seq1 = pF1KE3258.tfa, 1851 bp
seq2 = pF1KE3258/gi568815596r_223497432.tfa (gi568815596r:223497432_223699282), 201851 bp

>pF1KE3258 1851
>gi568815596r:223497432_223699282 (Chr2)

(complement)

1-1851  (100001-101851)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAAGCAAAGACCCACTGGCTTGGAGCAGCCCTGTCTCTTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAAGCAAAGACCCACTGGCTTGGAGCAGCCCTGTCTCTTATCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTAATTTTCCTCATCTCTGGGGCTGAAGCAGCTTCATTTCAGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTAATTTTCCTCATCTCTGGGGCTGAAGCAGCTTCATTTCAGAGAAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGCTTCAGAAAGAACCAGACCTCAGGTTGGAAAATGTCCAAAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGCTTCAGAAAGAACCAGACCTCAGGTTGGAAAATGTCCAAAAGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCAGTCCTGAAATGATCAGGGCTTTGGAGTACATAGAAAACCTCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCAGTCCTGAAATGATCAGGGCTTTGGAGTACATAGAAAACCTCCGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAAGCTCATAAGGAAGAAAGCAGCCCAGATTATAATCCCTACCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACAAGCTCATAAGGAAGAAAGCAGCCCAGATTATAATCCCTACCAAGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCTGTCCCCCTTCAGCAAAAAGAAAATGGCGATGAAAGCCACTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCTGTCCCCCTTCAGCAAAAAGAAAATGGCGATGAAAGCCACTTGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGAGGGATTCACTGAGTGAAGAAGACTGGATGAGAATAATACTCGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGAGGGATTCACTGAGTGAAGAAGACTGGATGAGAATAATACTCGAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTGAGACAGGCTGAAAATGAGCCTCAGTCTGCACCAAAAGAAAATAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTGAGACAGGCTGAAAATGAGCCTCAGTCTGCACCAAAAGAAAATAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTATGCCTTGAATTCAGAAAAGAACTTTCCAATGGACATGAGTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTATGCCTTGAATTCAGAAAAGAACTTTCCAATGGACATGAGTGATGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TATGAGACACAGCAGTGGCCAGAAAGAAAGCTTAAGCACATGCAATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TATGAGACACAGCAGTGGCCAGAAAGAAAGCTTAAGCACATGCAATTCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCCTATGTATGAAGAGAATTCCAGGGATAACCCCTTTAAACGCACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCCTATGTATGAAGAGAATTCCAGGGATAACCCCTTTAAACGCACAAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAATAGTGGAGGAACAATATACTCCTCAAAGCCTTGCTACATTGGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAATAGTGGAGGAACAATATACTCCTCAAAGCCTTGCTACATTGGAATCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTCTTCCAAGAGCTGGGGAAACTGACAGGACCAAACAACCAGAAACGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTCTTCCAAGAGCTGGGGAAACTGACAGGACCAAACAACCAGAAACGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAGGATGGATGAGGAGCAAAAACTTTATACGGATGATGAAGATGATATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAGGATGGATGAGGAGCAAAAACTTTATACGGATGATGAAGATGATATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAAGGCTAATAACATTGCCTATGAAGATGTGGTCGGGGGAGAAGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACAAGGCTAATAACATTGCCTATGAAGATGTGGTCGGGGGAGAAGACTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AACCCAGTAGAGGAGAAAATAGAGAGTCAAACCCAGGAAGAGGTGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AACCCAGTAGAGGAGAAAATAGAGAGTCAAACCCAGGAAGAGGTGAGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGCAAAGAGAATATAGAAAAAAATGAACAAATCAATGATGAGATGAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100801 CAGCAAAGAGAATATAGAAAAAAATGAACAAATCAACGATGAGATGAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTCAGGGCAGCTTGGCATCCAGGAAGAAGGTCTTCGGAAAGAGAGTAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100851 