seq1 = pF1KE3233.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KE3233/gi568815586r_50963749.tfa (gi568815586r:50963749_51176561), 212813 bp

>pF1KE3233 1629
>gi568815586r:50963749_51176561 (Chr12)

(complement)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-411  (102480-102739)   100% ->
412-708  (108593-108889)   100% ->
709-1629  (111893-112813)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGCATTCACGGGCTCGGGTCTCAAGAGGAAGTTTGATGATGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGCATTCACGGGCTCGGGTCTCAAGAGGAAGTTTGATGATGTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGGGCTCATCAGTTTCCAACTCAGATGATGAGATCTCCAGCAGTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGGGCTCATCAGTTTCCAACTCAGATGATGAGATCTCCAGCAGTGATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGCTGACAGCTGCGACAGCCTCAATCCTCCTACCACTGCCAGCTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGCTGACAGCTGCGACAGCCTCAATCCTCCTACCACTGCCAGCTTCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 C         CCACATCCATCCTGAAGCGGCAGAAGCAGCTGCGGAGGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGTG...CAGCCACATCCATCCTGAAGCGGCAGAAGCAGCTGCGGAGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAATGTACGCTTTGACCAGGTGACTGTATACTACTTTGCCCGGCGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102520 GAATGTACGCTTTGACCAGGTGACTGTATACTACTTTGCCCGGCGCCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTTTTACCAGTGTGCCCAGCCAGGGTGGTAGCTCTCTGGGCATGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102570 GTTTTACCAGTGTGCCCAGCCAGGGTGGTAGCTCTCTGGGCATGGCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGCCATAACTCTGTACGGAGCTATACACTCTGTGAGTTTGCCCAGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102620 CGCCATAACTCTGTACGGAGCTATACACTCTGTGAGTTTGCCCAGGAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAGGTGAACCATCGAGAGATTCTGCGTGAGCACCTGAAGGAAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102670 GGAGGTGAACCATCGAGAGATTCTGCGTGAGCACCTGAAGGAAGAGAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCATGCCAAGAAAATGAAG         CTGACCAAGAATGGGACAGTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102720 TCCATGCCAAGAAAATGAAGGTG...CAGCTGACCAAGAATGGGACAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGTCGGTGGAGGCTGATGGCCTGACGCTGGATGATGTGTCAGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108614 GAGTCGGTGGAGGCTGATGGCCTGACGCTGGATGATGTGTCAGATGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TATTGATGTGGAAAATGTGGAGGTGGATGATTACTTCTTCCTGCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108664 TATTGATGTGGAAAATGTGGAGGTGGATGATTACTTCTTCCTGCAGCCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCCCACCAAACGGCGACGGGCCCTGCTGAGGGCTTCTGGGGTCCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108714 TGCCCACCAAACGGCGACGGGCCCTGCTGAGGGCTTCTGGGGTCCACCGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATTGATGCTGAAGAGAAGCAAGAACTTCGAGCCATCCGCCTGTCACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108764 ATTGATGCTGAAGAGAAGCAAGAACTTCGAGCCATCCGCCTGTCACGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGAATGTGGTTGTGACTGCCGACTGTATTGTGACCCAGAAGCGTGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108814 AGAATGTGGTTGTGACTGCCGACTGTATTGTGACCCAGAAGCGTGTGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCAGCCAGGCTGGGATTAAATGCCAG         GTGGATCGCATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108864 GCAGCCAGGCTGGGATTAAATGCCAGGTC...CAGGTGGATCGCATGTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTTCCATGTGGCTGCTCCCGGGATGGCTGTGGGAACATGGCAGGACGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111908 TTTCCATGTGGCTGCTCCCGGGATGGCTGTGGGAACATGGCAGGACGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGAATTTAATCCAATCCGGGTCCGGACTCATTACCTCCACACCATTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111958 TGAATTTAATCCAATCCGGGTCCGGACTCATTACCTCCACACCATTATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGCTGGAGCTGGAGAGCAAGCGGCAGGTGAGCCGCCCAGCAGCCCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112008 AGCTGGAGCTGGAGAGCAAGCGGCAGGTGAGCCGCCCAGCAGCCCCAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GAGGAGCCCTCCCCGACTGCCAGTTGCAGCCTGACAGGAGCACAGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112058 GAGGAGCCCTCCCCGACTGCCAGTTGCAGCCTGACAGGAGCACAGGGCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGAGACCCAGGACTTCCAGGAGTTCATTGCTGAGAATGAGACAGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112108 TGAGACCCAGGACTTCCAGGAGTTCATTGCTGAGAATGAGACAGCAGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TGCACCTGCAGAGTGCAGAGGAACTGGAGCGGCTCAAGGCAGAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112158 TGCACCTGCAGAGTGCAGAGGAACTGGAGCGGCTCAAGGCAGAAGAAGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TCCAGCGGCTCTAGTGCCAGCCTGGACTCGAGCATCGAGAGCCTGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112208 TCCAGCGGCTCTAGTGCCAGCCTGGACTCGAGCATCGAGAGCCTGGGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GTGCATCCTAGAGGAGCCTCTGGCTGTCCCCGAAGAGCTGTGCCCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112258 GTGCATCCTAGAGGAGCCTCTGGCTGTCCCCGAAGAGCTGTGCCCAGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TTACAGCCCCCATTCTCATCCAGGCTCAGCTGCCCCCAGGCTCCTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112308 TTACAGCCCCCATTCTCATCCAGGCTCAGCTGCCCCCAGGCTCCTCTGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CTGTGTTTTACCGAGAACTCAGACCACCCAACTGCCTCAACGGTGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112358 CTGTGTTTTACCGAGAACTCAGACCACCCAACTGCCTCAACGGTGAACAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CCCATCCTACTTGAACAGTGGGCCCCTGGTCTATTATCAAGTGGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112408 CCCATCCTACTTGAACAGTGGGCCCCTGGTCTATTATCAAGTGGAGCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GGCCAGTCTTGGGAGTGAAAGGAGAGCCTGGTACGGAAGAAGGCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112458 GGCCAGTCTTGGGAGTGAAAGGAGAGCCTGGTACGGAAGAAGGCTCAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TCTTTCCCAAAGGAGAAGGATCTGAATGTCTTCTCTCTCCCTGTTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112508 TCTTTCCCAAAGGAGAAGGATCTGAATGTCTTCTCTCTCCCTGTTACCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 ACTCGTGGCTTGTAGCTCCACAGACCCAGCTGCCCTCTGTAAATCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112558 ACTCGTGGCTTGTAGCTCCACAGACCCAGCTGCCCTCTGTAAATCAGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TGGGGAAAACACCCACCCTAGAAGCTCTATTGCCCGAAGATTGTAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112608 TGGGGAAAACACCCACCCTAGAAGCTCTATTGCCCGAAGATTGTAACCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GAGGAGCCTGAAAATGAAGACTTCCACCCTTCCTGGTCCCCCTCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112658 GAGGAGCCTGAAAATGAAGACTTCCACCCTTCCTGGTCCCCCTCAAGCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CCCCTTCCGCACGGACAATGAAGAGGGCTGTGGGATGGTGAAGACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112708 CCCCTTCCGCACGGACAATGAAGAGGGCTGTGGGATGGTGAAGACCTCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 AGCAGAATGAGGATCGGCCCCCTGAAGATTCTTCCTTAGAACTCCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112758 AGCAGAATGAGGATCGGCCCCCTGAAGATTCTTCCTTAGAACTCCCTCTG

   1650     .
   1624 GCAGTG
        ||||||
 112808 GCAGTG