seq1 = pF1KE3218.tfa, 1485 bp
seq2 = pF1KE3218/gi568815584f_72837979.tfa (gi568815584f:72837979_73058802), 220824 bp

>pF1KE3218 1485
>gi568815584f:72837979_73058802 (Chr14)

1-92  (100001-100092)   100% ->
93-193  (101824-101924)   100% ->
194-351  (102242-102399)   100% ->
352-431  (103767-103846)   100% ->
432-534  (105016-105118)   100% ->
535-678  (107906-108049)   99% ->
679-728  (109164-109213)   100% ->
729-808  (113820-113899)   100% ->
809-907  (116186-116284)   100% ->
908-1005  (116408-116505)   98% ->
1006-1179  (117545-117718)   100% ->
1180-1294  (118408-118522)   100% ->
1295-1485  (120634-120824)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATAAAAGTCGCTGGCAGAGTAGAAGACGACATGGGAGAAGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATAAAAGTCGCTGGCAGAGTAGAAGACGACATGGGAGAAGAAGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCAGAACCCTTGGTTCAGACTCCGTGATTCTGAAGACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100051 CCAGCAGAACCCTTGGTTCAGACTCCGTGATTCTGAAGACAGGCA...CA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     93  GTCTGACTCCCGGGCAGCACAGCCCGCTCACGATTCCGGCCACGGTGAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101823 GGTCTGACTCCCGGGCAGCACAGCCCGCTCACGATTCCGGCCACGGTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACGAGTCTCCGTCAACCTCGTCTGGCACAGCTGGGACCTCCTCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101873 GACGAGTCTCCGTCAACCTCGTCTGGCACAGCTGGGACCTCCTCTGTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AG         AGCTACCTGGGTTTTACTTTGACCCTGAAAAGAAACGCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101923 AGGTA...AAGAGCTACCTGGGTTTTACTTTGACCCTGAAAAGAAACGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTTCCGCTTGCTCCCTGGACATAACAACTGCAACCCCCTGACGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102281 ACTTCCGCTTGCTCCCTGGACATAACAACTGCAACCCCCTGACGAAAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCATCCGGCAGAAGGAGATGGAGAGCAAGAGACTGCGGCTGCTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102331 AGCATCCGGCAGAAGGAGATGGAGAGCAAGAGACTGCGGCTGCTCCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAAGACAGACGGAAAAAG         ATTGCCAGGATGGGATTTAATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102381 AGAAGACAGACGGAAAAAGGTG...TAGATTGCCAGGATGGGATTTAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CATCTTCCATGCTACGAAAAAGCCAGCTGGGTTTTCTCAACGTCACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103789 CATCTTCCATGCTACGAAAAAGCCAGCTGGGTTTTCTCAACGTCACCAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACTGCCA         TTTAGCCCACGAGCTGCGTCTCAGCTGCATGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103839 TACTGCCAGTA...CAGTTTAGCCCACGAGCTGCGTCTCAGCTGCATGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGGAAAAAGGTCCAGATTCGAAGCATGGATCCCTCCGCCTTGGCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105049 GAGGAAAAAGGTCCAGATTCGAAGCATGGATCCCTCCGCCTTGGCAAGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCGATTTAACCTCATACTG         GCAGATACCAACAGTGACCGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105099 ACCGATTTAACCTCATACTGGTG...CAGGCAGATACCAACAGTGACCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTCTTCACAGTGAACGATGTTACAGTTGGAGGCTCCAAGTATGGTATCAT