GCTCAGGGCAGCTTGGCATCCAGGAAGAAGATCTTCGGAAAGAGAGTAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GACCAACTCTCAGATGATGTCTCCAAAGTAATTGCCTATTTGAAAAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GACCAACTCTCAGATGATGTCTCCAAAGTAATTGCCTATTTGAAAAGGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGTAAATGCTGCAGGAAGTGGGAGGTTACAGAATGGGCAAAATGGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGTAAATGCTGCAGGAAGTGGGAGGTTACAGAATGGGCAAAATGGGGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGGCCACCAGGCTTTTTGAGAAACCTCTTGATTCTCAGTCTATTTATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGGCCACCAGGCTTTTTGAGAAACCTCTTGATTCTCAGTCTATTTATCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTGATTGAAATCTCAAGGAATTTACAGATACCCCCAGAAGACTTAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTGATTGAAATCTCAAGGAATTTACAGATACCCCCAGAAGACTTAATTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GATGCTCAAAACTGGGGAGAAGCCGAATGGATCAGTGGAACCGGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GATGCTCAAAACTGGGGAGAAGCCGAATGGATCAGTGGAACCGGAGCGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGCTTGACCTTCCTGTTGACCTAGATGACATCTCAGAGGCTGACTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGCTTGACCTTCCTGTTGACCTAGATGACATCTCAGAGGCTGACTTAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CATCCAGACCTGTTCCAAAATAGGATGCTCTCCAAGAGTGGCTACCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CATCCAGACCTGTTCCAAAATAGGATGCTCTCCAAGAGTGGCTACCCTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AACACCTGGTGGTGCTGGGACTGAGGCCCTACCAGACGGGCTCAGTGTTG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AACACCTGGTCGTGCTGGGACTGAGGCCCTACCAGACGGGCTCAGTGTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGGATATTTTAAATCTTTTAGGGATGGAGAGTGCAGCAAATCAGAAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGGATATTTTAAATCTTTTAGGGATGGAGAGTGCAGCAAATCAGAAAACG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCGTATTTTCCCAATCCATATAACCAGGAGAAAGTTCTGCCAAGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCGTATTTTCCCAATCCATATAACCAGGAGAAAGTTCTGCCAAGGCTCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TTATGGTGCTGGAAGATCTAGATCGAACCAGCTTCCCAAAGCTGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TTATGGTGCTGGAAGATCTAGATCGAACCAGCTTCCCAAAGCTGCCTGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TTCCACATGTTGAAAACAGACAGATGGCATATGAAAACCTGAACGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TTCCACATGTTGAAAACAGACAGATGGCATATGAAAACCTGAACGACAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GATCAAGAATTAGGTGAGTACTTGGCCAGGATGCTAGTTAAATACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GATCAAGAATTAGGTGAGTACTTGGCCAGGATGCTAGTTAAATACCCTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GATCATTAATTCAAACCAAGTGAAGCGAGTTCCTGGTCAAGGCTCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GATCATTAATTCAAACCAAGTGAAGCGAGTTCCTGGTCAAGGCTCATCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AAGGTGACCTGCAGGAAGAGGAACAAATTGAGCAGGCCATCAAAGAGCAT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AAGATGACCTGCAGGAAGAGGAACAAATTGAGCAGGCCATCAAAGAGCAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTGAATCAAGGCAGCTCTCAGGAGACTGACAAGCTGGCCCCGGTGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TTGAATCAAGGCAGCTCTCAGGAGACTGACAAGCTGGCCCCGGTGAGCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 AAGGTTCCCTGTGGGGCCCCCGAAGAATGATGATACCCCAAATAGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 AAGGTTCCCTGTGGGGCCCCCGAAGAATGATGATACCCCAAATAGGCAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ACTGGGATGAAGATCTGTTAATGAAAGTGCTGGAATACCTCAACCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 ACTGGGATGAAGATCTGTTAATGAAAGTGCTGGAATACCTCAACCAAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AAGGCAGAAAAGGGAAGGGAGCATATTGCTAAGAGAGCAATGGAAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AAGGCAGAAAAGGGAAGGGAGCATATTGCTAAGAGAGCAATGGAAAATAT

   1850 
   1851 G
        |
 101851 G