATAATCGTGTCAGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135996 ACATGCAGAATGTCTCTTAATATTGCCGACAATAATCGTGTCAGGGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACATCAAGGAGAGAACTTGGATGAGAATTTGGTTCCTGTAGCAGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136046 ACATCAAGGAGAGAACTTGGATGAGAATTTGGTTCCTGTAGCAGCAGCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AAGGGAGACCTCGCTTAAACCAACACAATCACTTCTTCCATTTCGATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 136096 AAGGGAGACCTCGCTTAAACCAACACAATCACTTCTTCCATTTCGATGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1277        GGTCTCGGATTGCGAGCTGGCTGCCGAGTTTTTCGGTTGAAGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136146 T...CAGGGTCTCGGATTGCGAGCTGGCTGCCGAGTTTTTCGGTTGAAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GATGCACACCACCAACATTCTTGGCATTACGCAGGCCAGCAACTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139349 GATGCACACCACCAACATTCTTGGCATTACGCAGGCCAGCAACTCCCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TCAATGCAATG         GCTCATCAGATTCAAGAGATGTTTCCCCAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 139399 TCAATGCAATGGTA...TAGGCTCATCAGATTCAAGAGATGTTTCCCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTTCCATACCATCTGGTACTGCAGGACCTCCAGCTGACACGCTCAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156031 GTTCCATACCATCTGGTACTGCAGGACCTCCAGCTGACACGCTCAGTTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AATAACAACAGACAATATTTTAGAAGGACGGATTCAAGTACCTTTTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156081 AATAACAACAGACAATATTTTAGAAGGACGGATTCAAGTACCTTTTCCTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CACAG         CGGTCAGATAGCATCAGACCTGCATTGAACAGTCCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156131 CACAGGTA...CAGCGGTCAGATAGCATCAGACCTGCATTGAACAGTCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GTGGAAAGGCCAAGCAGTGACCAGGAAGAGGGAGAAACTTCTGCTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 157837 GTGGAAAGGCCAAGCAGTGACCAGGAAGAGGGAGAAACTTCTGCTCAGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1600        ACCGAGCGTGTGCCACTGGACCTCAGTCCTCGCCTGGAGGAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157887 A...CAGACCGAGCGTGTGCCACTGGACCTCAGTCCTCGCCTGGAGGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CGCTGGACTTCGGCGAGGTGGAAGTGGAGCCCAGTGAGGTGGAAGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161266 CGCTGGACTTCGGCGAGGTGGAAGTGGAGCCCAGTGAGGTGGAAGACTTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GAGGCTCGTGGGAGCCGCTTCTCCAAGTCTGCTGATGAGAGACAGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161316 GAGGCTCGTGGGAGCCGCTTCTCCAAGTCTGCTGATGAGAGACAGCGCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GCTGGTGCAGCGTAAGGACGAACTCCTCCAGCAAGCTCGCAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 161366 GCTGGTGCAGCGTAAGGACGAACTCCTCCAGCAAGCTCGCAAGTG...TA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1785  ACGTTTCTTGAACAAAAGTTCTGAAGATGATGCGGCCTCAGAGAGCTTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162271 GACGTTTCTTGAACAAAAGTTCTGAAGATGATGCGGCCTCAGAGAGCTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CTCCCCTCGGAAGGTGCGTCCTCTGACCCCGTGACCCTGCGTCGAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162321 CTCCCCTCGGAAGGTGCGTCCTCTGACCCCGTGACCCTGCGTCGAAGGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1884 GCTGGCTGCCGCCGCGGAACGGAGGCTTCAGAAGCAGCAGACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162371 GCTGGCTGCCGCCGCGGAACGGAGGCTTCAGAAGCAGCAGACCTCC