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 107927 CTCTTCACAGTGAACGATGTTAAAGTTGGAGGCTCCAAGTATGGTATCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAACCTGCAAAGTCTGAAGACCCCTACGCTCAAGGTGTTCATGCACGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107977 CAACCTGCAAAGTCTGAAGACCCCTACGCTCAAGGTGTTCATGCACGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACCTCTACTTCACCAACCGGAAG         GTGAATTCGGTGTGCTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108027 ACCTCTACTTCACCAACCGGAAGGTA...CAGGTGAATTCGGTGTGCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCCTCGCTGAATCACTTGGATTCCCACATTCT         GCTATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109182 GCCTCGCTGAATCACTTGGATTCCCACATTCTGTA...CAGGCTATGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CATGGGACTCGCAGAGACTCCAGGCTGTGCCACCCTGCTCCCAGCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113829 CATGGGACTCGCAGAGACTCCAGGCTGTGCCACCCTGCTCCCAGCATCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGTTCGTCAATAGTCACCCAG         GAATAGACCGGCCTGGCATG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113879 TGTTCGTCAATAGTCACCCAGGTA...CAGGAATAGACCGGCCTGGCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CTCTGCAGTTTCCGGATCCCTGGTGCCTGGTCCTGTGCCTGGTCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116206 CTCTGCAGTTTCCGGATCCCTGGTGCCTGGTCCTGTGCCTGGTCCCTGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TATCCAAGCAAATAACTGCTTCAGTACAG         GCTTGTCTCGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 116256 TATCCAAGCAAATAACTGCTTCAGTACAGGTG...CAGGCTTGTCTCGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GGGTCCTGTTGACCAACGTGGTGACGGGACACCGGCAGTCCTTTGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116420 GGGTCCTGTTGACCAACGTGGTGACGGGACACCGGCAGTCCTTTGGGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AACAGTGATGTCTTGGCCCAGCAGTTTGCTTTCATG         GCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||>>>...>>>|||||
 116470 AACAGTGATGTCTTGGCCCAGCAGTTTGCTCTCATGGTT...CAGGCTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TCTGCTGTTTAATGGCTGCCGCTCTGGGGAAATCTTTGCCATTGATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117550 TCTGCTGTTTAATGGCTGCCGCTCTGGGGAAATCTTTGCCATTGATCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GTTGTGGAAATCAAGGCAAGGGATGGAAGGCCACCCGCCTGTTTCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117600 GTTGTGGAAATCAAGGCAAGGGATGGAAGGCCACCCGCCTGTTTCATGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TCAGCAGTGACCTCTGTGCGGATCCTCCAAGATGAGCAATACCTGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117650 TCAGCAGTGACCTCTGTGCGGATCCTCCAAGATGAGCAATACCTGATGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TTCAGACATGGCTGGAAAG         ATCAAGCTGTGGGACCTGAGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 117700 TTCAGACATGGCTGGAAAGGTA...CAGATCAAGCTGTGGGACCTGAGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CCACGAAGTGCGTAAGGCAGTACGAAGGCCACGTGAATGAGTACGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118430 CCACGAAGTGCGTAAGGCAGTACGAAGGCCACGTGAATGAGTACGCCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CTGCCCCTGCATGTGCACGAGGAAGAAGGAATCCTGGTGGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 118480 CTGCCCCTGCATGTGCACGAGGAAGAAGGAATCCTGGTGGCAGGTA...T

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1295   TGGGCCAGGACTGCTACACGATAATCTGGAGCCTCCACGATGCCCGCC
        >>||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 120632 AGTGGGCCAGGACTGCTACACGAGAATCTGGAGCCTCCACGATGCCCGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TACTGAGAACCATACCCTCCCCGTACCCTGCCTCCAAGGCCGACATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120682 TACTGAGAACCATACCCTCCCCGTACCCTGCCTCCAAGGCCGACATTCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AGTGTGGCCTTCTCGTCGCGGCTGGGGGGCTCCCGGGGCGCGCCGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120732 AGTGTGGCCTTCTCGTCGCGGCTGGGGGGCTCCCGGGGCGCGCCGGGGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GCTCATGGCTGTCGGGCAGGACCTTTACTGTTACTCCTACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120782 GCTCATGGCTGTCGGGCAGGACCTTTACTGTTACTCCTACAGC